MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014736	CTC	2	6	165799	165804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122699
3502	NC_014736	TCTT	2	8	165808	165815	0 %	75 %	0 %	25 %	313122699
3503	NC_014736	CGA	2	6	165816	165821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122699
3504	NC_014736	AAC	2	6	165866	165871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_014736	TCAT	2	8	165882	165889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_014736	TAC	2	6	165904	165909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014736	ACT	2	6	166016	166021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014736	ACC	2	6	166111	166116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122700
3509	NC_014736	TCG	2	6	166125	166130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3510	NC_014736	TCG	2	6	166151	166156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3511	NC_014736	ACG	2	6	166161	166166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3512	NC_014736	GCC	2	6	166202	166207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3513	NC_014736	GAC	2	6	166223	166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3514	NC_014736	CGA	2	6	166246	166251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3515	NC_014736	CGC	2	6	166348	166353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3516	NC_014736	CACGTA	2	12	166387	166398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122700
3517	NC_014736	GTC	2	6	166469	166474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3518	NC_014736	GAT	2	6	166489	166494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122700
3519	NC_014736	GGT	2	6	166549	166554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122700
3520	NC_014736	CCG	2	6	166569	166574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3521	NC_014736	CCG	2	6	166599	166604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3522	NC_014736	CTA	2	6	166633	166638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122700
3523	NC_014736	CGT	3	9	166714	166722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3524	NC_014736	CGG	2	6	166735	166740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
3525	NC_014736	GAC	2	6	166784	166789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3526	NC_014736	ACG	2	6	166803	166808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3527	NC_014736	AC	3	6	166900	166905	50 %	0 %	0 %	50 %	313122700
3528	NC_014736	CGG	2	6	166909	166914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
3529	NC_014736	ACG	3	9	167048	167056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3530	NC_014736	TCG	2	6	167109	167114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3531	NC_014736	TCT	2	6	167133	167138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122700
3532	NC_014736	GTC	2	6	167206	167211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3533	NC_014736	CCT	2	6	167218	167223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122700
3534	NC_014736	CGTG	2	8	167252	167259	0 %	25 %	50 %	25 %	313122700
3535	NC_014736	GTG	2	6	167311	167316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122700
3536	NC_014736	CGG	2	6	167329	167334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
3537	NC_014736	ATG	2	6	167336	167341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122700
3538	NC_014736	CCG	2	6	167390	167395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3539	NC_014736	TTG	2	6	167418	167423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122700
3540	NC_014736	CGGG	2	8	167449	167456	0 %	0 %	75 %	25 %	313122700
3541	NC_014736	AAC	2	6	167510	167515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122700
3542	NC_014736	GGA	2	6	167542	167547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122700
3543	NC_014736	CGA	2	6	167566	167571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3544	NC_014736	GAC	2	6	167576	167581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3545	NC_014736	GAC	2	6	167651	167656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3546	NC_014736	TCG	2	6	167709	167714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3547	NC_014736	GTC	2	6	167741	167746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3548	NC_014736	GGC	2	6	167747	167752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
3549	NC_014736	CAT	2	6	167836	167841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122700
3550	NC_014736	ACG	2	6	167853	167858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3551	NC_014736	GTC	2	6	167888	167893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3552	NC_014736	GCC	2	6	167937	167942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
3553	NC_014736	TCG	2	6	168006	168011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
3554	NC_014736	ATCGA	2	10	168017	168026	40 %	20 %	20 %	20 %	313122700
3555	NC_014736	ACAAG	2	10	168077	168086	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3556	NC_014736	AAACG	2	10	168103	168112	60 %	0 %	20 %	20 %	313122701
3557	NC_014736	GCC	2	6	168161	168166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122701
3558	NC_014736	AG	3	6	168194	168199	50 %	0 %	50 %	0 %	313122701
3559	NC_014736	CTG	2	6	168206	168211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122701
3560	NC_014736	GGT	2	6	168247	168252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122701
3561	NC_014736	CTC	2	6	168278	168283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122701
3562	NC_014736	GCC	2	6	168292	168297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122701
3563	NC_014736	ACT	2	6	168363	168368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122701
3564	NC_014736	CGA	2	6	168442	168447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122701
3565	NC_014736	CA	3	6	168464	168469	50 %	0 %	0 %	50 %	313122701
3566	NC_014736	ACG	2	6	168473	168478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122701
3567	NC_014736	CCG	2	6	168510	168515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122701
3568	NC_014736	G	6	6	168524	168529	0 %	0 %	100 %	0 %	313122701
3569	NC_014736	GAC	2	6	168540	168545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122701
3570	NC_014736	TTC	2	6	168551	168556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122702
3571	NC_014736	CAT	2	6	168615	168620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122702
3572	NC_014736	GCC	2	6	168757	168762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122702
3573	NC_014736	TCA	2	6	168818	168823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122702
3574	NC_014736	GAC	2	6	168831	168836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3575	NC_014736	TCC	2	6	168848	168853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122702
3576	NC_014736	TCG	2	6	168908	168913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3577	NC_014736	GC	3	6	168950	168955	0 %	0 %	50 %	50 %	313122702
3578	NC_014736	TCGG	2	8	168985	168992	0 %	25 %	50 %	25 %	313122702
3579	NC_014736	TCG	2	6	169013	169018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3580	NC_014736	GTC	2	6	169054	169059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3581	NC_014736	TGA	2	6	169061	169066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122702
3582	NC_014736	ATG	2	6	169102	169107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122702
3583	NC_014736	TCG	2	6	169148	169153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3584	NC_014736	CGT	2	6	169173	169178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3585	NC_014736	CGG	2	6	169188	169193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122702
3586	NC_014736	CGG	2	6	169247	169252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122702
3587	NC_014736	CGAAAA	2	12	169365	169376	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313122702
3588	NC_014736	GGC	2	6	169446	169451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122702
3589	NC_014736	CGG	2	6	169506	169511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122702
3590	NC_014736	GTG	2	6	169540	169545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122702
3591	NC_014736	GGC	2	6	169548	169553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122702
3592	NC_014736	TCG	2	6	169580	169585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3593	NC_014736	CGC	3	9	169608	169616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122702
3594	NC_014736	CGA	2	6	169622	169627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3595	NC_014736	TCA	2	6	169640	169645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122702
3596	NC_014736	CCG	2	6	169780	169785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122702
3597	NC_014736	TCG	2	6	169790	169795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3598	NC_014736	TCGC	2	8	169819	169826	0 %	25 %	25 %	50 %	313122702
3599	NC_014736	TTC	2	6	169849	169854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122702
3600	NC_014736	TGG	2	6	169864	169869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122702
3601	NC_014736	GTC	2	6	169936	169941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3602	NC_014736	TCG	2	6	170006	170011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3603	NC_014736	AAG	2	6	170080	170085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122702
3604	NC_014736	AGA	2	6	170136	170141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122702
3605	NC_014736	GAC	2	6	170176	170181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122702
3606	NC_014736	CGG	2	6	170228	170233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122703
3607	NC_014736	TCGATG	2	12	170303	170314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313122703
3608	NC_014736	CGA	2	6	170370	170375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122703
3609	NC_014736	CGA	2	6	170400	170405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122703
3610	NC_014736	GAA	2	6	170455	170460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122703
3611	NC_014736	CT	3	6	170557	170562	0 %	50 %	0 %	50 %	313122703
3612	NC_014736	TCG	3	9	170621	170629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122703
3613	NC_014736	TCA	2	6	170654	170659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_014736	GAAT	2	8	170735	170742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014736	CA	3	6	170749	170754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_014736	CCG	2	6	170755	170760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_014736	CTGA	2	8	170832	170839	25 %	25 %	25 %	25 %	313122704
3618	NC_014736	TGT	2	6	170842	170847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122704
3619	NC_014736	CTA	2	6	170912	170917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122704
3620	NC_014736	CGT	2	6	170936	170941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122704
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3744	NC_014736	CTG	2	6	177783	177788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122711
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3992	NC_014736	AGT	2	6	190554	190559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3997	NC_014736	ACCG	2	8	190762	190769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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