MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 1793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015513	CTG	2	6	76698	76703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668508
1502	NC_015513	CAAC	2	8	76724	76731	50 %	0 %	0 %	50 %	332668508
1503	NC_015513	TTG	2	6	76774	76779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668508
1504	NC_015513	AACCTC	2	12	76815	76826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668508
1505	NC_015513	CAA	2	6	76928	76933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668508
1506	NC_015513	CAA	2	6	77047	77052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668509
1507	NC_015513	CTT	2	6	77093	77098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668509
1508	NC_015513	TCT	2	6	77108	77113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668509
1509	NC_015513	T	6	6	77113	77118	0 %	100 %	0 %	0 %	332668509
1510	NC_015513	AGCC	2	8	77141	77148	25 %	0 %	25 %	50 %	332668509
1511	NC_015513	TGG	2	6	77235	77240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668509
1512	NC_015513	GTTG	2	8	77248	77255	0 %	50 %	50 %	0 %	332668509
1513	NC_015513	GTTT	2	8	77346	77353	0 %	75 %	25 %	0 %	332668509
1514	NC_015513	TGT	2	6	77414	77419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668509
1515	NC_015513	CAA	2	6	77551	77556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668510
1516	NC_015513	T	6	6	77580	77585	0 %	100 %	0 %	0 %	332668510
1517	NC_015513	TGA	2	6	77636	77641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668510
1518	NC_015513	TA	3	6	77674	77679	50 %	50 %	0 %	0 %	332668510
1519	NC_015513	CAA	2	6	77790	77795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668510
1520	NC_015513	CAT	2	6	77801	77806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668510
1521	NC_015513	GAAA	2	8	77814	77821	75 %	0 %	25 %	0 %	332668510
1522	NC_015513	A	7	7	77819	77825	100 %	0 %	0 %	0 %	332668510
1523	NC_015513	TTG	2	6	77863	77868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015513	TGC	2	6	77939	77944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_015513	GGC	2	6	77964	77969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015513	AGT	2	6	77983	77988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015513	TCA	2	6	78059	78064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015513	ACA	2	6	78088	78093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015513	TGA	2	6	78106	78111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015513	GAT	2	6	78132	78137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015513	A	6	6	78409	78414	100 %	0 %	0 %	0 %	332668511
1532	NC_015513	GTT	3	9	78418	78426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668511
1533	NC_015513	AAT	2	6	78466	78471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668511
1534	NC_015513	CAA	2	6	78477	78482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668511
1535	NC_015513	AAT	2	6	78589	78594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668511
1536	NC_015513	ACA	2	6	78626	78631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668511
1537	NC_015513	TGG	2	6	78642	78647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668511
1538	NC_015513	CAA	2	6	78648	78653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668511
1539	NC_015513	A	6	6	78656	78661	100 %	0 %	0 %	0 %	332668511
1540	NC_015513	CAAT	2	8	78717	78724	50 %	25 %	0 %	25 %	332668511
1541	NC_015513	AAGA	2	8	78735	78742	75 %	0 %	25 %	0 %	332668511
1542	NC_015513	AAAGA	2	10	78811	78820	80 %	0 %	20 %	0 %	332668511
1543	NC_015513	AAT	2	6	78883	78888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668511
1544	NC_015513	TTAT	2	8	78889	78896	25 %	75 %	0 %	0 %	332668511
1545	NC_015513	T	6	6	78916	78921	0 %	100 %	0 %	0 %	332668511
1546	NC_015513	TTA	2	6	78968	78973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668511
1547	NC_015513	T	6	6	79096	79101	0 %	100 %	0 %	0 %	332668511
1548	NC_015513	ATTA	2	8	79119	79126	50 %	50 %	0 %	0 %	332668511
1549	NC_015513	ATTG	2	8	79127	79134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015513	ACA	2	6	79204	79209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015513	A	6	6	79287	79292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015513	ACC	2	6	79318	79323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015513	TTG	2	6	79327	79332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015513	CTG	2	6	79387	79392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668512
1555	NC_015513	GCA	2	6	79505	79510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668512
1556	NC_015513	GCC	2	6	79535	79540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668512
1557	NC_015513	AAT	2	6	79624	79629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668512
1558	NC_015513	ACCA	2	8	79650	79657	50 %	0 %	0 %	50 %	332668512
1559	NC_015513	A	6	6	79721	79726	100 %	0 %	0 %	0 %	332668512
1560	NC_015513	GGT	2	6	79741	79746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668512
1561	NC_015513	GCTT	2	8	79766	79773	0 %	50 %	25 %	25 %	332668512
1562	NC_015513	ATC	2	6	79811	79816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668512
1563	NC_015513	ACTT	2	8	79882	79889	25 %	50 %	0 %	25 %	332668512
1564	NC_015513	CAT	2	6	79900	79905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668512
1565	NC_015513	TTTCCA	2	12	79983	79994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332668512
1566	NC_015513	GCT	2	6	80006	80011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668512
1567	NC_015513	AGG	2	6	80040	80045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668512
1568	NC_015513	A	6	6	80092	80097	100 %	0 %	0 %	0 %	332668512
1569	NC_015513	AGC	2	6	80116	80121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668512
1570	NC_015513	TG	3	6	80172	80177	0 %	50 %	50 %	0 %	332668512
1571	NC_015513	AGG	2	6	80213	80218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668512
1572	NC_015513	GAT	2	6	80240	80245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668512
1573	NC_015513	AAT	2	6	80281	80286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668512
1574	NC_015513	A	8	8	80296	80303	100 %	0 %	0 %	0 %	332668512
1575	NC_015513	GAG	2	6	80398	80403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015513	ATT	2	6	80424	80429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668513
1577	NC_015513	TAT	2	6	80430	80435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668513
1578	NC_015513	TCT	2	6	80522	80527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668513
1579	NC_015513	TTGA	2	8	80587	80594	25 %	50 %	25 %	0 %	332668513
1580	NC_015513	GTT	2	6	80604	80609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015513	GCG	2	6	80622	80627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_015513	TTTA	2	8	80656	80663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015513	T	8	8	80686	80693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015513	T	6	6	80710	80715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015513	CTT	2	6	80763	80768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015513	CTTAT	2	10	80785	80794	20 %	60 %	0 %	20 %	332668514
1587	NC_015513	ATA	2	6	80848	80853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668514
1588	NC_015513	CTTC	2	8	80897	80904	0 %	50 %	0 %	50 %	332668514
1589	NC_015513	GTT	2	6	80977	80982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668514
1590	NC_015513	CCG	2	6	81027	81032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668514
1591	NC_015513	GCT	2	6	81083	81088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1592	NC_015513	TGC	2	6	81114	81119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1593	NC_015513	CAC	2	6	81120	81125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668514
1594	NC_015513	GTT	2	6	81158	81163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668514
1595	NC_015513	A	6	6	81247	81252	100 %	0 %	0 %	0 %	332668514
1596	NC_015513	T	6	6	81443	81448	0 %	100 %	0 %	0 %	332668514
1597	NC_015513	GCA	2	6	81479	81484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1598	NC_015513	ATGG	2	8	81592	81599	25 %	25 %	50 %	0 %	332668514
1599	NC_015513	AGGT	2	8	81631	81638	25 %	25 %	50 %	0 %	332668514
1600	NC_015513	CTG	2	6	81646	81651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1601	NC_015513	TTG	2	6	81662	81667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668514
1602	NC_015513	ACA	2	6	81684	81689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668514
1603	NC_015513	GGC	2	6	81730	81735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668514
1604	NC_015513	CAA	2	6	81806	81811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668514
1605	NC_015513	AAT	2	6	81884	81889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668514
1606	NC_015513	GGT	2	6	81907	81912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668514
1607	NC_015513	GCA	2	6	81986	81991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1608	NC_015513	AAC	2	6	82134	82139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668514
1609	NC_015513	GGC	2	6	82222	82227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668514
1610	NC_015513	TA	3	6	82344	82349	50 %	50 %	0 %	0 %	332668514
1611	NC_015513	TGA	3	9	82392	82400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668514
1612	NC_015513	CAC	2	6	82410	82415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668514
1613	NC_015513	ACC	2	6	82430	82435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668514
1614	NC_015513	GTAAG	2	10	82479	82488	40 %	20 %	40 %	0 %	332668514
1615	NC_015513	CAGG	2	8	82501	82508	25 %	0 %	50 %	25 %	332668514
1616	NC_015513	TTC	2	6	82552	82557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668514
1617	NC_015513	GCC	2	6	82612	82617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668514
1618	NC_015513	GCT	2	6	82832	82837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668514
1619	NC_015513	A	6	6	82970	82975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015513	TGGTTT	2	12	83033	83044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015513	T	6	6	83056	83061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015513	CTAA	2	8	83062	83069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_015513	TTG	2	6	83082	83087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015513	A	6	6	83092	83097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015513	A	7	7	83152	83158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015513	GTG	2	6	83173	83178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015513	CTT	2	6	83205	83210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668515
1628	NC_015513	GTG	2	6	83233	83238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668515
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1630	NC_015513	CCA	2	6	83348	83353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668515
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1632	NC_015513	CTT	2	6	83519	83524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668515
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1651	NC_015513	GTG	2	6	84157	84162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668516
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1793	NC_015513	T	8	8	92180	92187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.