MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015666	CCG	2	6	192960	192965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_015666	TCGG	2	8	192968	192975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_015666	CCCT	2	8	193080	193087	0 %	25 %	0 %	75 %	336252300
5504	NC_015666	CGG	2	6	193092	193097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252300
5505	NC_015666	ACT	2	6	193100	193105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252300
5506	NC_015666	CGG	2	6	193106	193111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252300
5507	NC_015666	GCC	2	6	193125	193130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252300
5508	NC_015666	GCC	2	6	193158	193163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252300
5509	NC_015666	CGAC	2	8	193167	193174	25 %	0 %	25 %	50 %	336252300
5510	NC_015666	CGA	2	6	193204	193209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
5511	NC_015666	CGC	2	6	193222	193227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252300
5512	NC_015666	GCT	2	6	193289	193294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252300
5513	NC_015666	CGA	2	6	193295	193300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
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5515	NC_015666	CGG	2	6	193323	193328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252300
5516	NC_015666	GCGG	2	8	193371	193378	0 %	0 %	75 %	25 %	336252300
5517	NC_015666	GGCG	2	8	193409	193416	0 %	0 %	75 %	25 %	336252300
5518	NC_015666	ACG	2	6	193423	193428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
5519	NC_015666	TGCG	2	8	193483	193490	0 %	25 %	50 %	25 %	336252300
5520	NC_015666	CTCG	2	8	193556	193563	0 %	25 %	25 %	50 %	336252300
5521	NC_015666	GCC	2	6	193566	193571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252300
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5524	NC_015666	CGA	2	6	193703	193708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
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5529	NC_015666	ACG	2	6	193807	193812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
5530	NC_015666	CGGA	2	8	193821	193828	25 %	0 %	50 %	25 %	336252300
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5534	NC_015666	TCG	2	6	194028	194033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252300
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5541	NC_015666	CGGT	2	8	194202	194209	0 %	25 %	50 %	25 %	336252300
5542	NC_015666	CGGT	2	8	194214	194221	0 %	25 %	50 %	25 %	336252300
5543	NC_015666	GATC	2	8	194294	194301	25 %	25 %	25 %	25 %	336252300
5544	NC_015666	CGA	3	9	194315	194323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252300
5545	NC_015666	GTC	2	6	194451	194456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015666	CAG	2	6	194459	194464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015666	AGA	2	6	194503	194508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015666	TTG	2	6	194565	194570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252301
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5550	NC_015666	CGA	2	6	194620	194625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252301
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5553	NC_015666	GCA	2	6	194764	194769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252301
5554	NC_015666	GCA	2	6	194779	194784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252301
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5559	NC_015666	GGC	2	6	194872	194877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252301
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5569	NC_015666	GCTT	2	8	195161	195168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_015666	GCC	2	6	195268	195273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_015666	GAAAC	2	10	195312	195321	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5585	NC_015666	AGC	2	6	195781	195786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_015666	CG	4	8	196027	196034	0 %	0 %	50 %	50 %	336252303
5593	NC_015666	TCG	2	6	196038	196043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252303
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5621	NC_015666	CG	3	6	197098	197103	0 %	0 %	50 %	50 %	336252305
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5737	NC_015666	CGT	2	6	201526	201531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252310
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5742	NC_015666	CGT	2	6	201781	201786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252310
5743	NC_015666	TCA	2	6	201792	201797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252310
5744	NC_015666	CGG	2	6	201859	201864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252310
5745	NC_015666	GTC	2	6	201875	201880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252310
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5747	NC_015666	CGAT	2	8	201924	201931	25 %	25 %	25 %	25 %	336252310
5748	NC_015666	TCA	3	9	201948	201956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252310
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5753	NC_015666	CTG	2	6	202151	202156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252310
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5759	NC_015666	CGT	2	6	202408	202413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252310
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5768	NC_015666	ACGA	2	8	202723	202730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5769	NC_015666	TCA	2	6	202765	202770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5772	NC_015666	AGAC	2	8	202874	202881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5773	NC_015666	TGG	2	6	202883	202888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5774	NC_015666	GAG	2	6	202923	202928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5775	NC_015666	CGA	3	9	202946	202954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252311
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5780	NC_015666	CGG	2	6	203153	203158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252311
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5784	NC_015666	TCG	2	6	203287	203292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252311
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5845	NC_015666	GGT	2	6	205495	205500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5846	NC_015666	CGA	2	6	205516	205521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252312
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5851	NC_015666	GAT	2	6	205663	205668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252312
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5853	NC_015666	TAC	3	9	205733	205741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252312
5854	NC_015666	CGCT	2	8	205748	205755	0 %	25 %	25 %	50 %	336252312
5855	NC_015666	CGG	2	6	205837	205842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252312
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5857	NC_015666	TC	3	6	205936	205941	0 %	50 %	0 %	50 %	336252312
5858	NC_015666	GC	3	6	205956	205961	0 %	0 %	50 %	50 %	336252312
5859	NC_015666	TCG	2	6	205980	205985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5860	NC_015666	CGG	2	6	206014	206019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252312
5861	NC_015666	CTG	2	6	206045	206050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5862	NC_015666	TTC	2	6	206081	206086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252312
5863	NC_015666	TGA	2	6	206106	206111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252312
5864	NC_015666	CGC	2	6	206127	206132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252312
5865	NC_015666	TCCT	2	8	206177	206184	0 %	50 %	0 %	50 %	336252312
5866	NC_015666	CGA	2	6	206202	206207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5867	NC_015666	GAA	2	6	206221	206226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252312
5868	NC_015666	ATC	2	6	206252	206257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252312
5869	NC_015666	ATC	2	6	206315	206320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252312
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5872	NC_015666	GCT	2	6	206425	206430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5873	NC_015666	CG	3	6	206470	206475	0 %	0 %	50 %	50 %	336252312
5874	NC_015666	GGGAC	2	10	206491	206500	20 %	0 %	60 %	20 %	336252312
5875	NC_015666	CGG	2	6	206572	206577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252312
5876	NC_015666	GAT	2	6	206578	206583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252312
5877	NC_015666	CTG	2	6	206585	206590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
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5879	NC_015666	TCC	2	6	206643	206648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252312
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5882	NC_015666	TCG	2	6	206829	206834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5883	NC_015666	CGT	2	6	206854	206859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5884	NC_015666	CGCC	2	8	206863	206870	0 %	0 %	25 %	75 %	336252312
5885	NC_015666	ACCG	2	8	206876	206883	25 %	0 %	25 %	50 %	336252312
5886	NC_015666	GAG	2	6	206921	206926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252312
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5890	NC_015666	CGG	2	6	206971	206976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252312
5891	NC_015666	GTC	2	6	206990	206995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
5892	NC_015666	CGGA	2	8	207014	207021	25 %	0 %	50 %	25 %	336252312
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5895	NC_015666	TCG	2	6	207090	207095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252312
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5918	NC_015666	CGAT	2	8	207869	207876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5980	NC_015666	CG	3	6	210029	210034	0 %	0 %	50 %	50 %	336252315
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5984	NC_015666	CCG	3	9	210069	210077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252315
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5988	NC_015666	CCG	2	6	210288	210293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5991	NC_015666	CGA	2	6	210330	210335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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