MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015666	ATT	2	6	635278	635283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17502	NC_015666	TCG	2	6	635295	635300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_015666	TAC	3	9	635318	635326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17504	NC_015666	ATG	2	6	635409	635414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252722
17505	NC_015666	AGT	2	6	635443	635448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252722
17506	NC_015666	CGAG	2	8	635486	635493	25 %	0 %	50 %	25 %	336252722
17507	NC_015666	GCG	2	6	635533	635538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17508	NC_015666	CAG	2	6	635666	635671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252723
17509	NC_015666	GAA	2	6	635675	635680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252723
17510	NC_015666	TCG	2	6	635725	635730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252723
17511	NC_015666	TCT	2	6	635845	635850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252723
17512	NC_015666	GAT	2	6	635852	635857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252723
17513	NC_015666	CAT	2	6	635858	635863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252723
17514	NC_015666	GC	3	6	635889	635894	0 %	0 %	50 %	50 %	336252723
17515	NC_015666	CTG	2	6	636015	636020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252723
17516	NC_015666	TCA	2	6	636022	636027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252723
17517	NC_015666	CTA	2	6	636044	636049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252723
17518	NC_015666	TAC	2	6	636060	636065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252723
17519	NC_015666	TCG	2	6	636131	636136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17520	NC_015666	GTTGCG	2	12	636175	636186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336252724
17521	NC_015666	GAC	2	6	636234	636239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17522	NC_015666	AAC	2	6	636292	636297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252724
17523	NC_015666	CGA	2	6	636408	636413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17524	NC_015666	GAC	2	6	636459	636464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17525	NC_015666	AGC	2	6	636475	636480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17526	NC_015666	GAC	2	6	636481	636486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17527	NC_015666	TCG	2	6	636523	636528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17528	NC_015666	CGA	2	6	636543	636548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17529	NC_015666	CGCTGA	2	12	636560	636571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17530	NC_015666	GTC	2	6	636583	636588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17531	NC_015666	CGA	2	6	636608	636613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17532	NC_015666	ACGA	2	8	636625	636632	50 %	0 %	25 %	25 %	336252724
17533	NC_015666	CCG	2	6	636638	636643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252724
17534	NC_015666	ACT	2	6	636659	636664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252724
17535	NC_015666	CGA	2	6	636741	636746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252724
17536	NC_015666	CGG	3	9	636756	636764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252724
17537	NC_015666	TTC	2	6	636766	636771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252724
17538	NC_015666	GGC	2	6	636846	636851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252724
17539	NC_015666	GGT	2	6	636865	636870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252724
17540	NC_015666	GAC	2	6	636897	636902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17541	NC_015666	G	6	6	636926	636931	0 %	0 %	100 %	0 %	336252725
17542	NC_015666	GCG	2	6	636965	636970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
17543	NC_015666	CGGCGA	2	12	636982	636993	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252725
17544	NC_015666	GCG	2	6	637008	637013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
17545	NC_015666	TC	3	6	637036	637041	0 %	50 %	0 %	50 %	336252725
17546	NC_015666	CCGC	2	8	637065	637072	0 %	0 %	25 %	75 %	336252725
17547	NC_015666	ACCG	2	8	637088	637095	25 %	0 %	25 %	50 %	336252725
17548	NC_015666	CGAAT	2	10	637214	637223	40 %	20 %	20 %	20 %	336252725
17549	NC_015666	ATC	2	6	637254	637259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252725
17550	NC_015666	ACG	2	6	637321	637326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17551	NC_015666	GCT	2	6	637353	637358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17552	NC_015666	GCG	2	6	637365	637370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
17553	NC_015666	CAC	2	6	637382	637387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252725
17554	NC_015666	GAA	2	6	637394	637399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252725
17555	NC_015666	CCT	2	6	637400	637405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252725
17556	NC_015666	TCA	2	6	637444	637449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252725
17557	NC_015666	GATACT	2	12	637509	637520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336252725
17558	NC_015666	CGGA	2	8	637533	637540	25 %	0 %	50 %	25 %	336252725
17559	NC_015666	CCG	2	6	637555	637560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252725
17560	NC_015666	TGT	2	6	637682	637687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252725
17561	NC_015666	CCG	2	6	637698	637703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252725
17562	NC_015666	ACG	2	6	637762	637767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17563	NC_015666	CGC	2	6	637873	637878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252725
17564	NC_015666	ATCGAG	2	12	637977	637988	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252725
17565	NC_015666	GCG	2	6	638089	638094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
17566	NC_015666	ACG	2	6	638110	638115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17567	NC_015666	TGC	2	6	638117	638122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17568	NC_015666	GA	3	6	638230	638235	50 %	0 %	50 %	0 %	336252725
17569	NC_015666	CGA	2	6	638252	638257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17570	NC_015666	ACGA	2	8	638271	638278	50 %	0 %	25 %	25 %	336252725
17571	NC_015666	AT	3	6	638305	638310	50 %	50 %	0 %	0 %	336252725
17572	NC_015666	CGAC	2	8	638365	638372	25 %	0 %	25 %	50 %	336252725
17573	NC_015666	ACG	2	6	638485	638490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
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17575	NC_015666	GAA	2	6	638559	638564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252725
17576	NC_015666	ACG	2	6	638572	638577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252725
17577	NC_015666	GGC	2	6	638601	638606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
17578	NC_015666	GCG	2	6	638620	638625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252725
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17580	NC_015666	CAAC	2	8	638683	638690	50 %	0 %	0 %	50 %	336252725
17581	NC_015666	CGTT	2	8	638698	638705	0 %	50 %	25 %	25 %	336252725
17582	NC_015666	GTA	2	6	638747	638752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252726
17583	NC_015666	CT	4	8	638756	638763	0 %	50 %	0 %	50 %	336252726
17584	NC_015666	CGC	2	6	638785	638790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252726
17585	NC_015666	ACTG	2	8	638870	638877	25 %	25 %	25 %	25 %	336252726
17586	NC_015666	CCGG	2	8	638884	638891	0 %	0 %	50 %	50 %	336252726
17587	NC_015666	CGG	2	6	638950	638955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252726
17588	NC_015666	GTTC	2	8	638973	638980	0 %	50 %	25 %	25 %	336252726
17589	NC_015666	GAG	2	6	639002	639007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252726
17590	NC_015666	ACCG	2	8	639035	639042	25 %	0 %	25 %	50 %	336252726
17591	NC_015666	GTCGCG	2	12	639056	639067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252726
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17594	NC_015666	TCGG	2	8	639107	639114	0 %	25 %	50 %	25 %	336252726
17595	NC_015666	CGG	2	6	639145	639150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252726
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17600	NC_015666	CGG	2	6	639327	639332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252727
17601	NC_015666	ATCG	2	8	639342	639349	25 %	25 %	25 %	25 %	336252727
17602	NC_015666	GCT	2	6	639441	639446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252727
17603	NC_015666	TCA	2	6	639455	639460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252727
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17605	NC_015666	GA	3	6	639530	639535	50 %	0 %	50 %	0 %	336252727
17606	NC_015666	TAC	2	6	639538	639543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252727
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17608	NC_015666	TCGT	2	8	639662	639669	0 %	50 %	25 %	25 %	336252727
17609	NC_015666	GCT	2	6	639671	639676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252727
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17616	NC_015666	TCG	2	6	639953	639958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252727
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17618	NC_015666	GAC	2	6	639987	639992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252727
17619	NC_015666	CGA	2	6	640058	640063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252728
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17657	NC_015666	GGC	2	6	641337	641342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17662	NC_015666	GC	3	6	641397	641402	0 %	0 %	50 %	50 %	336252729
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17860	NC_015666	TCGACG	2	12	650120	650131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252740
17861	NC_015666	TCG	2	6	650141	650146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252740
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17863	NC_015666	GCGA	2	8	650340	650347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17864	NC_015666	ATGA	2	8	650366	650373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17865	NC_015666	GA	3	6	650372	650377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17866	NC_015666	GCG	2	6	650404	650409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17867	NC_015666	GCC	2	6	650430	650435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252741
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17979	NC_015666	GCT	2	6	654405	654410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252745
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17982	NC_015666	CCG	2	6	654500	654505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252745
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