MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_015666	TCG	2	6	689500	689505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19003	NC_015666	GAG	2	6	689514	689519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252787
19004	NC_015666	CAT	2	6	689528	689533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252787
19005	NC_015666	ACC	2	6	689553	689558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252787
19006	NC_015666	GTG	2	6	689666	689671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252787
19007	NC_015666	ACG	2	6	689698	689703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19008	NC_015666	CGG	2	6	689753	689758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252787
19009	NC_015666	CGA	2	6	689765	689770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19010	NC_015666	GAC	2	6	689786	689791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19011	NC_015666	CCG	2	6	689848	689853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252787
19012	NC_015666	CCG	2	6	689898	689903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252787
19013	NC_015666	CGGA	2	8	689919	689926	25 %	0 %	50 %	25 %	336252787
19014	NC_015666	CG	3	6	689934	689939	0 %	0 %	50 %	50 %	336252787
19015	NC_015666	GCG	2	6	689965	689970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252787
19016	NC_015666	CGA	2	6	690083	690088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19017	NC_015666	CTCG	2	8	690095	690102	0 %	25 %	25 %	50 %	336252787
19018	NC_015666	CGA	2	6	690110	690115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19019	NC_015666	GTCG	2	8	690116	690123	0 %	25 %	50 %	25 %	336252787
19020	NC_015666	CGC	2	6	690140	690145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252787
19021	NC_015666	GAC	2	6	690162	690167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252787
19022	NC_015666	CTG	2	6	690224	690229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252788
19023	NC_015666	GC	3	6	690241	690246	0 %	0 %	50 %	50 %	336252788
19024	NC_015666	GAG	2	6	690248	690253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252788
19025	NC_015666	GGC	2	6	690259	690264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252788
19026	NC_015666	GAT	2	6	690313	690318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252788
19027	NC_015666	GCACCC	2	12	690333	690344	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336252788
19028	NC_015666	GGC	2	6	690377	690382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252788
19029	NC_015666	GAC	2	6	690404	690409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252788
19030	NC_015666	GTC	2	6	690539	690544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252788
19031	NC_015666	CGA	2	6	690556	690561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252788
19032	NC_015666	CTG	2	6	690590	690595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252788
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19034	NC_015666	CGG	2	6	690633	690638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252788
19035	NC_015666	CAA	2	6	690655	690660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252788
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19037	NC_015666	CGA	2	6	690739	690744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252788
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19039	NC_015666	GCG	2	6	690774	690779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252788
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19041	NC_015666	AGG	2	6	690861	690866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252788
19042	NC_015666	GC	3	6	690928	690933	0 %	0 %	50 %	50 %	336252788
19043	NC_015666	CTGC	2	8	690955	690962	0 %	25 %	25 %	50 %	336252788
19044	NC_015666	GAG	2	6	690977	690982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252788
19045	NC_015666	CGA	2	6	690988	690993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252788
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19048	NC_015666	GCTG	2	8	691068	691075	0 %	25 %	50 %	25 %	336252788
19049	NC_015666	CGCCCG	2	12	691088	691099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19050	NC_015666	CGA	2	6	691104	691109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_015666	CGT	2	6	691159	691164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_015666	CCG	2	6	691168	691173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19053	NC_015666	TAT	2	6	691208	691213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_015666	AT	3	6	691227	691232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_015666	TCA	3	9	691264	691272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_015666	TGC	2	6	691273	691278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_015666	CGG	2	6	691285	691290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_015666	CGGT	2	8	691364	691371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19059	NC_015666	CACT	2	8	691397	691404	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19060	NC_015666	TCC	2	6	691410	691415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19061	NC_015666	AGTCTC	2	12	691438	691449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252789
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19083	NC_015666	GAG	2	6	692239	692244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252789
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19091	NC_015666	TCG	2	6	692555	692560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252789
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19098	NC_015666	CG	3	6	692724	692729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19099	NC_015666	GACT	2	8	692749	692756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19102	NC_015666	CCG	2	6	692895	692900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252790
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19107	NC_015666	CGAG	2	8	693045	693052	25 %	0 %	50 %	25 %	336252790
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19113	NC_015666	GAC	2	6	693244	693249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19240	NC_015666	GCG	2	6	698053	698058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252794
19241	NC_015666	GGA	2	6	698098	698103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252794
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19243	NC_015666	CGA	2	6	698215	698220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252794
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19355	NC_015666	CGGT	2	8	701915	701922	0 %	25 %	50 %	25 %	336252795
19356	NC_015666	CGA	2	6	701975	701980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252795
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19358	NC_015666	ACCGGG	2	12	702061	702072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252795
19359	NC_015666	GGC	3	9	702086	702094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19360	NC_015666	GCC	2	6	702161	702166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19361	NC_015666	CCG	2	6	702230	702235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19362	NC_015666	GCC	2	6	702239	702244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252796
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