MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015666	CAT	2	6	581953	581958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252664
16002	NC_015666	GGA	2	6	581997	582002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252664
16003	NC_015666	CCG	2	6	582011	582016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
16004	NC_015666	CCG	2	6	582075	582080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
16005	NC_015666	GTA	2	6	582112	582117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252664
16006	NC_015666	AGCGCG	2	12	582128	582139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252664
16007	NC_015666	AGAC	2	8	582140	582147	50 %	0 %	25 %	25 %	336252664
16008	NC_015666	CGT	3	9	582201	582209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
16009	NC_015666	CAC	3	9	582240	582248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252664
16010	NC_015666	CCG	2	6	582251	582256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
16011	NC_015666	GTTC	2	8	582279	582286	0 %	50 %	25 %	25 %	336252664
16012	NC_015666	TCGG	2	8	582341	582348	0 %	25 %	50 %	25 %	336252664
16013	NC_015666	CGT	2	6	582349	582354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
16014	NC_015666	AGC	2	6	582379	582384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
16015	NC_015666	GGCC	2	8	582385	582392	0 %	0 %	50 %	50 %	336252664
16016	NC_015666	CG	3	6	582397	582402	0 %	0 %	50 %	50 %	336252664
16017	NC_015666	CGT	2	6	582408	582413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
16018	NC_015666	GTC	2	6	582435	582440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_015666	TCT	2	6	582456	582461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_015666	GCG	2	6	582465	582470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_015666	CGT	2	6	582480	582485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_015666	CGGG	2	8	582549	582556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_015666	CGCT	2	8	582558	582565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16024	NC_015666	ACGT	2	8	582573	582580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16025	NC_015666	CCAGCC	2	12	582656	582667	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_015666	TATT	2	8	582770	582777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_015666	CGA	2	6	582778	582783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_015666	CGA	2	6	582830	582835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16029	NC_015666	CGG	2	6	582845	582850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252665
16030	NC_015666	CCG	2	6	582885	582890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252665
16031	NC_015666	GC	3	6	582913	582918	0 %	0 %	50 %	50 %	336252665
16032	NC_015666	TCG	2	6	582991	582996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16033	NC_015666	GTC	2	6	583004	583009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16034	NC_015666	CGAG	2	8	583072	583079	25 %	0 %	50 %	25 %	336252665
16035	NC_015666	TTC	2	6	583089	583094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252665
16036	NC_015666	TCG	2	6	583098	583103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16037	NC_015666	CGG	2	6	583109	583114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252665
16038	NC_015666	ATCGA	2	10	583167	583176	40 %	20 %	20 %	20 %	336252665
16039	NC_015666	GTC	2	6	583191	583196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16040	NC_015666	TCGAC	2	10	583198	583207	20 %	20 %	20 %	40 %	336252665
16041	NC_015666	TGC	2	6	583210	583215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16042	NC_015666	TAC	2	6	583221	583226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252665
16043	NC_015666	CGA	2	6	583232	583237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16044	NC_015666	CGACG	2	10	583280	583289	20 %	0 %	40 %	40 %	336252665
16045	NC_015666	GTC	2	6	583296	583301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252665
16046	NC_015666	GGC	2	6	583386	583391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252665
16047	NC_015666	TCA	2	6	583411	583416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252665
16048	NC_015666	CCA	2	6	583448	583453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252665
16049	NC_015666	ACCG	2	8	583464	583471	25 %	0 %	25 %	50 %	336252665
16050	NC_015666	AGA	2	6	583495	583500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252665
16051	NC_015666	CGA	2	6	583560	583565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16052	NC_015666	GCGCC	2	10	583572	583581	0 %	0 %	40 %	60 %	336252666
16053	NC_015666	ACC	2	6	583616	583621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252666
16054	NC_015666	TCG	2	6	583676	583681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16055	NC_015666	GCC	2	6	583700	583705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252666
16056	NC_015666	CGA	2	6	583734	583739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16057	NC_015666	CGA	2	6	583767	583772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16058	NC_015666	CGC	2	6	583787	583792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252666
16059	NC_015666	C	6	6	583799	583804	0 %	0 %	0 %	100 %	336252666
16060	NC_015666	CGA	2	6	583830	583835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16061	NC_015666	GAC	2	6	583900	583905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252666
16062	NC_015666	CGG	2	6	583921	583926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252666
16063	NC_015666	AG	3	6	583966	583971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_015666	CGG	2	6	583977	583982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_015666	TCG	2	6	584045	584050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_015666	CCG	2	6	584057	584062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_015666	CGGA	2	8	584069	584076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16068	NC_015666	CCG	2	6	584077	584082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_015666	CGC	2	6	584091	584096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252667
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16072	NC_015666	TCG	2	6	584122	584127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252667
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16077	NC_015666	CGA	2	6	584273	584278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252667
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16079	NC_015666	GGA	2	6	584390	584395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252667
16080	NC_015666	CGAT	2	8	584402	584409	25 %	25 %	25 %	25 %	336252667
16081	NC_015666	TCT	2	6	584429	584434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252667
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16088	NC_015666	CAG	3	9	584549	584557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252668
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16094	NC_015666	CGA	2	6	584722	584727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252668
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16097	NC_015666	CG	4	8	584855	584862	0 %	0 %	50 %	50 %	336252668
16098	NC_015666	GAA	2	6	584876	584881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252668
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16102	NC_015666	GCCG	2	8	585059	585066	0 %	0 %	50 %	50 %	336252668
16103	NC_015666	GCG	2	6	585072	585077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252668
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16105	NC_015666	GCG	3	9	585102	585110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252668
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16110	NC_015666	CGGT	2	8	585283	585290	0 %	25 %	50 %	25 %	336252668
16111	NC_015666	GTC	2	6	585329	585334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252668
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16118	NC_015666	ACG	2	6	585621	585626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16120	NC_015666	CGG	2	6	585693	585698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_015666	GAC	2	6	585717	585722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252669
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16240	NC_015666	GAG	2	6	589498	589503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252671
16241	NC_015666	ACG	2	6	589520	589525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252671
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16297	NC_015666	CGATGG	2	12	591554	591565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252674
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16345	NC_015666	GACG	2	8	593578	593585	25 %	0 %	50 %	25 %	336252675
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16350	NC_015666	AACG	2	8	593729	593736	50 %	0 %	25 %	25 %	336252675
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16353	NC_015666	CGA	2	6	593788	593793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252675
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