MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015666	CTTCT	2	10	372839	372848	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10002	NC_015666	ACG	2	6	372983	372988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_015666	TCGAA	2	10	372993	373002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10004	NC_015666	CCG	2	6	373027	373032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_015666	TCG	2	6	373096	373101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10006	NC_015666	CCG	2	6	373128	373133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252472
10007	NC_015666	ACG	2	6	373156	373161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10008	NC_015666	CCT	2	6	373169	373174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252472
10009	NC_015666	CGG	2	6	373202	373207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252472
10010	NC_015666	CGA	2	6	373250	373255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10011	NC_015666	GCG	2	6	373266	373271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252472
10012	NC_015666	CGC	2	6	373292	373297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252472
10013	NC_015666	TCG	2	6	373315	373320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10014	NC_015666	CAG	2	6	373323	373328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10015	NC_015666	GCC	3	9	373341	373349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252472
10016	NC_015666	TCG	2	6	373354	373359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10017	NC_015666	CG	3	6	373391	373396	0 %	0 %	50 %	50 %	336252472
10018	NC_015666	CTG	2	6	373398	373403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10019	NC_015666	TCG	2	6	373456	373461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10020	NC_015666	CGAC	2	8	373504	373511	25 %	0 %	25 %	50 %	336252472
10021	NC_015666	CTG	2	6	373524	373529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10022	NC_015666	CGT	2	6	373546	373551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10023	NC_015666	CCG	2	6	373574	373579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252472
10024	NC_015666	CGG	2	6	373628	373633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252472
10025	NC_015666	CCT	2	6	373637	373642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252472
10026	NC_015666	GACC	2	8	373694	373701	25 %	0 %	25 %	50 %	336252472
10027	NC_015666	GC	3	6	373714	373719	0 %	0 %	50 %	50 %	336252472
10028	NC_015666	GCGCGA	2	12	373738	373749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252472
10029	NC_015666	CTG	2	6	373758	373763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10030	NC_015666	CGC	2	6	373832	373837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252472
10031	NC_015666	GTC	2	6	373839	373844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10032	NC_015666	GGCT	2	8	373845	373852	0 %	25 %	50 %	25 %	336252472
10033	NC_015666	GTC	2	6	373866	373871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10034	NC_015666	GTTCGG	2	12	373886	373897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336252472
10035	NC_015666	TCG	3	9	373903	373911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252472
10036	NC_015666	TCC	2	6	373915	373920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252472
10037	NC_015666	GCG	2	6	373928	373933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252472
10038	NC_015666	GAG	2	6	373944	373949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252472
10039	NC_015666	GGTG	2	8	373966	373973	0 %	25 %	75 %	0 %	336252472
10040	NC_015666	CGG	2	6	373986	373991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015666	CGCAAC	2	12	374013	374024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_015666	CCG	2	6	374030	374035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_015666	GCG	2	6	374079	374084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252473
10044	NC_015666	CCG	2	6	374113	374118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252473
10045	NC_015666	CGG	2	6	374123	374128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252473
10046	NC_015666	GGA	2	6	374161	374166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252473
10047	NC_015666	C	6	6	374182	374187	0 %	0 %	0 %	100 %	336252473
10048	NC_015666	TCG	2	6	374218	374223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252473
10049	NC_015666	CGCT	2	8	374228	374235	0 %	25 %	25 %	50 %	336252473
10050	NC_015666	GGT	2	6	374242	374247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252473
10051	NC_015666	CGC	2	6	374251	374256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252473
10052	NC_015666	GCCC	2	8	374267	374274	0 %	0 %	25 %	75 %	336252473
10053	NC_015666	CCG	2	6	374306	374311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252473
10054	NC_015666	CG	3	6	374314	374319	0 %	0 %	50 %	50 %	336252473
10055	NC_015666	AT	3	6	374379	374384	50 %	50 %	0 %	0 %	336252473
10056	NC_015666	CGA	2	6	374472	374477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_015666	GCAG	2	8	374494	374501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_015666	CA	3	6	374513	374518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_015666	CGG	2	6	374595	374600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_015666	GCG	2	6	374697	374702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_015666	GTGCGG	2	12	374710	374721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10062	NC_015666	CGA	2	6	374772	374777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10063	NC_015666	CGGT	2	8	374779	374786	0 %	25 %	50 %	25 %	336252474
10064	NC_015666	GCC	2	6	374792	374797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10065	NC_015666	GCC	2	6	374801	374806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10066	NC_015666	GTA	2	6	374831	374836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252474
10067	NC_015666	TCG	2	6	374857	374862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10068	NC_015666	CGA	2	6	374902	374907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10069	NC_015666	TCCTCG	2	12	374916	374927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252474
10070	NC_015666	CGC	2	6	374942	374947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10071	NC_015666	CCGT	2	8	374985	374992	0 %	25 %	25 %	50 %	336252474
10072	NC_015666	CGG	2	6	375022	375027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10073	NC_015666	GCG	2	6	375031	375036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10074	NC_015666	ATC	2	6	375093	375098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252474
10075	NC_015666	TCC	2	6	375180	375185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252474
10076	NC_015666	CAG	2	6	375212	375217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10077	NC_015666	GAC	2	6	375224	375229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10078	NC_015666	CGC	4	12	375256	375267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10079	NC_015666	TCG	2	6	375291	375296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10080	NC_015666	AAG	2	6	375297	375302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252474
10081	NC_015666	CGG	2	6	375464	375469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10082	NC_015666	CAG	2	6	375476	375481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10083	NC_015666	CGGC	2	8	375487	375494	0 %	0 %	50 %	50 %	336252474
10084	NC_015666	GCC	2	6	375581	375586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10085	NC_015666	CGT	2	6	375589	375594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10086	NC_015666	CGA	2	6	375616	375621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10087	NC_015666	ATC	2	6	375687	375692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252474
10088	NC_015666	CGG	2	6	375707	375712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10089	NC_015666	TCC	2	6	375717	375722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252474
10090	NC_015666	TCG	2	6	375723	375728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10091	NC_015666	CCG	2	6	375749	375754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10092	NC_015666	CCT	2	6	375772	375777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252474
10093	NC_015666	CGA	2	6	375802	375807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10094	NC_015666	TCG	2	6	375819	375824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10095	NC_015666	CGT	2	6	375844	375849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10096	NC_015666	GGA	2	6	375880	375885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252474
10097	NC_015666	TCG	2	6	375903	375908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10098	NC_015666	CGATCT	2	12	375916	375927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252474
10099	NC_015666	GAC	2	6	375946	375951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10100	NC_015666	CGC	2	6	375986	375991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
10101	NC_015666	GATGAC	2	12	375992	376003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252474
10102	NC_015666	CG	3	6	376009	376014	0 %	0 %	50 %	50 %	336252474
10103	NC_015666	CAT	2	6	376028	376033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252474
10104	NC_015666	CGA	2	6	376048	376053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10105	NC_015666	TCC	2	6	376080	376085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252474
10106	NC_015666	TCG	2	6	376110	376115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10107	NC_015666	GAT	2	6	376121	376126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252474
10108	NC_015666	CTC	2	6	376136	376141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252474
10109	NC_015666	CTG	2	6	376169	376174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10110	NC_015666	GTA	2	6	376187	376192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252474
10111	NC_015666	GAT	2	6	376199	376204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252474
10112	NC_015666	GAA	2	6	376223	376228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252474
10113	NC_015666	AGC	2	6	376263	376268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252474
10114	NC_015666	CGG	2	6	376283	376288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10115	NC_015666	AGG	2	6	376296	376301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252474
10116	NC_015666	GCG	2	6	376309	376314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252474
10117	NC_015666	CTT	2	6	376328	376333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252474
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10119	NC_015666	GCC	3	9	376424	376432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252474
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10359	NC_015666	CGA	2	6	385598	385603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252481
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10361	NC_015666	GTC	2	6	385623	385628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252481
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10369	NC_015666	GCG	2	6	385879	385884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10465	NC_015666	GCT	2	6	389091	389096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10467	NC_015666	GCG	2	6	389192	389197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252486
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10470	NC_015666	CG	3	6	389227	389232	0 %	0 %	50 %	50 %	336252486
10471	NC_015666	CGT	2	6	389259	389264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252486
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10478	NC_015666	CGG	2	6	389614	389619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252486
10479	NC_015666	ACT	2	6	389621	389626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252486
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10481	NC_015666	CGG	2	6	389748	389753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252486
10482	NC_015666	GTC	2	6	389761	389766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252486
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