MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014736	TTG	2	6	191180	191185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122724
4002	NC_014736	TCG	2	6	191345	191350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122724
4003	NC_014736	GTT	2	6	191368	191373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122724
4004	NC_014736	CTC	2	6	191374	191379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122724
4005	NC_014736	CTT	2	6	191394	191399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122724
4006	NC_014736	AGC	2	6	191648	191653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122724
4007	NC_014736	TCCC	2	8	191718	191725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4008	NC_014736	ACT	2	6	191744	191749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_014736	GTT	2	6	191762	191767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014736	CCA	2	6	191825	191830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122725
4011	NC_014736	CGG	2	6	191875	191880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122725
4012	NC_014736	CGC	2	6	191923	191928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122725
4013	NC_014736	TGA	2	6	192006	192011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122725
4014	NC_014736	ATC	3	9	192089	192097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122725
4015	NC_014736	CGT	2	6	192106	192111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4016	NC_014736	CGA	2	6	192124	192129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4017	NC_014736	GGT	2	6	192183	192188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122725
4018	NC_014736	GCAC	2	8	192193	192200	25 %	0 %	25 %	50 %	313122725
4019	NC_014736	GAA	2	6	192239	192244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122725
4020	NC_014736	TTG	2	6	192252	192257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122725
4021	NC_014736	TCG	2	6	192285	192290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4022	NC_014736	GAT	2	6	192334	192339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122725
4023	NC_014736	AC	3	6	192489	192494	50 %	0 %	0 %	50 %	313122725
4024	NC_014736	AGCCG	2	10	192544	192553	20 %	0 %	40 %	40 %	313122725
4025	NC_014736	TC	3	6	192592	192597	0 %	50 %	0 %	50 %	313122725
4026	NC_014736	TCG	2	6	192663	192668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4027	NC_014736	GAAC	2	8	192679	192686	50 %	0 %	25 %	25 %	313122725
4028	NC_014736	ACG	2	6	192708	192713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4029	NC_014736	GTCAC	2	10	192738	192747	20 %	20 %	20 %	40 %	313122725
4030	NC_014736	CAA	2	6	192864	192869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122725
4031	NC_014736	GAC	2	6	192902	192907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122725
4032	NC_014736	GAC	2	6	192941	192946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122726
4033	NC_014736	CGA	3	9	192985	192993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122726
4034	NC_014736	CAT	2	6	193042	193047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122726
4035	NC_014736	TGA	2	6	193081	193086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122726
4036	NC_014736	GTC	2	6	193103	193108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122726
4037	NC_014736	TGT	2	6	193156	193161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122726
4038	NC_014736	GAC	2	6	193205	193210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122726
4039	NC_014736	GCT	2	6	193228	193233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122726
4040	NC_014736	ACT	2	6	193579	193584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122727
4041	NC_014736	ATC	2	6	193609	193614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122727
4042	NC_014736	TC	3	6	193613	193618	0 %	50 %	0 %	50 %	313122727
4043	NC_014736	TTA	2	6	193633	193638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313122727
4044	NC_014736	ACTG	2	8	193718	193725	25 %	25 %	25 %	25 %	313122727
4045	NC_014736	GGC	2	6	193778	193783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122727
4046	NC_014736	CGT	2	6	193854	193859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4047	NC_014736	CCGA	2	8	193911	193918	25 %	0 %	25 %	50 %	313122727
4048	NC_014736	TC	3	6	193953	193958	0 %	50 %	0 %	50 %	313122727
4049	NC_014736	CTC	2	6	193971	193976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122727
4050	NC_014736	GAA	2	6	194013	194018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122727
4051	NC_014736	GCT	2	6	194096	194101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4052	NC_014736	TCG	3	9	194131	194139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4053	NC_014736	CTG	2	6	194164	194169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4054	NC_014736	CGA	2	6	194204	194209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4055	NC_014736	CTTC	2	8	194210	194217	0 %	50 %	0 %	50 %	313122727
4056	NC_014736	CCGG	2	8	194227	194234	0 %	0 %	50 %	50 %	313122727
4057	NC_014736	GA	3	6	194249	194254	50 %	0 %	50 %	0 %	313122727
4058	NC_014736	CGA	2	6	194323	194328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122727
4059	NC_014736	GTG	2	6	194547	194552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122727
4060	NC_014736	GCGA	2	8	194562	194569	25 %	0 %	50 %	25 %	313122727
4061	NC_014736	TG	3	6	194613	194618	0 %	50 %	50 %	0 %	313122727
4062	NC_014736	ACGA	2	8	194625	194632	50 %	0 %	25 %	25 %	313122727
4063	NC_014736	GA	3	6	194663	194668	50 %	0 %	50 %	0 %	313122727
4064	NC_014736	AAT	2	6	194677	194682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122727
4065	NC_014736	CAA	2	6	194684	194689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122728
4066	NC_014736	TGT	2	6	194739	194744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122728
4067	NC_014736	GGA	2	6	194773	194778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122728
4068	NC_014736	TCC	2	6	194784	194789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122728
4069	NC_014736	ACTC	2	8	194797	194804	25 %	25 %	0 %	50 %	313122728
4070	NC_014736	CCGT	2	8	194822	194829	0 %	25 %	25 %	50 %	313122728
4071	NC_014736	CGG	2	6	194967	194972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122728
4072	NC_014736	CTA	2	6	195022	195027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122728
4073	NC_014736	CGG	2	6	195055	195060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122728
4074	NC_014736	CCGC	2	8	195083	195090	0 %	0 %	25 %	75 %	313122728
4075	NC_014736	AAC	2	6	195159	195164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122728
4076	NC_014736	GCG	2	6	195215	195220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122728
4077	NC_014736	TCG	2	6	195237	195242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4078	NC_014736	TCTG	2	8	195283	195290	0 %	50 %	25 %	25 %	313122728
4079	NC_014736	CGG	2	6	195291	195296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122728
4080	NC_014736	CTG	2	6	195401	195406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4081	NC_014736	ATG	2	6	195411	195416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122728
4082	NC_014736	CTC	2	6	195434	195439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122728
4083	NC_014736	TGG	3	9	195514	195522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122728
4084	NC_014736	TTCC	2	8	195569	195576	0 %	50 %	0 %	50 %	313122728
4085	NC_014736	AC	3	6	195683	195688	50 %	0 %	0 %	50 %	313122728
4086	NC_014736	TC	3	6	195696	195701	0 %	50 %	0 %	50 %	313122728
4087	NC_014736	GATT	2	8	195772	195779	25 %	50 %	25 %	0 %	313122728
4088	NC_014736	CCA	2	6	195802	195807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122728
4089	NC_014736	ACG	2	6	195834	195839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4090	NC_014736	AAG	2	6	195854	195859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122728
4091	NC_014736	TCG	2	6	195906	195911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4092	NC_014736	TGA	2	6	195921	195926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122728
4093	NC_014736	ACG	2	6	195953	195958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4094	NC_014736	CCG	2	6	196035	196040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122728
4095	NC_014736	GA	3	6	196069	196074	50 %	0 %	50 %	0 %	313122728
4096	NC_014736	GCA	2	6	196090	196095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122728
4097	NC_014736	CAC	2	6	196111	196116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_014736	TGGT	2	8	196205	196212	0 %	50 %	50 %	0 %	313122729
4099	NC_014736	ACC	2	6	196217	196222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122729
4100	NC_014736	AAG	2	6	196277	196282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122729
4101	NC_014736	CAAA	2	8	196355	196362	75 %	0 %	0 %	25 %	313122729
4102	NC_014736	TAC	2	6	196390	196395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122729
4103	NC_014736	GT	3	6	196511	196516	0 %	50 %	50 %	0 %	313122729
4104	NC_014736	TGG	2	6	196569	196574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122729
4105	NC_014736	TC	4	8	196578	196585	0 %	50 %	0 %	50 %	313122729
4106	NC_014736	ATC	2	6	196722	196727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122729
4107	NC_014736	ACGA	2	8	196751	196758	50 %	0 %	25 %	25 %	313122729
4108	NC_014736	CGA	2	6	196761	196766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122729
4109	NC_014736	GCA	2	6	196774	196779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122729
4110	NC_014736	ATC	2	6	196790	196795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122729
4111	NC_014736	TCACG	2	10	196809	196818	20 %	20 %	20 %	40 %	313122729
4112	NC_014736	GAG	2	6	196907	196912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122729
4113	NC_014736	GATT	2	8	196913	196920	25 %	50 %	25 %	0 %	313122729
4114	NC_014736	ACG	2	6	196924	196929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122729
4115	NC_014736	GCAGA	2	10	196939	196948	40 %	0 %	40 %	20 %	313122729
4116	NC_014736	AGGG	2	8	196976	196983	25 %	0 %	75 %	0 %	313122729
4117	NC_014736	AGG	2	6	197024	197029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122729
4118	NC_014736	GACG	2	8	197034	197041	25 %	0 %	50 %	25 %	313122729
4119	NC_014736	GAA	2	6	197047	197052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122729
4120	NC_014736	GA	3	6	197104	197109	50 %	0 %	50 %	0 %	313122729
4121	NC_014736	GACA	2	8	197133	197140	50 %	0 %	25 %	25 %	313122729
4122	NC_014736	CAC	2	6	197271	197276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122729
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4230	NC_014736	GT	3	6	203247	203252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4242	NC_014736	GATT	2	8	203841	203848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_014736	AAC	2	6	203991	203996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_014736	GTC	2	6	204041	204046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_014736	CGTA	2	8	204081	204088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4246	NC_014736	TCAAT	2	10	204140	204149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4247	NC_014736	AGTT	2	8	204198	204205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_014736	ACGG	2	8	204233	204240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4249	NC_014736	TCT	2	6	204261	204266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_014736	TA	3	6	204398	204403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_014736	AT	3	6	204421	204426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_014736	TTG	2	6	204436	204441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_014736	AGATAT	2	12	204466	204477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_014736	TGGT	2	8	204492	204499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_014736	TACGG	2	10	204554	204563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4256	NC_014736	AT	3	6	204595	204600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_014736	GTT	2	6	204755	204760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_014736	AAC	2	6	204818	204823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122735
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4265	NC_014736	CGG	2	6	205250	205255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122735
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4327	NC_014736	GGA	2	6	207973	207978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122736
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4332	NC_014736	CGA	2	6	208239	208244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122737
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4335	NC_014736	CGA	2	6	208344	208349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122737
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4342	NC_014736	CCT	2	6	208582	208587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4343	NC_014736	GTT	2	6	208595	208600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_014736	CGT	3	9	208659	208667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122738
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4346	NC_014736	TCGA	2	8	208784	208791	25 %	25 %	25 %	25 %	313122738
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4352	NC_014736	CAG	2	6	209080	209085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122738
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4354	NC_014736	AGC	2	6	209213	209218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122738
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4357	NC_014736	CG	3	6	209327	209332	0 %	0 %	50 %	50 %	313122738
4358	NC_014736	CGGC	2	8	209417	209424	0 %	0 %	50 %	50 %	313122738
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4361	NC_014736	CGAG	2	8	209550	209557	25 %	0 %	50 %	25 %	313122738
4362	NC_014736	GTT	2	6	209584	209589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122738
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4365	NC_014736	GAA	2	6	209752	209757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122738
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4367	NC_014736	AGG	2	6	209955	209960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122738
4368	NC_014736	GCC	2	6	210055	210060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122738
4369	NC_014736	ACC	2	6	210061	210066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122738
4370	NC_014736	T	7	7	210104	210110	0 %	100 %	0 %	0 %	313122738
4371	NC_014736	CCA	2	6	210130	210135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122738
4372	NC_014736	GGT	2	6	210187	210192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122738
4373	NC_014736	TTG	2	6	210252	210257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122738

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