MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014736	AC	3	6	118183	118188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_014736	TCT	2	6	118212	118217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_014736	GAGT	2	8	118221	118228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_014736	GCTGAT	2	12	118290	118301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2505	NC_014736	GAC	2	6	118424	118429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_014736	AGA	2	6	118449	118454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_014736	GATT	2	8	118509	118516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_014736	CAT	2	6	118569	118574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_014736	ATT	2	6	118583	118588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_014736	GTT	2	6	118609	118614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_014736	ATG	2	6	118643	118648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_014736	ATA	2	6	118672	118677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_014736	CAGA	2	8	118678	118685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_014736	TGAG	2	8	118734	118741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_014736	GTAC	2	8	118840	118847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_014736	GAC	2	6	118936	118941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2517	NC_014736	GTCGCA	2	12	118955	118966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2518	NC_014736	AC	3	6	118986	118991	50 %	0 %	0 %	50 %	313122652
2519	NC_014736	TTGGAC	2	12	118997	119008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313122652
2520	NC_014736	AGGA	2	8	119013	119020	50 %	0 %	50 %	0 %	313122652
2521	NC_014736	ACT	2	6	119275	119280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122652
2522	NC_014736	ACG	2	6	119310	119315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2523	NC_014736	CG	3	6	119335	119340	0 %	0 %	50 %	50 %	313122652
2524	NC_014736	AGA	2	6	119344	119349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122652
2525	NC_014736	TGA	2	6	119437	119442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122652
2526	NC_014736	TCG	2	6	119445	119450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2527	NC_014736	TAGAGA	2	12	119469	119480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313122652
2528	NC_014736	CAG	2	6	119531	119536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2529	NC_014736	GGT	2	6	119644	119649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122652
2530	NC_014736	GA	3	6	119682	119687	50 %	0 %	50 %	0 %	313122652
2531	NC_014736	GAC	2	6	119872	119877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122652
2532	NC_014736	TGG	2	6	119922	119927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122653
2533	NC_014736	CGA	3	9	119928	119936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122653
2534	NC_014736	AGA	2	6	119937	119942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122653
2535	NC_014736	GCG	2	6	119959	119964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122653
2536	NC_014736	AAG	2	6	119978	119983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122653
2537	NC_014736	CGA	2	6	119990	119995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122653
2538	NC_014736	CA	3	6	120006	120011	50 %	0 %	0 %	50 %	313122653
2539	NC_014736	AATC	2	8	120055	120062	50 %	25 %	0 %	25 %	313122653
2540	NC_014736	GGA	2	6	120069	120074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122653
2541	NC_014736	CGG	2	6	120092	120097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122653
2542	NC_014736	AAG	2	6	120188	120193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122653
2543	NC_014736	CTC	2	6	120268	120273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122653
2544	NC_014736	GA	3	6	120341	120346	50 %	0 %	50 %	0 %	313122653
2545	NC_014736	GCG	2	6	120384	120389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_014736	CTG	2	6	120560	120565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_014736	GAG	2	6	120662	120667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122654
2548	NC_014736	AGA	2	6	120802	120807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122654
2549	NC_014736	GCG	3	9	120876	120884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122654
2550	NC_014736	ACT	2	6	120926	120931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122654
2551	NC_014736	TCG	2	6	120942	120947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122654
2552	NC_014736	GGGAA	2	10	121118	121127	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_014736	TG	3	6	121197	121202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_014736	TCTT	2	8	121213	121220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_014736	CGTGTT	2	12	121296	121307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313122655
2556	NC_014736	CTG	2	6	121333	121338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2557	NC_014736	GTC	3	9	121357	121365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2558	NC_014736	GTT	2	6	121386	121391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122655
2559	NC_014736	GGT	2	6	121474	121479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122655
2560	NC_014736	GCC	2	6	121555	121560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122655
2561	NC_014736	GTC	2	6	121606	121611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2562	NC_014736	GCC	2	6	121636	121641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122655
2563	NC_014736	GTT	2	6	121671	121676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122655
2564	NC_014736	GCG	2	6	121720	121725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122655
2565	NC_014736	CGG	2	6	121728	121733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122655
2566	NC_014736	TGC	2	6	121754	121759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2567	NC_014736	TCG	2	6	121775	121780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2568	NC_014736	TCG	2	6	121790	121795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2569	NC_014736	GGC	2	6	121806	121811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122655
2570	NC_014736	TCG	2	6	121844	121849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2571	NC_014736	GCC	2	6	121858	121863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122655
2572	NC_014736	CGA	2	6	121917	121922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2573	NC_014736	ACCG	2	8	121984	121991	25 %	0 %	25 %	50 %	313122655
2574	NC_014736	CGG	2	6	122019	122024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122655
2575	NC_014736	CGG	2	6	122070	122075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122655
2576	NC_014736	TGG	2	6	122094	122099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122655
2577	NC_014736	CGT	2	6	122157	122162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2578	NC_014736	TCG	3	9	122186	122194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2579	NC_014736	CGT	2	6	122241	122246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2580	NC_014736	CA	3	6	122249	122254	50 %	0 %	0 %	50 %	313122655
2581	NC_014736	GTCC	2	8	122280	122287	0 %	25 %	25 %	50 %	313122655
2582	NC_014736	CG	3	6	122290	122295	0 %	0 %	50 %	50 %	313122655
2583	NC_014736	ATC	2	6	122331	122336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122655
2584	NC_014736	TCC	2	6	122339	122344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122655
2585	NC_014736	TCAG	2	8	122359	122366	25 %	25 %	25 %	25 %	313122655
2586	NC_014736	GA	3	6	122384	122389	50 %	0 %	50 %	0 %	313122655
2587	NC_014736	GCT	2	6	122433	122438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122655
2588	NC_014736	ATC	2	6	122459	122464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_014736	TAG	2	6	122539	122544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_014736	CGA	2	6	122591	122596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122656
2591	NC_014736	CATC	2	8	122611	122618	25 %	25 %	0 %	50 %	313122656
2592	NC_014736	GGGTG	2	10	122700	122709	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014736	ACC	2	6	122801	122806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122657
2594	NC_014736	TCG	2	6	122821	122826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122657
2595	NC_014736	TCG	2	6	122842	122847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122657
2596	NC_014736	GTC	2	6	122853	122858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122657
2597	NC_014736	TGA	2	6	122869	122874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122657
2598	NC_014736	ATCCAG	2	12	122971	122982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122657
2599	NC_014736	AG	3	6	123014	123019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_014736	GT	3	6	123038	123043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_014736	ACG	2	6	123087	123092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_014736	GTCC	2	8	123128	123135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_014736	TCAC	2	8	123183	123190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_014736	GTA	2	6	123226	123231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_014736	CCG	2	6	123269	123274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122658
2606	NC_014736	ACTCCG	2	12	123298	123309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313122658
2607	NC_014736	GTA	2	6	123315	123320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122658
2608	NC_014736	CAGA	2	8	123392	123399	50 %	0 %	25 %	25 %	313122658
2609	NC_014736	CATA	2	8	123443	123450	50 %	25 %	0 %	25 %	313122658
2610	NC_014736	ATT	2	6	123462	123467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_014736	TACC	2	8	123512	123519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_014736	CGG	2	6	123643	123648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_014736	TGC	2	6	123714	123719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_014736	AGG	2	6	123799	123804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_014736	CGG	2	6	123871	123876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122659
2616	NC_014736	CTC	2	6	123878	123883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122659
2617	NC_014736	CAG	2	6	123954	123959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2618	NC_014736	TGC	2	6	123972	123977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2619	NC_014736	CTC	2	6	123992	123997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122659
2620	NC_014736	GGT	2	6	124001	124006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122659
2621	NC_014736	TGC	2	6	124039	124044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2622	NC_014736	CGA	2	6	124080	124085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2623	NC_014736	CAG	2	6	124118	124123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2624	NC_014736	TCA	2	6	124140	124145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122659
2625	NC_014736	GCT	2	6	124213	124218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122659
2626	NC_014736	TCA	2	6	124267	124272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122660
2627	NC_014736	TTC	2	6	124300	124305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122660
2628	NC_014736	CGG	2	6	124383	124388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122660
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2634	NC_014736	CAG	2	6	124593	124598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122660
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2644	NC_014736	GTC	2	6	125119	125124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122660
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2730	NC_014736	TAG	2	6	129598	129603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2736	NC_014736	TTC	2	6	129837	129842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122666
2737	NC_014736	GACG	2	8	129852	129859	25 %	0 %	50 %	25 %	313122666
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2741	NC_014736	GGC	2	6	129924	129929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122666
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2743	NC_014736	GAA	2	6	129990	129995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122666
2744	NC_014736	CGA	2	6	130103	130108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122666
2745	NC_014736	CAG	2	6	130137	130142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122666
2746	NC_014736	GAA	2	6	130200	130205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122666
2747	NC_014736	AGG	2	6	130256	130261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122666
2748	NC_014736	CCA	2	6	130343	130348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2749	NC_014736	ACC	2	6	130353	130358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2750	NC_014736	CACAC	2	10	130363	130372	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2751	NC_014736	GAC	2	6	130580	130585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122667
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2753	NC_014736	AACA	2	8	130692	130699	75 %	0 %	0 %	25 %	313122667
2754	NC_014736	AACTCG	2	12	130749	130760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122667
2755	NC_014736	GTC	2	6	130771	130776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122667
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2773	NC_014736	CTG	2	6	131660	131665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122668
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2799	NC_014736	GA	3	6	132809	132814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2800	NC_014736	GTC	2	6	132854	132859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2802	NC_014736	CA	3	6	132949	132954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2803	NC_014736	AT	4	8	132958	132965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2804	NC_014736	GTT	2	6	133022	133027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2812	NC_014736	ATCGG	2	10	133518	133527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2824	NC_014736	GCG	2	6	134059	134064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2845	NC_014736	CCGA	2	8	135222	135229	25 %	0 %	25 %	50 %	313122672
2846	NC_014736	AACG	2	8	135230	135237	50 %	0 %	25 %	25 %	313122672
2847	NC_014736	TCG	2	6	135271	135276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122672
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2851	NC_014736	GA	3	6	135383	135388	50 %	0 %	50 %	0 %	313122672
2852	NC_014736	GGCC	2	8	135428	135435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2853	NC_014736	TCC	2	6	135437	135442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2854	NC_014736	AG	3	6	135455	135460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2855	NC_014736	ATA	2	6	135475	135480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2856	NC_014736	GAT	2	6	135580	135585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122673
2857	NC_014736	CGGC	2	8	135588	135595	0 %	0 %	50 %	50 %	313122673
2858	NC_014736	CTG	2	6	135615	135620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122673
2859	NC_014736	CGC	2	6	135661	135666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122673
2860	NC_014736	GTC	2	6	135668	135673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122673
2861	NC_014736	GCC	2	6	135686	135691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122673
2862	NC_014736	GGGT	2	8	135730	135737	0 %	25 %	75 %	0 %	313122673
2863	NC_014736	CCGA	2	8	135768	135775	25 %	0 %	25 %	50 %	313122673
2864	NC_014736	CAA	2	6	135840	135845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122673
2865	NC_014736	TTC	2	6	135857	135862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122673
2866	NC_014736	ACTC	2	8	135879	135886	25 %	25 %	0 %	50 %	313122673
2867	NC_014736	CT	3	6	135917	135922	0 %	50 %	0 %	50 %	313122673
2868	NC_014736	GGA	2	6	135958	135963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122673
2869	NC_014736	GCCGG	2	10	136043	136052	0 %	0 %	60 %	40 %	313122673
2870	NC_014736	TTC	2	6	136136	136141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122673
2871	NC_014736	CAT	2	6	136219	136224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122673
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2873	NC_014736	TGC	2	6	136324	136329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122673
2874	NC_014736	TCG	2	6	136362	136367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122673
2875	NC_014736	TCT	2	6	136377	136382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122673
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2877	NC_014736	TCG	2	6	136533	136538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122673
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2884	NC_014736	GGT	2	6	136885	136890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122673
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2888	NC_014736	TACG	2	8	137021	137028	25 %	25 %	25 %	25 %	313122673
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2901	NC_014736	CGG	2	6	137663	137668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122673
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2903	NC_014736	ATT	2	6	137732	137737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313122673
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2942	NC_014736	CGAAA	2	10	139304	139313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2977	NC_014736	TGG	2	6	140782	140787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2989	NC_014736	ACTG	2	8	141522	141529	25 %	25 %	25 %	25 %	313122677
2990	NC_014736	AAT	2	6	141560	141565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122677
2991	NC_014736	GCA	2	6	141595	141600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122677
2992	NC_014736	CGG	2	6	141653	141658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122677
2993	NC_014736	A	6	6	141661	141666	100 %	0 %	0 %	0 %	313122677
2994	NC_014736	TCC	2	6	141745	141750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122677
2995	NC_014736	TGC	2	6	141786	141791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122677
2996	NC_014736	TC	3	6	141925	141930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2997	NC_014736	GGT	2	6	141960	141965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_014736	ACG	2	6	142035	142040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122678
2999	NC_014736	AGCT	2	8	142055	142062	25 %	25 %	25 %	25 %	313122678
3000	NC_014736	TGCCG	2	10	142177	142186	0 %	20 %	40 %	40 %	313122678

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