MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015666	TCGG	2	8	463651	463658	0 %	25 %	50 %	25 %	336252553
12502	NC_015666	CGTCGC	2	12	463666	463677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252553
12503	NC_015666	ACG	2	6	463679	463684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12504	NC_015666	GCG	2	6	463704	463709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12505	NC_015666	CCG	2	6	463718	463723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12506	NC_015666	CGAC	2	8	463797	463804	25 %	0 %	25 %	50 %	336252553
12507	NC_015666	GGC	2	6	463805	463810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12508	NC_015666	CG	3	6	463819	463824	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12509	NC_015666	TCG	2	6	463866	463871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12510	NC_015666	CTC	2	6	463874	463879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252553
12511	NC_015666	CGC	2	6	463882	463887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12512	NC_015666	TGC	2	6	463935	463940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12513	NC_015666	CGC	2	6	463949	463954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12514	NC_015666	TCGCG	2	10	463983	463992	0 %	20 %	40 %	40 %	336252553
12515	NC_015666	GGC	2	6	464003	464008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12516	NC_015666	CTG	2	6	464018	464023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12517	NC_015666	CGG	2	6	464026	464031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12518	NC_015666	CCG	2	6	464046	464051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12519	NC_015666	CGAC	2	8	464064	464071	25 %	0 %	25 %	50 %	336252553
12520	NC_015666	GCT	2	6	464098	464103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12521	NC_015666	CCG	2	6	464112	464117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12522	NC_015666	GGC	2	6	464131	464136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12523	NC_015666	CG	3	6	464142	464147	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12524	NC_015666	TCG	2	6	464154	464159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12525	NC_015666	TCG	2	6	464166	464171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12526	NC_015666	GCG	2	6	464180	464185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12527	NC_015666	CCG	2	6	464232	464237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12528	NC_015666	CGG	2	6	464260	464265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12529	NC_015666	GCT	2	6	464278	464283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12530	NC_015666	TGG	2	6	464289	464294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252553
12531	NC_015666	CG	4	8	464301	464308	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12532	NC_015666	CCGG	2	8	464323	464330	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12533	NC_015666	TCCCG	2	10	464365	464374	0 %	20 %	20 %	60 %	336252553
12534	NC_015666	CTC	2	6	464404	464409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252553
12535	NC_015666	GCT	2	6	464410	464415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12536	NC_015666	ATC	2	6	464438	464443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252553
12537	NC_015666	TCA	2	6	464463	464468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252553
12538	NC_015666	GCC	2	6	464471	464476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12539	NC_015666	TCG	2	6	464487	464492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12540	NC_015666	GCT	2	6	464500	464505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12541	NC_015666	CT	3	6	464509	464514	0 %	50 %	0 %	50 %	336252553
12542	NC_015666	CTG	2	6	464519	464524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12543	NC_015666	GC	3	6	464535	464540	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12544	NC_015666	GGC	2	6	464551	464556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12545	NC_015666	GC	3	6	464559	464564	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12546	NC_015666	TCG	2	6	464565	464570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12547	NC_015666	GCG	2	6	464571	464576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12548	NC_015666	CGC	2	6	464581	464586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12549	NC_015666	GTC	2	6	464612	464617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12550	NC_015666	GCC	2	6	464621	464626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12551	NC_015666	TCG	2	6	464640	464645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12552	NC_015666	TCG	2	6	464676	464681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12553	NC_015666	GCCG	2	8	464709	464716	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12554	NC_015666	CGT	3	9	464740	464748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12555	NC_015666	GTC	2	6	464753	464758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12556	NC_015666	TCGCGC	2	12	464763	464774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252553
12557	NC_015666	CCG	2	6	464784	464789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12558	NC_015666	GC	3	6	464797	464802	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
12559	NC_015666	CGT	2	6	464824	464829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12560	NC_015666	GCT	2	6	464848	464853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252553
12561	NC_015666	CGG	2	6	464886	464891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12562	NC_015666	GCG	2	6	464897	464902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
12563	NC_015666	CGA	2	6	464934	464939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_015666	CGGC	2	8	464952	464959	0 %	0 %	50 %	50 %	336252554
12565	NC_015666	ACG	2	6	464987	464992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12566	NC_015666	GTCG	2	8	465022	465029	0 %	25 %	50 %	25 %	336252554
12567	NC_015666	CGT	2	6	465075	465080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12568	NC_015666	CGC	2	6	465109	465114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252554
12569	NC_015666	GCC	2	6	465125	465130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252554
12570	NC_015666	GTA	2	6	465133	465138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252554
12571	NC_015666	CG	3	6	465150	465155	0 %	0 %	50 %	50 %	336252554
12572	NC_015666	GTC	2	6	465178	465183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12573	NC_015666	CGA	2	6	465207	465212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12574	NC_015666	CGC	2	6	465273	465278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252554
12575	NC_015666	CGAC	2	8	465297	465304	25 %	0 %	25 %	50 %	336252554
12576	NC_015666	CCT	2	6	465429	465434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252554
12577	NC_015666	AAG	2	6	465464	465469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252554
12578	NC_015666	GTC	2	6	465488	465493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12579	NC_015666	GGC	2	6	465535	465540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252554
12580	NC_015666	CGG	2	6	465550	465555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252554
12581	NC_015666	CG	3	6	465556	465561	0 %	0 %	50 %	50 %	336252554
12582	NC_015666	GAC	2	6	465580	465585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12583	NC_015666	AACTCG	2	12	465611	465622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252554
12584	NC_015666	GCA	2	6	465666	465671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252554
12585	NC_015666	TCCCGG	2	12	465744	465755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252554
12586	NC_015666	GAG	2	6	465766	465771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252554
12587	NC_015666	GCG	2	6	465791	465796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252554
12588	NC_015666	GGC	3	9	465877	465885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252554
12589	NC_015666	CGGGTC	2	12	465898	465909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252554
12590	NC_015666	GTC	2	6	465924	465929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_015666	GGC	2	6	465979	465984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_015666	AGC	2	6	466016	466021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_015666	ACG	2	6	466057	466062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_015666	GAG	2	6	466087	466092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252555
12595	NC_015666	CGG	2	6	466134	466139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252555
12596	NC_015666	AGC	2	6	466140	466145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12597	NC_015666	GAC	2	6	466153	466158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12598	NC_015666	CTC	2	6	466179	466184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252555
12599	NC_015666	GAG	2	6	466213	466218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252555
12600	NC_015666	GAG	2	6	466228	466233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252555
12601	NC_015666	CGA	2	6	466236	466241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12602	NC_015666	CCCCAC	2	12	466258	466269	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	336252555
12603	NC_015666	ACG	2	6	466337	466342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12604	NC_015666	CGG	2	6	466349	466354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252555
12605	NC_015666	CGA	2	6	466410	466415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12606	NC_015666	ATC	2	6	466417	466422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252555
12607	NC_015666	CAG	3	9	466429	466437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12608	NC_015666	CGC	2	6	466479	466484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252555
12609	NC_015666	CGA	2	6	466509	466514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12610	NC_015666	CCT	2	6	466530	466535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252555
12611	NC_015666	GCT	2	6	466539	466544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12612	NC_015666	AGGA	2	8	466565	466572	50 %	0 %	50 %	0 %	336252555
12613	NC_015666	GTCG	2	8	466701	466708	0 %	25 %	50 %	25 %	336252555
12614	NC_015666	GAG	2	6	466744	466749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252555
12615	NC_015666	CG	3	6	466803	466808	0 %	0 %	50 %	50 %	336252555
12616	NC_015666	CTT	2	6	466830	466835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252555
12617	NC_015666	CGA	3	9	466929	466937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252555
12618	NC_015666	GAG	2	6	466972	466977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252555
12619	NC_015666	CTT	2	6	467076	467081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252555
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12740	NC_015666	CGA	2	6	471457	471462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252558
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12978	NC_015666	CGC	2	6	479074	479079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252565
12979	NC_015666	GTC	2	6	479139	479144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252565
12980	NC_015666	CGT	2	6	479161	479166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252565
12981	NC_015666	GCG	2	6	479313	479318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252565
12982	NC_015666	CGC	2	6	479345	479350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252565
12983	NC_015666	CTC	2	6	479351	479356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252565
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12985	NC_015666	CGGCG	2	10	479444	479453	0 %	0 %	60 %	40 %	336252565
12986	NC_015666	AGCG	2	8	479460	479467	25 %	0 %	50 %	25 %	336252565
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