MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_015666	GTCG	2	8	3565854	3565861	0 %	25 %	50 %	25 %	336255579
100003	NC_015666	CTC	2	6	3565863	3565868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255579
100004	NC_015666	TCG	2	6	3565924	3565929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255579
100005	NC_015666	CG	3	6	3565933	3565938	0 %	0 %	50 %	50 %	336255579
100006	NC_015666	CCG	2	6	3565949	3565954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100007	NC_015666	TCG	2	6	3565988	3565993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100008	NC_015666	GCC	2	6	3565997	3566002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100009	NC_015666	CGG	2	6	3566021	3566026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100010	NC_015666	CGTC	2	8	3566102	3566109	0 %	25 %	25 %	50 %	336255580
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100012	NC_015666	CGT	2	6	3566214	3566219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255580
100013	NC_015666	CGT	2	6	3566236	3566241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255580
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100015	NC_015666	CGA	3	9	3566278	3566286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255580
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100017	NC_015666	AGC	2	6	3566414	3566419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255580
100018	NC_015666	CGA	2	6	3566428	3566433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255580
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100020	NC_015666	CGA	2	6	3566494	3566499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255580
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100023	NC_015666	ACCGGG	2	12	3566571	3566582	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336255580
100024	NC_015666	CG	3	6	3566650	3566655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100025	NC_015666	ACG	2	6	3566733	3566738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255581
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100032	NC_015666	CGC	2	6	3567001	3567006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255581
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100034	NC_015666	CGA	2	6	3567091	3567096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255581
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100038	NC_015666	CGT	2	6	3567269	3567274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100039	NC_015666	ATTC	2	8	3567287	3567294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100040	NC_015666	CG	3	6	3567401	3567406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100041	NC_015666	TAT	2	6	3567421	3567426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100042	NC_015666	GAG	2	6	3567495	3567500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255582
100043	NC_015666	ATCGGA	2	12	3567587	3567598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336255582
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100051	NC_015666	TCG	2	6	3567757	3567762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255582
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100053	NC_015666	CGA	2	6	3567905	3567910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255582
100054	NC_015666	GAG	2	6	3567927	3567932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255582
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100113	NC_015666	GCG	2	6	3569864	3569869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255583
100114	NC_015666	GCG	2	6	3569877	3569882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255583
100115	NC_015666	GCG	2	6	3569889	3569894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255583
100116	NC_015666	CGA	2	6	3569899	3569904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255583
100117	NC_015666	CTG	2	6	3569912	3569917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255583
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100142	NC_015666	CGA	2	6	3570427	3570432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255583
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100162	NC_015666	TTC	2	6	3570767	3570772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100163	NC_015666	GAC	2	6	3570792	3570797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100164	NC_015666	CGA	3	9	3570800	3570808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100165	NC_015666	TCG	2	6	3570834	3570839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100166	NC_015666	CGA	2	6	3570881	3570886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100167	NC_015666	CACC	2	8	3570950	3570957	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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100169	NC_015666	GT	3	6	3571017	3571022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100170	NC_015666	CGGT	2	8	3571045	3571052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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100173	NC_015666	CTG	2	6	3571172	3571177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255584
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100175	NC_015666	TCGCC	2	10	3571213	3571222	0 %	20 %	20 %	60 %	336255584
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100181	NC_015666	CAG	2	6	3571366	3571371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100182	NC_015666	GAT	2	6	3571396	3571401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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100184	NC_015666	CGTT	2	8	3571499	3571506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100185	NC_015666	ACG	2	6	3571557	3571562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255585
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100188	NC_015666	GAG	2	6	3571664	3571669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255585
100189	NC_015666	AAG	2	6	3571676	3571681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255585
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100198	NC_015666	CGG	2	6	3571891	3571896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100199	NC_015666	GGC	3	9	3571898	3571906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100200	NC_015666	CGGC	2	8	3571909	3571916	0 %	0 %	50 %	50 %	336255585
100201	NC_015666	GCC	2	6	3571917	3571922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255585
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100210	NC_015666	GCG	3	9	3572202	3572210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100211	NC_015666	CGG	2	6	3572253	3572258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
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100213	NC_015666	GGC	2	6	3572315	3572320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100214	NC_015666	CTG	2	6	3572333	3572338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255585
100215	NC_015666	CGAGCA	2	12	3572356	3572367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255585
100216	NC_015666	CGA	2	6	3572383	3572388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255585
100217	NC_015666	GCG	2	6	3572499	3572504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100218	NC_015666	GCGGCC	2	12	3572544	3572555	0 %	0 %	50 %	50 %	336255585
100219	NC_015666	GTC	2	6	3572582	3572587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255585
100220	NC_015666	GAA	2	6	3572606	3572611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255585
100221	NC_015666	CGG	2	6	3572644	3572649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255585
100222	NC_015666	CGA	2	6	3572650	3572655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255585
100223	NC_015666	GAAG	2	8	3572665	3572672	50 %	0 %	50 %	0 %	336255585
100224	NC_015666	CTT	2	6	3572674	3572679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336255585
100225	NC_015666	CGC	2	6	3572711	3572716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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100228	NC_015666	GTC	2	6	3572852	3572857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255586
100229	NC_015666	TAC	2	6	3572921	3572926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255586
100230	NC_015666	GCT	2	6	3572959	3572964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255586
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100341	NC_015666	CGA	2	6	3576519	3576524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255589
100342	NC_015666	GACGGC	2	12	3576541	3576552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336255589
100343	NC_015666	CTTC	2	8	3576561	3576568	0 %	50 %	0 %	50 %	336255589
100344	NC_015666	GTC	2	6	3576581	3576586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255589
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100347	NC_015666	CGACGT	2	12	3576615	3576626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336255589
100348	NC_015666	CGT	2	6	3576633	3576638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255589
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100354	NC_015666	GAC	2	6	3576840	3576845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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