MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015666	GAG	2	6	532046	532051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252615
14502	NC_015666	GGC	2	6	532066	532071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252615
14503	NC_015666	CGA	2	6	532081	532086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252615
14504	NC_015666	GCC	2	6	532096	532101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252615
14505	NC_015666	CGC	2	6	532136	532141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_015666	CGCTCG	2	12	532165	532176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14507	NC_015666	GAC	2	6	532180	532185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_015666	GAC	2	6	532214	532219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14509	NC_015666	GAC	2	6	532268	532273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14510	NC_015666	CGA	2	6	532297	532302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14511	NC_015666	CGG	2	6	532321	532326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252616
14512	NC_015666	CGG	2	6	532329	532334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252616
14513	NC_015666	CGA	2	6	532342	532347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14514	NC_015666	TTC	2	6	532361	532366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252616
14515	NC_015666	CGA	2	6	532387	532392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14516	NC_015666	ACGG	2	8	532395	532402	25 %	0 %	50 %	25 %	336252616
14517	NC_015666	CGT	2	6	532417	532422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14518	NC_015666	CGG	2	6	532434	532439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252616
14519	NC_015666	CGA	2	6	532462	532467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14520	NC_015666	TGC	2	6	532521	532526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252616
14521	NC_015666	CGG	2	6	532626	532631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_015666	CGA	2	6	532669	532674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_015666	GAC	2	6	532687	532692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14524	NC_015666	GAC	2	6	532701	532706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14525	NC_015666	CTG	2	6	532720	532725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14526	NC_015666	ACG	2	6	532732	532737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14527	NC_015666	GCC	2	6	532828	532833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252617
14528	NC_015666	CGG	2	6	532851	532856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252617
14529	NC_015666	GCC	3	9	532870	532878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252617
14530	NC_015666	ACC	2	6	532892	532897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252617
14531	NC_015666	CGG	2	6	532902	532907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252617
14532	NC_015666	GAC	2	6	532920	532925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14533	NC_015666	CGC	2	6	532962	532967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252617
14534	NC_015666	GCG	2	6	532970	532975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252617
14535	NC_015666	ACC	2	6	532984	532989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252617
14536	NC_015666	CCG	2	6	532994	532999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252617
14537	NC_015666	CGAC	2	8	533012	533019	25 %	0 %	25 %	50 %	336252617
14538	NC_015666	CCCG	2	8	533028	533035	0 %	0 %	25 %	75 %	336252617
14539	NC_015666	CGA	2	6	533042	533047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14540	NC_015666	GC	3	6	533090	533095	0 %	0 %	50 %	50 %	336252617
14541	NC_015666	GTC	2	6	533110	533115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252617
14542	NC_015666	GC	3	6	533162	533167	0 %	0 %	50 %	50 %	336252617
14543	NC_015666	CG	3	6	533213	533218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14544	NC_015666	CGG	3	9	533262	533270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_015666	CGGT	2	8	533277	533284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14546	NC_015666	TCG	2	6	533365	533370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14547	NC_015666	GGTC	2	8	533375	533382	0 %	25 %	50 %	25 %	336252618
14548	NC_015666	GTC	3	9	533388	533396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14549	NC_015666	GGGC	2	8	533440	533447	0 %	0 %	75 %	25 %	336252618
14550	NC_015666	CGG	2	6	533507	533512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252618
14551	NC_015666	GCC	2	6	533598	533603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252618
14552	NC_015666	CGA	2	6	533612	533617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14553	NC_015666	CGA	2	6	533639	533644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14554	NC_015666	CG	3	6	533656	533661	0 %	0 %	50 %	50 %	336252618
14555	NC_015666	CG	3	6	533678	533683	0 %	0 %	50 %	50 %	336252618
14556	NC_015666	GAA	2	6	533700	533705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252618
14557	NC_015666	CCG	2	6	533710	533715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252618
14558	NC_015666	TGA	2	6	533774	533779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252618
14559	NC_015666	TCG	2	6	533783	533788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14560	NC_015666	GAC	2	6	533829	533834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14561	NC_015666	CGA	2	6	533837	533842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14562	NC_015666	CGT	2	6	533871	533876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14563	NC_015666	GCG	2	6	533908	533913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252618
14564	NC_015666	TCG	2	6	533947	533952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14565	NC_015666	AAG	2	6	533953	533958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252618
14566	NC_015666	CG	3	6	533961	533966	0 %	0 %	50 %	50 %	336252618
14567	NC_015666	CGT	2	6	533978	533983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14568	NC_015666	CGTCGG	2	12	533996	534007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252618
14569	NC_015666	GAC	2	6	534102	534107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14570	NC_015666	GAA	2	6	534126	534131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252618
14571	NC_015666	GC	3	6	534146	534151	0 %	0 %	50 %	50 %	336252618
14572	NC_015666	GTCGGC	2	12	534186	534197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252618
14573	NC_015666	CGGTCG	2	12	534202	534213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252618
14574	NC_015666	GCC	2	6	534214	534219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252618
14575	NC_015666	TCG	2	6	534229	534234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14576	NC_015666	CAG	2	6	534312	534317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14577	NC_015666	CCGAGA	2	12	534341	534352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14578	NC_015666	CGA	2	6	534371	534376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14579	NC_015666	TGA	2	6	534416	534421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252618
14580	NC_015666	CGA	2	6	534422	534427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14581	NC_015666	ACG	2	6	534475	534480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14582	NC_015666	GCC	2	6	534523	534528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252618
14583	NC_015666	C	6	6	534587	534592	0 %	0 %	0 %	100 %	336252618
14584	NC_015666	GCT	2	6	534604	534609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
14585	NC_015666	CGC	2	6	534656	534661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252618
14586	NC_015666	CAC	2	6	534753	534758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14587	NC_015666	CGA	2	6	534794	534799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_015666	GCC	3	9	534837	534845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14589	NC_015666	TCGA	2	8	534863	534870	25 %	25 %	25 %	25 %	336252619
14590	NC_015666	GC	3	6	534900	534905	0 %	0 %	50 %	50 %	336252619
14591	NC_015666	CGT	2	6	534934	534939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14592	NC_015666	GCG	2	6	534990	534995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14593	NC_015666	CGA	2	6	535011	535016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14594	NC_015666	CGG	2	6	535017	535022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14595	NC_015666	TCGCGA	2	12	535035	535046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14596	NC_015666	ACG	2	6	535161	535166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14597	NC_015666	TCG	2	6	535176	535181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14598	NC_015666	CGG	2	6	535228	535233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14599	NC_015666	GCG	2	6	535308	535313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14600	NC_015666	ACG	2	6	535326	535331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14601	NC_015666	GGC	2	6	535393	535398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14602	NC_015666	CCG	2	6	535401	535406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252619
14603	NC_015666	TGGA	2	8	535433	535440	25 %	25 %	50 %	0 %	336252619
14604	NC_015666	GGC	2	6	535448	535453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252619
14605	NC_015666	CGC	2	6	535468	535473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252619
14606	NC_015666	CGGA	2	8	535481	535488	25 %	0 %	50 %	25 %	336252619
14607	NC_015666	CCG	2	6	535512	535517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252619
14608	NC_015666	CGGC	2	8	535524	535531	0 %	0 %	50 %	50 %	336252619
14609	NC_015666	GAC	2	6	535550	535555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14610	NC_015666	CGA	2	6	535579	535584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14611	NC_015666	TCG	2	6	535590	535595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14612	NC_015666	CGA	2	6	535654	535659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252619
14613	NC_015666	CACC	2	8	535690	535697	25 %	0 %	0 %	75 %	336252619
14614	NC_015666	GC	3	6	535734	535739	0 %	0 %	50 %	50 %	336252619
14615	NC_015666	CGA	2	6	535834	535839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
14616	NC_015666	CGCCGG	2	12	535845	535856	0 %	0 %	50 %	50 %	336252620
14617	NC_015666	GCT	2	6	535883	535888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252620
14618	NC_015666	CGA	2	6	535902	535907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
14619	NC_015666	CGA	2	6	535944	535949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
14620	NC_015666	CCG	2	6	535970	535975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252620
14621	NC_015666	ACG	2	6	536000	536005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
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14623	NC_015666	CGA	2	6	536016	536021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
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14632	NC_015666	CTG	2	6	536326	536331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252620
14633	NC_015666	CGG	2	6	536343	536348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252620
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14638	NC_015666	CG	4	8	536464	536471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14639	NC_015666	GTC	2	6	536530	536535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
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14642	NC_015666	CG	3	6	536639	536644	0 %	0 %	50 %	50 %	336252621
14643	NC_015666	TCG	2	6	536649	536654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
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14664	NC_015666	CCG	2	6	537547	537552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14665	NC_015666	ACGT	2	8	537593	537600	25 %	25 %	25 %	25 %	336252622
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14735	NC_015666	CGA	2	6	540297	540302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252623
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14977	NC_015666	TCG	2	6	548053	548058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252630
14978	NC_015666	CAG	2	6	548109	548114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252630
14979	NC_015666	TCG	2	6	548137	548142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252630
14980	NC_015666	TGC	2	6	548171	548176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252630
14981	NC_015666	GTCA	2	8	548187	548194	25 %	25 %	25 %	25 %	336252630
14982	NC_015666	AACG	2	8	548225	548232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14983	NC_015666	CAT	2	6	548247	548252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14984	NC_015666	GCC	2	6	548264	548269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14985	NC_015666	TCACCT	2	12	548391	548402	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336252631
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14999	NC_015666	CAA	2	6	548819	548824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15000	NC_015666	GAC	2	6	548841	548846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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