MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015666	CCA	2	6	428822	428827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252521
11502	NC_015666	GAG	2	6	428853	428858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252521
11503	NC_015666	GAG	2	6	428877	428882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252521
11504	NC_015666	GATC	2	8	428900	428907	25 %	25 %	25 %	25 %	336252521
11505	NC_015666	CGG	2	6	428920	428925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252521
11506	NC_015666	GTC	2	6	429011	429016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252522
11507	NC_015666	TCG	3	9	429030	429038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252522
11508	NC_015666	CGG	2	6	429074	429079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252522
11509	NC_015666	CTC	2	6	429194	429199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252522
11510	NC_015666	TGCTCG	2	12	429207	429218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252522
11511	NC_015666	TCG	2	6	429271	429276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_015666	TCT	2	6	429277	429282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_015666	CGT	2	6	429283	429288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_015666	ACAG	2	8	429385	429392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_015666	CGT	2	6	429442	429447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11516	NC_015666	TCG	2	6	429465	429470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11517	NC_015666	GCC	2	6	429509	429514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252523
11518	NC_015666	GGT	2	6	429530	429535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252523
11519	NC_015666	CGA	2	6	429628	429633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11520	NC_015666	TCC	2	6	429636	429641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252523
11521	NC_015666	CGA	2	6	429682	429687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11522	NC_015666	GAC	2	6	429740	429745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11523	NC_015666	GCG	2	6	429781	429786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252523
11524	NC_015666	CGT	2	6	429862	429867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11525	NC_015666	CGC	2	6	429877	429882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252523
11526	NC_015666	CGG	2	6	429944	429949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252523
11527	NC_015666	GGA	2	6	429973	429978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252523
11528	NC_015666	GGT	2	6	430000	430005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252523
11529	NC_015666	CGT	2	6	430117	430122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11530	NC_015666	CGTGGA	2	12	430144	430155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252523
11531	NC_015666	GCGG	2	8	430162	430169	0 %	0 %	75 %	25 %	336252523
11532	NC_015666	CCT	2	6	430210	430215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252523
11533	NC_015666	GCTCG	2	10	430241	430250	0 %	20 %	40 %	40 %	336252523
11534	NC_015666	GTC	2	6	430253	430258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11535	NC_015666	GCC	2	6	430295	430300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252523
11536	NC_015666	TCG	2	6	430308	430313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11537	NC_015666	TGG	2	6	430323	430328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252523
11538	NC_015666	CG	3	6	430329	430334	0 %	0 %	50 %	50 %	336252523
11539	NC_015666	CGA	2	6	430378	430383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11540	NC_015666	GCG	2	6	430387	430392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252523
11541	NC_015666	GCG	2	6	430417	430422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252523
11542	NC_015666	TCG	2	6	430428	430433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11543	NC_015666	GTC	2	6	430439	430444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252523
11544	NC_015666	CCG	2	6	430470	430475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252523
11545	NC_015666	GCG	2	6	430476	430481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252523
11546	NC_015666	CGC	2	6	430483	430488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252523
11547	NC_015666	AG	3	6	430499	430504	50 %	0 %	50 %	0 %	336252523
11548	NC_015666	GT	3	6	430582	430587	0 %	50 %	50 %	0 %	336252523
11549	NC_015666	GA	3	6	430689	430694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_015666	CGA	2	6	430708	430713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_015666	GGAC	2	8	430721	430728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_015666	CGG	2	6	430739	430744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_015666	CGG	2	6	430797	430802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252524
11554	NC_015666	CGA	2	6	430899	430904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11555	NC_015666	CGA	2	6	430923	430928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11556	NC_015666	CGT	2	6	430950	430955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11557	NC_015666	CGA	2	6	430965	430970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11558	NC_015666	GTC	2	6	430997	431002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11559	NC_015666	GC	3	6	431004	431009	0 %	0 %	50 %	50 %	336252524
11560	NC_015666	CTT	2	6	431058	431063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252524
11561	NC_015666	GAC	2	6	431113	431118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11562	NC_015666	TGG	2	6	431132	431137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252524
11563	NC_015666	CGC	2	6	431143	431148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
11564	NC_015666	CGG	2	6	431169	431174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252524
11565	NC_015666	GTC	2	6	431293	431298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11566	NC_015666	CGA	2	6	431358	431363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11567	NC_015666	CGTC	2	8	431415	431422	0 %	25 %	25 %	50 %	336252524
11568	NC_015666	GCC	2	6	431437	431442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
11569	NC_015666	CGG	3	9	431445	431453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252524
11570	NC_015666	CGA	2	6	431472	431477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11571	NC_015666	GCCGTC	2	12	431485	431496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252524
11572	NC_015666	CGAACT	2	12	431529	431540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252524
11573	NC_015666	GTC	3	9	431584	431592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11574	NC_015666	TCGAG	2	10	431607	431616	20 %	20 %	40 %	20 %	336252524
11575	NC_015666	CGA	3	9	431691	431699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11576	NC_015666	AGCGCC	2	12	431723	431734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252524
11577	NC_015666	TCG	2	6	431756	431761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11578	NC_015666	CGA	2	6	431805	431810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11579	NC_015666	CGC	2	6	431850	431855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
11580	NC_015666	CGC	2	6	431943	431948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
11581	NC_015666	CGA	2	6	431961	431966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11582	NC_015666	CGT	2	6	431967	431972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11583	NC_015666	GTCG	2	8	432058	432065	0 %	25 %	50 %	25 %	336252524
11584	NC_015666	CAGG	2	8	432103	432110	25 %	0 %	50 %	25 %	336252524
11585	NC_015666	GCC	2	6	432112	432117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
11586	NC_015666	CGA	2	6	432132	432137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11587	NC_015666	GGCC	2	8	432159	432166	0 %	0 %	50 %	50 %	336252524
11588	NC_015666	GCCGG	2	10	432188	432197	0 %	0 %	60 %	40 %	336252524
11589	NC_015666	GGT	2	6	432223	432228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252524
11590	NC_015666	CGA	2	6	432237	432242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
11591	NC_015666	TCC	2	6	432255	432260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_015666	GATTCG	2	12	432265	432276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11593	NC_015666	GGT	2	6	432282	432287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_015666	AT	3	6	432304	432309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_015666	TAG	2	6	432334	432339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252525
11596	NC_015666	CG	3	6	432380	432385	0 %	0 %	50 %	50 %	336252525
11597	NC_015666	GGT	2	6	432408	432413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252525
11598	NC_015666	CGACAG	2	12	432418	432429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11599	NC_015666	TCGA	2	8	432449	432456	25 %	25 %	25 %	25 %	336252525
11600	NC_015666	CGA	2	6	432474	432479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11601	NC_015666	TGA	2	6	432534	432539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252525
11602	NC_015666	CGC	2	6	432555	432560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252525
11603	NC_015666	GAG	2	6	432659	432664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252525
11604	NC_015666	GCA	2	6	432669	432674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11605	NC_015666	TCG	2	6	432683	432688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11606	NC_015666	GTCG	2	8	432721	432728	0 %	25 %	50 %	25 %	336252525
11607	NC_015666	TGT	2	6	432744	432749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252525
11608	NC_015666	AGT	2	6	432750	432755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252525
11609	NC_015666	TCG	2	6	432770	432775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11610	NC_015666	TCG	2	6	432782	432787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11611	NC_015666	CGA	2	6	432825	432830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11612	NC_015666	ATG	2	6	432839	432844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252525
11613	NC_015666	CTC	2	6	432874	432879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252525
11614	NC_015666	CG	3	6	432900	432905	0 %	0 %	50 %	50 %	336252525
11615	NC_015666	CGA	2	6	432909	432914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11616	NC_015666	TCG	2	6	432932	432937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252525
11617	NC_015666	TGG	2	6	432938	432943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252525
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11619	NC_015666	TCGAC	2	10	432966	432975	20 %	20 %	20 %	40 %	336252525
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