MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_015666	GAA	2	6	3013674	3013679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255067
84502	NC_015666	TCC	2	6	3013756	3013761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255067
84503	NC_015666	GAC	2	6	3013794	3013799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255067
84504	NC_015666	CGT	2	6	3013832	3013837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255067
84505	NC_015666	CGA	2	6	3013841	3013846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255067
84506	NC_015666	GCC	2	6	3013857	3013862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255067
84507	NC_015666	CGCGAG	2	12	3013863	3013874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336255067
84508	NC_015666	CGT	2	6	3013919	3013924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84509	NC_015666	ACG	2	6	3013925	3013930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84510	NC_015666	GGAC	2	8	3013966	3013973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84511	NC_015666	CCGC	2	8	3013992	3013999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84512	NC_015666	CCG	2	6	3014046	3014051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84513	NC_015666	GGT	2	6	3014134	3014139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336255068
84514	NC_015666	CGA	2	6	3014191	3014196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84515	NC_015666	CACGGG	2	12	3014228	3014239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336255068
84516	NC_015666	GAC	2	6	3014249	3014254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84517	NC_015666	ACG	3	9	3014282	3014290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84518	NC_015666	GAAC	2	8	3014305	3014312	50 %	0 %	25 %	25 %	336255068
84519	NC_015666	CGA	2	6	3014347	3014352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84520	NC_015666	CCG	2	6	3014356	3014361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255068
84521	NC_015666	GAG	2	6	3014372	3014377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336255068
84522	NC_015666	CGG	2	6	3014386	3014391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255068
84523	NC_015666	CG	3	6	3014408	3014413	0 %	0 %	50 %	50 %	336255068
84524	NC_015666	CCA	2	6	3014428	3014433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336255068
84525	NC_015666	CGA	3	9	3014449	3014457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84526	NC_015666	CG	3	6	3014495	3014500	0 %	0 %	50 %	50 %	336255068
84527	NC_015666	CGT	2	6	3014506	3014511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84528	NC_015666	CGC	2	6	3014517	3014522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255068
84529	NC_015666	CGG	2	6	3014536	3014541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255068
84530	NC_015666	CGG	2	6	3014560	3014565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255068
84531	NC_015666	AAG	2	6	3014615	3014620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255068
84532	NC_015666	CGG	2	6	3014644	3014649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255068
84533	NC_015666	GC	3	6	3014671	3014676	0 %	0 %	50 %	50 %	336255068
84534	NC_015666	CGA	2	6	3014692	3014697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84535	NC_015666	CGG	2	6	3014698	3014703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255068
84536	NC_015666	CGT	2	6	3014752	3014757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84537	NC_015666	GAC	2	6	3014758	3014763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84538	NC_015666	ACG	2	6	3014808	3014813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255068
84539	NC_015666	CT	3	6	3014890	3014895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84540	NC_015666	GCT	2	6	3014984	3014989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255069
84541	NC_015666	TCC	2	6	3015007	3015012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336255069
84542	NC_015666	GGGAC	2	10	3015039	3015048	20 %	0 %	60 %	20 %	336255069
84543	NC_015666	GCA	2	6	3015054	3015059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255069
84544	NC_015666	CTG	2	6	3015111	3015116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255069
84545	NC_015666	GATA	2	8	3015227	3015234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84546	NC_015666	CTA	2	6	3015238	3015243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336255070
84547	NC_015666	GTCGC	2	10	3015295	3015304	0 %	20 %	40 %	40 %	336255070
84548	NC_015666	ACG	2	6	3015305	3015310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255070
84549	NC_015666	GAC	2	6	3015330	3015335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255070
84550	NC_015666	CGA	2	6	3015359	3015364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255070
84551	NC_015666	GAA	2	6	3015392	3015397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255070
84552	NC_015666	GAA	2	6	3015399	3015404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336255070
84553	NC_015666	CGG	2	6	3015422	3015427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336255070
84554	NC_015666	GCCG	2	8	3015450	3015457	0 %	0 %	50 %	50 %	336255070
84555	NC_015666	CCGCG	2	10	3015476	3015485	0 %	0 %	40 %	60 %	336255070
84556	NC_015666	CGA	2	6	3015572	3015577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255071
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84558	NC_015666	CTG	2	6	3015618	3015623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336255071
84559	NC_015666	CGT	2	6	3015666	3015671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84560	NC_015666	TCT	2	6	3015688	3015693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336255072
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84583	NC_015666	CCGTC	2	10	3016540	3016549	0 %	20 %	20 %	60 %	336255073
84584	NC_015666	CG	3	6	3016584	3016589	0 %	0 %	50 %	50 %	336255073
84585	NC_015666	GCCG	2	8	3016604	3016611	0 %	0 %	50 %	50 %	336255073
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84602	NC_015666	GCGAC	2	10	3017098	3017107	20 %	0 %	40 %	40 %	336255073
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84604	NC_015666	CGA	3	9	3017197	3017205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255073
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84607	NC_015666	AC	3	6	3017316	3017321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84608	NC_015666	CTT	2	6	3017339	3017344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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84612	NC_015666	TAGT	2	8	3017494	3017501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84613	NC_015666	TTG	2	6	3017516	3017521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84614	NC_015666	GCGA	2	8	3017617	3017624	25 %	0 %	50 %	25 %	336255074
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84842	NC_015666	GCG	2	6	3025887	3025892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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84965	NC_015666	GCC	2	6	3029879	3029884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336255089
84966	NC_015666	GCACC	2	10	3029891	3029900	20 %	0 %	20 %	60 %	336255089
84967	NC_015666	CGGCG	2	10	3029925	3029934	0 %	0 %	60 %	40 %	336255089
84968	NC_015666	GGCCG	2	10	3029952	3029961	0 %	0 %	60 %	40 %	336255089
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84977	NC_015666	CGA	2	6	3030224	3030229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336255089
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84980	NC_015666	CGGCGT	2	12	3030319	3030330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336255089
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