MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_015666	ACT	2	6	723999	724004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252817
20003	NC_015666	CGT	2	6	724027	724032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252817
20004	NC_015666	CGCGAC	2	12	724033	724044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252817
20005	NC_015666	ACG	2	6	724050	724055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252817
20006	NC_015666	GTC	2	6	724064	724069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252817
20007	NC_015666	GGAT	2	8	724071	724078	25 %	25 %	50 %	0 %	336252817
20008	NC_015666	ACC	2	6	724079	724084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252817
20009	NC_015666	CGA	3	9	724141	724149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252817
20010	NC_015666	GCTG	2	8	724174	724181	0 %	25 %	50 %	25 %	336252817
20011	NC_015666	GAG	2	6	724205	724210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252817
20012	NC_015666	TTCCG	2	10	724221	724230	0 %	40 %	20 %	40 %	336252817
20013	NC_015666	GAC	2	6	724237	724242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252817
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20015	NC_015666	GGC	2	6	724262	724267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252817
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20017	NC_015666	CGA	2	6	724309	724314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252817
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20020	NC_015666	GAG	2	6	724436	724441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252817
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20025	NC_015666	AGCG	2	8	724619	724626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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20051	NC_015666	CGAC	2	8	725544	725551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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20121	NC_015666	CGG	2	6	728075	728080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252821
20122	NC_015666	GTC	2	6	728092	728097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252821
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20137	NC_015666	GGCC	2	8	728735	728742	0 %	0 %	50 %	50 %	336252822
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20230	NC_015666	ATC	2	6	732062	732067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252824
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20238	NC_015666	CGA	2	6	732328	732333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252824
20239	NC_015666	ACTGA	2	10	732372	732381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20240	NC_015666	CGT	2	6	732400	732405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20241	NC_015666	CGC	2	6	732528	732533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252825
20242	NC_015666	GCTC	2	8	732554	732561	0 %	25 %	25 %	50 %	336252825
20243	NC_015666	CTGT	2	8	732567	732574	0 %	50 %	25 %	25 %	336252825
20244	NC_015666	CGAT	2	8	732644	732651	25 %	25 %	25 %	25 %	336252825
20245	NC_015666	CTC	2	6	732690	732695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252825
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20248	NC_015666	CGT	2	6	732816	732821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252825
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20257	NC_015666	GA	3	6	732995	733000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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20259	NC_015666	CG	3	6	733029	733034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20260	NC_015666	CGA	2	6	733082	733087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20477	NC_015666	ACGCCG	2	12	740774	740785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252834
20478	NC_015666	TGA	2	6	740789	740794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252834
20479	NC_015666	AAG	2	6	740800	740805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252834
20480	NC_015666	TCG	2	6	740831	740836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252834
20481	NC_015666	CGA	3	9	740841	740849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252834
20482	NC_015666	GC	3	6	740874	740879	0 %	0 %	50 %	50 %	336252834
20483	NC_015666	CGG	2	6	740907	740912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252834
20484	NC_015666	GGCC	2	8	740916	740923	0 %	0 %	50 %	50 %	336252834
20485	NC_015666	GCTCG	2	10	741006	741015	0 %	20 %	40 %	40 %	336252834
20486	NC_015666	CTG	2	6	741016	741021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252834
20487	NC_015666	CGG	2	6	741054	741059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252834
20488	NC_015666	CGC	3	9	741078	741086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252834
20489	NC_015666	GGC	2	6	741154	741159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252834
20490	NC_015666	ACC	2	6	741245	741250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252834
20491	NC_015666	CCG	2	6	741278	741283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252834
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20495	NC_015666	GCTG	2	8	741593	741600	0 %	25 %	50 %	25 %	336252835
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20499	NC_015666	GCC	2	6	741708	741713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252835
20500	NC_015666	GTC	2	6	741908	741913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252836

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