MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 37680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	TAATA	2	10	13	22	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015318	A	6	6	61	66	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
3	NC_015318	TAG	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398174
4	NC_015318	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398174
5	NC_015318	AG	3	6	202	207	50 %	0 %	50 %	0 %	327398174
6	NC_015318	TAA	2	6	249	254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
7	NC_015318	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398174
8	NC_015318	TGC	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398174
9	NC_015318	TA	3	6	388	393	50 %	50 %	0 %	0 %	327398174
10	NC_015318	TCAA	2	8	443	450	50 %	25 %	0 %	25 %	327398174
11	NC_015318	GAA	2	6	451	456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398174
12	NC_015318	GAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398174
13	NC_015318	A	7	7	530	536	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
14	NC_015318	AAAT	2	8	550	557	75 %	25 %	0 %	0 %	327398174
15	NC_015318	GAT	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398174
16	NC_015318	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
17	NC_015318	GAA	3	9	620	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398174
18	NC_015318	ACC	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398174
19	NC_015318	TCG	2	6	753	758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398174
20	NC_015318	ATC	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398174
21	NC_015318	A	6	6	803	808	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
22	NC_015318	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398174
23	NC_015318	ATA	2	6	842	847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
24	NC_015318	TAA	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
25	NC_015318	AAGAA	2	10	985	994	80 %	0 %	20 %	0 %	327398174
26	NC_015318	A	6	6	993	998	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
27	NC_015318	A	6	6	1020	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
28	NC_015318	ATC	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398174
29	NC_015318	A	7	7	1078	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
30	NC_015318	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
31	NC_015318	CAA	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398174
32	NC_015318	TAA	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
33	NC_015318	A	9	9	1244	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	327398174
34	NC_015318	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	327398175
35	NC_015318	CAAAA	2	10	1342	1351	80 %	0 %	0 %	20 %	327398175
36	NC_015318	AAC	3	9	1353	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398175
37	NC_015318	AGAA	2	8	1408	1415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015318	A	7	7	1417	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015318	TTA	3	9	1448	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015318	A	6	6	1463	1468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015318	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015318	AGG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015318	AAG	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
44	NC_015318	CCAAA	2	10	1510	1519	60 %	0 %	0 %	40 %	327398176
45	NC_015318	TAA	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
46	NC_015318	AAAAGA	2	12	1561	1572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	327398176
47	NC_015318	AGA	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
48	NC_015318	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
49	NC_015318	ATA	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
50	NC_015318	A	6	6	1653	1658	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
51	NC_015318	ATA	2	6	1694	1699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
52	NC_015318	GAA	2	6	1739	1744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
53	NC_015318	A	7	7	1764	1770	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
54	NC_015318	ATC	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398176
55	NC_015318	CA	3	6	1836	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	327398176
56	NC_015318	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
57	NC_015318	A	7	7	1885	1891	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
58	NC_015318	A	7	7	1894	1900	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
59	NC_015318	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	327398176
60	NC_015318	TATAAA	2	12	2020	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
61	NC_015318	GCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398176
62	NC_015318	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
63	NC_015318	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398176
64	NC_015318	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398176
65	NC_015318	TAGA	2	8	2226	2233	50 %	25 %	25 %	0 %	327398176
66	NC_015318	TAGAAA	2	12	2250	2261	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327398176
67	NC_015318	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
68	NC_015318	A	6	6	2343	2348	100 %	0 %	0 %	0 %	327398176
69	NC_015318	GA	3	6	2379	2384	50 %	0 %	50 %	0 %	327398176
70	NC_015318	ATT	2	6	2556	2561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398176
71	NC_015318	A	6	6	2601	2606	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
72	NC_015318	CAT	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398177
73	NC_015318	AAT	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
74	NC_015318	A	7	7	2766	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
75	NC_015318	AAT	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
76	NC_015318	CA	3	6	2815	2820	50 %	0 %	0 %	50 %	327398177
77	NC_015318	AT	3	6	2850	2855	50 %	50 %	0 %	0 %	327398177
78	NC_015318	TTAG	2	8	2872	2879	25 %	50 %	25 %	0 %	327398177
79	NC_015318	GTT	2	6	2881	2886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398177
80	NC_015318	A	8	8	2892	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
81	NC_015318	GCTT	2	8	2905	2912	0 %	50 %	25 %	25 %	327398177
82	NC_015318	TAG	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398177
83	NC_015318	ATA	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
84	NC_015318	A	7	7	3028	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
85	NC_015318	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
86	NC_015318	GTT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398177
87	NC_015318	TCA	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398177
88	NC_015318	ATAAA	2	10	3104	3113	80 %	20 %	0 %	0 %	327398177
89	NC_015318	ATTT	2	8	3150	3157	25 %	75 %	0 %	0 %	327398177
90	NC_015318	A	6	6	3165	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
91	NC_015318	CTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398177
92	NC_015318	A	6	6	3205	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
93	NC_015318	GAAAAA	2	12	3256	3267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	327398177
94	NC_015318	A	7	7	3269	3275	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
95	NC_015318	A	6	6	3295	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
96	NC_015318	ATA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
97	NC_015318	A	7	7	3361	3367	100 %	0 %	0 %	0 %	327398177
98	NC_015318	GAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398177
99	NC_015318	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398177
100	NC_015318	ATA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
101	NC_015318	CAG	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398178
102	NC_015318	TA	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	327398178
103	NC_015318	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398178
104	NC_015318	TGA	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
105	NC_015318	TGGC	2	8	3734	3741	0 %	25 %	50 %	25 %	327398178
106	NC_015318	GGT	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398178
107	NC_015318	ATA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
108	NC_015318	GTT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
109	NC_015318	CAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398178
110	NC_015318	AAAG	2	8	4060	4067	75 %	0 %	25 %	0 %	327398178
111	NC_015318	CCTG	2	8	4086	4093	0 %	25 %	25 %	50 %	327398178
112	NC_015318	CTT	2	6	4161	4166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398178
113	NC_015318	AGA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
114	NC_015318	TGA	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
115	NC_015318	GCTT	2	8	4335	4342	0 %	50 %	25 %	25 %	327398178
116	NC_015318	TA	3	6	4346	4351	50 %	50 %	0 %	0 %	327398178
117	NC_015318	TCA	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398178
118	NC_015318	AAT	2	6	4474	4479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
119	NC_015318	TGT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
120	NC_015318	TGA	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
121	NC_015318	AGGG	2	8	4519	4526	25 %	0 %	75 %	0 %	327398178
122	NC_015318	TTG	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
123	NC_015318	CAAAA	2	10	4581	4590	80 %	0 %	0 %	20 %	327398178
124	NC_015318	A	6	6	4608	4613	100 %	0 %	0 %	0 %	327398178
125	NC_015318	GAG	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
126	NC_015318	ATA	2	6	4684	4689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
127	NC_015318	AAGG	2	8	4728	4735	50 %	0 %	50 %	0 %	327398178
128	NC_015318	AAG	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
129	NC_015318	GTT	2	6	4830	4835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
130	NC_015318	AGAA	2	8	4932	4939	75 %	0 %	25 %	0 %	327398178
131	NC_015318	A	6	6	4947	4952	100 %	0 %	0 %	0 %	327398178
132	NC_015318	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
133	NC_015318	ATT	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398178
134	NC_015318	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398178
135	NC_015318	GAT	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
136	NC_015318	CGGATG	2	12	5060	5071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327398178
137	NC_015318	T	6	6	5110	5115	0 %	100 %	0 %	0 %	327398178
138	NC_015318	TATATC	2	12	5146	5157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327398178
139	NC_015318	A	6	6	5191	5196	100 %	0 %	0 %	0 %	327398178
140	NC_015318	GAT	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
141	NC_015318	TTG	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
142	NC_015318	GGA	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
143	NC_015318	GAT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
144	NC_015318	ATG	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
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147	NC_015318	TTCG	2	8	5514	5521	0 %	50 %	25 %	25 %	327398178
148	NC_015318	TTA	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398178
149	NC_015318	T	6	6	5575	5580	0 %	100 %	0 %	0 %	327398178
150	NC_015318	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327398178
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153	NC_015318	AAG	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
154	NC_015318	GAG	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
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162	NC_015318	ATG	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398179
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164	NC_015318	CAGG	2	8	6727	6734	25 %	0 %	50 %	25 %	327398179
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171	NC_015318	TGGT	2	8	6972	6979	0 %	50 %	50 %	0 %	327398179
172	NC_015318	TTG	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
173	NC_015318	ATAGA	2	10	7032	7041	60 %	20 %	20 %	0 %	327398179
174	NC_015318	TGT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
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243	NC_015318	GTTT	2	8	10760	10767	0 %	75 %	25 %	0 %	327398182
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250	NC_015318	A	7	7	11043	11049	100 %	0 %	0 %	0 %	327398182
251	NC_015318	GGCTT	2	10	11102	11111	0 %	40 %	40 %	20 %	327398182
252	NC_015318	ATG	2	6	11114	11119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398182
253	NC_015318	TATG	2	8	11127	11134	25 %	50 %	25 %	0 %	327398182
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257	NC_015318	AAG	2	6	11376	11381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398182
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261	NC_015318	ATTT	2	8	11598	11605	25 %	75 %	0 %	0 %	327398183
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270	NC_015318	CTC	2	6	11965	11970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398183
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