MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015666	ACCGTC	2	12	446531	446542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12002	NC_015666	CAGT	2	8	446551	446558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12003	NC_015666	CCCT	2	8	446594	446601	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12004	NC_015666	CCGC	2	8	446614	446621	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12005	NC_015666	TCC	2	6	446641	446646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12006	NC_015666	GCC	2	6	446704	446709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_015666	GTC	2	6	446812	446817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12008	NC_015666	CTC	2	6	446827	446832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252539
12009	NC_015666	GGC	2	6	446847	446852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12010	NC_015666	GACG	2	8	446865	446872	25 %	0 %	50 %	25 %	336252539
12011	NC_015666	TCGC	2	8	446881	446888	0 %	25 %	25 %	50 %	336252539
12012	NC_015666	GC	3	6	446903	446908	0 %	0 %	50 %	50 %	336252539
12013	NC_015666	CGA	2	6	446991	446996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12014	NC_015666	CCG	2	6	447032	447037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252539
12015	NC_015666	ACG	2	6	447068	447073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12016	NC_015666	GAC	2	6	447118	447123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12017	NC_015666	ACG	2	6	447163	447168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12018	NC_015666	GCGAC	2	10	447182	447191	20 %	0 %	40 %	40 %	336252539
12019	NC_015666	GC	3	6	447204	447209	0 %	0 %	50 %	50 %	336252539
12020	NC_015666	GCG	2	6	447234	447239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12021	NC_015666	TTCG	2	8	447240	447247	0 %	50 %	25 %	25 %	336252539
12022	NC_015666	CGT	2	6	447261	447266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12023	NC_015666	TCG	2	6	447293	447298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12024	NC_015666	GAC	2	6	447307	447312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12025	NC_015666	TCC	2	6	447320	447325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252539
12026	NC_015666	CGA	2	6	447357	447362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12027	NC_015666	GCT	2	6	447372	447377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12028	NC_015666	CGG	2	6	447389	447394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12029	NC_015666	GCG	2	6	447432	447437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12030	NC_015666	GGCGG	2	10	447455	447464	0 %	0 %	80 %	20 %	336252539
12031	NC_015666	TCA	2	6	447476	447481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252539
12032	NC_015666	GTG	2	6	447499	447504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252539
12033	NC_015666	CGG	2	6	447510	447515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12034	NC_015666	CGT	2	6	447549	447554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12035	NC_015666	CGAC	2	8	447591	447598	25 %	0 %	25 %	50 %	336252539
12036	NC_015666	CGA	2	6	447602	447607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12037	NC_015666	AGCG	2	8	447663	447670	25 %	0 %	50 %	25 %	336252539
12038	NC_015666	GAC	2	6	447706	447711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12039	NC_015666	GGC	2	6	447762	447767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12040	NC_015666	CTC	2	6	447805	447810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252539
12041	NC_015666	GAG	2	6	447817	447822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252539
12042	NC_015666	TCC	2	6	447827	447832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252539
12043	NC_015666	CGG	2	6	447849	447854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252539
12044	NC_015666	CAG	2	6	447865	447870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12045	NC_015666	GTC	2	6	447874	447879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12046	NC_015666	GTC	2	6	447916	447921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12047	NC_015666	GAC	2	6	447937	447942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252539
12048	NC_015666	CGC	2	6	448005	448010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252539
12049	NC_015666	GAC	3	9	448056	448064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12050	NC_015666	GCCGAA	2	12	448076	448087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_015666	CCG	2	6	448100	448105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_015666	CGG	2	6	448110	448115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_015666	CCCGTA	2	12	448158	448169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12054	NC_015666	CCCA	2	8	448170	448177	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12055	NC_015666	ACG	2	6	448207	448212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12056	NC_015666	CGA	2	6	448223	448228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12057	NC_015666	TCG	2	6	448232	448237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12058	NC_015666	CGG	2	6	448260	448265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252540
12059	NC_015666	GCG	2	6	448289	448294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252540
12060	NC_015666	GACG	2	8	448302	448309	25 %	0 %	50 %	25 %	336252540
12061	NC_015666	CGAA	2	8	448322	448329	50 %	0 %	25 %	25 %	336252540
12062	NC_015666	GC	3	6	448343	448348	0 %	0 %	50 %	50 %	336252540
12063	NC_015666	CGT	2	6	448359	448364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12064	NC_015666	CAG	2	6	448372	448377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12065	NC_015666	GC	3	6	448404	448409	0 %	0 %	50 %	50 %	336252540
12066	NC_015666	CGC	2	6	448413	448418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252540
12067	NC_015666	AAC	2	6	448438	448443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252540
12068	NC_015666	GGC	2	6	448452	448457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252540
12069	NC_015666	ATC	2	6	448459	448464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252540
12070	NC_015666	CGA	2	6	448478	448483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12071	NC_015666	GCG	2	6	448509	448514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252540
12072	NC_015666	ACG	2	6	448556	448561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12073	NC_015666	CG	3	6	448570	448575	0 %	0 %	50 %	50 %	336252540
12074	NC_015666	CCG	2	6	448637	448642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252540
12075	NC_015666	CGCGA	2	10	448687	448696	20 %	0 %	40 %	40 %	336252540
12076	NC_015666	CG	3	6	448752	448757	0 %	0 %	50 %	50 %	336252540
12077	NC_015666	GCCG	2	8	448777	448784	0 %	0 %	50 %	50 %	336252540
12078	NC_015666	CCG	2	6	448813	448818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252540
12079	NC_015666	TCGACG	2	12	448820	448831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252540
12080	NC_015666	GCG	2	6	448894	448899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252540
12081	NC_015666	T	6	6	449001	449006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_015666	AGC	2	6	449036	449041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252541
12083	NC_015666	TCG	2	6	449057	449062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252541
12084	NC_015666	AGC	2	6	449063	449068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252541
12085	NC_015666	CGC	2	6	449081	449086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252541
12086	NC_015666	GCTCGC	2	12	449223	449234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252541
12087	NC_015666	CTCG	2	8	449238	449245	0 %	25 %	25 %	50 %	336252541
12088	NC_015666	GGCGA	2	10	449257	449266	20 %	0 %	60 %	20 %	336252541
12089	NC_015666	GAG	2	6	449269	449274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252541
12090	NC_015666	GAG	2	6	449290	449295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252541
12091	NC_015666	GCG	2	6	449347	449352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12092	NC_015666	CGC	2	6	449409	449414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252542
12093	NC_015666	CGG	2	6	449439	449444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252542
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12097	NC_015666	CGA	3	9	449537	449545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12098	NC_015666	CG	4	8	449550	449557	0 %	0 %	50 %	50 %	336252542
12099	NC_015666	CGG	2	6	449576	449581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252542
12100	NC_015666	CGA	2	6	449669	449674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12101	NC_015666	CG	3	6	449691	449696	0 %	0 %	50 %	50 %	336252542
12102	NC_015666	TCGCG	2	10	449739	449748	0 %	20 %	40 %	40 %	336252542
12103	NC_015666	CGG	2	6	449753	449758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252542
12104	NC_015666	CGA	2	6	449825	449830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12105	NC_015666	GAG	2	6	449841	449846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252542
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12107	NC_015666	TCA	2	6	449915	449920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252542
12108	NC_015666	CG	3	6	449926	449931	0 %	0 %	50 %	50 %	336252542
12109	NC_015666	GC	3	6	449936	449941	0 %	0 %	50 %	50 %	336252542
12110	NC_015666	GATC	2	8	450020	450027	25 %	25 %	25 %	25 %	336252542
12111	NC_015666	GTG	2	6	450048	450053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252542
12112	NC_015666	CGC	2	6	450138	450143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252542
12113	NC_015666	TCG	2	6	450223	450228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12114	NC_015666	TGG	2	6	450229	450234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252542
12115	NC_015666	TGG	2	6	450268	450273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252542
12116	NC_015666	CGT	2	6	450293	450298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12117	NC_015666	GCC	2	6	450307	450312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252542
12118	NC_015666	CGT	2	6	450335	450340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12119	NC_015666	CCGC	2	8	450359	450366	0 %	0 %	25 %	75 %	336252542
12120	NC_015666	GGT	2	6	450374	450379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252542
12121	NC_015666	CAG	2	6	450486	450491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12122	NC_015666	TCG	2	6	450542	450547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252542
12123	NC_015666	CGT	2	6	450560	450565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_015666	TCGT	2	8	450587	450594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12125	NC_015666	GTC	2	6	450611	450616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12126	NC_015666	CGCT	2	8	450623	450630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12127	NC_015666	TCGA	2	8	450724	450731	25 %	25 %	25 %	25 %	336252543
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12145	NC_015666	CGAA	2	8	451320	451327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12146	NC_015666	CGG	2	6	451330	451335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12147	NC_015666	CG	3	6	451346	451351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12148	NC_015666	CCACGA	2	12	451382	451393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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12151	NC_015666	TCCA	2	8	451465	451472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12228	NC_015666	CCGG	2	8	454376	454383	0 %	0 %	50 %	50 %	336252546
12229	NC_015666	TCG	2	6	454405	454410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252546
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12231	NC_015666	CGC	2	6	454495	454500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12232	NC_015666	TCG	2	6	454507	454512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12233	NC_015666	GTA	2	6	454571	454576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_015666	CTC	2	6	454589	454594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12235	NC_015666	TC	3	6	454656	454661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12236	NC_015666	TA	3	6	454741	454746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12237	NC_015666	GAA	2	6	454773	454778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12238	NC_015666	ATC	2	6	454805	454810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12239	NC_015666	CGA	2	6	454831	454836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12240	NC_015666	CCG	2	6	454853	454858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12241	NC_015666	CGA	2	6	454936	454941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252547
12242	NC_015666	TCA	2	6	454974	454979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252547
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12244	NC_015666	GAG	2	6	454997	455002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252547
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12323	NC_015666	GCGG	2	8	458288	458295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12324	NC_015666	AGCG	2	8	458411	458418	25 %	0 %	50 %	25 %	336252550
12325	NC_015666	AGTC	2	8	458422	458429	25 %	25 %	25 %	25 %	336252550
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12342	NC_015666	CCG	2	6	458950	458955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252550
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12347	NC_015666	GAC	2	6	459107	459112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252550
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12351	NC_015666	TGG	2	6	459275	459280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252550
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12477	NC_015666	GCG	2	6	463035	463040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252552
12478	NC_015666	GCCG	2	8	463049	463056	0 %	0 %	50 %	50 %	336252552
12479	NC_015666	CCGACG	2	12	463060	463071	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252552
12480	NC_015666	CGG	2	6	463098	463103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252552
12481	NC_015666	GC	3	6	463107	463112	0 %	0 %	50 %	50 %	336252552
12482	NC_015666	CGC	2	6	463165	463170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252552
12483	NC_015666	GCGA	2	8	463217	463224	25 %	0 %	50 %	25 %	336252553
12484	NC_015666	CCG	2	6	463235	463240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12485	NC_015666	GGC	2	6	463243	463248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252553
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12490	NC_015666	CGC	2	6	463384	463389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252553
12491	NC_015666	CGGC	2	8	463395	463402	0 %	0 %	50 %	50 %	336252553
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