MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 3192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015511	GTC	2	6	154226	154231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661882
3002	NC_015511	ATGCT	2	10	154249	154258	20 %	40 %	20 %	20 %	332661882
3003	NC_015511	GCA	2	6	154329	154334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661882
3004	NC_015511	TGA	2	6	154337	154342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661882
3005	NC_015511	A	6	6	154374	154379	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
3006	NC_015511	A	6	6	154386	154391	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
3007	NC_015511	T	6	6	154409	154414	0 %	100 %	0 %	0 %	332661882
3008	NC_015511	CAAC	2	8	154430	154437	50 %	0 %	0 %	50 %	332661882
3009	NC_015511	AATTT	2	10	154467	154476	40 %	60 %	0 %	0 %	332661882
3010	NC_015511	CGCT	2	8	154492	154499	0 %	25 %	25 %	50 %	332661882
3011	NC_015511	CTA	2	6	154530	154535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661882
3012	NC_015511	TAA	2	6	154572	154577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661882
3013	NC_015511	AT	3	6	154578	154583	50 %	50 %	0 %	0 %	332661882
3014	NC_015511	TAC	2	6	154624	154629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661882
3015	NC_015511	A	6	6	154637	154642	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
3016	NC_015511	AAT	2	6	154652	154657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661882
3017	NC_015511	GTG	2	6	154663	154668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661882
3018	NC_015511	GTT	2	6	154744	154749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661883
3019	NC_015511	A	6	6	154787	154792	100 %	0 %	0 %	0 %	332661883
3020	NC_015511	GTAA	2	8	154793	154800	50 %	25 %	25 %	0 %	332661883
3021	NC_015511	CT	3	6	154808	154813	0 %	50 %	0 %	50 %	332661883
3022	NC_015511	CTC	3	9	154831	154839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
3023	NC_015511	TCC	2	6	154850	154855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
3024	NC_015511	TTC	2	6	154903	154908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661883
3025	NC_015511	AGG	2	6	154920	154925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661883
3026	NC_015511	GTT	2	6	155034	155039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661883
3027	NC_015511	CGG	2	6	155085	155090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
3028	NC_015511	GCCTGG	2	12	155123	155134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332661883
3029	NC_015511	CTG	2	6	155137	155142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3030	NC_015511	CTC	2	6	155161	155166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
3031	NC_015511	CTG	2	6	155170	155175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3032	NC_015511	GCT	2	6	155182	155187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3033	NC_015511	A	6	6	155344	155349	100 %	0 %	0 %	0 %	332661883
3034	NC_015511	TGCG	2	8	155460	155467	0 %	25 %	50 %	25 %	332661883
3035	NC_015511	GCG	2	6	155495	155500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
3036	NC_015511	TGC	2	6	155592	155597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3037	NC_015511	CGT	2	6	155667	155672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3038	NC_015511	GTA	2	6	155737	155742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661883
3039	NC_015511	GGCGG	2	10	155749	155758	0 %	0 %	80 %	20 %	332661883
3040	NC_015511	CGC	2	6	155763	155768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661883
3041	NC_015511	CGG	2	6	155814	155819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
3042	NC_015511	T	6	6	155820	155825	0 %	100 %	0 %	0 %	332661883
3043	NC_015511	GGTATC	2	12	155851	155862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332661883
3044	NC_015511	CGG	2	6	155876	155881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
3045	NC_015511	ACC	2	6	155984	155989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661883
3046	NC_015511	GAA	2	6	156001	156006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661883
3047	NC_015511	GTA	2	6	156146	156151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661883
3048	NC_015511	CTT	2	6	156252	156257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661883
3049	NC_015511	G	6	6	156292	156297	0 %	0 %	100 %	0 %	332661883
3050	NC_015511	TGC	2	6	156341	156346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
3051	NC_015511	CGG	2	6	156495	156500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
3052	NC_015511	TAA	2	6	156579	156584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015511	TAA	2	6	156609	156614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015511	CA	3	6	156622	156627	50 %	0 %	0 %	50 %	332661884
3055	NC_015511	G	6	6	156688	156693	0 %	0 %	100 %	0 %	332661884
3056	NC_015511	CAA	2	6	156759	156764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661884
3057	NC_015511	TGA	2	6	156866	156871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661885
3058	NC_015511	GT	3	6	156901	156906	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
3059	NC_015511	GT	3	6	156909	156914	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
3060	NC_015511	GGC	2	6	156930	156935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661885
3061	NC_015511	T	6	6	156960	156965	0 %	100 %	0 %	0 %	332661885
3062	NC_015511	AGC	2	6	157015	157020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661885
3063	NC_015511	GAA	2	6	157096	157101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661885
3064	NC_015511	AGT	2	6	157140	157145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661885
3065	NC_015511	T	6	6	157278	157283	0 %	100 %	0 %	0 %	332661885
3066	NC_015511	GGATTT	2	12	157319	157330	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332661885
3067	NC_015511	GGC	2	6	157464	157469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661885
3068	NC_015511	TAGG	2	8	157501	157508	25 %	25 %	50 %	0 %	332661885
3069	NC_015511	CTG	2	6	157538	157543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661885
3070	NC_015511	TCT	3	9	157591	157599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661885
3071	NC_015511	TCT	2	6	157603	157608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661885
3072	NC_015511	TCA	2	6	157634	157639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661885
3073	NC_015511	TTC	2	6	157695	157700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661885
3074	NC_015511	GAG	2	6	157725	157730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661885
3075	NC_015511	GAG	2	6	157752	157757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661885
3076	NC_015511	ATG	2	6	157812	157817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661885
3077	NC_015511	GTG	2	6	157842	157847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661885
3078	NC_015511	A	6	6	157849	157854	100 %	0 %	0 %	0 %	332661885
3079	NC_015511	GT	3	6	157862	157867	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
3080	NC_015511	GCTGAT	2	12	158073	158084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332661885
3081	NC_015511	TGT	2	6	158096	158101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661885
3082	NC_015511	TTCC	2	8	158139	158146	0 %	50 %	0 %	50 %	332661885
3083	NC_015511	TCG	2	6	158149	158154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661885
3084	NC_015511	TTG	2	6	158158	158163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661885
3085	NC_015511	GAT	2	6	158172	158177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661885
3086	NC_015511	TTC	2	6	158271	158276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661885
3087	NC_015511	ACT	2	6	158308	158313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661885
3088	NC_015511	CCG	2	6	158371	158376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661885
3089	NC_015511	GGGGAG	2	12	158415	158426	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	332661885
3090	NC_015511	GTGG	2	8	158451	158458	0 %	25 %	75 %	0 %	332661885
3091	NC_015511	TTTG	2	8	158543	158550	0 %	75 %	25 %	0 %	332661885
3092	NC_015511	AGG	2	6	158558	158563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661885
3093	NC_015511	GCGTT	2	10	158614	158623	0 %	40 %	40 %	20 %	332661885
3094	NC_015511	G	7	7	158637	158643	0 %	0 %	100 %	0 %	332661885
3095	NC_015511	A	7	7	158692	158698	100 %	0 %	0 %	0 %	332661885
3096	NC_015511	TTAAG	2	10	158933	158942	40 %	40 %	20 %	0 %	332661885
3097	NC_015511	TCGC	2	8	158980	158987	0 %	25 %	25 %	50 %	332661885
3098	NC_015511	GGT	2	6	159102	159107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661885
3099	NC_015511	ATG	2	6	159139	159144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661885
3100	NC_015511	TCAGA	2	10	159173	159182	40 %	20 %	20 %	20 %	332661885
3101	NC_015511	TCAAG	2	10	159263	159272	40 %	20 %	20 %	20 %	332661885
3102	NC_015511	TC	3	6	159457	159462	0 %	50 %	0 %	50 %	332661885
3103	NC_015511	GGTC	2	8	159638	159645	0 %	25 %	50 %	25 %	332661885
3104	NC_015511	TCAAG	2	10	159659	159668	40 %	20 %	20 %	20 %	332661885
3105	NC_015511	A	7	7	159793	159799	100 %	0 %	0 %	0 %	332661885
3106	NC_015511	GGA	2	6	159832	159837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661885
3107	NC_015511	TAT	2	6	159858	159863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661885
3108	NC_015511	TCA	2	6	159901	159906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661885
3109	NC_015511	AAT	2	6	159911	159916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661885
3110	NC_015511	AACTC	2	10	159929	159938	40 %	20 %	0 %	40 %	332661885
3111	NC_015511	CA	4	8	159946	159953	50 %	0 %	0 %	50 %	332661885
3112	NC_015511	TCAG	2	8	159976	159983	25 %	25 %	25 %	25 %	332661885
3113	NC_015511	TGCC	2	8	160061	160068	0 %	25 %	25 %	50 %	332661885
3114	NC_015511	A	7	7	160153	160159	100 %	0 %	0 %	0 %	332661885
3115	NC_015511	AGGGC	2	10	160185	160194	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3116	NC_015511	TGG	2	6	160224	160229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015511	GCA	2	6	160290	160295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015511	AGGC	2	8	160315	160322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_015511	GGA	2	6	160362	160367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015511	TTGAAT	2	12	160388	160399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015511	T	6	6	160415	160420	0 %	100 %	0 %	0 %	332661886
3122	NC_015511	TGA	2	6	160506	160511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661886
3123	NC_015511	GGC	2	6	160568	160573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661886
3124	NC_015511	TGT	2	6	160686	160691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661886
3125	NC_015511	TCA	2	6	160803	160808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661886
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3127	NC_015511	TCT	2	6	160948	160953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661886
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3129	NC_015511	T	6	6	161330	161335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015511	T	7	7	161340	161346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015511	T	6	6	161351	161356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015511	TA	3	6	161468	161473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015511	TGC	2	6	161563	161568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661887
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3140	NC_015511	GCC	2	6	161929	161934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661888
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3157	NC_015511	GCTGC	2	10	162734	162743	0 %	20 %	40 %	40 %	332661889
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3163	NC_015511	G	8	8	162854	162861	0 %	0 %	100 %	0 %	332661889
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3169	NC_015511	ATTT	2	8	163053	163060	25 %	75 %	0 %	0 %	332661889
3170	NC_015511	A	6	6	163150	163155	100 %	0 %	0 %	0 %	332661889
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3188	NC_015511	T	7	7	163840	163846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3189	NC_015511	T	6	6	163886	163891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3190	NC_015511	TTAG	2	8	163931	163938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3191	NC_015511	T	6	6	163976	163981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3192	NC_015511	CTA	2	6	164013	164018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.