MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015666	GCG	2	6	616592	616597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252702
17002	NC_015666	CAC	2	6	616618	616623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252702
17003	NC_015666	ACGA	2	8	616646	616653	50 %	0 %	25 %	25 %	336252702
17004	NC_015666	GCG	2	6	616667	616672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252702
17005	NC_015666	GTC	3	9	616768	616776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17006	NC_015666	TCG	2	6	616787	616792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17007	NC_015666	TCG	2	6	616810	616815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17008	NC_015666	GTC	2	6	616828	616833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17009	NC_015666	TCG	2	6	616856	616861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17010	NC_015666	GCGT	2	8	616875	616882	0 %	25 %	50 %	25 %	336252703
17011	NC_015666	CGT	2	6	616891	616896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17012	NC_015666	TCG	3	9	616910	616918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17013	NC_015666	TCG	2	6	616937	616942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17014	NC_015666	TGG	2	6	616949	616954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252703
17015	NC_015666	GTC	2	6	617020	617025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
17016	NC_015666	TC	3	6	617034	617039	0 %	50 %	0 %	50 %	336252703
17017	NC_015666	GGC	2	6	617119	617124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_015666	CCG	2	6	617133	617138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17019	NC_015666	TTC	2	6	617217	617222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_015666	CCG	2	6	617230	617235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17021	NC_015666	CCGG	2	8	617266	617273	0 %	0 %	50 %	50 %	336252704
17022	NC_015666	TCGC	2	8	617335	617342	0 %	25 %	25 %	50 %	336252704
17023	NC_015666	CGT	2	6	617408	617413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252704
17024	NC_015666	GAG	2	6	617421	617426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252704
17025	NC_015666	CAG	2	6	617444	617449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17026	NC_015666	CAG	2	6	617456	617461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17027	NC_015666	GCA	2	6	617527	617532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17028	NC_015666	CGA	2	6	617548	617553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17029	NC_015666	GCG	3	9	617610	617618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252705
17030	NC_015666	CG	3	6	617627	617632	0 %	0 %	50 %	50 %	336252705
17031	NC_015666	TCG	2	6	617658	617663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17032	NC_015666	CGC	2	6	617680	617685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252705
17033	NC_015666	GAC	2	6	617699	617704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17034	NC_015666	AAG	2	6	617726	617731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252705
17035	NC_015666	CGA	2	6	617740	617745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17036	NC_015666	CGA	2	6	617752	617757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17037	NC_015666	GAG	2	6	617765	617770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252705
17038	NC_015666	CGAGAG	2	12	617782	617793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336252705
17039	NC_015666	AGC	2	6	617796	617801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17040	NC_015666	AGC	2	6	617805	617810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17041	NC_015666	CAG	2	6	617816	617821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17042	NC_015666	CAG	3	9	617825	617833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17043	NC_015666	CAG	2	6	617843	617848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17044	NC_015666	GCA	2	6	617851	617856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17045	NC_015666	GGGCCA	2	12	617860	617871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252705
17046	NC_015666	CGA	3	9	617878	617886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252705
17047	NC_015666	CAC	2	6	617897	617902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17048	NC_015666	GCC	2	6	617966	617971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17049	NC_015666	GAG	2	6	617972	617977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252706
17050	NC_015666	GAG	2	6	617984	617989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252706
17051	NC_015666	CGAGGA	2	12	617992	618003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336252706
17052	NC_015666	CGA	2	6	618019	618024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17053	NC_015666	GGC	2	6	618025	618030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252706
17054	NC_015666	AGCCG	2	10	618076	618085	20 %	0 %	40 %	40 %	336252706
17055	NC_015666	CGA	2	6	618109	618114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17056	NC_015666	CGAGGC	2	12	618154	618165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252706
17057	NC_015666	GGC	3	9	618187	618195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252706
17058	NC_015666	GCG	2	6	618215	618220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252706
17059	NC_015666	CGAACC	2	12	618223	618234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336252706
17060	NC_015666	CCG	2	6	618240	618245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17061	NC_015666	GAACCT	2	12	618269	618280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252706
17062	NC_015666	GAACCC	2	12	618281	618292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336252706
17063	NC_015666	TCCGGT	3	18	618308	618325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17064	NC_015666	GAC	2	6	618356	618361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17065	NC_015666	GAG	2	6	618368	618373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252706
17066	NC_015666	CCG	2	6	618375	618380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17067	NC_015666	CGG	2	6	618384	618389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252706
17068	NC_015666	CGC	2	6	618391	618396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17069	NC_015666	GAC	2	6	618455	618460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17070	NC_015666	ACCGAC	2	12	618464	618475	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336252706
17071	NC_015666	GAG	3	9	618551	618559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252706
17072	NC_015666	CGT	2	6	618622	618627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17073	NC_015666	CGA	2	6	618628	618633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17074	NC_015666	CGA	2	6	618652	618657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17075	NC_015666	GAG	2	6	618707	618712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252706
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17077	NC_015666	CGT	2	6	618793	618798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252706
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17085	NC_015666	GCC	2	6	619068	619073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17086	NC_015666	CGA	2	6	619081	619086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
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17088	NC_015666	TCG	2	6	619146	619151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252706
17089	NC_015666	GCC	2	6	619205	619210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252706
17090	NC_015666	GCCGAC	2	12	619238	619249	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252706
17091	NC_015666	CGG	2	6	619255	619260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252706
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17093	NC_015666	CGA	2	6	619351	619356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252706
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17096	NC_015666	TCG	2	6	619470	619475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17097	NC_015666	GCG	2	6	619494	619499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_015666	CGA	2	6	619514	619519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_015666	CGG	2	6	619666	619671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_015666	TC	3	6	619823	619828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17101	NC_015666	GAA	2	6	619888	619893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252707
17102	NC_015666	CAAG	2	8	619896	619903	50 %	0 %	25 %	25 %	336252707
17103	NC_015666	CGA	2	6	619962	619967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252707
17104	NC_015666	CGG	3	9	619986	619994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252707
17105	NC_015666	GAC	2	6	620041	620046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252707
17106	NC_015666	GGC	2	6	620074	620079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252707
17107	NC_015666	GAG	2	6	620143	620148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252707
17108	NC_015666	CGG	2	6	620151	620156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252707
17109	NC_015666	ACG	2	6	620267	620272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252707
17110	NC_015666	GAC	2	6	620283	620288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252707
17111	NC_015666	CGC	2	6	620334	620339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252707
17112	NC_015666	CGA	2	6	620346	620351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252707
17113	NC_015666	ACT	2	6	620396	620401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252707
17114	NC_015666	GATCAC	2	12	620445	620456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252707
17115	NC_015666	A	6	6	620515	620520	100 %	0 %	0 %	0 %	336252707
17116	NC_015666	TAC	3	9	620536	620544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252707
17117	NC_015666	CGG	3	9	620562	620570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252707
17118	NC_015666	GGA	2	6	620622	620627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252707
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17123	NC_015666	GCG	2	6	620894	620899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252707
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17228	NC_015666	CA	3	6	624300	624305	50 %	0 %	0 %	50 %	336252709
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17231	NC_015666	CGC	3	9	624512	624520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252710
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17237	NC_015666	TCG	3	9	624706	624714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252710
17238	NC_015666	TCG	2	6	624733	624738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252710
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17246	NC_015666	GACGG	2	10	625021	625030	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17247	NC_015666	GAG	2	6	625072	625077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17250	NC_015666	GC	3	6	625100	625105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17251	NC_015666	ATCGCG	2	12	625139	625150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252711
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17335	NC_015666	CTA	2	6	627919	627924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17338	NC_015666	CCCG	2	8	628062	628069	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17339	NC_015666	GTC	2	6	628151	628156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252715
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17346	NC_015666	TCG	2	6	628428	628433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252715
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17353	NC_015666	GCG	2	6	628734	628739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252715
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17475	NC_015666	CGAT	2	8	634160	634167	25 %	25 %	25 %	25 %	336252720
17476	NC_015666	ATC	2	6	634218	634223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252720
17477	NC_015666	AGCC	2	8	634237	634244	25 %	0 %	25 %	50 %	336252720
17478	NC_015666	CAC	2	6	634286	634291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252720
17479	NC_015666	TCG	2	6	634294	634299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252720
17480	NC_015666	CGT	2	6	634361	634366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252720
17481	NC_015666	CG	3	6	634386	634391	0 %	0 %	50 %	50 %	336252720
17482	NC_015666	CGA	2	6	634403	634408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252720
17483	NC_015666	CGT	2	6	634436	634441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252720
17484	NC_015666	GC	3	6	634446	634451	0 %	0 %	50 %	50 %	336252720
17485	NC_015666	ATCA	2	8	634502	634509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17486	NC_015666	TA	4	8	634664	634671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17487	NC_015666	AAGG	2	8	634714	634721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17488	NC_015666	GT	3	6	634735	634740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17489	NC_015666	C	6	6	634747	634752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17490	NC_015666	GGT	2	6	634761	634766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17491	NC_015666	TCGGA	2	10	634849	634858	20 %	20 %	40 %	20 %	336252721
17492	NC_015666	AAC	2	6	634861	634866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252721
17493	NC_015666	AAC	2	6	635007	635012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252721
17494	NC_015666	GA	3	6	635017	635022	50 %	0 %	50 %	0 %	336252721
17495	NC_015666	AGG	2	6	635041	635046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252721
17496	NC_015666	GAG	2	6	635055	635060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252721
17497	NC_015666	GTT	2	6	635064	635069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252721
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17499	NC_015666	GTGAA	2	10	635191	635200	40 %	20 %	40 %	0 %	336252721
17500	NC_015666	TCG	2	6	635203	635208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252721

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