MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015666	CAT	2	6	230222	230227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252331
6502	NC_015666	TCGG	2	8	230274	230281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6503	NC_015666	ATC	2	6	230383	230388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252332
6504	NC_015666	GC	3	6	230390	230395	0 %	0 %	50 %	50 %	336252332
6505	NC_015666	CCG	2	6	230415	230420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252332
6506	NC_015666	CGA	2	6	230466	230471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6507	NC_015666	GC	3	6	230478	230483	0 %	0 %	50 %	50 %	336252332
6508	NC_015666	CGA	2	6	230499	230504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6509	NC_015666	GGA	2	6	230529	230534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252332
6510	NC_015666	GAC	2	6	230551	230556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6511	NC_015666	CGG	2	6	230577	230582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252332
6512	NC_015666	TCC	2	6	230612	230617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252332
6513	NC_015666	CGCC	2	8	230637	230644	0 %	0 %	25 %	75 %	336252332
6514	NC_015666	CGG	2	6	230697	230702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252332
6515	NC_015666	CG	4	8	230739	230746	0 %	0 %	50 %	50 %	336252332
6516	NC_015666	TCGG	2	8	230849	230856	0 %	25 %	50 %	25 %	336252332
6517	NC_015666	GAG	2	6	230902	230907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252332
6518	NC_015666	GCA	2	6	230930	230935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6519	NC_015666	CGA	2	6	230937	230942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6520	NC_015666	CGT	2	6	231021	231026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6521	NC_015666	CGAC	2	8	231047	231054	25 %	0 %	25 %	50 %	336252332
6522	NC_015666	CCTCGA	2	12	231078	231089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252332
6523	NC_015666	GATC	2	8	231093	231100	25 %	25 %	25 %	25 %	336252332
6524	NC_015666	CGG	2	6	231135	231140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252332
6525	NC_015666	CGC	2	6	231162	231167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252332
6526	NC_015666	GCG	2	6	231183	231188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252332
6527	NC_015666	TCC	2	6	231206	231211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252332
6528	NC_015666	CGT	2	6	231222	231227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6529	NC_015666	CGA	2	6	231246	231251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252332
6530	NC_015666	CGG	2	6	231263	231268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252332
6531	NC_015666	TAGT	2	8	231419	231426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_015666	CGT	3	9	231438	231446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6533	NC_015666	GCCGGT	2	12	231463	231474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252333
6534	NC_015666	CG	3	6	231510	231515	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
6535	NC_015666	ACC	2	6	231542	231547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252333
6536	NC_015666	GTC	2	6	231658	231663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6537	NC_015666	TCGACG	2	12	231668	231679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6538	NC_015666	GTC	2	6	231685	231690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6539	NC_015666	TCG	2	6	231731	231736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6540	NC_015666	CTA	2	6	231756	231761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252333
6541	NC_015666	CT	3	6	231786	231791	0 %	50 %	0 %	50 %	336252333
6542	NC_015666	GAC	2	6	231808	231813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6543	NC_015666	AGG	2	6	231839	231844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252333
6544	NC_015666	CCAG	2	8	231845	231852	25 %	0 %	25 %	50 %	336252333
6545	NC_015666	CGG	2	6	231888	231893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252333
6546	NC_015666	CCG	2	6	231917	231922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252333
6547	NC_015666	CGA	2	6	231942	231947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6548	NC_015666	CG	3	6	231952	231957	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
6549	NC_015666	TCG	2	6	231974	231979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6550	NC_015666	GGA	2	6	231987	231992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252333
6551	NC_015666	CAG	2	6	232021	232026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6552	NC_015666	CGATC	2	10	232074	232083	20 %	20 %	20 %	40 %	336252333
6553	NC_015666	GAG	2	6	232096	232101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252333
6554	NC_015666	CGA	2	6	232113	232118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6555	NC_015666	ACG	2	6	232136	232141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6556	NC_015666	CGG	2	6	232155	232160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252333
6557	NC_015666	GAC	2	6	232183	232188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6558	NC_015666	GCCGA	2	10	232222	232231	20 %	0 %	40 %	40 %	336252333
6559	NC_015666	CGA	2	6	232245	232250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6560	NC_015666	TCG	2	6	232280	232285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6561	NC_015666	CGC	2	6	232304	232309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252333
6562	NC_015666	GCC	2	6	232321	232326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252333
6563	NC_015666	CG	3	6	232363	232368	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
6564	NC_015666	CGT	2	6	232416	232421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6565	NC_015666	CGG	2	6	232494	232499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252333
6566	NC_015666	GAA	2	6	232518	232523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252333
6567	NC_015666	CGC	2	6	232530	232535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252333
6568	NC_015666	GC	3	6	232534	232539	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
6569	NC_015666	GC	3	6	232570	232575	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
6570	NC_015666	GTC	2	6	232584	232589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252333
6571	NC_015666	ATCGA	2	10	232630	232639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6572	NC_015666	TCG	2	6	232666	232671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6573	NC_015666	GGCCG	2	10	232738	232747	0 %	0 %	60 %	40 %	336252334
6574	NC_015666	CGT	2	6	232761	232766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6575	NC_015666	CGAG	2	8	232790	232797	25 %	0 %	50 %	25 %	336252334
6576	NC_015666	CGC	2	6	232800	232805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252334
6577	NC_015666	CG	3	6	232808	232813	0 %	0 %	50 %	50 %	336252334
6578	NC_015666	ATC	2	6	232861	232866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252334
6579	NC_015666	CGA	3	9	232877	232885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6580	NC_015666	CCGGT	2	10	232891	232900	0 %	20 %	40 %	40 %	336252334
6581	NC_015666	CGT	2	6	232937	232942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6582	NC_015666	CGA	2	6	232946	232951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6583	NC_015666	AGA	2	6	232985	232990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252334
6584	NC_015666	CGT	2	6	233021	233026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6585	NC_015666	GAC	3	9	233100	233108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6586	NC_015666	GCGA	2	8	233155	233162	25 %	0 %	50 %	25 %	336252334
6587	NC_015666	CCG	2	6	233174	233179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252334
6588	NC_015666	GATTCG	2	12	233221	233232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252334
6589	NC_015666	CCGGAA	3	18	233236	233253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6590	NC_015666	GTC	2	6	233256	233261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
6591	NC_015666	TCG	2	6	233268	233273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_015666	TCG	2	6	233357	233362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252335
6593	NC_015666	CCGA	2	8	233372	233379	25 %	0 %	25 %	50 %	336252335
6594	NC_015666	GCC	2	6	233387	233392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
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6596	NC_015666	CGC	2	6	233459	233464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
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6599	NC_015666	CGGAT	2	10	233554	233563	20 %	20 %	40 %	20 %	336252335
6600	NC_015666	CCG	2	6	233578	233583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
6601	NC_015666	CGA	2	6	233597	233602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252335
6602	NC_015666	TCT	2	6	233612	233617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252335
6603	NC_015666	GCC	2	6	233630	233635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
6604	NC_015666	CGG	3	9	233697	233705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252335
6605	NC_015666	GC	3	6	233767	233772	0 %	0 %	50 %	50 %	336252335
6606	NC_015666	CGC	2	6	233774	233779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
6607	NC_015666	GCC	2	6	233783	233788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252335
6608	NC_015666	CGA	2	6	233807	233812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252335
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6613	NC_015666	TCT	2	6	234068	234073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252335
6614	NC_015666	CGT	3	9	234101	234109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252335
6615	NC_015666	GC	3	6	234122	234127	0 %	0 %	50 %	50 %	336252335
6616	NC_015666	GAC	2	6	234162	234167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252335
6617	NC_015666	CGG	2	6	234174	234179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_015666	AGG	2	6	234311	234316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252336
6619	NC_015666	GGCGAT	2	12	234340	234351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252336
6620	NC_015666	TCG	2	6	234357	234362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252336
6621	NC_015666	C	6	6	234419	234424	0 %	0 %	0 %	100 %	336252336
6622	NC_015666	CGA	2	6	234426	234431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252336
6623	NC_015666	ACG	2	6	234467	234472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252336
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6625	NC_015666	CGGC	2	8	234495	234502	0 %	0 %	50 %	50 %	336252336
6626	NC_015666	GTC	2	6	234511	234516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252336
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6629	NC_015666	TCGA	2	8	234580	234587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6630	NC_015666	GGC	2	6	234601	234606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_015666	CGC	2	6	234622	234627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6632	NC_015666	CGTCC	2	10	234635	234644	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6633	NC_015666	CGAG	2	8	234782	234789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6634	NC_015666	CGT	2	6	234847	234852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6639	NC_015666	CGC	2	6	234986	234991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252337
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6643	NC_015666	CGT	2	6	235087	235092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252337
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6649	NC_015666	TCT	2	6	235244	235249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6650	NC_015666	AAATT	2	10	235274	235283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6651	NC_015666	AAG	2	6	235365	235370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6652	NC_015666	CCG	2	6	235376	235381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6653	NC_015666	CGC	2	6	235512	235517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6743	NC_015666	CGA	2	6	239548	239553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6744	NC_015666	GAC	2	6	239651	239656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
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6772	NC_015666	TCG	2	6	240897	240902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6839	NC_015666	TCC	2	6	243902	243907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6840	NC_015666	CGAAC	2	10	243912	243921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6841	NC_015666	AGAA	2	8	243993	244000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6842	NC_015666	AC	3	6	244005	244010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6843	NC_015666	GAG	2	6	244025	244030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6844	NC_015666	ACG	2	6	244034	244039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6845	NC_015666	TCG	2	6	244051	244056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6846	NC_015666	CCG	2	6	244086	244091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6847	NC_015666	C	6	6	244192	244197	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6848	NC_015666	CG	3	6	244224	244229	0 %	0 %	50 %	50 %	336252345
6849	NC_015666	TCG	2	6	244278	244283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
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6851	NC_015666	CGA	3	9	244348	244356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252345
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6853	NC_015666	CAT	2	6	244435	244440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252345
6854	NC_015666	GTC	2	6	244454	244459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6855	NC_015666	AAC	2	6	244500	244505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252345
6856	NC_015666	GGA	2	6	244507	244512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252345
6857	NC_015666	GATCGA	2	12	244516	244527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252345
6858	NC_015666	CTA	2	6	244558	244563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252345
6859	NC_015666	TCG	2	6	244602	244607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6860	NC_015666	ACG	2	6	244637	244642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6861	NC_015666	TG	3	6	244773	244778	0 %	50 %	50 %	0 %	336252345
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6985	NC_015666	CCGC	2	8	249305	249312	0 %	0 %	25 %	75 %	336252347
6986	NC_015666	CGC	2	6	249319	249324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252347
6987	NC_015666	CGTTC	2	10	249328	249337	0 %	40 %	20 %	40 %	336252347
6988	NC_015666	CTC	2	6	249481	249486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252347
6989	NC_015666	GGATC	2	10	249525	249534	20 %	20 %	40 %	20 %	336252347
6990	NC_015666	CGT	2	6	249576	249581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6991	NC_015666	CAG	2	6	249588	249593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6992	NC_015666	GTC	3	9	249667	249675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6993	NC_015666	CGT	2	6	249687	249692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6994	NC_015666	CGG	2	6	249697	249702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252347
6995	NC_015666	AG	3	6	249757	249762	50 %	0 %	50 %	0 %	336252347
6996	NC_015666	AGC	2	6	249764	249769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6997	NC_015666	AGAC	2	8	249770	249777	50 %	0 %	25 %	25 %	336252347
6998	NC_015666	CG	3	6	249811	249816	0 %	0 %	50 %	50 %	336252347
6999	NC_015666	AC	4	8	249836	249843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7000	NC_015666	AAG	2	6	249860	249865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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