MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_015666	GACC	2	8	3319410	3319417	25 %	0 %	25 %	50 %	336255344
93002	NC_015666	CA	3	6	3319421	3319426	50 %	0 %	0 %	50 %	336255344
93003	NC_015666	CGA	2	6	3319473	3319478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93004	NC_015666	CGC	2	6	3319485	3319490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255344
93005	NC_015666	CGAC	2	8	3319496	3319503	25 %	0 %	25 %	50 %	336255344
93006	NC_015666	CTGG	2	8	3319524	3319531	0 %	25 %	50 %	25 %	336255344
93007	NC_015666	CGT	2	6	3319586	3319591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93008	NC_015666	CGT	2	6	3319625	3319630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93009	NC_015666	CGA	3	9	3319689	3319697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93010	NC_015666	CCGA	2	8	3319715	3319722	25 %	0 %	25 %	50 %	336255344
93011	NC_015666	TCG	2	6	3319760	3319765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93012	NC_015666	CGC	2	6	3319782	3319787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255344
93013	NC_015666	CGA	2	6	3319821	3319826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93014	NC_015666	GC	3	6	3319860	3319865	0 %	0 %	50 %	50 %	336255344
93015	NC_015666	GCC	2	6	3319867	3319872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255344
93016	NC_015666	GTC	2	6	3319905	3319910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93017	NC_015666	CG	3	6	3319930	3319935	0 %	0 %	50 %	50 %	336255344
93018	NC_015666	CGACG	2	10	3319944	3319953	20 %	0 %	40 %	40 %	336255344
93019	NC_015666	CGACT	2	10	3319966	3319975	20 %	20 %	20 %	40 %	336255344
93020	NC_015666	CCA	2	6	3320001	3320006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336255344
93021	NC_015666	CGT	2	6	3320013	3320018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93022	NC_015666	CGG	2	6	3320061	3320066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255344
93023	NC_015666	GAC	2	6	3320086	3320091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255344
93024	NC_015666	CGC	2	6	3320093	3320098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255344
93025	NC_015666	GAA	2	6	3320212	3320217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255344
93026	NC_015666	ACGG	2	8	3320218	3320225	25 %	0 %	50 %	25 %	336255344
93027	NC_015666	CGC	2	6	3320234	3320239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255344
93028	NC_015666	GGC	2	6	3320252	3320257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93029	NC_015666	CCG	2	6	3320272	3320277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93030	NC_015666	GTAG	2	8	3320305	3320312	25 %	25 %	50 %	0 %	336255345
93031	NC_015666	GAC	2	6	3320318	3320323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
93032	NC_015666	GCGCC	2	10	3320338	3320347	0 %	0 %	40 %	60 %	336255345
93033	NC_015666	CAT	2	6	3320378	3320383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255345
93034	NC_015666	GAC	2	6	3320393	3320398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
93035	NC_015666	TGA	2	6	3320461	3320466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255345
93036	NC_015666	CGA	2	6	3320470	3320475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
93037	NC_015666	TGT	2	6	3320494	3320499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336255345
93038	NC_015666	CGA	2	6	3320512	3320517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
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93040	NC_015666	CGC	2	6	3320567	3320572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255345
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93043	NC_015666	TGA	2	6	3320665	3320670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255345
93044	NC_015666	CGA	3	9	3320683	3320691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
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93046	NC_015666	GTA	2	6	3320789	3320794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255345
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93049	NC_015666	CGA	2	6	3320878	3320883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
93050	NC_015666	CGC	2	6	3320891	3320896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255345
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93053	NC_015666	TGA	2	6	3320953	3320958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255345
93054	NC_015666	CGA	2	6	3321004	3321009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
93055	NC_015666	GC	3	6	3321043	3321048	0 %	0 %	50 %	50 %	336255345
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93061	NC_015666	ACG	2	6	3321210	3321215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255345
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93064	NC_015666	GC	3	6	3321303	3321308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93065	NC_015666	GCA	2	6	3321332	3321337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93066	NC_015666	CCCA	2	8	3321350	3321357	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93067	NC_015666	CCG	2	6	3321366	3321371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93068	NC_015666	CGC	2	6	3321439	3321444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255346
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93071	NC_015666	CG	3	6	3321482	3321487	0 %	0 %	50 %	50 %	336255346
93072	NC_015666	CGA	2	6	3321512	3321517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255346
93073	NC_015666	GTC	2	6	3321603	3321608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255346
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93081	NC_015666	GTC	3	9	3321762	3321770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255346
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93085	NC_015666	CGA	2	6	3322084	3322089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255346
93086	NC_015666	CTC	2	6	3322110	3322115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255346
93087	NC_015666	GCGCT	2	10	3322182	3322191	0 %	20 %	40 %	40 %	336255346
93088	NC_015666	GAC	2	6	3322264	3322269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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93094	NC_015666	GCCG	2	8	3322455	3322462	0 %	0 %	50 %	50 %	336255347
93095	NC_015666	GACG	2	8	3322518	3322525	25 %	0 %	50 %	25 %	336255347
93096	NC_015666	CCGA	2	8	3322543	3322550	25 %	0 %	25 %	50 %	336255347
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93100	NC_015666	CGG	2	6	3322778	3322783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255347
93101	NC_015666	CCGGAA	2	12	3322804	3322815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255347
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93103	NC_015666	CGA	2	6	3322854	3322859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255347
93104	NC_015666	CCGAAT	2	12	3322865	3322876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336255347
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93106	NC_015666	CGA	2	6	3322947	3322952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255347
93107	NC_015666	GCC	2	6	3322960	3322965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255347
93108	NC_015666	CAGG	2	8	3323051	3323058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93109	NC_015666	GC	3	6	3323097	3323102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93110	NC_015666	GC	3	6	3323119	3323124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93111	NC_015666	CCGACG	2	12	3323166	3323177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93112	NC_015666	AGA	2	6	3323202	3323207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93113	NC_015666	CG	3	6	3323245	3323250	0 %	0 %	50 %	50 %	336255348
93114	NC_015666	ACG	2	6	3323256	3323261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255348
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93116	NC_015666	CGA	3	9	3323315	3323323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255348
93117	NC_015666	CGA	2	6	3323332	3323337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255348
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93199	NC_015666	CGA	2	6	3326108	3326113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255350
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93201	NC_015666	CGA	2	6	3326167	3326172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255350
93202	NC_015666	CG	4	8	3326245	3326252	0 %	0 %	50 %	50 %	336255350
93203	NC_015666	GCC	2	6	3326268	3326273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255350
93204	NC_015666	AGG	2	6	3326276	3326281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255350
93205	NC_015666	CGA	2	6	3326330	3326335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255350
93206	NC_015666	CGG	3	9	3326399	3326407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255350
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93209	NC_015666	CAA	2	6	3326526	3326531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93210	NC_015666	CCG	2	6	3326569	3326574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93211	NC_015666	CCA	2	6	3326580	3326585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93212	NC_015666	CGA	2	6	3326610	3326615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255351
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93215	NC_015666	CGG	2	6	3326870	3326875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255351
93216	NC_015666	GAC	3	9	3326877	3326885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255351
93217	NC_015666	GCC	2	6	3326914	3326919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255351
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93221	NC_015666	CGG	2	6	3327137	3327142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255351
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93226	NC_015666	CG	3	6	3327229	3327234	0 %	0 %	50 %	50 %	336255351
93227	NC_015666	CGA	2	6	3327285	3327290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255351
93228	NC_015666	GAG	2	6	3327340	3327345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255351
93229	NC_015666	TTTCTC	2	12	3327401	3327412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336255351
93230	NC_015666	CGA	2	6	3327437	3327442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255351
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93232	NC_015666	GTG	2	6	3327484	3327489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336255351
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