MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015666	GTCG	2	8	18334	18341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_015666	CGC	2	6	18360	18365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_015666	CGA	2	6	18388	18393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015666	C	6	6	18439	18444	0 %	0 %	0 %	100 %	336252113
505	NC_015666	GAG	2	6	18447	18452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252113
506	NC_015666	TCA	2	6	18463	18468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252113
507	NC_015666	CG	3	6	18500	18505	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
508	NC_015666	GCC	2	6	18510	18515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252113
509	NC_015666	GC	3	6	18523	18528	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
510	NC_015666	GTC	2	6	18531	18536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252113
511	NC_015666	GAG	2	6	18576	18581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252113
512	NC_015666	CG	3	6	18585	18590	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
513	NC_015666	CGG	2	6	18593	18598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
514	NC_015666	CGT	2	6	18611	18616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252113
515	NC_015666	CGA	2	6	18635	18640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252113
516	NC_015666	GAG	2	6	18666	18671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252113
517	NC_015666	CGG	2	6	18677	18682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
518	NC_015666	GCC	2	6	18705	18710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252113
519	NC_015666	GCT	2	6	18785	18790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252113
520	NC_015666	GCTC	2	8	18796	18803	0 %	25 %	25 %	50 %	336252113
521	NC_015666	CGG	3	9	18830	18838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
522	NC_015666	CCGA	2	8	18868	18875	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
523	NC_015666	GAG	3	9	18954	18962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252113
524	NC_015666	GGC	2	6	19046	19051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
525	NC_015666	CG	3	6	19088	19093	0 %	0 %	50 %	50 %	336252113
526	NC_015666	TCC	2	6	19099	19104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252113
527	NC_015666	CGG	2	6	19145	19150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
528	NC_015666	GGC	2	6	19152	19157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
529	NC_015666	TCGG	2	8	19174	19181	0 %	25 %	50 %	25 %	336252113
530	NC_015666	TCG	2	6	19222	19227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252113
531	NC_015666	CAG	2	6	19233	19238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252113
532	NC_015666	GCC	2	6	19247	19252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252113
533	NC_015666	CGA	2	6	19271	19276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252113
534	NC_015666	CCGA	2	8	19278	19285	25 %	0 %	25 %	50 %	336252113
535	NC_015666	GAA	2	6	19293	19298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252113
536	NC_015666	CGG	2	6	19301	19306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252113
537	NC_015666	CGAGT	2	10	19325	19334	20 %	20 %	40 %	20 %	336252113
538	NC_015666	GTC	2	6	19377	19382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252113
539	NC_015666	CGC	2	6	19391	19396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252113
540	NC_015666	GGAA	2	8	19467	19474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015666	GGA	2	6	19642	19647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015666	TCG	2	6	19708	19713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
543	NC_015666	TCG	2	6	19724	19729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
544	NC_015666	TGA	2	6	19754	19759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252114
545	NC_015666	TGA	2	6	19787	19792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252114
546	NC_015666	CGT	2	6	19796	19801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
547	NC_015666	GAG	2	6	19815	19820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252114
548	NC_015666	CTTGGA	2	12	19830	19841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252114
549	NC_015666	CGA	2	6	19856	19861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
550	NC_015666	GCC	2	6	19881	19886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
551	NC_015666	GAC	2	6	19905	19910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
552	NC_015666	TCG	2	6	19918	19923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
553	NC_015666	GAG	2	6	19926	19931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252114
554	NC_015666	TTC	2	6	19932	19937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252114
555	NC_015666	CCG	2	6	19957	19962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
556	NC_015666	CAG	2	6	19982	19987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
557	NC_015666	GCT	2	6	20004	20009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
558	NC_015666	CGC	2	6	20063	20068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
559	NC_015666	GGA	2	6	20112	20117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252114
560	NC_015666	GCCG	2	8	20121	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
561	NC_015666	CGT	2	6	20168	20173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
562	NC_015666	CGG	2	6	20179	20184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
563	NC_015666	GCC	3	9	20196	20204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
564	NC_015666	GGCC	2	8	20225	20232	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
565	NC_015666	GAC	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
566	NC_015666	CGA	2	6	20268	20273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
567	NC_015666	CGC	3	9	20279	20287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
568	NC_015666	GGC	2	6	20289	20294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
569	NC_015666	GAC	2	6	20307	20312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
570	NC_015666	GTC	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
571	NC_015666	GAA	2	6	20328	20333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252114
572	NC_015666	CGC	2	6	20342	20347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
573	NC_015666	CCT	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252114
574	NC_015666	CGG	2	6	20456	20461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
575	NC_015666	CGG	2	6	20480	20485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
576	NC_015666	CGA	2	6	20513	20518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
577	NC_015666	CGA	2	6	20570	20575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
578	NC_015666	CG	3	6	20605	20610	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
579	NC_015666	TCG	2	6	20624	20629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
580	NC_015666	CCGG	2	8	20640	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
581	NC_015666	CTC	2	6	20727	20732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252114
582	NC_015666	CTC	2	6	20751	20756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252114
583	NC_015666	CGT	2	6	20844	20849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
584	NC_015666	GCC	2	6	20914	20919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
585	NC_015666	CGA	2	6	20928	20933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
586	NC_015666	GAGT	2	8	20947	20954	25 %	25 %	50 %	0 %	336252114
587	NC_015666	ACT	2	6	20961	20966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252114
588	NC_015666	GGT	2	6	21045	21050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252114
589	NC_015666	CGG	2	6	21056	21061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
590	NC_015666	ACG	2	6	21106	21111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
591	NC_015666	CCGG	2	8	21131	21138	0 %	0 %	50 %	50 %	336252114
592	NC_015666	CG	3	6	21157	21162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_015666	CG	3	6	21230	21235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_015666	CGA	2	6	21239	21244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015666	GAG	2	6	21263	21268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015666	ACGCAA	2	12	21269	21280	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015666	CGG	2	6	21323	21328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252115
598	NC_015666	TCG	2	6	21359	21364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252115
599	NC_015666	GCGA	2	8	21368	21375	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
600	NC_015666	TCG	2	6	21383	21388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252115
601	NC_015666	CGT	2	6	21408	21413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252115
602	NC_015666	GTC	2	6	21454	21459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252115
603	NC_015666	ACG	2	6	21536	21541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252115
604	NC_015666	CGAT	2	8	21560	21567	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
605	NC_015666	GAC	2	6	21643	21648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252115
606	NC_015666	CGGA	2	8	21724	21731	25 %	0 %	50 %	25 %	336252115
607	NC_015666	AGG	2	6	21737	21742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252115
608	NC_015666	ATCG	2	8	21769	21776	25 %	25 %	25 %	25 %	336252115
609	NC_015666	CGA	2	6	21792	21797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252115
610	NC_015666	CGA	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252115
611	NC_015666	ACG	2	6	21931	21936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252116
612	NC_015666	CGT	2	6	22016	22021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252116
613	NC_015666	CGG	2	6	22061	22066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252116
614	NC_015666	GC	3	6	22112	22117	0 %	0 %	50 %	50 %	336252116
615	NC_015666	CGCA	2	8	22123	22130	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
616	NC_015666	GTTC	2	8	22154	22161	0 %	50 %	25 %	25 %	336252116
617	NC_015666	GCC	2	6	22162	22167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252116
618	NC_015666	TCCG	2	8	22188	22195	0 %	25 %	25 %	50 %	336252116
619	NC_015666	TCGA	2	8	22249	22256	25 %	25 %	25 %	25 %	336252116
620	NC_015666	CGA	2	6	22283	22288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252116
621	NC_015666	GTT	2	6	22305	22310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252116
622	NC_015666	CGA	2	6	22316	22321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252116
623	NC_015666	CGA	2	6	22328	22333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252116
624	NC_015666	CGAC	2	8	22369	22376	25 %	0 %	25 %	50 %	336252116
625	NC_015666	GCC	2	6	22496	22501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252116
626	NC_015666	TCG	2	6	22543	22548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252116
627	NC_015666	GC	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	336252116
628	NC_015666	TGC	2	6	22600	22605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252116
629	NC_015666	TCG	2	6	22684	22689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252116
630	NC_015666	GTC	2	6	22690	22695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252116
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754	NC_015666	CGG	2	6	27575	27580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_015666	CGGCGC	2	12	27627	27638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
756	NC_015666	CGAC	2	8	27662	27669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
757	NC_015666	TCG	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252121
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