MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_015666	CTG	2	6	3600776	3600781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101002	NC_015666	CGT	2	6	3600805	3600810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101003	NC_015666	G	6	6	3600857	3600862	0 %	0 %	100 %	0 %	336255612
101004	NC_015666	CGGA	2	8	3600917	3600924	25 %	0 %	50 %	25 %	336255612
101005	NC_015666	CG	3	6	3600934	3600939	0 %	0 %	50 %	50 %	336255612
101006	NC_015666	CGA	2	6	3600952	3600957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101007	NC_015666	GAG	3	9	3601049	3601057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255612
101008	NC_015666	ACG	2	6	3601089	3601094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101009	NC_015666	GAC	3	9	3601118	3601126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101010	NC_015666	CCG	2	6	3601150	3601155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255612
101011	NC_015666	CGAAG	2	10	3601255	3601264	40 %	0 %	40 %	20 %	336255612
101012	NC_015666	CTG	2	6	3601286	3601291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101013	NC_015666	CCA	2	6	3601327	3601332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336255612
101014	NC_015666	CGG	2	6	3601420	3601425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255612
101015	NC_015666	GGCGCG	2	12	3601487	3601498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255612
101016	NC_015666	GCG	2	6	3601510	3601515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255612
101017	NC_015666	AGCG	2	8	3601521	3601528	25 %	0 %	50 %	25 %	336255612
101018	NC_015666	GCGA	2	8	3601584	3601591	25 %	0 %	50 %	25 %	336255612
101019	NC_015666	GAC	2	6	3601598	3601603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255612
101020	NC_015666	ACT	2	6	3601622	3601627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101021	NC_015666	TCGG	2	8	3601705	3601712	0 %	25 %	50 %	25 %	336255613
101022	NC_015666	CGA	2	6	3601725	3601730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101023	NC_015666	CGG	2	6	3601743	3601748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255613
101024	NC_015666	ACGA	2	8	3601764	3601771	50 %	0 %	25 %	25 %	336255613
101025	NC_015666	CCG	2	6	3601777	3601782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255613
101026	NC_015666	CGA	2	6	3601787	3601792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101027	NC_015666	CGA	2	6	3601806	3601811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101028	NC_015666	AGG	2	6	3601838	3601843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255613
101029	NC_015666	CAA	2	6	3601849	3601854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336255613
101030	NC_015666	CG	3	6	3601863	3601868	0 %	0 %	50 %	50 %	336255613
101031	NC_015666	CGT	2	6	3602013	3602018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101032	NC_015666	CGC	2	6	3602045	3602050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255613
101033	NC_015666	TCG	2	6	3602051	3602056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101034	NC_015666	AGCG	2	8	3602065	3602072	25 %	0 %	50 %	25 %	336255613
101035	NC_015666	ACG	2	6	3602127	3602132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255613
101036	NC_015666	CGT	2	6	3602154	3602159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101037	NC_015666	CG	3	6	3602171	3602176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101038	NC_015666	CAGT	2	8	3602188	3602195	25 %	25 %	25 %	25 %	336255614
101039	NC_015666	GC	3	6	3602250	3602255	0 %	0 %	50 %	50 %	336255614
101040	NC_015666	TCG	2	6	3602264	3602269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101041	NC_015666	CGA	2	6	3602349	3602354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101042	NC_015666	TCG	2	6	3602369	3602374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101043	NC_015666	CAG	2	6	3602380	3602385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101044	NC_015666	GAC	2	6	3602434	3602439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101045	NC_015666	GAGATC	2	12	3602443	3602454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336255614
101046	NC_015666	GTA	2	6	3602485	3602490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255614
101047	NC_015666	GTC	2	6	3602533	3602538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101048	NC_015666	CTC	2	6	3602545	3602550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255614
101049	NC_015666	CCGA	2	8	3602564	3602571	25 %	0 %	25 %	50 %	336255614
101050	NC_015666	GCC	3	9	3602593	3602601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255614
101051	NC_015666	ATG	2	6	3602645	3602650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255614
101052	NC_015666	TCG	2	6	3602672	3602677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101053	NC_015666	ACG	2	6	3602678	3602683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101054	NC_015666	CGAC	2	8	3602697	3602704	25 %	0 %	25 %	50 %	336255614
101055	NC_015666	CG	4	8	3602734	3602741	0 %	0 %	50 %	50 %	336255614
101056	NC_015666	CGC	2	6	3602791	3602796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255614
101057	NC_015666	CCT	2	6	3602811	3602816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255614
101058	NC_015666	TCG	3	9	3602837	3602845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101059	NC_015666	TCGG	2	8	3602850	3602857	0 %	25 %	50 %	25 %	336255614
101060	NC_015666	GCA	2	6	3602877	3602882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101061	NC_015666	CGA	2	6	3602898	3602903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101062	NC_015666	CGG	2	6	3602913	3602918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255614
101063	NC_015666	GTC	2	6	3602944	3602949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101064	NC_015666	CGA	2	6	3602979	3602984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101065	NC_015666	CTC	2	6	3602989	3602994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255614
101066	NC_015666	CGT	2	6	3603007	3603012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101067	NC_015666	TCG	2	6	3603015	3603020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101068	NC_015666	CGA	2	6	3603027	3603032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101069	NC_015666	CGG	2	6	3603045	3603050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255614
101070	NC_015666	CCG	2	6	3603060	3603065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255614
101071	NC_015666	CG	3	6	3603064	3603069	0 %	0 %	50 %	50 %	336255614
101072	NC_015666	CTC	2	6	3603070	3603075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255614
101073	NC_015666	CGG	2	6	3603079	3603084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255614
101074	NC_015666	GGTC	2	8	3603108	3603115	0 %	25 %	50 %	25 %	336255614
101075	NC_015666	CG	4	8	3603153	3603160	0 %	0 %	50 %	50 %	336255614
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101079	NC_015666	CGA	3	9	3603228	3603236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
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101081	NC_015666	CGC	2	6	3603303	3603308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255614
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101083	NC_015666	CAT	2	6	3603358	3603363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255614
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101086	NC_015666	TCG	2	6	3603438	3603443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101087	NC_015666	CGG	2	6	3603468	3603473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255614
101088	NC_015666	CGA	2	6	3603501	3603506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101089	NC_015666	CGCC	2	8	3603510	3603517	0 %	0 %	25 %	75 %	336255614
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101097	NC_015666	CGA	2	6	3603852	3603857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101098	NC_015666	CGT	2	6	3603888	3603893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255614
101099	NC_015666	CCT	2	6	3603911	3603916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101100	NC_015666	TGG	2	6	3603940	3603945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101101	NC_015666	GCCG	2	8	3603946	3603953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101102	NC_015666	CGC	2	6	3603989	3603994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101103	NC_015666	TAT	2	6	3604004	3604009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101104	NC_015666	AT	3	6	3604008	3604013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101105	NC_015666	GA	3	6	3604046	3604051	50 %	0 %	50 %	0 %	336255615
101106	NC_015666	CGC	3	9	3604114	3604122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255615
101107	NC_015666	CGA	2	6	3604154	3604159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101108	NC_015666	GGC	2	6	3604175	3604180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255615
101109	NC_015666	CGC	2	6	3604190	3604195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255615
101110	NC_015666	CGC	2	6	3604202	3604207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255615
101111	NC_015666	GAC	3	9	3604263	3604271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101112	NC_015666	GTCGC	2	10	3604294	3604303	0 %	20 %	40 %	40 %	336255615
101113	NC_015666	CGA	2	6	3604315	3604320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101114	NC_015666	GCTGT	2	10	3604331	3604340	0 %	40 %	40 %	20 %	336255615
101115	NC_015666	CTC	2	6	3604341	3604346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255615
101116	NC_015666	ACC	2	6	3604408	3604413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336255615
101117	NC_015666	CGA	2	6	3604447	3604452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101118	NC_015666	G	6	6	3604488	3604493	0 %	0 %	100 %	0 %	336255615
101119	NC_015666	CGT	2	6	3604541	3604546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101120	NC_015666	CTG	2	6	3604557	3604562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101121	NC_015666	CGA	2	6	3604580	3604585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101122	NC_015666	GACTAC	2	12	3604593	3604604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336255615
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101125	NC_015666	TCG	3	9	3604699	3604707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255615
101126	NC_015666	TCGC	2	8	3604717	3604724	0 %	25 %	25 %	50 %	336255615
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101128	NC_015666	CGG	2	6	3604738	3604743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255615
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101144	NC_015666	CCG	2	6	3605205	3605210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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101228	NC_015666	GCCG	2	8	3608365	3608372	0 %	0 %	50 %	50 %	336255620
101229	NC_015666	GTC	2	6	3608388	3608393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255620
101230	NC_015666	CTC	3	9	3608403	3608411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255620
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101233	NC_015666	CGA	2	6	3608561	3608566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255620
101234	NC_015666	CCG	2	6	3608580	3608585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255620
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101254	NC_015666	GCCG	2	8	3609651	3609658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101255	NC_015666	GCG	2	6	3609763	3609768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255622
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101326	NC_015666	GC	3	6	3612332	3612337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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101344	NC_015666	CG	3	6	3612985	3612990	0 %	0 %	50 %	50 %	336255627
101345	NC_015666	TCC	2	6	3613111	3613116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255627
101346	NC_015666	CGA	2	6	3613163	3613168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255627
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101461	NC_015666	CAC	2	6	3619231	3619236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336255637
101462	NC_015666	CA	3	6	3619294	3619299	50 %	0 %	0 %	50 %	336255637
101463	NC_015666	CGC	2	6	3619312	3619317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255637
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101492	NC_015666	GTC	3	9	3620501	3620509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255637
101493	NC_015666	ATC	2	6	3620594	3620599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255637
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101495	NC_015666	GCG	2	6	3620667	3620672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255638
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101499	NC_015666	ATGGGC	2	12	3620713	3620724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336255638
101500	NC_015666	GTC	2	6	3620731	3620736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255638

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