MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015666	TCGTGA	2	12	36245	36256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252129
1002	NC_015666	AG	3	6	36275	36280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015666	TGC	2	6	36343	36348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015666	CGT	2	6	36430	36435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1005	NC_015666	CG	4	8	36468	36475	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1006	NC_015666	AACG	2	8	36476	36483	50 %	0 %	25 %	25 %	336252130
1007	NC_015666	ACG	2	6	36522	36527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1008	NC_015666	TCG	2	6	36579	36584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1009	NC_015666	CTGCG	2	10	36599	36608	0 %	20 %	40 %	40 %	336252130
1010	NC_015666	GTC	2	6	36710	36715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1011	NC_015666	CGG	3	9	36727	36735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252130
1012	NC_015666	TCC	2	6	36744	36749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252130
1013	NC_015666	CGC	3	9	36753	36761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1014	NC_015666	CCG	2	6	36778	36783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1015	NC_015666	CGA	2	6	36793	36798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1016	NC_015666	CCG	2	6	36812	36817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1017	NC_015666	CCGG	2	8	36837	36844	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1018	NC_015666	CCG	3	9	36847	36855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1019	NC_015666	TCG	2	6	36858	36863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1020	NC_015666	TCG	2	6	36894	36899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1021	NC_015666	CGAC	2	8	36910	36917	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
1022	NC_015666	CGGCGC	2	12	36957	36968	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1023	NC_015666	CCAC	2	8	36981	36988	25 %	0 %	0 %	75 %	336252130
1024	NC_015666	CCGA	2	8	36995	37002	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
1025	NC_015666	GCCT	2	8	37013	37020	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
1026	NC_015666	GCT	2	6	37060	37065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1027	NC_015666	CGA	2	6	37078	37083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1028	NC_015666	CCGA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
1029	NC_015666	CGT	2	6	37108	37113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1030	NC_015666	CCGCGG	2	12	37126	37137	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1031	NC_015666	CGC	2	6	37174	37179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1032	NC_015666	ACGC	2	8	37212	37219	25 %	0 %	25 %	50 %	336252130
1033	NC_015666	CGC	2	6	37222	37227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1034	NC_015666	GACGTA	2	12	37271	37282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252130
1035	NC_015666	CGC	2	6	37298	37303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1036	NC_015666	GGC	2	6	37319	37324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252130
1037	NC_015666	CCG	2	6	37344	37349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1038	NC_015666	TCG	4	12	37380	37391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1039	NC_015666	TC	3	6	37413	37418	0 %	50 %	0 %	50 %	336252130
1040	NC_015666	CGCGT	2	10	37445	37454	0 %	20 %	40 %	40 %	336252130
1041	NC_015666	CGA	3	9	37458	37466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1042	NC_015666	TCCG	2	8	37499	37506	0 %	25 %	25 %	50 %	336252130
1043	NC_015666	ACG	2	6	37536	37541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1044	NC_015666	TCG	2	6	37557	37562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1045	NC_015666	CGG	2	6	37578	37583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252130
1046	NC_015666	CG	3	6	37610	37615	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1047	NC_015666	CG	3	6	37627	37632	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1048	NC_015666	GCC	2	6	37633	37638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1049	NC_015666	CGC	2	6	37644	37649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1050	NC_015666	TCG	2	6	37650	37655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1051	NC_015666	CGA	2	6	37699	37704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1052	NC_015666	CGA	2	6	37714	37719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1053	NC_015666	GCT	2	6	37723	37728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1054	NC_015666	TGCTCG	2	12	37746	37757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1055	NC_015666	ACCGA	3	15	37764	37778	40 %	0 %	20 %	40 %	336252130
1056	NC_015666	CG	3	6	37786	37791	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1057	NC_015666	CG	3	6	37820	37825	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1058	NC_015666	GTC	2	6	37844	37849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1059	NC_015666	CTG	2	6	37859	37864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1060	NC_015666	GAT	2	6	37900	37905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252130
1061	NC_015666	GGC	2	6	37913	37918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252130
1062	NC_015666	CGT	2	6	37999	38004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1063	NC_015666	CAC	2	6	38018	38023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252130
1064	NC_015666	GC	3	6	38027	38032	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1065	NC_015666	CG	3	6	38034	38039	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1066	NC_015666	GTGC	2	8	38062	38069	0 %	25 %	50 %	25 %	336252130
1067	NC_015666	CCT	2	6	38128	38133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252130
1068	NC_015666	GC	3	6	38143	38148	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1069	NC_015666	CGA	2	6	38175	38180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1070	NC_015666	ACG	2	6	38187	38192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1071	NC_015666	GCG	2	6	38196	38201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252130
1072	NC_015666	GGT	2	6	38268	38273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252130
1073	NC_015666	CGCC	2	8	38275	38282	0 %	0 %	25 %	75 %	336252130
1074	NC_015666	CGC	2	6	38287	38292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1075	NC_015666	GAC	2	6	38312	38317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1076	NC_015666	GCC	2	6	38363	38368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1077	NC_015666	GCC	2	6	38371	38376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1078	NC_015666	CGT	2	6	38404	38409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1079	NC_015666	CCG	2	6	38461	38466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252130
1080	NC_015666	GTC	2	6	38471	38476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1081	NC_015666	TCG	2	6	38484	38489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252130
1082	NC_015666	GGAA	2	8	38520	38527	50 %	0 %	50 %	0 %	336252130
1083	NC_015666	GC	4	8	38614	38621	0 %	0 %	50 %	50 %	336252130
1084	NC_015666	TGG	2	6	38643	38648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252130
1085	NC_015666	ACT	2	6	38649	38654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252130
1086	NC_015666	GAG	2	6	38722	38727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015666	GTC	2	6	38742	38747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252131
1088	NC_015666	CGG	2	6	38757	38762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252131
1089	NC_015666	CGA	2	6	38774	38779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252131
1090	NC_015666	CGT	2	6	38780	38785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252131
1091	NC_015666	CTG	2	6	38793	38798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252131
1092	NC_015666	CGC	2	6	38817	38822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252131
1093	NC_015666	GTTC	2	8	38845	38852	0 %	50 %	25 %	25 %	336252131
1094	NC_015666	GAAC	2	8	38853	38860	50 %	0 %	25 %	25 %	336252131
1095	NC_015666	CAC	2	6	38927	38932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252131
1096	NC_015666	TCGG	2	8	38980	38987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_015666	CGC	2	6	39005	39010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_015666	AGC	2	6	39013	39018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015666	GCA	2	6	39109	39114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1100	NC_015666	ACC	2	6	39129	39134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252132
1101	NC_015666	GCC	2	6	39136	39141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1102	NC_015666	GCG	2	6	39143	39148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252132
1103	NC_015666	TTC	2	6	39165	39170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252132
1104	NC_015666	GCC	2	6	39201	39206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1105	NC_015666	GCC	2	6	39230	39235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1106	NC_015666	CGA	2	6	39253	39258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1107	NC_015666	TCG	2	6	39271	39276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1108	NC_015666	TGC	2	6	39300	39305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1109	NC_015666	GCC	2	6	39371	39376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1110	NC_015666	CGAC	2	8	39394	39401	25 %	0 %	25 %	50 %	336252132
1111	NC_015666	CCA	2	6	39409	39414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252132
1112	NC_015666	GCC	2	6	39468	39473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1113	NC_015666	CCG	2	6	39515	39520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252132
1114	NC_015666	TGA	2	6	39568	39573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252132
1115	NC_015666	CGA	2	6	39574	39579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1116	NC_015666	GAA	2	6	39611	39616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252132
1117	NC_015666	TCG	2	6	39652	39657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1118	NC_015666	TCG	2	6	39670	39675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1119	NC_015666	GTTCG	2	10	39703	39712	0 %	40 %	40 %	20 %	336252132
1120	NC_015666	TCG	2	6	39741	39746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1121	NC_015666	GCGCC	2	10	39763	39772	0 %	0 %	40 %	60 %	336252132
1122	NC_015666	GGA	2	6	39779	39784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252132
1123	NC_015666	CGA	2	6	39790	39795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252132
1124	NC_015666	CGT	2	6	39908	39913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252133
1125	NC_015666	TCG	2	6	39928	39933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252133
1126	NC_015666	GCG	2	6	39934	39939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252133
1127	NC_015666	CGG	2	6	39968	39973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252133
1128	NC_015666	GGCG	2	8	39986	39993	0 %	0 %	75 %	25 %	336252133
1129	NC_015666	TGG	2	6	40005	40010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252133
1130	NC_015666	GTC	2	6	40080	40085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252133
1131	NC_015666	CGG	2	6	40094	40099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252133
1132	NC_015666	CGC	2	6	40106	40111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252133
1133	NC_015666	CGG	2	6	40118	40123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252133
1134	NC_015666	CGT	2	6	40126	40131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252133
1135	NC_015666	GCC	3	9	40143	40151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252133
1136	NC_015666	GTC	2	6	40155	40160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252133
1137	NC_015666	GC	3	6	40264	40269	0 %	0 %	50 %	50 %	336252133
1138	NC_015666	ACG	2	6	40284	40289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252133
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1140	NC_015666	TCT	2	6	40369	40374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252133
1141	NC_015666	CGGA	2	8	40455	40462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_015666	GCT	2	6	40484	40489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252134
1143	NC_015666	CGG	2	6	40491	40496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252134
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1146	NC_015666	TAC	2	6	40710	40715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252134
1147	NC_015666	CGA	2	6	40747	40752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252134
1148	NC_015666	CGT	2	6	40754	40759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252134
1149	NC_015666	CGC	2	6	40766	40771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252134
1150	NC_015666	GAC	2	6	40773	40778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252134
1151	NC_015666	CGA	2	6	40780	40785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252134
1152	NC_015666	GC	3	6	40805	40810	0 %	0 %	50 %	50 %	336252134
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1154	NC_015666	CGA	2	6	40867	40872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252134
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1161	NC_015666	GTC	2	6	41070	41075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252134
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1168	NC_015666	GAC	2	6	41327	41332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252134
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1174	NC_015666	GGA	2	6	41645	41650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252135
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1188	NC_015666	CGG	2	6	42200	42205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252135
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1190	NC_015666	CGA	2	6	42272	42277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252135
1191	NC_015666	CCG	2	6	42299	42304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1192	NC_015666	GGT	2	6	42346	42351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1193	NC_015666	GTA	2	6	42442	42447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252136
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1202	NC_015666	TCG	3	9	42656	42664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252136
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1210	NC_015666	GCG	2	6	42892	42897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252136
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1222	NC_015666	GAT	2	6	43237	43242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252136
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1232	NC_015666	GTA	2	6	43591	43596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252136
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1237	NC_015666	CGG	2	6	43770	43775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252136
1238	NC_015666	CG	3	6	43781	43786	0 %	0 %	50 %	50 %	336252136
1239	NC_015666	TCG	2	6	43838	43843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252136
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1242	NC_015666	TCC	2	6	43889	43894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252136
1243	NC_015666	CGA	2	6	43980	43985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252136
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1245	NC_015666	GCGG	2	8	44019	44026	0 %	0 %	75 %	25 %	336252136
1246	NC_015666	ATG	2	6	44057	44062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252136
1247	NC_015666	TCG	2	6	44147	44152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252136
1248	NC_015666	GC	3	6	44202	44207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_015666	CGG	2	6	44279	44284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252137
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1252	NC_015666	CCG	2	6	44398	44403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252137
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1255	NC_015666	CGC	2	6	44511	44516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252137
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1257	NC_015666	CGC	2	6	44601	44606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252137
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1263	NC_015666	TCGT	2	8	44763	44770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_015666	ATCGC	2	10	44803	44812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1265	NC_015666	TCGC	2	8	44830	44837	0 %	25 %	25 %	50 %	336252138
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1334	NC_015666	CGATTT	2	12	47283	47294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336252139
1335	NC_015666	CCG	2	6	47420	47425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1336	NC_015666	ACTG	2	8	47577	47584	25 %	25 %	25 %	25 %	336252140
1337	NC_015666	ACGA	2	8	47621	47628	50 %	0 %	25 %	25 %	336252140
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1343	NC_015666	TCG	2	6	47726	47731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252140
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1360	NC_015666	TCGA	2	8	48179	48186	25 %	25 %	25 %	25 %	336252140
1361	NC_015666	CGC	2	6	48201	48206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252140
1362	NC_015666	CGA	3	9	48225	48233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252140
1363	NC_015666	GAC	2	6	48298	48303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252140
1364	NC_015666	GATC	2	8	48315	48322	25 %	25 %	25 %	25 %	336252140
1365	NC_015666	A	6	6	48356	48361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_015666	AGC	2	6	48526	48531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252141
1367	NC_015666	GCC	2	6	48552	48557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252141
1368	NC_015666	GTCG	2	8	48564	48571	0 %	25 %	50 %	25 %	336252141
1369	NC_015666	ACG	2	6	48608	48613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252141
1370	NC_015666	TCG	2	6	48637	48642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252141
1371	NC_015666	CGAG	2	8	48697	48704	25 %	0 %	50 %	25 %	336252141
1372	NC_015666	CGA	2	6	48710	48715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252141
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1447	NC_015666	CGC	2	6	51385	51390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1483	NC_015666	CGA	2	6	52605	52610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252146
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1490	NC_015666	CTC	2	6	52741	52746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252146
1491	NC_015666	TCC	2	6	52775	52780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252146
1492	NC_015666	GCCG	2	8	52795	52802	0 %	0 %	50 %	50 %	336252146
1493	NC_015666	ACTCGT	2	12	52803	52814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252146
1494	NC_015666	CGT	2	6	52830	52835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1495	NC_015666	CGG	2	6	52842	52847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252146
1496	NC_015666	TCG	2	6	52910	52915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1497	NC_015666	CGT	2	6	52935	52940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1498	NC_015666	TCG	2	6	52964	52969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252146
1499	NC_015666	CTC	2	6	52993	52998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252146
1500	NC_015666	GTCG	2	8	53095	53102	0 %	25 %	50 %	25 %	336252146

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