MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015666	TCG	2	6	479817	479822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252565
13002	NC_015666	GCG	2	6	479823	479828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252565
13003	NC_015666	CGG	2	6	479846	479851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252565
13004	NC_015666	CGC	2	6	479858	479863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252565
13005	NC_015666	GCC	2	6	479879	479884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252565
13006	NC_015666	GCG	2	6	479915	479920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252565
13007	NC_015666	GTCCCT	2	12	479936	479947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252565
13008	NC_015666	GTC	2	6	480042	480047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_015666	TCGCGG	2	12	480053	480064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_015666	GGC	2	6	480082	480087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_015666	CGA	2	6	480183	480188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13012	NC_015666	CCG	2	6	480189	480194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252566
13013	NC_015666	CGA	3	9	480199	480207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13014	NC_015666	CGAT	2	8	480210	480217	25 %	25 %	25 %	25 %	336252566
13015	NC_015666	TCG	2	6	480240	480245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13016	NC_015666	GCG	2	6	480258	480263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252566
13017	NC_015666	GCG	2	6	480273	480278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252566
13018	NC_015666	ACG	2	6	480342	480347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13019	NC_015666	CGT	2	6	480352	480357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13020	NC_015666	GCCA	2	8	480422	480429	25 %	0 %	25 %	50 %	336252566
13021	NC_015666	GGA	2	6	480604	480609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252566
13022	NC_015666	CTT	2	6	480640	480645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252566
13023	NC_015666	CGCC	2	8	480654	480661	0 %	0 %	25 %	75 %	336252566
13024	NC_015666	GCG	2	6	480678	480683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252566
13025	NC_015666	GTC	2	6	480698	480703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13026	NC_015666	CTG	3	9	480728	480736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13027	NC_015666	CATCGA	2	12	480829	480840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252566
13028	NC_015666	AGG	2	6	480867	480872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252566
13029	NC_015666	GAG	2	6	480878	480883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252566
13030	NC_015666	GAA	2	6	480887	480892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252566
13031	NC_015666	GGC	2	6	480902	480907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252566
13032	NC_015666	CGGCT	2	10	480917	480926	0 %	20 %	40 %	40 %	336252566
13033	NC_015666	CGT	2	6	480943	480948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252566
13034	NC_015666	AAT	2	6	480951	480956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252566
13035	NC_015666	CGG	2	6	480967	480972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_015666	CGC	2	6	480997	481002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13037	NC_015666	GCT	2	6	481058	481063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13038	NC_015666	TCG	2	6	481084	481089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13039	NC_015666	ACG	2	6	481126	481131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13040	NC_015666	CCG	2	6	481137	481142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252567
13041	NC_015666	CG	3	6	481141	481146	0 %	0 %	50 %	50 %	336252567
13042	NC_015666	TCC	2	6	481150	481155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252567
13043	NC_015666	GATCG	2	10	481176	481185	20 %	20 %	40 %	20 %	336252567
13044	NC_015666	CCG	2	6	481190	481195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252567
13045	NC_015666	TCG	2	6	481199	481204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13046	NC_015666	TCA	2	6	481217	481222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252567
13047	NC_015666	CGGC	2	8	481229	481236	0 %	0 %	50 %	50 %	336252567
13048	NC_015666	CGACG	2	10	481239	481248	20 %	0 %	40 %	40 %	336252567
13049	NC_015666	TCG	2	6	481249	481254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13050	NC_015666	CGGT	2	8	481282	481289	0 %	25 %	50 %	25 %	336252567
13051	NC_015666	TCG	2	6	481306	481311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13052	NC_015666	CGA	2	6	481316	481321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13053	NC_015666	ACG	2	6	481324	481329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13054	NC_015666	GTT	2	6	481338	481343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252567
13055	NC_015666	GAC	2	6	481395	481400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252567
13056	NC_015666	AGC	2	6	481450	481455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_015666	AGTG	2	8	481489	481496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_015666	CCGCA	2	10	481506	481515	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13059	NC_015666	CGA	2	6	481565	481570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13060	NC_015666	CGA	2	6	481604	481609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13061	NC_015666	CGA	2	6	481625	481630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13062	NC_015666	GTACT	2	10	481638	481647	20 %	40 %	20 %	20 %	336252568
13063	NC_015666	GAC	2	6	481659	481664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13064	NC_015666	TCGA	2	8	481677	481684	25 %	25 %	25 %	25 %	336252568
13065	NC_015666	CGAC	2	8	481750	481757	25 %	0 %	25 %	50 %	336252568
13066	NC_015666	TCGACG	2	12	481846	481857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13067	NC_015666	GCG	3	9	481861	481869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252568
13068	NC_015666	CG	3	6	481874	481879	0 %	0 %	50 %	50 %	336252568
13069	NC_015666	GAC	2	6	481880	481885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13070	NC_015666	TTC	2	6	481887	481892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252568
13071	NC_015666	CG	3	6	481946	481951	0 %	0 %	50 %	50 %	336252568
13072	NC_015666	TGC	2	6	481957	481962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252568
13073	NC_015666	GCGA	2	8	481982	481989	25 %	0 %	50 %	25 %	336252568
13074	NC_015666	AGT	2	6	481999	482004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252568
13075	NC_015666	CGG	2	6	482014	482019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_015666	CCG	2	6	482027	482032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_015666	GTA	2	6	482101	482106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_015666	CGA	2	6	482116	482121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252569
13079	NC_015666	CGA	2	6	482130	482135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252569
13080	NC_015666	GAG	2	6	482140	482145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252569
13081	NC_015666	GAG	2	6	482173	482178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252569
13082	NC_015666	GCG	2	6	482189	482194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252569
13083	NC_015666	CGA	2	6	482241	482246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252569
13084	NC_015666	CGT	2	6	482250	482255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252569
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13086	NC_015666	CGA	2	6	482283	482288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252569
13087	NC_015666	GCG	2	6	482373	482378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252569
13088	NC_015666	CCG	2	6	482403	482408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252569
13089	NC_015666	CGG	2	6	482447	482452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252569
13090	NC_015666	CGG	3	9	482493	482501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252569
13091	NC_015666	CGCT	2	8	482569	482576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_015666	CGGC	2	8	482579	482586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_015666	CCGA	2	8	482594	482601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_015666	ACCG	2	8	482655	482662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_015666	ATT	2	6	482696	482701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_015666	CGA	2	6	482821	482826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252570
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13098	NC_015666	GACG	2	8	482843	482850	25 %	0 %	50 %	25 %	336252570
13099	NC_015666	GCG	2	6	482869	482874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252570
13100	NC_015666	CGA	2	6	482878	482883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13101	NC_015666	CGT	2	6	482900	482905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13102	NC_015666	GAAC	2	8	482922	482929	50 %	0 %	25 %	25 %	336252570
13103	NC_015666	GCC	2	6	482958	482963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252570
13104	NC_015666	GGC	2	6	482974	482979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252570
13105	NC_015666	CCG	2	6	482981	482986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252570
13106	NC_015666	CAGT	2	8	483008	483015	25 %	25 %	25 %	25 %	336252570
13107	NC_015666	CGC	2	6	483089	483094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252570
13108	NC_015666	TCG	2	6	483129	483134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13109	NC_015666	CGA	2	6	483146	483151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13110	NC_015666	CGATC	2	10	483182	483191	20 %	20 %	20 %	40 %	336252570
13111	NC_015666	ACC	2	6	483276	483281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252570
13112	NC_015666	GTC	2	6	483306	483311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13113	NC_015666	CGA	2	6	483320	483325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13114	NC_015666	TCC	2	6	483370	483375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252570
13115	NC_015666	AGACG	2	10	483383	483392	40 %	0 %	40 %	20 %	336252570
13116	NC_015666	TCG	2	6	483499	483504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252570
13117	NC_015666	GCGAG	2	10	483536	483545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13118	NC_015666	CTC	2	6	483553	483558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_015666	AGC	2	6	483611	483616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_015666	CCGT	2	8	483621	483628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_015666	GTC	2	6	483639	483644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13123	NC_015666	TAA	2	6	483698	483703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13238	NC_015666	TCG	2	6	487699	487704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252572
13239	NC_015666	CGG	2	6	487709	487714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252572
13240	NC_015666	CGG	2	6	487724	487729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252572
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13242	NC_015666	CCGGC	2	10	487909	487918	0 %	0 %	40 %	60 %	336252573
13243	NC_015666	GCG	2	6	487926	487931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252573
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13325	NC_015666	CG	3	6	491130	491135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13326	NC_015666	GGC	2	6	491150	491155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13327	NC_015666	TAC	2	6	491229	491234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252576
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13346	NC_015666	CGA	2	6	491864	491869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252576
13347	NC_015666	GCG	2	6	491872	491877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252576
13348	NC_015666	CGAACG	2	12	491880	491891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252576
13349	NC_015666	GCT	2	6	491900	491905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252576
13350	NC_015666	TTCGGT	2	12	491939	491950	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13351	NC_015666	TCGGTG	2	12	492025	492036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336252577
13352	NC_015666	GCG	2	6	492077	492082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252577
13353	NC_015666	CGA	2	6	492101	492106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252577
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13355	NC_015666	GTG	2	6	492141	492146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252577
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13357	NC_015666	GGC	2	6	492255	492260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252577
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13472	NC_015666	GTCG	2	8	496255	496262	0 %	25 %	50 %	25 %	336252581
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13477	NC_015666	CGG	2	6	496350	496355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252581
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13479	NC_015666	CGG	2	6	496485	496490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252581
13480	NC_015666	CGG	2	6	496500	496505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252581
13481	NC_015666	TCG	2	6	496574	496579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252581
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13491	NC_015666	CGGG	2	8	496859	496866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13492	NC_015666	CGTC	2	8	496873	496880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13493	NC_015666	GCG	3	9	496893	496901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13497	NC_015666	CGA	2	6	496961	496966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252582
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