MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015666	CGG	2	6	315124	315129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252402
8502	NC_015666	GCG	2	6	315183	315188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252402
8503	NC_015666	GTC	2	6	315209	315214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8504	NC_015666	CGA	2	6	315241	315246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8505	NC_015666	GCT	2	6	315262	315267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8506	NC_015666	CCA	2	6	315277	315282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252402
8507	NC_015666	TCT	2	6	315318	315323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252402
8508	NC_015666	GTTG	2	8	315337	315344	0 %	50 %	50 %	0 %	336252402
8509	NC_015666	ACG	2	6	315345	315350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8510	NC_015666	ACC	2	6	315399	315404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252402
8511	NC_015666	CGG	2	6	315482	315487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252402
8512	NC_015666	ACG	2	6	315510	315515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8513	NC_015666	TTC	2	6	315527	315532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252402
8514	NC_015666	GAC	2	6	315557	315562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8515	NC_015666	CGA	2	6	315565	315570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8516	NC_015666	GCT	2	6	315571	315576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
8517	NC_015666	CTACGT	2	12	315631	315642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252402
8518	NC_015666	GACGG	2	10	315647	315656	20 %	0 %	60 %	20 %	336252402
8519	NC_015666	GC	3	6	315660	315665	0 %	0 %	50 %	50 %	336252402
8520	NC_015666	AAG	2	6	315668	315673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252402
8521	NC_015666	CACC	2	8	315811	315818	25 %	0 %	0 %	75 %	336252402
8522	NC_015666	CGA	2	6	315883	315888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8523	NC_015666	CGT	2	6	315899	315904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8524	NC_015666	CGCCGG	2	12	315908	315919	0 %	0 %	50 %	50 %	336252403
8525	NC_015666	CGC	2	6	315945	315950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8526	NC_015666	CCT	2	6	315959	315964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252403
8527	NC_015666	TCC	2	6	315994	315999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252403
8528	NC_015666	AAC	2	6	316014	316019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252403
8529	NC_015666	GCG	2	6	316020	316025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252403
8530	NC_015666	CGT	2	6	316043	316048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8531	NC_015666	ACT	2	6	316060	316065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252403
8532	NC_015666	CGA	2	6	316166	316171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8533	NC_015666	CGT	2	6	316180	316185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8534	NC_015666	CTC	2	6	316194	316199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252403
8535	NC_015666	ACT	2	6	316276	316281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252403
8536	NC_015666	ACG	2	6	316294	316299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8537	NC_015666	CGC	2	6	316331	316336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8538	NC_015666	CGAC	2	8	316351	316358	25 %	0 %	25 %	50 %	336252403
8539	NC_015666	TCCT	2	8	316383	316390	0 %	50 %	0 %	50 %	336252403
8540	NC_015666	GAG	2	6	316404	316409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8541	NC_015666	GCT	2	6	316510	316515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8542	NC_015666	CGA	2	6	316568	316573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8543	NC_015666	GAC	2	6	316608	316613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8544	NC_015666	ACG	2	6	316630	316635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8545	NC_015666	CTG	2	6	316692	316697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8546	NC_015666	TCG	2	6	316765	316770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8547	NC_015666	CGAG	2	8	316786	316793	25 %	0 %	50 %	25 %	336252403
8548	NC_015666	GTC	2	6	316842	316847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8549	NC_015666	ACA	2	6	316894	316899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252403
8550	NC_015666	GAG	2	6	316911	316916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8551	NC_015666	CG	3	6	316955	316960	0 %	0 %	50 %	50 %	336252403
8552	NC_015666	GAC	2	6	316977	316982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8553	NC_015666	GAG	2	6	317076	317081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8554	NC_015666	GAC	2	6	317100	317105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8555	NC_015666	AGC	2	6	317117	317122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8556	NC_015666	AGG	2	6	317176	317181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8557	NC_015666	TCG	2	6	317206	317211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8558	NC_015666	ACG	3	9	317263	317271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8559	NC_015666	GACGCG	2	12	317282	317293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252403
8560	NC_015666	GGC	2	6	317355	317360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252403
8561	NC_015666	GTC	2	6	317448	317453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8562	NC_015666	GAG	2	6	317457	317462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8563	NC_015666	CGA	2	6	317477	317482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8564	NC_015666	CG	3	6	317573	317578	0 %	0 %	50 %	50 %	336252403
8565	NC_015666	TCGA	2	8	317587	317594	25 %	25 %	25 %	25 %	336252403
8566	NC_015666	CGA	2	6	317603	317608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8567	NC_015666	CACC	2	8	317657	317664	25 %	0 %	0 %	75 %	336252403
8568	NC_015666	CCAC	2	8	317716	317723	25 %	0 %	0 %	75 %	336252403
8569	NC_015666	CGG	2	6	317741	317746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252403
8570	NC_015666	CGC	2	6	317774	317779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8571	NC_015666	TCA	2	6	317803	317808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252403
8572	NC_015666	CCG	2	6	317835	317840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8573	NC_015666	GGT	2	6	317844	317849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252403
8574	NC_015666	CGGAT	2	10	317854	317863	20 %	20 %	40 %	20 %	336252403
8575	NC_015666	GAG	2	6	317871	317876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8576	NC_015666	GTC	2	6	317920	317925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8577	NC_015666	TC	3	6	317957	317962	0 %	50 %	0 %	50 %	336252403
8578	NC_015666	ACG	2	6	317983	317988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8579	NC_015666	GCT	2	6	317999	318004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
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8581	NC_015666	CCG	2	6	318046	318051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8582	NC_015666	CGG	2	6	318131	318136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252403
8583	NC_015666	GAC	2	6	318213	318218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8584	NC_015666	GGGAA	2	10	318243	318252	40 %	0 %	60 %	0 %	336252403
8585	NC_015666	CAA	2	6	318316	318321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252403
8586	NC_015666	CGA	2	6	318326	318331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8587	NC_015666	GAG	2	6	318381	318386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252403
8588	NC_015666	GCA	2	6	318416	318421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8589	NC_015666	TCG	2	6	318439	318444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8590	NC_015666	CGA	2	6	318461	318466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8591	NC_015666	ACCG	2	8	318492	318499	25 %	0 %	25 %	50 %	336252403
8592	NC_015666	GCC	2	6	318502	318507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
8593	NC_015666	CTA	2	6	318542	318547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252403
8594	NC_015666	CGT	2	6	318551	318556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8595	NC_015666	CGA	2	6	318586	318591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8596	NC_015666	CTA	2	6	318596	318601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252403
8597	NC_015666	CTG	2	6	318604	318609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
8598	NC_015666	AGTCGA	2	12	318620	318631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252403
8599	NC_015666	GAA	2	6	318684	318689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252403
8600	NC_015666	CCAT	2	8	318743	318750	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8601	NC_015666	TC	3	6	318759	318764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_015666	ACA	2	6	318794	318799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_015666	TTATG	2	10	318803	318812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_015666	GA	3	6	318841	318846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_015666	GAA	2	6	318852	318857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_015666	TTA	2	6	318895	318900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_015666	CGG	2	6	318915	318920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_015666	CGT	2	6	318946	318951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8610	NC_015666	CGA	2	6	319009	319014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252404
8611	NC_015666	ACG	2	6	319017	319022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252404
8612	NC_015666	CAG	2	6	319025	319030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252404
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8614	NC_015666	TGA	2	6	319132	319137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252404
8615	NC_015666	GAA	2	6	319259	319264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252404
8616	NC_015666	GAG	2	6	319451	319456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252404
8617	NC_015666	GAG	2	6	319484	319489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252404
8618	NC_015666	GAG	2	6	319517	319522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252404
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8620	NC_015666	GGA	2	6	319591	319596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252404
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8986	NC_015666	GTCCTC	2	12	335022	335033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252423
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8988	NC_015666	GAG	2	6	335074	335079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252423
8989	NC_015666	GTC	2	6	335121	335126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252423
8990	NC_015666	GCCCTT	2	12	335214	335225	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252423
8991	NC_015666	GCT	2	6	335237	335242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252423
8992	NC_015666	GCG	2	6	335262	335267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252423
8993	NC_015666	GAG	2	6	335346	335351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252423
8994	NC_015666	CTC	2	6	335355	335360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252423
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