MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015666	TGG	2	6	271582	271587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_015666	ACC	2	6	271606	271611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7503	NC_015666	ACGC	2	8	271649	271656	25 %	0 %	25 %	50 %	336252369
7504	NC_015666	CAG	2	6	271684	271689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7505	NC_015666	CGA	2	6	271716	271721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7506	NC_015666	GCA	2	6	271772	271777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7507	NC_015666	GAT	2	6	271803	271808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252369
7508	NC_015666	GT	3	6	271816	271821	0 %	50 %	50 %	0 %	336252369
7509	NC_015666	GA	3	6	271826	271831	50 %	0 %	50 %	0 %	336252369
7510	NC_015666	CGAT	2	8	271849	271856	25 %	25 %	25 %	25 %	336252369
7511	NC_015666	ACG	2	6	271889	271894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7512	NC_015666	TCG	2	6	271907	271912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7513	NC_015666	GTC	3	9	271933	271941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7514	NC_015666	ACG	2	6	271943	271948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7515	NC_015666	CT	3	6	272011	272016	0 %	50 %	0 %	50 %	336252369
7516	NC_015666	GAT	2	6	272040	272045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252369
7517	NC_015666	AGC	2	6	272048	272053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7518	NC_015666	CGC	2	6	272073	272078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252369
7519	NC_015666	GAA	2	6	272080	272085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252369
7520	NC_015666	GAG	2	6	272155	272160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252369
7521	NC_015666	AGG	2	6	272192	272197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252369
7522	NC_015666	CCG	2	6	272214	272219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252369
7523	NC_015666	CGA	2	6	272245	272250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7524	NC_015666	GTC	2	6	272263	272268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7525	NC_015666	CGA	3	9	272301	272309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252369
7526	NC_015666	TGA	2	6	272328	272333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252369
7527	NC_015666	ACT	2	6	272404	272409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_015666	ACT	2	6	272445	272450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252370
7529	NC_015666	CGA	2	6	272466	272471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252370
7530	NC_015666	CTT	2	6	272529	272534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252370
7531	NC_015666	TCG	2	6	272549	272554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252370
7532	NC_015666	TCG	2	6	272606	272611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252370
7533	NC_015666	GCT	2	6	272712	272717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_015666	CAGGA	2	10	272722	272731	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7535	NC_015666	ACT	2	6	272764	272769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_015666	CTA	2	6	272828	272833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_015666	ACG	2	6	272836	272841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_015666	AGT	2	6	272883	272888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_015666	GTCGAT	2	12	272889	272900	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7540	NC_015666	GTG	2	6	272929	272934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_015666	CGA	2	6	272939	272944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_015666	CTG	2	6	272960	272965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_015666	CCG	2	6	273025	273030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252371
7544	NC_015666	CTC	2	6	273031	273036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252371
7545	NC_015666	CAG	2	6	273100	273105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252371
7546	NC_015666	CAG	2	6	273121	273126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252371
7547	NC_015666	GTC	2	6	273169	273174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252371
7548	NC_015666	CGA	2	6	273210	273215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252371
7549	NC_015666	CAA	2	6	273219	273224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252371
7550	NC_015666	CTC	2	6	273232	273237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252371
7551	NC_015666	CCA	2	6	273291	273296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252371
7552	NC_015666	CTG	2	6	273314	273319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_015666	CAG	2	6	273348	273353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_015666	GCT	2	6	273386	273391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_015666	TCA	2	6	273466	273471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252372
7556	NC_015666	GAA	2	6	273489	273494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252372
7557	NC_015666	CTC	2	6	273501	273506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252372
7558	NC_015666	GA	3	6	273679	273684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_015666	CGA	2	6	273695	273700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_015666	CGAA	2	8	273727	273734	50 %	0 %	25 %	25 %	336252373
7561	NC_015666	GAC	2	6	273741	273746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252373
7562	NC_015666	GA	3	6	273848	273853	50 %	0 %	50 %	0 %	336252373
7563	NC_015666	AAG	2	6	273904	273909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252374
7564	NC_015666	GTT	2	6	273935	273940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252374
7565	NC_015666	TCC	2	6	273947	273952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252374
7566	NC_015666	TAG	2	6	273956	273961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252374
7567	NC_015666	GAC	3	9	273975	273983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7568	NC_015666	GCT	2	6	274049	274054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
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7570	NC_015666	CAT	2	6	274097	274102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252374
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7572	NC_015666	CAT	2	6	274157	274162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252374
7573	NC_015666	GTC	2	6	274186	274191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7574	NC_015666	GAC	2	6	274278	274283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7575	NC_015666	ACG	2	6	274292	274297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7576	NC_015666	CGT	3	9	274298	274306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7577	NC_015666	CAGT	2	8	274373	274380	25 %	25 %	25 %	25 %	336252374
7578	NC_015666	AGA	2	6	274409	274414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252374
7579	NC_015666	TCG	2	6	274489	274494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7580	NC_015666	GA	3	6	274513	274518	50 %	0 %	50 %	0 %	336252374
7581	NC_015666	TCT	2	6	274525	274530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252374
7582	NC_015666	TTC	2	6	274548	274553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252374
7583	NC_015666	ATC	2	6	274554	274559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252374
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7585	NC_015666	TCG	2	6	274606	274611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7586	NC_015666	CTCTGT	2	12	274617	274628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336252374
7587	NC_015666	AGAC	2	8	274664	274671	50 %	0 %	25 %	25 %	336252374
7588	NC_015666	CTC	2	6	274674	274679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252374
7589	NC_015666	GTC	3	9	274818	274826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7590	NC_015666	GAA	2	6	274855	274860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252374
7591	NC_015666	GC	5	10	274896	274905	0 %	0 %	50 %	50 %	336252374
7592	NC_015666	CTC	2	6	274926	274931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252374
7593	NC_015666	CT	3	6	274935	274940	0 %	50 %	0 %	50 %	336252374
7594	NC_015666	GAG	2	6	274983	274988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252374
7595	NC_015666	CTTT	2	8	275054	275061	0 %	75 %	0 %	25 %	336252374
7596	NC_015666	GAT	2	6	275088	275093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252374
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7598	NC_015666	TAG	2	6	275178	275183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252374
7599	NC_015666	TCG	2	6	275188	275193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252374
7600	NC_015666	GA	3	6	275241	275246	50 %	0 %	50 %	0 %	336252374
7601	NC_015666	GGT	2	6	275302	275307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_015666	GTG	2	6	275417	275422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_015666	CTCGA	2	10	275485	275494	20 %	20 %	20 %	40 %	336252375
7604	NC_015666	TC	3	6	275498	275503	0 %	50 %	0 %	50 %	336252375
7605	NC_015666	CGCT	2	8	275561	275568	0 %	25 %	25 %	50 %	336252375
7606	NC_015666	GTC	2	6	275599	275604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252375
7607	NC_015666	GAA	2	6	275620	275625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252375
7608	NC_015666	CGA	2	6	275631	275636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252375
7609	NC_015666	CG	3	6	275645	275650	0 %	0 %	50 %	50 %	336252375
7610	NC_015666	GTACT	2	10	275776	275785	20 %	40 %	20 %	20 %	336252375
7611	NC_015666	GGA	2	6	275796	275801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252375
7612	NC_015666	GAT	2	6	275920	275925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252375
7613	NC_015666	CGA	2	6	275951	275956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252375
7614	NC_015666	GA	3	6	275993	275998	50 %	0 %	50 %	0 %	336252375
7615	NC_015666	AC	3	6	276011	276016	50 %	0 %	0 %	50 %	336252375
7616	NC_015666	GAC	2	6	276051	276056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252375
7617	NC_015666	TCG	2	6	276065	276070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252375
7618	NC_015666	ATC	2	6	276185	276190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252375
7619	NC_015666	AAGC	2	8	276200	276207	50 %	0 %	25 %	25 %	336252375
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7621	NC_015666	CGC	2	6	276302	276307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252376
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7741	NC_015666	GGA	2	6	281190	281195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252378
7742	NC_015666	ATCG	2	8	281205	281212	25 %	25 %	25 %	25 %	336252378
7743	NC_015666	ACG	2	6	281213	281218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252378
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7756	NC_015666	CTG	2	6	282007	282012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252378
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7836	NC_015666	TGA	3	9	285641	285649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7858	NC_015666	ACG	3	9	286911	286919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
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