MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA03

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015659	CG	3	6	43818	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_015659	GGAC	2	8	43947	43954	25 %	0 %	50 %	25 %	336251537
1003	NC_015659	GCG	2	6	44045	44050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251537
1004	NC_015659	AGGT	2	8	44057	44064	25 %	25 %	50 %	0 %	336251537
1005	NC_015659	CTGT	2	8	44106	44113	0 %	50 %	25 %	25 %	336251537
1006	NC_015659	CGG	2	6	44132	44137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015659	CCAC	2	8	44145	44152	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1008	NC_015659	TCCAG	2	10	44181	44190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_015659	ACT	2	6	44193	44198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251538
1010	NC_015659	CG	3	6	44224	44229	0 %	0 %	50 %	50 %	336251538
1011	NC_015659	TCG	2	6	44294	44299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251538
1012	NC_015659	CGA	2	6	44352	44357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251538
1013	NC_015659	TCG	2	6	44381	44386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251538
1014	NC_015659	TCG	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251538
1015	NC_015659	TGGT	2	8	44468	44475	0 %	50 %	50 %	0 %	336251538
1016	NC_015659	ATCG	2	8	44600	44607	25 %	25 %	25 %	25 %	336251539
1017	NC_015659	GTC	2	6	44655	44660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1018	NC_015659	GGA	2	6	44714	44719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251539
1019	NC_015659	CG	3	6	44772	44777	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
1020	NC_015659	CTC	2	6	44823	44828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1021	NC_015659	CTG	2	6	44835	44840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1022	NC_015659	TCG	3	9	44854	44862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1023	NC_015659	TCC	2	6	44908	44913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1024	NC_015659	TCG	2	6	44917	44922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1025	NC_015659	CTC	2	6	44964	44969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1026	NC_015659	CGG	2	6	44989	44994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251539
1027	NC_015659	CTC	2	6	44997	45002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1028	NC_015659	GCG	2	6	45069	45074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251539
1029	NC_015659	CGC	2	6	45086	45091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251539
1030	NC_015659	CTC	2	6	45111	45116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1031	NC_015659	GGTC	2	8	45152	45159	0 %	25 %	50 %	25 %	336251539
1032	NC_015659	ACG	2	6	45181	45186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1033	NC_015659	GCT	2	6	45188	45193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1034	NC_015659	CGC	2	6	45200	45205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251539
1035	NC_015659	GTT	2	6	45206	45211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251539
1036	NC_015659	GA	3	6	45346	45351	50 %	0 %	50 %	0 %	336251539
1037	NC_015659	CGA	3	9	45365	45373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1038	NC_015659	CGG	2	6	45389	45394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251539
1039	NC_015659	TCT	2	6	45431	45436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251539
1040	NC_015659	TCG	2	6	45475	45480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1041	NC_015659	CG	3	6	45681	45686	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
1042	NC_015659	CGAG	2	8	45727	45734	25 %	0 %	50 %	25 %	336251539
1043	NC_015659	CTC	2	6	45744	45749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251539
1044	NC_015659	CGG	2	6	45804	45809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251539
1045	NC_015659	CG	3	6	45904	45909	0 %	0 %	50 %	50 %	336251539
1046	NC_015659	CAG	2	6	45978	45983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1047	NC_015659	GTC	2	6	45984	45989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1048	NC_015659	TGC	2	6	46038	46043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1049	NC_015659	TCG	2	6	46063	46068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251539
1050	NC_015659	TGG	2	6	46077	46082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251539
1051	NC_015659	TC	3	6	46105	46110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015659	TCGT	2	8	46118	46125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_015659	CCG	2	6	46140	46145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_015659	CGC	2	6	46155	46160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_015659	ACA	2	6	46173	46178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015659	GT	3	6	46206	46211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015659	GC	3	6	46230	46235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015659	GCG	2	6	46283	46288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015659	TCT	2	6	46309	46314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015659	GCG	2	6	46338	46343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015659	CCT	2	6	46442	46447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251540
1062	NC_015659	CGG	2	6	46450	46455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251540
1063	NC_015659	TCG	2	6	46510	46515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1064	NC_015659	CGTT	2	8	46590	46597	0 %	50 %	25 %	25 %	336251540
1065	NC_015659	CGG	2	6	46746	46751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251540
1066	NC_015659	CGG	2	6	46770	46775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251540
1067	NC_015659	ATG	2	6	46777	46782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251540
1068	NC_015659	TCT	2	6	46787	46792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251540
1069	NC_015659	TTCG	2	8	46863	46870	0 %	50 %	25 %	25 %	336251540
1070	NC_015659	CTT	2	6	46940	46945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251540
1071	NC_015659	CGA	2	6	46973	46978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1072	NC_015659	CCT	2	6	47093	47098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251540
1073	NC_015659	TCG	2	6	47117	47122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1074	NC_015659	CG	3	6	47137	47142	0 %	0 %	50 %	50 %	336251540
1075	NC_015659	GGA	2	6	47150	47155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251540
1076	NC_015659	TCG	2	6	47158	47163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1077	NC_015659	TCG	2	6	47218	47223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1078	NC_015659	ACG	2	6	47248	47253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1079	NC_015659	GTC	2	6	47298	47303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251540
1080	NC_015659	TCC	2	6	47339	47344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251541
1081	NC_015659	CGCT	2	8	47371	47378	0 %	25 %	25 %	50 %	336251541
1082	NC_015659	GTC	2	6	47515	47520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1083	NC_015659	TCG	2	6	47525	47530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1084	NC_015659	ACG	2	6	47531	47536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1085	NC_015659	CG	3	6	47559	47564	0 %	0 %	50 %	50 %	336251541
1086	NC_015659	TGT	2	6	47607	47612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251541
1087	NC_015659	CGA	2	6	47619	47624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1088	NC_015659	CGT	2	6	47635	47640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1089	NC_015659	CTG	2	6	47650	47655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1090	NC_015659	GTCG	2	8	47676	47683	0 %	25 %	50 %	25 %	336251541
1091	NC_015659	TCG	2	6	47774	47779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1092	NC_015659	GAC	2	6	47851	47856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1093	NC_015659	CGGT	2	8	47861	47868	0 %	25 %	50 %	25 %	336251541
1094	NC_015659	GCC	2	6	47902	47907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251541
1095	NC_015659	CGT	2	6	47913	47918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1096	NC_015659	GCCGAG	2	12	47980	47991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336251541
1097	NC_015659	CCG	2	6	48035	48040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251541
1098	NC_015659	TGCCC	2	10	48051	48060	0 %	20 %	20 %	60 %	336251541
1099	NC_015659	TCC	2	6	48131	48136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251541
1100	NC_015659	TCG	2	6	48159	48164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1101	NC_015659	CGT	2	6	48192	48197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1102	NC_015659	GAA	2	6	48256	48261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251541
1103	NC_015659	GGC	2	6	48366	48371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251541
1104	NC_015659	GGA	2	6	48450	48455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251541
1105	NC_015659	ACA	2	6	48460	48465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251541
1106	NC_015659	TTTCG	2	10	48622	48631	0 %	60 %	20 %	20 %	336251541
1107	NC_015659	CGC	2	6	48642	48647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251541
1108	NC_015659	TCG	2	6	48678	48683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1109	NC_015659	GAA	2	6	48819	48824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251541
1110	NC_015659	GTC	2	6	48841	48846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1111	NC_015659	GTT	2	6	48961	48966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251541
1112	NC_015659	TCG	2	6	48980	48985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1113	NC_015659	ATC	2	6	48998	49003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251541
1114	NC_015659	AGT	2	6	49044	49049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251541
1115	NC_015659	ACG	2	6	49137	49142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1116	NC_015659	CGT	2	6	49182	49187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1117	NC_015659	CGA	3	9	49199	49207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1118	NC_015659	TCGCCG	2	12	49212	49223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251541
1119	NC_015659	GGC	2	6	49239	49244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251541
1120	NC_015659	CAA	2	6	49305	49310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251541
1121	NC_015659	CGA	2	6	49332	49337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1122	NC_015659	GTA	2	6	49427	49432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251541
1123	NC_015659	GTCG	2	8	49448	49455	0 %	25 %	50 %	25 %	336251541
1124	NC_015659	AGAGGT	2	12	49470	49481	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	336251541
1125	NC_015659	CTC	2	6	49486	49491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251541
1126	NC_015659	CTC	2	6	49498	49503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251541
1127	NC_015659	CGGT	2	8	49511	49518	0 %	25 %	50 %	25 %	336251541
1128	NC_015659	CGA	2	6	49530	49535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251541
1129	NC_015659	GTTT	2	8	49626	49633	0 %	75 %	25 %	0 %	336251541
1130	NC_015659	CCGG	2	8	49728	49735	0 %	0 %	50 %	50 %	336251542
1131	NC_015659	GTC	3	9	49756	49764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251542
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1134	NC_015659	CGAG	2	8	49866	49873	25 %	0 %	50 %	25 %	336251542
1135	NC_015659	GCG	2	6	49874	49879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251542
1136	NC_015659	TC	3	6	49884	49889	0 %	50 %	0 %	50 %	336251542
1137	NC_015659	CGA	2	6	49932	49937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251542
1138	NC_015659	CGA	2	6	49950	49955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251542
1139	NC_015659	CGA	2	6	50001	50006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251542
1140	NC_015659	CAG	2	6	50008	50013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251542
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1142	NC_015659	GAG	2	6	50059	50064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251542
1143	NC_015659	CGT	2	6	50091	50096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251542
1144	NC_015659	CACGC	2	10	50145	50154	20 %	0 %	20 %	60 %	336251542
1145	NC_015659	AGG	2	6	50180	50185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251542
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1147	NC_015659	CG	3	6	50261	50266	0 %	0 %	50 %	50 %	336251542
1148	NC_015659	CTCG	2	8	50281	50288	0 %	25 %	25 %	50 %	336251542
1149	NC_015659	GTA	2	6	50314	50319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251542
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1152	NC_015659	TTC	2	6	50383	50388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251542
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1154	NC_015659	CGG	3	9	50411	50419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251542
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1160	NC_015659	CGA	2	6	50529	50534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251542
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1188	NC_015659	GTA	2	6	51672	51677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1189	NC_015659	CGC	2	6	51696	51701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1202	NC_015659	CGA	2	6	52128	52133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1241	NC_015659	CGC	2	6	53513	53518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251543
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1246	NC_015659	ACA	2	6	53783	53788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251544
1247	NC_015659	CTT	2	6	53866	53871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251544
1248	NC_015659	GTC	2	6	53941	53946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251544
1249	NC_015659	TCC	2	6	53957	53962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251544
1250	NC_015659	CGGC	2	8	54042	54049	0 %	0 %	50 %	50 %	336251544
1251	NC_015659	CGG	2	6	54057	54062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251544
1252	NC_015659	TCCA	2	8	54065	54072	25 %	25 %	0 %	50 %	336251544
1253	NC_015659	GTC	2	6	54121	54126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251544
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1378	NC_015659	GTC	2	6	60092	60097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251553
1379	NC_015659	CCGTCG	2	12	60162	60173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336251553
1380	NC_015659	CGC	2	6	60247	60252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251553
1381	NC_015659	ACC	2	6	60262	60267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251553
1382	NC_015659	CGC	2	6	60274	60279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251553
1383	NC_015659	CGA	2	6	60292	60297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251553
1384	NC_015659	ACG	2	6	60391	60396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1385	NC_015659	CAG	2	6	60429	60434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251554
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1390	NC_015659	TCG	2	6	60609	60614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251554
1391	NC_015659	CGT	2	6	60727	60732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251554
1392	NC_015659	GAA	2	6	60745	60750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251554
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1394	NC_015659	TTG	2	6	60863	60868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251554
1395	NC_015659	GTC	2	6	60869	60874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251554
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1398	NC_015659	TCGTT	2	10	61095	61104	0 %	60 %	20 %	20 %	336251554
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1402	NC_015659	CTG	2	6	61205	61210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251555
1403	NC_015659	CGT	2	6	61249	61254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251555
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1405	NC_015659	GCG	2	6	61457	61462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251555
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1407	NC_015659	TTGG	2	8	61483	61490	0 %	50 %	50 %	0 %	336251555
1408	NC_015659	TCG	2	6	61539	61544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251555
1409	NC_015659	CGC	2	6	61627	61632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251555
1410	NC_015659	GTCGC	2	10	61717	61726	0 %	20 %	40 %	40 %	336251555
1411	NC_015659	GTC	2	6	61727	61732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251555
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1415	NC_015659	CGT	2	6	61820	61825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251555
1416	NC_015659	CGG	3	9	61856	61864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251555
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1418	NC_015659	ATA	3	9	61937	61945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336251555
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1427	NC_015659	CCG	3	9	62273	62281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251556
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1470	NC_015659	CG	3	6	64040	64045	0 %	0 %	50 %	50 %	336251557
1471	NC_015659	CG	3	6	64054	64059	0 %	0 %	50 %	50 %	336251557
1472	NC_015659	GCT	2	6	64118	64123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251557
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1482	NC_015659	TGCG	2	8	64498	64505	0 %	25 %	50 %	25 %	336251557
1483	NC_015659	TC	3	6	64614	64619	0 %	50 %	0 %	50 %	336251557
1484	NC_015659	AGC	2	6	64641	64646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251558
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1487	NC_015659	CGC	2	6	64685	64690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1488	NC_015659	CGC	2	6	64700	64705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1489	NC_015659	TCG	2	6	64754	64759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251558
1490	NC_015659	GGCG	2	8	64772	64779	0 %	0 %	75 %	25 %	336251558
1491	NC_015659	CGC	2	6	64880	64885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1492	NC_015659	GCC	2	6	64914	64919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1493	NC_015659	ACG	2	6	64946	64951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251558
1494	NC_015659	TCG	2	6	65032	65037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251558
1495	NC_015659	CGC	2	6	65123	65128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1496	NC_015659	CGA	2	6	65201	65206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251558
1497	NC_015659	GC	4	8	65276	65283	0 %	0 %	50 %	50 %	336251558
1498	NC_015659	GCC	2	6	65307	65312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251558
1499	NC_015659	CG	3	6	65331	65336	0 %	0 %	50 %	50 %	336251558
1500	NC_015659	TCG	2	6	65377	65382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251558

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