MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015666	GTC	2	6	497058	497063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252582
13502	NC_015666	CGG	2	6	497066	497071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252582
13503	NC_015666	CGG	2	6	497118	497123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252582
13504	NC_015666	GTC	2	6	497124	497129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252582
13505	NC_015666	CGA	2	6	497134	497139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252582
13506	NC_015666	GCG	2	6	497168	497173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252582
13507	NC_015666	AGG	2	6	497269	497274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252582
13508	NC_015666	TCG	2	6	497278	497283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252582
13509	NC_015666	CGA	2	6	497357	497362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252582
13510	NC_015666	CGG	2	6	497465	497470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_015666	TGG	3	9	497471	497479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_015666	CGG	2	6	497480	497485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_015666	TCGG	2	8	497492	497499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13514	NC_015666	CGT	2	6	497513	497518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13515	NC_015666	GC	3	6	497534	497539	0 %	0 %	50 %	50 %	336252583
13516	NC_015666	GTC	2	6	497571	497576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13517	NC_015666	GTC	2	6	497578	497583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13518	NC_015666	CGC	2	6	497600	497605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252583
13519	NC_015666	TCG	2	6	497645	497650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13520	NC_015666	GCGA	2	8	497690	497697	25 %	0 %	50 %	25 %	336252583
13521	NC_015666	CGA	2	6	497726	497731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13522	NC_015666	CGG	2	6	497735	497740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252583
13523	NC_015666	TCG	2	6	497812	497817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13524	NC_015666	CGT	2	6	497823	497828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13525	NC_015666	TCG	2	6	497848	497853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252583
13526	NC_015666	TCGATG	2	12	497866	497877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252583
13527	NC_015666	TCC	2	6	497878	497883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252583
13528	NC_015666	GGT	2	6	497942	497947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_015666	CGA	2	6	497954	497959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_015666	GCGT	2	8	498011	498018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13531	NC_015666	GCG	2	6	498047	498052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_015666	TCG	2	6	498109	498114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13533	NC_015666	CGC	2	6	498164	498169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252584
13534	NC_015666	TCG	2	6	498178	498183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13535	NC_015666	AGG	2	6	498184	498189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252584
13536	NC_015666	ACG	2	6	498202	498207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13537	NC_015666	CCAC	2	8	498211	498218	25 %	0 %	0 %	75 %	336252584
13538	NC_015666	GCCGAC	2	12	498243	498254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252584
13539	NC_015666	CGA	2	6	498281	498286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13540	NC_015666	CGG	2	6	498304	498309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252584
13541	NC_015666	GTC	3	9	498360	498368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13542	NC_015666	CGG	2	6	498380	498385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252584
13543	NC_015666	TCGGCG	2	12	498394	498405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252584
13544	NC_015666	CGGC	2	8	498451	498458	0 %	0 %	50 %	50 %	336252584
13545	NC_015666	GTC	2	6	498459	498464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13546	NC_015666	GAG	2	6	498465	498470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252584
13547	NC_015666	ACG	2	6	498505	498510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252584
13548	NC_015666	CG	4	8	498590	498597	0 %	0 %	50 %	50 %	336252584
13549	NC_015666	GAG	2	6	498606	498611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252584
13550	NC_015666	GAAC	2	8	498704	498711	50 %	0 %	25 %	25 %	336252585
13551	NC_015666	GCC	2	6	498716	498721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252585
13552	NC_015666	GA	3	6	498733	498738	50 %	0 %	50 %	0 %	336252585
13553	NC_015666	GCT	2	6	498740	498745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13554	NC_015666	TCG	2	6	498749	498754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13555	NC_015666	ATC	2	6	498780	498785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252585
13556	NC_015666	CGT	2	6	498857	498862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13557	NC_015666	CGG	2	6	498878	498883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252585
13558	NC_015666	CGC	2	6	498892	498897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252585
13559	NC_015666	AGA	2	6	498989	498994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252585
13560	NC_015666	GGCC	2	8	499001	499008	0 %	0 %	50 %	50 %	336252585
13561	NC_015666	GC	3	6	499016	499021	0 %	0 %	50 %	50 %	336252585
13562	NC_015666	TCG	2	6	499046	499051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13563	NC_015666	CGG	2	6	499104	499109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252585
13564	NC_015666	GTC	2	6	499144	499149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13565	NC_015666	GCG	2	6	499150	499155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252585
13566	NC_015666	CGT	2	6	499241	499246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13567	NC_015666	GAC	2	6	499275	499280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13568	NC_015666	CCG	2	6	499307	499312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252585
13569	NC_015666	GCGTC	2	10	499320	499329	0 %	20 %	40 %	40 %	336252585
13570	NC_015666	GACG	2	8	499404	499411	25 %	0 %	50 %	25 %	336252585
13571	NC_015666	CGA	2	6	499418	499423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13572	NC_015666	GTC	2	6	499429	499434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13573	NC_015666	GCC	2	6	499453	499458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252585
13574	NC_015666	GAG	2	6	499476	499481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252585
13575	NC_015666	CGGCG	2	10	499502	499511	0 %	0 %	60 %	40 %	336252585
13576	NC_015666	CGA	2	6	499524	499529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252585
13577	NC_015666	CGG	2	6	499530	499535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252585
13578	NC_015666	CGGC	2	8	499567	499574	0 %	0 %	50 %	50 %	336252585
13579	NC_015666	CGA	2	6	499589	499594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_015666	TCGC	2	8	499637	499644	0 %	25 %	25 %	50 %	336252586
13581	NC_015666	GA	3	6	499655	499660	50 %	0 %	50 %	0 %	336252586
13582	NC_015666	TCG	2	6	499673	499678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13583	NC_015666	CGA	2	6	499707	499712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13584	NC_015666	GCC	2	6	499766	499771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252586
13585	NC_015666	AGC	2	6	499808	499813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13586	NC_015666	CAG	2	6	499831	499836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13587	NC_015666	GCTC	2	8	499859	499866	0 %	25 %	25 %	50 %	336252586
13588	NC_015666	GAT	2	6	499897	499902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252586
13589	NC_015666	TCG	2	6	500024	500029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13590	NC_015666	AGG	2	6	500039	500044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252586
13591	NC_015666	CGAACG	2	12	500061	500072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13592	NC_015666	TCG	2	6	500126	500131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13593	NC_015666	CGGCGA	2	12	500160	500171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252586
13594	NC_015666	CGG	2	6	500173	500178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13595	NC_015666	GCC	2	6	500222	500227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252586
13596	NC_015666	CGA	2	6	500232	500237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13597	NC_015666	GCG	2	6	500253	500258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13598	NC_015666	GAT	2	6	500278	500283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252586
13599	NC_015666	GTC	2	6	500294	500299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13600	NC_015666	CATCCC	2	12	500302	500313	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	336252586
13601	NC_015666	GAT	2	6	500317	500322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252586
13602	NC_015666	AGG	2	6	500348	500353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252586
13603	NC_015666	CCG	2	6	500363	500368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252586
13604	NC_015666	TGA	2	6	500418	500423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252586
13605	NC_015666	ACG	2	6	500432	500437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13606	NC_015666	CGG	2	6	500442	500447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13607	NC_015666	CGA	3	9	500454	500462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13608	NC_015666	CGT	2	6	500464	500469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13609	NC_015666	CG	3	6	500477	500482	0 %	0 %	50 %	50 %	336252586
13610	NC_015666	AGG	2	6	500501	500506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252586
13611	NC_015666	CGG	2	6	500574	500579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13612	NC_015666	CGT	2	6	500580	500585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13613	NC_015666	CGT	2	6	500589	500594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13614	NC_015666	AGC	2	6	500606	500611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
13615	NC_015666	CGG	2	6	500688	500693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13616	NC_015666	CGG	2	6	500697	500702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252586
13617	NC_015666	CCCG	2	8	500738	500745	0 %	0 %	25 %	75 %	336252586
13618	NC_015666	CGC	2	6	500782	500787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252586
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13620	NC_015666	CGTT	2	8	500840	500847	0 %	50 %	25 %	25 %	336252586
13621	NC_015666	CGC	2	6	500851	500856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252586
13622	NC_015666	GAC	2	6	500857	500862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252586
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13689	NC_015666	TCT	2	6	502821	502826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252587
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13707	NC_015666	CGTCGC	2	12	503337	503348	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252588
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13714	NC_015666	TCG	2	6	503825	503830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252588
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13716	NC_015666	AT	3	6	504041	504046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13717	NC_015666	CAT	2	6	504048	504053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13718	NC_015666	TAA	2	6	504133	504138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13719	NC_015666	TCG	2	6	504197	504202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13720	NC_015666	GGT	2	6	504245	504250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13721	NC_015666	GAC	2	6	504278	504283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13722	NC_015666	CGCGT	2	10	504427	504436	0 %	20 %	40 %	40 %	336252589
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13724	NC_015666	GAC	3	9	504457	504465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252589
13725	NC_015666	TCG	2	6	504485	504490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252589
13726	NC_015666	CGG	2	6	504498	504503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252589
13727	NC_015666	CGA	2	6	504504	504509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252589
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13729	NC_015666	CGAC	2	8	504606	504613	25 %	0 %	25 %	50 %	336252589
13730	NC_015666	AGC	2	6	504614	504619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252589
13731	NC_015666	GTC	2	6	504625	504630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252589
13732	NC_015666	CCGA	2	8	504631	504638	25 %	0 %	25 %	50 %	336252589
13733	NC_015666	CGG	2	6	504639	504644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252589
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13735	NC_015666	CGTC	2	8	504662	504669	0 %	25 %	25 %	50 %	336252589
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13855	NC_015666	TGA	2	6	508932	508937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252593
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13975	NC_015666	GCG	2	6	513539	513544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252598
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13978	NC_015666	TCG	2	6	513624	513629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252598
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13983	NC_015666	ATCG	2	8	513761	513768	25 %	25 %	25 %	25 %	336252598
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