MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015666	GC	3	6	564716	564721	0 %	0 %	50 %	50 %	336252646
15502	NC_015666	CGTT	2	8	564722	564729	0 %	50 %	25 %	25 %	336252646
15503	NC_015666	TCG	2	6	564798	564803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252646
15504	NC_015666	CCG	2	6	564831	564836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252646
15505	NC_015666	CGT	2	6	564841	564846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252646
15506	NC_015666	CG	3	6	564898	564903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15507	NC_015666	GA	3	6	564921	564926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_015666	CG	3	6	564960	564965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_015666	GAC	2	6	564966	564971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_015666	CGGC	2	8	564980	564987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15511	NC_015666	CGT	2	6	564994	564999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_015666	TCG	2	6	565057	565062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252647
15513	NC_015666	CGT	2	6	565064	565069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252647
15514	NC_015666	CGG	2	6	565079	565084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252647
15515	NC_015666	ATC	2	6	565113	565118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252647
15516	NC_015666	GCTCGT	2	12	565133	565144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252647
15517	NC_015666	CGGACT	2	12	565145	565156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252647
15518	NC_015666	C	6	6	565320	565325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15519	NC_015666	TCCG	2	8	565334	565341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15520	NC_015666	ACT	2	6	565361	565366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252648
15521	NC_015666	CGG	2	6	565389	565394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252648
15522	NC_015666	CGC	2	6	565401	565406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252648
15523	NC_015666	CGC	2	6	565455	565460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252648
15524	NC_015666	CGA	2	6	565518	565523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252648
15525	NC_015666	GGA	2	6	565527	565532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252648
15526	NC_015666	CGG	2	6	565589	565594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252648
15527	NC_015666	CGG	2	6	565601	565606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_015666	GAAC	2	8	565626	565633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15529	NC_015666	GTT	2	6	565667	565672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252649
15530	NC_015666	TGA	2	6	565690	565695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252649
15531	NC_015666	GGC	2	6	565726	565731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15532	NC_015666	GC	3	6	565740	565745	0 %	0 %	50 %	50 %	336252649
15533	NC_015666	TCG	2	6	565755	565760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15534	NC_015666	CGT	2	6	565774	565779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15535	NC_015666	TCG	2	6	565800	565805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15536	NC_015666	CCT	2	6	565807	565812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15537	NC_015666	CGT	2	6	565822	565827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15538	NC_015666	CGG	2	6	565828	565833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15539	NC_015666	TCG	2	6	565851	565856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15540	NC_015666	TCG	2	6	565866	565871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15541	NC_015666	CCG	2	6	565887	565892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
15542	NC_015666	AGT	2	6	565926	565931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252649
15543	NC_015666	CGC	2	6	565951	565956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
15544	NC_015666	GAC	2	6	565973	565978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15545	NC_015666	TCG	2	6	566004	566009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15546	NC_015666	CGA	2	6	566041	566046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15547	NC_015666	CTT	2	6	566069	566074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252649
15548	NC_015666	TCT	2	6	566137	566142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252649
15549	NC_015666	CCT	2	6	566155	566160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15550	NC_015666	TCG	2	6	566169	566174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15551	NC_015666	GCG	2	6	566201	566206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15552	NC_015666	CCT	2	6	566236	566241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15553	NC_015666	GCG	2	6	566252	566257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15554	NC_015666	GGC	2	6	566258	566263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15555	NC_015666	GTC	2	6	566282	566287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15556	NC_015666	GTC	2	6	566294	566299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15557	NC_015666	TCG	2	6	566418	566423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15558	NC_015666	TCG	3	9	566433	566441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15559	NC_015666	TCC	2	6	566442	566447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15560	NC_015666	CTC	2	6	566474	566479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15561	NC_015666	CGA	2	6	566485	566490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15562	NC_015666	CGC	2	6	566506	566511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
15563	NC_015666	CGG	2	6	566522	566527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15564	NC_015666	GCC	2	6	566586	566591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
15565	NC_015666	TGG	2	6	566604	566609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252649
15566	NC_015666	CG	3	6	566629	566634	0 %	0 %	50 %	50 %	336252649
15567	NC_015666	TCG	2	6	566649	566654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15568	NC_015666	GGTC	2	8	566662	566669	0 %	25 %	50 %	25 %	336252649
15569	NC_015666	CAGC	2	8	566679	566686	25 %	0 %	25 %	50 %	336252649
15570	NC_015666	CGG	2	6	566700	566705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15571	NC_015666	CGA	3	9	566746	566754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15572	NC_015666	CGGC	2	8	566756	566763	0 %	0 %	50 %	50 %	336252649
15573	NC_015666	CGA	2	6	566770	566775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15574	NC_015666	CGG	2	6	566791	566796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15575	NC_015666	CGA	2	6	566845	566850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
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15578	NC_015666	CGA	2	6	566884	566889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15579	NC_015666	TCCCG	2	10	566929	566938	0 %	20 %	20 %	60 %	336252649
15580	NC_015666	GGCTT	2	10	567003	567012	0 %	40 %	40 %	20 %	336252649
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15584	NC_015666	GCG	2	6	567137	567142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
15585	NC_015666	GCC	2	6	567164	567169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
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15589	NC_015666	GCT	2	6	567286	567291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15590	NC_015666	GCT	2	6	567340	567345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15591	NC_015666	CGG	2	6	567418	567423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252649
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15598	NC_015666	CCT	2	6	567517	567522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
15599	NC_015666	CGT	2	6	567526	567531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
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15601	NC_015666	CGC	2	6	567571	567576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252649
15602	NC_015666	GAC	2	6	567596	567601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252649
15603	NC_015666	GGCG	2	8	567667	567674	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15604	NC_015666	GGT	2	6	567680	567685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_015666	TCTA	2	8	567724	567731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15606	NC_015666	GATC	2	8	567751	567758	25 %	25 %	25 %	25 %	336252650
15607	NC_015666	GAC	2	6	567815	567820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252650
15608	NC_015666	CCG	2	6	567837	567842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252650
15609	NC_015666	GCT	2	6	567969	567974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_015666	GGGA	2	8	567999	568006	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_015666	ACC	2	6	568025	568030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252651
15612	NC_015666	ACCG	2	8	568088	568095	25 %	0 %	25 %	50 %	336252651
15613	NC_015666	GAG	2	6	568115	568120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252651
15614	NC_015666	GC	3	6	568138	568143	0 %	0 %	50 %	50 %	336252651
15615	NC_015666	CTT	2	6	568162	568167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252651
15616	NC_015666	GAG	2	6	568202	568207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252651
15617	NC_015666	CGACCG	2	12	568234	568245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252651
15618	NC_015666	GTC	2	6	568250	568255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252651
15619	NC_015666	GCG	2	6	568275	568280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252651
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15858	NC_015666	GCC	2	6	576591	576596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15859	NC_015666	CGT	2	6	576616	576621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15861	NC_015666	CCG	2	6	576632	576637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15862	NC_015666	GCCG	2	8	576687	576694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15975	NC_015666	GTC	2	6	581086	581091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15976	NC_015666	CGA	2	6	581118	581123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15977	NC_015666	CGATC	2	10	581199	581208	20 %	20 %	20 %	40 %	336252664
15978	NC_015666	GC	3	6	581227	581232	0 %	0 %	50 %	50 %	336252664
15979	NC_015666	CGA	2	6	581253	581258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15980	NC_015666	GAC	2	6	581311	581316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15981	NC_015666	CGA	2	6	581322	581327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15982	NC_015666	CGATCG	2	12	581343	581354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15983	NC_015666	CCG	2	6	581373	581378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
15984	NC_015666	GCG	2	6	581390	581395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252664
15985	NC_015666	AGA	2	6	581397	581402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252664
15986	NC_015666	TGCG	2	8	581432	581439	0 %	25 %	50 %	25 %	336252664
15987	NC_015666	CTG	2	6	581449	581454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15988	NC_015666	CCT	2	6	581457	581462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252664
15989	NC_015666	GTC	2	6	581543	581548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15990	NC_015666	CCG	2	6	581549	581554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
15991	NC_015666	TCG	2	6	581561	581566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15992	NC_015666	CGA	2	6	581637	581642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15993	NC_015666	CTC	2	6	581692	581697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252664
15994	NC_015666	GTC	2	6	581701	581706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15995	NC_015666	CGG	2	6	581754	581759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252664
15996	NC_015666	TCG	2	6	581783	581788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252664
15997	NC_015666	GC	3	6	581790	581795	0 %	0 %	50 %	50 %	336252664
15998	NC_015666	CCG	2	6	581803	581808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252664
15999	NC_015666	AGA	2	6	581871	581876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252664
16000	NC_015666	CAG	2	6	581947	581952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252664

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