MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85002	NC_015666	CCT	2	6	3030964	3030969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255090
85003	NC_015666	TGA	2	6	3030970	3030975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336255090
85004	NC_015666	CCT	2	6	3030985	3030990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255090
85005	NC_015666	CAG	3	9	3031040	3031048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85006	NC_015666	GCGA	2	8	3031065	3031072	25 %	0 %	50 %	25 %	336255090
85007	NC_015666	GCC	2	6	3031100	3031105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255090
85008	NC_015666	GTC	2	6	3031124	3031129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85009	NC_015666	CGA	2	6	3031147	3031152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85010	NC_015666	GAG	2	6	3031157	3031162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255090
85011	NC_015666	CGG	2	6	3031289	3031294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255090
85012	NC_015666	CTC	2	6	3031307	3031312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255090
85013	NC_015666	GTC	2	6	3031328	3031333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85014	NC_015666	ACCCG	2	10	3031344	3031353	20 %	0 %	20 %	60 %	336255090
85015	NC_015666	CGT	3	9	3031388	3031396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85016	NC_015666	CAG	2	6	3031418	3031423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85017	NC_015666	CGACAG	2	12	3031448	3031459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85018	NC_015666	GAC	2	6	3031514	3031519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85019	NC_015666	GTC	2	6	3031520	3031525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85020	NC_015666	CGG	2	6	3031531	3031536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255090
85021	NC_015666	TCG	2	6	3031569	3031574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255090
85022	NC_015666	CCGG	2	8	3031615	3031622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85023	NC_015666	CCG	2	6	3031685	3031690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85024	NC_015666	GGC	2	6	3031712	3031717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85025	NC_015666	CGC	2	6	3031774	3031779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255091
85026	NC_015666	TCG	3	9	3031815	3031823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255091
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85030	NC_015666	GAC	2	6	3032021	3032026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255091
85031	NC_015666	CGG	2	6	3032029	3032034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255091
85032	NC_015666	TCG	2	6	3032079	3032084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255091
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85034	NC_015666	TCG	2	6	3032131	3032136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255091
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85037	NC_015666	CGAA	2	8	3032295	3032302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85038	NC_015666	TCG	2	6	3032337	3032342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85039	NC_015666	TCGG	2	8	3032411	3032418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85040	NC_015666	ATG	2	6	3032426	3032431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85041	NC_015666	CGA	2	6	3032448	3032453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85042	NC_015666	C	6	6	3032459	3032464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85043	NC_015666	CGG	2	6	3032468	3032473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85044	NC_015666	CCCGA	2	10	3032558	3032567	20 %	0 %	20 %	60 %	336255092
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85048	NC_015666	TGCCGA	2	12	3032617	3032628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336255092
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85051	NC_015666	CGA	2	6	3032703	3032708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255092
85052	NC_015666	CGA	2	6	3032716	3032721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255092
85053	NC_015666	CG	3	6	3032730	3032735	0 %	0 %	50 %	50 %	336255092
85054	NC_015666	GAG	2	6	3032777	3032782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255092
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85058	NC_015666	CGT	2	6	3032863	3032868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255092
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85070	NC_015666	GAC	2	6	3033286	3033291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255092
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85078	NC_015666	GAAGG	2	10	3033635	3033644	40 %	0 %	60 %	0 %	336255092
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85088	NC_015666	TAC	2	6	3034172	3034177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255092
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85111	NC_015666	CG	3	6	3035002	3035007	0 %	0 %	50 %	50 %	336255093
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85115	NC_015666	CGGC	2	8	3035107	3035114	0 %	0 %	50 %	50 %	336255093
85116	NC_015666	TCG	2	6	3035142	3035147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85117	NC_015666	TCC	2	6	3035163	3035168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255093
85118	NC_015666	CT	3	6	3035183	3035188	0 %	50 %	0 %	50 %	336255093
85119	NC_015666	AGG	2	6	3035220	3035225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255093
85120	NC_015666	CAG	2	6	3035237	3035242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85121	NC_015666	TCA	2	6	3035316	3035321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255093
85122	NC_015666	TGG	2	6	3035328	3035333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336255093
85123	NC_015666	CGG	2	6	3035455	3035460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
85124	NC_015666	GTC	2	6	3035507	3035512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85125	NC_015666	CGG	2	6	3035539	3035544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
85126	NC_015666	GC	3	6	3035555	3035560	0 %	0 %	50 %	50 %	336255093
85127	NC_015666	AGC	2	6	3035586	3035591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255093
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85130	NC_015666	GAC	2	6	3035659	3035664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85131	NC_015666	CTCG	2	8	3035686	3035693	0 %	25 %	25 %	50 %	336255093
85132	NC_015666	CGC	2	6	3035716	3035721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255093
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85134	NC_015666	CGG	2	6	3035739	3035744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
85135	NC_015666	CCG	2	6	3035772	3035777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255093
85136	NC_015666	CGA	2	6	3035779	3035784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85137	NC_015666	CGT	2	6	3035785	3035790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85138	NC_015666	GC	3	6	3035799	3035804	0 %	0 %	50 %	50 %	336255093
85139	NC_015666	TCG	3	9	3035808	3035816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
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85142	NC_015666	CGAT	2	8	3035937	3035944	25 %	25 %	25 %	25 %	336255093
85143	NC_015666	TCGG	2	8	3036045	3036052	0 %	25 %	50 %	25 %	336255093
85144	NC_015666	GTC	2	6	3036080	3036085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85145	NC_015666	GGC	3	9	3036154	3036162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
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85147	NC_015666	TTC	2	6	3036230	3036235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336255093
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85153	NC_015666	GCG	2	6	3036339	3036344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
85154	NC_015666	CGG	2	6	3036358	3036363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255093
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85158	NC_015666	TGT	2	6	3036519	3036524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336255093
85159	NC_015666	CGT	2	6	3036529	3036534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255093
85160	NC_015666	CCG	2	6	3036545	3036550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85161	NC_015666	GAC	2	6	3036625	3036630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255094
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85164	NC_015666	CG	3	6	3036667	3036672	0 %	0 %	50 %	50 %	336255094
85165	NC_015666	CG	3	6	3036707	3036712	0 %	0 %	50 %	50 %	336255094
85166	NC_015666	TCGT	2	8	3036736	3036743	0 %	50 %	25 %	25 %	336255094
85167	NC_015666	CGA	2	6	3036744	3036749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255094
85168	NC_015666	GC	3	6	3036750	3036755	0 %	0 %	50 %	50 %	336255094
85169	NC_015666	CCG	2	6	3036800	3036805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255094
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85172	NC_015666	CGT	2	6	3036870	3036875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255094
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85175	NC_015666	GCC	2	6	3036982	3036987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255094
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85178	NC_015666	CG	3	6	3037071	3037076	0 %	0 %	50 %	50 %	336255094
85179	NC_015666	CG	3	6	3037096	3037101	0 %	0 %	50 %	50 %	336255094
85180	NC_015666	GGC	2	6	3037152	3037157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255094
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85182	NC_015666	CGG	2	6	3037194	3037199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255094
85183	NC_015666	CGACCT	2	12	3037266	3037277	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336255094
85184	NC_015666	GCC	2	6	3037505	3037510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85185	NC_015666	GACG	2	8	3037567	3037574	25 %	0 %	50 %	25 %	336255095
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85193	NC_015666	GGCG	2	8	3037839	3037846	0 %	0 %	75 %	25 %	336255095
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85202	NC_015666	CGA	2	6	3038153	3038158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255095
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85212	NC_015666	GGC	2	6	3038367	3038372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255095
85213	NC_015666	CACC	2	8	3038577	3038584	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85214	NC_015666	CGGA	2	8	3038594	3038601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85215	NC_015666	CTT	2	6	3038619	3038624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85216	NC_015666	GTCG	2	8	3038644	3038651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85217	NC_015666	GAGC	2	8	3038654	3038661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85218	NC_015666	GC	3	6	3038739	3038744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85219	NC_015666	GC	3	6	3038819	3038824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85220	NC_015666	TGC	2	6	3039039	3039044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255096
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85226	NC_015666	TCCG	2	8	3039165	3039172	0 %	25 %	25 %	50 %	336255096
85227	NC_015666	GT	3	6	3039185	3039190	0 %	50 %	50 %	0 %	336255096
85228	NC_015666	CGAA	2	8	3039204	3039211	50 %	0 %	25 %	25 %	336255096
85229	NC_015666	GAG	2	6	3039244	3039249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255096
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85231	NC_015666	GAC	2	6	3039329	3039334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255096
85232	NC_015666	CGG	2	6	3039355	3039360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255096
85233	NC_015666	CTGA	2	8	3039363	3039370	25 %	25 %	25 %	25 %	336255096
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85342	NC_015666	ACTCG	2	10	3044039	3044048	20 %	20 %	20 %	40 %	336255101
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85344	NC_015666	CG	4	8	3044115	3044122	0 %	0 %	50 %	50 %	336255101
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85500	NC_015666	GTTC	2	8	3049506	3049513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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