MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_015666	CGC	2	6	598614	598619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252678
16502	NC_015666	CCG	2	6	598696	598701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252678
16503	NC_015666	CCA	2	6	598707	598712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252678
16504	NC_015666	CGC	2	6	598727	598732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252678
16505	NC_015666	TCTCCG	2	12	598745	598756	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252678
16506	NC_015666	CCGG	2	8	598760	598767	0 %	0 %	50 %	50 %	336252678
16507	NC_015666	GAA	2	6	598770	598775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252678
16508	NC_015666	CCG	2	6	598827	598832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252678
16509	NC_015666	GAAC	2	8	598847	598854	50 %	0 %	25 %	25 %	336252678
16510	NC_015666	CG	3	6	598933	598938	0 %	0 %	50 %	50 %	336252678
16511	NC_015666	GCC	2	6	598945	598950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252678
16512	NC_015666	CGT	2	6	598952	598957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252678
16513	NC_015666	GCG	2	6	598994	598999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_015666	TTC	2	6	599009	599014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_015666	CGG	3	9	599039	599047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_015666	AGT	2	6	599052	599057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252679
16517	NC_015666	CGG	2	6	599058	599063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252679
16518	NC_015666	CGA	2	6	599107	599112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16519	NC_015666	GAC	2	6	599116	599121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16520	NC_015666	CGA	2	6	599160	599165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16521	NC_015666	GCC	2	6	599215	599220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252679
16522	NC_015666	GTC	2	6	599222	599227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16523	NC_015666	CGA	2	6	599265	599270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16524	NC_015666	TCG	2	6	599330	599335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16525	NC_015666	TCG	2	6	599360	599365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16526	NC_015666	CGC	2	6	599379	599384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252679
16527	NC_015666	CGG	3	9	599413	599421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252679
16528	NC_015666	CGCGA	2	10	599446	599455	20 %	0 %	40 %	40 %	336252679
16529	NC_015666	CGGC	2	8	599507	599514	0 %	0 %	50 %	50 %	336252679
16530	NC_015666	CGA	2	6	599523	599528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252679
16531	NC_015666	GC	3	6	599606	599611	0 %	0 %	50 %	50 %	336252679
16532	NC_015666	AGCG	2	8	599612	599619	25 %	0 %	50 %	25 %	336252679
16533	NC_015666	GGT	2	6	599628	599633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252679
16534	NC_015666	TGT	2	6	599671	599676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252679
16535	NC_015666	GA	3	6	599827	599832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16536	NC_015666	CG	3	6	599893	599898	0 %	0 %	50 %	50 %	336252680
16537	NC_015666	CGG	2	6	599945	599950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252680
16538	NC_015666	CCG	2	6	599952	599957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252680
16539	NC_015666	GAA	2	6	599998	600003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252680
16540	NC_015666	AGC	2	6	600018	600023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252680
16541	NC_015666	GAGTC	2	10	600062	600071	20 %	20 %	40 %	20 %	336252680
16542	NC_015666	GA	3	6	600125	600130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_015666	CGAGT	2	10	600171	600180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16544	NC_015666	CGC	2	6	600214	600219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16545	NC_015666	CTG	2	6	600239	600244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16546	NC_015666	CGC	2	6	600256	600261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252681
16547	NC_015666	GC	3	6	600271	600276	0 %	0 %	50 %	50 %	336252681
16548	NC_015666	CGA	2	6	600307	600312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16549	NC_015666	CGA	2	6	600430	600435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16550	NC_015666	GTC	2	6	600437	600442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16551	NC_015666	GGCC	2	8	600454	600461	0 %	0 %	50 %	50 %	336252681
16552	NC_015666	AGG	2	6	600462	600467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252681
16553	NC_015666	GGA	2	6	600493	600498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252681
16554	NC_015666	GAC	3	9	600530	600538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16555	NC_015666	CGC	2	6	600568	600573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252681
16556	NC_015666	GCT	2	6	600607	600612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252681
16557	NC_015666	GGC	2	6	600613	600618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252681
16558	NC_015666	CCG	2	6	600673	600678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252681
16559	NC_015666	CTA	2	6	600685	600690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252681
16560	NC_015666	AGCG	2	8	600812	600819	25 %	0 %	50 %	25 %	336252681
16561	NC_015666	CCAC	2	8	600862	600869	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16562	NC_015666	CAT	2	6	600934	600939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_015666	GAC	2	6	601019	601024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_015666	C	6	6	601034	601039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16565	NC_015666	TCG	2	6	601046	601051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_015666	CAG	2	6	601093	601098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16567	NC_015666	CGG	2	6	601136	601141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252682
16568	NC_015666	GAG	2	6	601176	601181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252682
16569	NC_015666	GGTC	2	8	601186	601193	0 %	25 %	50 %	25 %	336252682
16570	NC_015666	CGC	2	6	601199	601204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252682
16571	NC_015666	GCC	2	6	601214	601219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252682
16572	NC_015666	CCGG	2	8	601288	601295	0 %	0 %	50 %	50 %	336252682
16573	NC_015666	CGG	3	9	601293	601301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252682
16574	NC_015666	CGAC	2	8	601324	601331	25 %	0 %	25 %	50 %	336252682
16575	NC_015666	CG	3	6	601389	601394	0 %	0 %	50 %	50 %	336252682
16576	NC_015666	CG	3	6	601401	601406	0 %	0 %	50 %	50 %	336252682
16577	NC_015666	CGCGCT	2	12	601454	601465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252682
16578	NC_015666	GGCG	2	8	601472	601479	0 %	0 %	75 %	25 %	336252682
16579	NC_015666	AC	3	6	601496	601501	50 %	0 %	0 %	50 %	336252682
16580	NC_015666	GTC	2	6	601569	601574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16581	NC_015666	CGA	2	6	601592	601597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16582	NC_015666	CG	3	6	601615	601620	0 %	0 %	50 %	50 %	336252682
16583	NC_015666	GAG	2	6	601674	601679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252682
16584	NC_015666	GAC	2	6	601685	601690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16585	NC_015666	CGG	2	6	601729	601734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252682
16586	NC_015666	CGA	2	6	601751	601756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16587	NC_015666	GCT	2	6	601766	601771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16588	NC_015666	CGT	2	6	601831	601836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16589	NC_015666	TGC	2	6	601846	601851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16590	NC_015666	GAC	2	6	601862	601867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16591	NC_015666	TCG	2	6	601870	601875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16592	NC_015666	GCC	2	6	601918	601923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252682
16593	NC_015666	GGCT	2	8	601935	601942	0 %	25 %	50 %	25 %	336252682
16594	NC_015666	GAA	2	6	601949	601954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252682
16595	NC_015666	GGT	2	6	601991	601996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252682
16596	NC_015666	CGA	2	6	602021	602026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16597	NC_015666	CG	3	6	602082	602087	0 %	0 %	50 %	50 %	336252682
16598	NC_015666	CGA	4	12	602144	602155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252682
16599	NC_015666	CGAT	2	8	602217	602224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16600	NC_015666	CGATCG	2	12	602275	602286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16601	NC_015666	CTG	2	6	602302	602307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16602	NC_015666	GCC	2	6	602327	602332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16603	NC_015666	CACTTT	2	12	602339	602350	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16604	NC_015666	G	6	6	602376	602381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_015666	TCGCC	2	10	602498	602507	0 %	20 %	20 %	60 %	336252683
16606	NC_015666	CCG	2	6	602546	602551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252683
16607	NC_015666	CGC	2	6	602565	602570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252683
16608	NC_015666	CGC	2	6	602577	602582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252683
16609	NC_015666	CGG	2	6	602589	602594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252683
16610	NC_015666	CGA	2	6	602658	602663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16611	NC_015666	CGA	2	6	602667	602672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16612	NC_015666	CGG	3	9	602679	602687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252683
16613	NC_015666	CACC	2	8	602748	602755	25 %	0 %	0 %	75 %	336252683
16614	NC_015666	AGG	2	6	602783	602788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252683
16615	NC_015666	CGG	2	6	602790	602795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252683
16616	NC_015666	CGA	2	6	602853	602858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16617	NC_015666	GAC	2	6	602878	602883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16618	NC_015666	GAG	2	6	602935	602940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252683
16619	NC_015666	CGA	2	6	602946	602951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16620	NC_015666	TCG	2	6	602954	602959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252683
16621	NC_015666	ACC	2	6	603005	603010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252683
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16980	NC_015666	GAC	2	6	615738	615743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252701
16981	NC_015666	CGG	2	6	615747	615752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252701
16982	NC_015666	TTC	2	6	615753	615758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252701
16983	NC_015666	CGAGCG	2	12	615825	615836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252701
16984	NC_015666	GAG	2	6	615841	615846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252701
16985	NC_015666	CGGC	2	8	615890	615897	0 %	0 %	50 %	50 %	336252701
16986	NC_015666	CGT	2	6	615900	615905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252701
16987	NC_015666	ATC	2	6	615964	615969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252701
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16989	NC_015666	CGAC	2	8	616076	616083	25 %	0 %	25 %	50 %	336252701
16990	NC_015666	GAG	2	6	616102	616107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252701
16991	NC_015666	GC	3	6	616148	616153	0 %	0 %	50 %	50 %	336252701
16992	NC_015666	CGT	2	6	616194	616199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252701
16993	NC_015666	GACT	2	8	616258	616265	25 %	25 %	25 %	25 %	336252701
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16998	NC_015666	TCG	2	6	616539	616544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252702
16999	NC_015666	GCT	2	6	616564	616569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252702
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