MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 3192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015511	A	6	6	102999	103004	100 %	0 %	0 %	0 %	332661847
2002	NC_015511	TAT	2	6	103013	103018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661847
2003	NC_015511	AGC	2	6	103027	103032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661847
2004	NC_015511	TTG	2	6	103043	103048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661847
2005	NC_015511	ACCT	2	8	103148	103155	25 %	25 %	0 %	50 %	332661847
2006	NC_015511	AAAAC	2	10	103270	103279	80 %	0 %	0 %	20 %	332661847
2007	NC_015511	TGG	2	6	103324	103329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661847
2008	NC_015511	TGT	2	6	103338	103343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661847
2009	NC_015511	TCC	2	6	103385	103390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661847
2010	NC_015511	ATG	2	6	103457	103462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661847
2011	NC_015511	GAA	2	6	103513	103518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661847
2012	NC_015511	ACA	2	6	103542	103547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661847
2013	NC_015511	GAA	2	6	103607	103612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661847
2014	NC_015511	ATT	2	6	103672	103677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661847
2015	NC_015511	A	6	6	103760	103765	100 %	0 %	0 %	0 %	332661848
2016	NC_015511	TCCAAT	2	12	103777	103788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661848
2017	NC_015511	CTTG	2	8	103812	103819	0 %	50 %	25 %	25 %	332661848
2018	NC_015511	GCTG	2	8	103827	103834	0 %	25 %	50 %	25 %	332661848
2019	NC_015511	AAGA	2	8	103846	103853	75 %	0 %	25 %	0 %	332661848
2020	NC_015511	AGTC	2	8	103880	103887	25 %	25 %	25 %	25 %	332661848
2021	NC_015511	AAAC	2	8	103975	103982	75 %	0 %	0 %	25 %	332661848
2022	NC_015511	TGC	2	6	103983	103988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2023	NC_015511	CCAA	2	8	104047	104054	50 %	0 %	0 %	50 %	332661848
2024	NC_015511	A	7	7	104093	104099	100 %	0 %	0 %	0 %	332661848
2025	NC_015511	GCAGA	2	10	104101	104110	40 %	0 %	40 %	20 %	332661848
2026	NC_015511	ACAAG	2	10	104146	104155	60 %	0 %	20 %	20 %	332661848
2027	NC_015511	GCA	2	6	104159	104164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2028	NC_015511	TGGC	2	8	104177	104184	0 %	25 %	50 %	25 %	332661848
2029	NC_015511	A	6	6	104219	104224	100 %	0 %	0 %	0 %	332661848
2030	NC_015511	ACT	2	6	104241	104246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661848
2031	NC_015511	TGA	2	6	104267	104272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661848
2032	NC_015511	CAA	2	6	104278	104283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661848
2033	NC_015511	CTG	2	6	104296	104301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2034	NC_015511	CATT	2	8	104324	104331	25 %	50 %	0 %	25 %	332661848
2035	NC_015511	AGC	2	6	104334	104339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2036	NC_015511	GCTT	2	8	104354	104361	0 %	50 %	25 %	25 %	332661848
2037	NC_015511	ACG	2	6	104369	104374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2038	NC_015511	GCA	2	6	104468	104473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2039	NC_015511	AGA	2	6	104520	104525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661848
2040	NC_015511	AAG	2	6	104537	104542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661848
2041	NC_015511	CTT	2	6	104721	104726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661848
2042	NC_015511	CAA	2	6	104766	104771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661848
2043	NC_015511	CAG	2	6	104855	104860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2044	NC_015511	CAG	3	9	104976	104984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661848
2045	NC_015511	A	7	7	105042	105048	100 %	0 %	0 %	0 %	332661848
2046	NC_015511	TTG	2	6	105087	105092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661849
2047	NC_015511	GGT	2	6	105167	105172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661849
2048	NC_015511	A	7	7	105228	105234	100 %	0 %	0 %	0 %	332661849
2049	NC_015511	AAC	2	6	105243	105248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661849
2050	NC_015511	GAGC	2	8	105263	105270	25 %	0 %	50 %	25 %	332661849
2051	NC_015511	GAC	2	6	105324	105329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661849
2052	NC_015511	CTT	2	6	105373	105378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661849
2053	NC_015511	A	6	6	105444	105449	100 %	0 %	0 %	0 %	332661849
2054	NC_015511	GAA	2	6	105477	105482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661849
2055	NC_015511	TGC	2	6	105568	105573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661849
2056	NC_015511	A	7	7	105642	105648	100 %	0 %	0 %	0 %	332661849
2057	NC_015511	CTA	2	6	105655	105660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661849
2058	NC_015511	ACA	2	6	105670	105675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661849
2059	NC_015511	AAG	2	6	105709	105714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661849
2060	NC_015511	TGCT	2	8	105970	105977	0 %	50 %	25 %	25 %	332661849
2061	NC_015511	TGA	2	6	106121	106126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661849
2062	NC_015511	TCGAA	2	10	106127	106136	40 %	20 %	20 %	20 %	332661849
2063	NC_015511	TTG	2	6	106188	106193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661849
2064	NC_015511	A	6	6	106212	106217	100 %	0 %	0 %	0 %	332661849
2065	NC_015511	TTG	2	6	106414	106419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661850
2066	NC_015511	GCT	2	6	106424	106429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661850
2067	NC_015511	GGAA	2	8	106481	106488	50 %	0 %	50 %	0 %	332661850
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2069	NC_015511	TAC	3	9	106643	106651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661850
2070	NC_015511	CA	3	6	106699	106704	50 %	0 %	0 %	50 %	332661850
2071	NC_015511	TGGC	2	8	106714	106721	0 %	25 %	50 %	25 %	332661850
2072	NC_015511	TAT	2	6	106832	106837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661850
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2075	NC_015511	TGA	2	6	106925	106930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661850
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2080	NC_015511	TGA	2	6	107315	107320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661850
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2090	NC_015511	ATG	2	6	107790	107795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661850
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2092	NC_015511	GTG	2	6	107958	107963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661850
2093	NC_015511	CAA	2	6	107970	107975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661850
2094	NC_015511	TCA	2	6	107983	107988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661850
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2098	NC_015511	GTT	2	6	108297	108302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661851
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2101	NC_015511	TTTG	2	8	108506	108513	0 %	75 %	25 %	0 %	332661851
2102	NC_015511	ATC	2	6	108578	108583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661851
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2104	NC_015511	GCG	2	6	108668	108673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661851
2105	NC_015511	CTC	2	6	108704	108709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661851
2106	NC_015511	TGA	2	6	108711	108716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661851
2107	NC_015511	CAT	2	6	108736	108741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661851
2108	NC_015511	GCA	2	6	108763	108768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661851
2109	NC_015511	TGG	2	6	108774	108779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661851
2110	NC_015511	GCTG	2	8	108835	108842	0 %	25 %	50 %	25 %	332661851
2111	NC_015511	AC	3	6	108881	108886	50 %	0 %	0 %	50 %	332661851
2112	NC_015511	ATT	2	6	108905	108910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661851
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2117	NC_015511	TGA	2	6	109425	109430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661851
2118	NC_015511	TTCC	2	8	109439	109446	0 %	50 %	0 %	50 %	332661851
2119	NC_015511	TGC	2	6	109503	109508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661851
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2122	NC_015511	ATT	2	6	109667	109672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661851
2123	NC_015511	ATTG	2	8	109680	109687	25 %	50 %	25 %	0 %	332661851
2124	NC_015511	ATT	2	6	109715	109720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661851
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2135	NC_015511	TGT	2	6	110246	110251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_015511	TGC	2	6	110264	110269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_015511	TCAA	2	8	110381	110388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2138	NC_015511	CCCAAT	2	12	110392	110403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2139	NC_015511	A	6	6	110466	110471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_015511	CAT	2	6	110505	110510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661852
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2154	NC_015511	A	7	7	111222	111228	100 %	0 %	0 %	0 %	332661852
2155	NC_015511	GCC	2	6	111298	111303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661852
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2212	NC_015511	TGGT	2	8	114239	114246	0 %	50 %	50 %	0 %	332661853
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2223	NC_015511	AGCA	2	8	114719	114726	50 %	0 %	25 %	25 %	332661854
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2227	NC_015511	CCTG	2	8	114963	114970	0 %	25 %	25 %	50 %	332661854
2228	NC_015511	GGA	2	6	114990	114995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661854
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2230	NC_015511	GTT	2	6	115078	115083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661854
2231	NC_015511	AG	3	6	115135	115140	50 %	0 %	50 %	0 %	332661854
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2234	NC_015511	ATTGCG	2	12	115364	115375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332661854
2235	NC_015511	CCT	2	6	115401	115406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661854
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2237	NC_015511	AAC	2	6	115617	115622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_015511	TAT	2	6	115647	115652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2239	NC_015511	AAGA	2	8	115670	115677	75 %	0 %	25 %	0 %	332661855
2240	NC_015511	CAC	2	6	115731	115736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661855
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2242	NC_015511	A	6	6	115798	115803	100 %	0 %	0 %	0 %	332661855
2243	NC_015511	GAT	2	6	115875	115880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
2244	NC_015511	T	6	6	115998	116003	0 %	100 %	0 %	0 %	332661855
2245	NC_015511	TGA	2	6	116099	116104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
2246	NC_015511	CCT	2	6	116111	116116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661855
2247	NC_015511	TCC	2	6	116263	116268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661855
2248	NC_015511	ATG	2	6	116334	116339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
2249	NC_015511	GCC	2	6	116412	116417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661855
2250	NC_015511	AAG	2	6	116419	116424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661855
2251	NC_015511	ATC	2	6	116443	116448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661855
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2253	NC_015511	TGA	2	6	116509	116514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
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2256	NC_015511	GTT	2	6	116589	116594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_015511	ATT	2	6	116667	116672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661856
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2259	NC_015511	TGA	2	6	116895	116900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661856
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2262	NC_015511	AAC	2	6	117011	117016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_015511	GCG	2	6	117144	117149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661857
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2268	NC_015511	CCA	2	6	117426	117431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661857
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2273	NC_015511	T	6	6	117800	117805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_015511	TGG	2	6	117824	117829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_015511	GTTTAA	2	12	117917	117928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2276	NC_015511	GTT	4	12	117935	117946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2277	NC_015511	GGT	2	6	118021	118026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2278	NC_015511	TG	3	6	118030	118035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2279	NC_015511	TTGAA	2	10	118100	118109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_015511	GTT	2	6	118121	118126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2281	NC_015511	GTT	2	6	118243	118248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_015511	GTT	2	6	118298	118303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2283	NC_015511	TGGT	2	8	118342	118349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2284	NC_015511	TGA	2	6	118381	118386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_015511	TGG	2	6	118441	118446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_015511	TAT	2	6	118495	118500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_015511	TTA	2	6	118516	118521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2288	NC_015511	GGA	2	6	118538	118543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_015511	ATG	2	6	118559	118564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2291	NC_015511	T	6	6	118628	118633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_015511	TGCGG	2	10	118643	118652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2295	NC_015511	TGG	2	6	118766	118771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2296	NC_015511	A	6	6	118788	118793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2297	NC_015511	TTGAG	2	10	118855	118864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2298	NC_015511	GTT	2	6	118880	118885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2299	NC_015511	GTT	2	6	118902	118907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2300	NC_015511	GAG	2	6	118947	118952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2301	NC_015511	TTTGA	2	10	119033	119042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2302	NC_015511	AAAT	2	8	119072	119079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2303	NC_015511	CCCGT	2	10	119091	119100	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2304	NC_015511	CCA	2	6	119128	119133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2306	NC_015511	GAC	2	6	119148	119153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2342	NC_015511	TGTT	2	8	121122	121129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2343	NC_015511	ATTT	2	8	121220	121227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2349	NC_015511	A	6	6	121514	121519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2350	NC_015511	TAAA	2	8	121555	121562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2351	NC_015511	TAA	2	6	121585	121590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2352	NC_015511	CTTTT	2	10	121619	121628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2353	NC_015511	T	6	6	121698	121703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_015511	GTT	2	6	121704	121709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2355	NC_015511	T	7	7	121724	121730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2356	NC_015511	AT	3	6	121761	121766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2357	NC_015511	A	6	6	121809	121814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2358	NC_015511	TAAA	2	8	122068	122075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_015511	ATC	2	6	122198	122203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2361	NC_015511	TTA	2	6	122210	122215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2362	NC_015511	T	6	6	122221	122226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2363	NC_015511	A	6	6	122289	122294	100 %	0 %	0 %	0 %	332661861
2364	NC_015511	GTG	2	6	122320	122325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661861
2365	NC_015511	CAAT	2	8	122334	122341	50 %	25 %	0 %	25 %	332661861
2366	NC_015511	ACT	2	6	122354	122359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661861
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2369	NC_015511	TCA	2	6	122462	122467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661861
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2371	NC_015511	A	6	6	122536	122541	100 %	0 %	0 %	0 %	332661861
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2373	NC_015511	AAT	2	6	122686	122691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661861
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2495	NC_015511	GGA	2	6	128346	128351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2496	NC_015511	A	8	8	128379	128386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_015511	G	6	6	128390	128395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_015511	GGGT	2	8	128403	128410	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2499	NC_015511	T	6	6	128444	128449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_015511	ACC	2	6	128452	128457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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