MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015666	CGG	2	6	53106	53111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1502	NC_015666	CGA	2	6	53127	53132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1503	NC_015666	GCG	2	6	53142	53147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1504	NC_015666	GCC	2	6	53173	53178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252146
1505	NC_015666	GCG	2	6	53193	53198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1506	NC_015666	CGG	2	6	53226	53231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1507	NC_015666	GTC	2	6	53275	53280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1508	NC_015666	CGG	2	6	53289	53294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1509	NC_015666	ATCGA	2	10	53303	53312	40 %	20 %	20 %	20 %	336252146
1510	NC_015666	CGA	2	6	53343	53348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1511	NC_015666	TCGG	2	8	53387	53394	0 %	25 %	50 %	25 %	336252146
1512	NC_015666	TGC	3	9	53440	53448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1513	NC_015666	GCC	2	6	53458	53463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252146
1514	NC_015666	GAC	2	6	53473	53478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1515	NC_015666	CG	3	6	53502	53507	0 %	0 %	50 %	50 %	336252146
1516	NC_015666	GTCGGA	2	12	53520	53531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252146
1517	NC_015666	CGT	2	6	53593	53598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252147
1518	NC_015666	CGG	2	6	53605	53610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252147
1519	NC_015666	GTG	2	6	53739	53744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015666	CGA	2	6	53770	53775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252148
1521	NC_015666	TGAC	2	8	53784	53791	25 %	25 %	25 %	25 %	336252148
1522	NC_015666	CCG	2	6	53798	53803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252148
1523	NC_015666	CAG	2	6	53805	53810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252148
1524	NC_015666	TCG	2	6	53829	53834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252148
1525	NC_015666	TCG	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252148
1526	NC_015666	GCTC	2	8	53868	53875	0 %	25 %	25 %	50 %	336252148
1527	NC_015666	CTC	2	6	53882	53887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252148
1528	NC_015666	CGA	2	6	53899	53904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252148
1529	NC_015666	ACCGG	2	10	53923	53932	20 %	0 %	40 %	40 %	336252148
1530	NC_015666	CAT	2	6	53936	53941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252148
1531	NC_015666	GC	3	6	53975	53980	0 %	0 %	50 %	50 %	336252149
1532	NC_015666	GCC	2	6	53993	53998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252149
1533	NC_015666	TTCGG	2	10	54006	54015	0 %	40 %	40 %	20 %	336252149
1534	NC_015666	CGT	2	6	54025	54030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252149
1535	NC_015666	CAG	2	6	54035	54040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252149
1536	NC_015666	CGT	2	6	54079	54084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252149
1537	NC_015666	CCG	2	6	54147	54152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252149
1538	NC_015666	GCGA	2	8	54308	54315	25 %	0 %	50 %	25 %	336252149
1539	NC_015666	CG	3	6	54510	54515	0 %	0 %	50 %	50 %	336252150
1540	NC_015666	CTT	2	6	54517	54522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252150
1541	NC_015666	GCA	2	6	54528	54533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252150
1542	NC_015666	GTA	2	6	54577	54582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252150
1543	NC_015666	TGA	2	6	54651	54656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252150
1544	NC_015666	GC	4	8	54699	54706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252150
1545	NC_015666	GCGAC	2	10	54722	54731	20 %	0 %	40 %	40 %	336252150
1546	NC_015666	CGA	3	9	54753	54761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252150
1547	NC_015666	GATC	2	8	54869	54876	25 %	25 %	25 %	25 %	336252151
1548	NC_015666	CGA	2	6	54888	54893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252151
1549	NC_015666	ACG	3	9	54961	54969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252151
1550	NC_015666	TCT	2	6	54973	54978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252151
1551	NC_015666	CGTC	2	8	55073	55080	0 %	25 %	25 %	50 %	336252151
1552	NC_015666	TCC	2	6	55151	55156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015666	CGT	2	6	55181	55186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_015666	CGA	2	6	55236	55241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_015666	CGA	2	6	55243	55248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_015666	CCGACC	2	12	55277	55288	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_015666	TCG	2	6	55300	55305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_015666	GA	3	6	55324	55329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015666	ACGG	2	8	55526	55533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_015666	CTT	2	6	55606	55611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252152
1561	NC_015666	GC	3	6	55623	55628	0 %	0 %	50 %	50 %	336252152
1562	NC_015666	CGG	2	6	55642	55647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252152
1563	NC_015666	CCGT	2	8	55680	55687	0 %	25 %	25 %	50 %	336252152
1564	NC_015666	CGAC	2	8	55723	55730	25 %	0 %	25 %	50 %	336252152
1565	NC_015666	CTCG	2	8	55772	55779	0 %	25 %	25 %	50 %	336252152
1566	NC_015666	CGT	2	6	55795	55800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1567	NC_015666	CGA	2	6	55804	55809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1568	NC_015666	CGC	2	6	55810	55815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252152
1569	NC_015666	CTC	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252152
1570	NC_015666	GTC	2	6	55853	55858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1571	NC_015666	CGA	3	9	55861	55869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1572	NC_015666	CGACCG	2	12	55891	55902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252152
1573	NC_015666	TCGGCC	2	12	55947	55958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252152
1574	NC_015666	GTC	2	6	55970	55975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1575	NC_015666	GAT	2	6	55985	55990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252152
1576	NC_015666	TCG	2	6	56022	56027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1577	NC_015666	TCGA	2	8	56073	56080	25 %	25 %	25 %	25 %	336252152
1578	NC_015666	CGG	2	6	56117	56122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252152
1579	NC_015666	GTC	2	6	56124	56129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1580	NC_015666	CGAGCC	2	12	56137	56148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252152
1581	NC_015666	TCG	2	6	56163	56168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1582	NC_015666	CGA	2	6	56177	56182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1583	NC_015666	CGA	2	6	56188	56193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1584	NC_015666	TCG	2	6	56215	56220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1585	NC_015666	CG	3	6	56237	56242	0 %	0 %	50 %	50 %	336252152
1586	NC_015666	CGC	2	6	56272	56277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252152
1587	NC_015666	GTC	2	6	56300	56305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1588	NC_015666	CGA	2	6	56311	56316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1589	NC_015666	CGT	2	6	56323	56328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252152
1590	NC_015666	TAG	2	6	56346	56351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252153
1591	NC_015666	GC	3	6	56370	56375	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
1592	NC_015666	CGT	2	6	56380	56385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252153
1593	NC_015666	GC	3	6	56440	56445	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
1594	NC_015666	TCG	2	6	56449	56454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252153
1595	NC_015666	GC	3	6	56458	56463	0 %	0 %	50 %	50 %	336252153
1596	NC_015666	GCC	2	6	56489	56494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252153
1597	NC_015666	CCT	2	6	56542	56547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252153
1598	NC_015666	TCG	2	6	56592	56597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252153
1599	NC_015666	CCG	2	6	56611	56616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252153
1600	NC_015666	GGA	2	6	56624	56629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252153
1601	NC_015666	GTT	2	6	56678	56683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252153
1602	NC_015666	TCG	2	6	56718	56723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252153
1603	NC_015666	CTCGT	2	10	56784	56793	0 %	40 %	20 %	40 %	336252154
1604	NC_015666	CGA	2	6	56800	56805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1605	NC_015666	TCC	2	6	56808	56813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252154
1606	NC_015666	TCG	2	6	56814	56819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1607	NC_015666	CGA	2	6	56824	56829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1608	NC_015666	CGTG	2	8	56875	56882	0 %	25 %	50 %	25 %	336252154
1609	NC_015666	CTG	2	6	56897	56902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1610	NC_015666	GAC	2	6	56930	56935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1611	NC_015666	TCG	2	6	56994	56999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1612	NC_015666	TCG	2	6	57003	57008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1613	NC_015666	CTC	2	6	57041	57046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252154
1614	NC_015666	CGT	2	6	57051	57056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1615	NC_015666	TCG	2	6	57066	57071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252154
1616	NC_015666	GGT	2	6	57214	57219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252154
1617	NC_015666	ATT	2	6	57258	57263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336252154
1618	NC_015666	CGG	2	6	57279	57284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252155
1619	NC_015666	TTC	2	6	57298	57303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252155
1620	NC_015666	TTCG	2	8	57356	57363	0 %	50 %	25 %	25 %	336252155
1621	NC_015666	ATC	2	6	57416	57421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252155
1622	NC_015666	TGC	2	6	57440	57445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252155
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1624	NC_015666	GTT	2	6	57511	57516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252155
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1750	NC_015666	CGG	2	6	61061	61066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252157
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1753	NC_015666	CGC	2	6	61090	61095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252157
1754	NC_015666	GGCC	2	8	61142	61149	0 %	0 %	50 %	50 %	336252157
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1782	NC_015666	CGG	2	6	61896	61901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1783	NC_015666	AGCG	2	8	61905	61912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1784	NC_015666	TCG	2	6	61942	61947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252159
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1997	NC_015666	CACAA	2	10	69150	69159	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1998	NC_015666	TA	3	6	69175	69180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_015666	GGGC	2	8	69188	69195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2000	NC_015666	GAC	2	6	69201	69206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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