MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015666	CGTC	2	8	654970	654977	0 %	25 %	25 %	50 %	336252745
18002	NC_015666	CGAGG	2	10	655016	655025	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18003	NC_015666	CGTC	2	8	655056	655063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18004	NC_015666	GTG	2	6	655065	655070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_015666	TCG	2	6	655097	655102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18006	NC_015666	CGG	3	9	655107	655115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252746
18007	NC_015666	GGC	2	6	655161	655166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252746
18008	NC_015666	GAG	2	6	655381	655386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252746
18009	NC_015666	TCG	2	6	655424	655429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18010	NC_015666	ACCG	2	8	655452	655459	25 %	0 %	25 %	50 %	336252746
18011	NC_015666	GCG	2	6	655466	655471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252746
18012	NC_015666	GCGAT	2	10	655490	655499	20 %	20 %	40 %	20 %	336252746
18013	NC_015666	CCG	2	6	655531	655536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252746
18014	NC_015666	CGA	2	6	655572	655577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18015	NC_015666	CGA	2	6	655590	655595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18016	NC_015666	CGA	2	6	655602	655607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18017	NC_015666	TCG	2	6	655616	655621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18018	NC_015666	CTT	2	6	655653	655658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252746
18019	NC_015666	GAT	2	6	655683	655688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252746
18020	NC_015666	GAC	3	9	655720	655728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18021	NC_015666	GTC	2	6	655738	655743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18022	NC_015666	CTCG	2	8	655749	655756	0 %	25 %	25 %	50 %	336252746
18023	NC_015666	ACT	2	6	655760	655765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252746
18024	NC_015666	GGC	2	6	655788	655793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252746
18025	NC_015666	CGA	3	9	655848	655856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18026	NC_015666	CGA	2	6	655881	655886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18027	NC_015666	CTC	3	9	655888	655896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252746
18028	NC_015666	CGCTCG	2	12	655925	655936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252746
18029	NC_015666	CGA	2	6	655956	655961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18030	NC_015666	CG	3	6	655983	655988	0 %	0 %	50 %	50 %	336252746
18031	NC_015666	GCC	2	6	655999	656004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252746
18032	NC_015666	TCG	2	6	656030	656035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18033	NC_015666	AGC	2	6	656039	656044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18034	NC_015666	ACG	2	6	656099	656104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18035	NC_015666	CGA	2	6	656219	656224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18036	NC_015666	CGC	2	6	656238	656243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252746
18037	NC_015666	CGA	2	6	656268	656273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18038	NC_015666	CGT	2	6	656325	656330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18039	NC_015666	AGG	2	6	656357	656362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252746
18040	NC_015666	TCG	3	9	656363	656371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18041	NC_015666	GCG	2	6	656381	656386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252746
18042	NC_015666	CGA	2	6	656397	656402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18043	NC_015666	CGA	2	6	656460	656465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18044	NC_015666	CTC	2	6	656469	656474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252746
18045	NC_015666	TCG	2	6	656485	656490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252746
18046	NC_015666	CGA	2	6	656554	656559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_015666	GCA	2	6	656560	656565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_015666	GATC	2	8	656601	656608	25 %	25 %	25 %	25 %	336252747
18049	NC_015666	TCGA	2	8	656624	656631	25 %	25 %	25 %	25 %	336252747
18050	NC_015666	TCC	2	6	656648	656653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252747
18051	NC_015666	GCA	2	6	656672	656677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18052	NC_015666	GGT	2	6	656694	656699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252747
18053	NC_015666	AGC	2	6	656744	656749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18054	NC_015666	GCGTC	2	10	656772	656781	0 %	20 %	40 %	40 %	336252747
18055	NC_015666	GCG	2	6	656838	656843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252747
18056	NC_015666	CGA	2	6	656850	656855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18057	NC_015666	AGT	2	6	656859	656864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252747
18058	NC_015666	TGCGCG	2	12	656873	656884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252747
18059	NC_015666	AGC	2	6	656903	656908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18060	NC_015666	GCG	2	6	656937	656942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252747
18061	NC_015666	TCG	2	6	656963	656968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18062	NC_015666	TCG	2	6	657029	657034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18063	NC_015666	TAG	2	6	657035	657040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252747
18064	NC_015666	CAG	2	6	657088	657093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18065	NC_015666	CGGG	2	8	657159	657166	0 %	0 %	75 %	25 %	336252747
18066	NC_015666	CGT	2	6	657168	657173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18067	NC_015666	TCG	2	6	657186	657191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18068	NC_015666	GTC	2	6	657202	657207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18069	NC_015666	CTC	2	6	657247	657252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252747
18070	NC_015666	GTC	2	6	657373	657378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
18071	NC_015666	ATCGG	2	10	657386	657395	20 %	20 %	40 %	20 %	336252747
18072	NC_015666	TTC	2	6	657418	657423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_015666	CCG	2	6	657437	657442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18074	NC_015666	CG	3	6	657445	657450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18075	NC_015666	GCA	2	6	657452	657457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_015666	GCC	2	6	657496	657501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18077	NC_015666	TCC	2	6	657541	657546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_015666	GCC	2	6	657588	657593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18079	NC_015666	TA	3	6	657632	657637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_015666	CGG	2	6	657725	657730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252748
18081	NC_015666	ATG	2	6	657792	657797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252748
18082	NC_015666	TCC	3	9	657865	657873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252748
18083	NC_015666	TCG	2	6	657898	657903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18084	NC_015666	ACG	2	6	657924	657929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18085	NC_015666	TCG	2	6	657937	657942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18086	NC_015666	TCG	2	6	657997	658002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18087	NC_015666	TTC	2	6	658026	658031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252748
18088	NC_015666	CGA	2	6	658036	658041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18089	NC_015666	ATGTTC	2	12	658044	658055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336252748
18090	NC_015666	TCA	2	6	658087	658092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252748
18091	NC_015666	TCGCCG	2	12	658123	658134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252748
18092	NC_015666	GCCG	2	8	658143	658150	0 %	0 %	50 %	50 %	336252748
18093	NC_015666	GCT	2	6	658202	658207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
18094	NC_015666	TTCCG	2	10	658268	658277	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18095	NC_015666	GAC	2	6	658293	658298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_015666	GAC	2	6	658312	658317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18097	NC_015666	CGTTC	2	10	658342	658351	0 %	40 %	20 %	40 %	336252749
18098	NC_015666	TC	3	6	658376	658381	0 %	50 %	0 %	50 %	336252749
18099	NC_015666	CGA	2	6	658386	658391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18100	NC_015666	CGTTCC	2	12	658417	658428	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252749
18101	NC_015666	TCG	2	6	658474	658479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18102	NC_015666	GGT	2	6	658523	658528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252749
18103	NC_015666	CCGG	2	8	658535	658542	0 %	0 %	50 %	50 %	336252749
18104	NC_015666	CGA	3	9	658556	658564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18105	NC_015666	CTT	2	6	658590	658595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252749
18106	NC_015666	CGT	2	6	658599	658604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18107	NC_015666	TCG	2	6	658624	658629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18108	NC_015666	CTC	2	6	658653	658658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252749
18109	NC_015666	CAA	2	6	658678	658683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252749
18110	NC_015666	CGT	3	9	658685	658693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
18111	NC_015666	GAT	2	6	658704	658709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252749
18112	NC_015666	GGTCGG	2	12	658712	658723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336252749
18113	NC_015666	CGAC	2	8	658733	658740	25 %	0 %	25 %	50 %	336252749
18114	NC_015666	CGT	2	6	658859	658864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
18115	NC_015666	GAC	2	6	658929	658934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
18116	NC_015666	CCG	2	6	658950	658955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252750
18117	NC_015666	CG	3	6	658954	658959	0 %	0 %	50 %	50 %	336252750
18118	NC_015666	AGC	2	6	659011	659016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
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18121	NC_015666	CG	3	6	659126	659131	0 %	0 %	50 %	50 %	336252750
18122	NC_015666	CGA	2	6	659135	659140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
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18231	NC_015666	CGA	2	6	662871	662876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252755
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18234	NC_015666	TGC	2	6	662987	662992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18235	NC_015666	TCG	2	6	663080	663085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252756
18236	NC_015666	CGT	2	6	663099	663104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252756
18237	NC_015666	CTC	2	6	663151	663156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252756
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18475	NC_015666	TCG	2	6	671462	671467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252767
18476	NC_015666	CGA	2	6	671499	671504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252767
18477	NC_015666	CGG	2	6	671510	671515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252767
18478	NC_015666	CG	3	6	671526	671531	0 %	0 %	50 %	50 %	336252767
18479	NC_015666	GCT	2	6	671532	671537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252767
18480	NC_015666	CGA	2	6	671687	671692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252767
18481	NC_015666	CGGTT	2	10	671693	671702	0 %	40 %	40 %	20 %	336252767
18482	NC_015666	CACC	2	8	671706	671713	25 %	0 %	0 %	75 %	336252767
18483	NC_015666	ACT	2	6	671772	671777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252767
18484	NC_015666	AGC	2	6	671819	671824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252768
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18490	NC_015666	CGAC	2	8	671977	671984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18491	NC_015666	ACG	2	6	671997	672002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18492	NC_015666	CCG	2	6	672089	672094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18493	NC_015666	CG	3	6	672093	672098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18494	NC_015666	ATCG	2	8	672167	672174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18495	NC_015666	CCG	2	6	672195	672200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18496	NC_015666	CCCCGA	2	12	672246	672257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18497	NC_015666	CG	3	6	672266	672271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18498	NC_015666	CCG	2	6	672323	672328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18499	NC_015666	CGTCC	2	10	672383	672392	0 %	20 %	20 %	60 %	336252769
18500	NC_015666	CG	3	6	672466	672471	0 %	0 %	50 %	50 %	336252769

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