MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014736	TCG	2	6	94035	94040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2002	NC_014736	CGA	2	6	94045	94050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2003	NC_014736	AGA	2	6	94051	94056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122625
2004	NC_014736	CGA	2	6	94084	94089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2005	NC_014736	TCGAAA	2	12	94128	94139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313122625
2006	NC_014736	CGA	2	6	94141	94146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2007	NC_014736	GAC	2	6	94160	94165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2008	NC_014736	TCG	3	9	94167	94175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2009	NC_014736	GACGTC	2	12	94205	94216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2010	NC_014736	CAA	2	6	94279	94284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122625
2011	NC_014736	CGA	2	6	94324	94329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2012	NC_014736	GC	3	6	94344	94349	0 %	0 %	50 %	50 %	313122625
2013	NC_014736	CTGA	2	8	94373	94380	25 %	25 %	25 %	25 %	313122625
2014	NC_014736	CGC	2	6	94434	94439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122625
2015	NC_014736	CGGTC	2	10	94447	94456	0 %	20 %	40 %	40 %	313122625
2016	NC_014736	TAC	3	9	94496	94504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122625
2017	NC_014736	GA	3	6	94539	94544	50 %	0 %	50 %	0 %	313122625
2018	NC_014736	CCG	2	6	94553	94558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122625
2019	NC_014736	GGC	2	6	94559	94564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122625
2020	NC_014736	GACC	2	8	94588	94595	25 %	0 %	25 %	50 %	313122625
2021	NC_014736	TCG	2	6	94644	94649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2022	NC_014736	CGT	2	6	94761	94766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2023	NC_014736	CGC	2	6	94796	94801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122625
2024	NC_014736	CTGTTC	2	12	94802	94813	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313122625
2025	NC_014736	TCC	2	6	94908	94913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122625
2026	NC_014736	GAC	2	6	95000	95005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2027	NC_014736	TCG	2	6	95025	95030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122625
2028	NC_014736	CCG	2	6	95055	95060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122625
2029	NC_014736	CA	3	6	95110	95115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2030	NC_014736	CTAA	2	8	95123	95130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2031	NC_014736	CGT	2	6	95225	95230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122626
2032	NC_014736	GAA	2	6	95249	95254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122626
2033	NC_014736	CGA	2	6	95375	95380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122626
2034	NC_014736	AGC	2	6	95390	95395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122626
2035	NC_014736	TCGC	2	8	95467	95474	0 %	25 %	25 %	50 %	313122626
2036	NC_014736	ACA	2	6	95476	95481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122626
2037	NC_014736	C	6	6	95510	95515	0 %	0 %	0 %	100 %	313122626
2038	NC_014736	TGG	2	6	95534	95539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122626
2039	NC_014736	TCG	3	9	95563	95571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122626
2040	NC_014736	CCA	2	6	95613	95618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122627
2041	NC_014736	CCGAC	2	10	95619	95628	20 %	0 %	20 %	60 %	313122627
2042	NC_014736	GAG	2	6	95657	95662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122627
2043	NC_014736	AAT	2	6	95722	95727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122627
2044	NC_014736	GAA	2	6	95738	95743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122627
2045	NC_014736	GAC	2	6	95816	95821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122628
2046	NC_014736	CCG	2	6	95862	95867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122628
2047	NC_014736	AAC	2	6	95888	95893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122628
2048	NC_014736	TCG	2	6	95912	95917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122628
2049	NC_014736	TGC	2	6	95931	95936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122628
2050	NC_014736	CG	3	6	95938	95943	0 %	0 %	50 %	50 %	313122628
2051	NC_014736	GCTC	2	8	95961	95968	0 %	25 %	25 %	50 %	313122628
2052	NC_014736	ATC	2	6	95987	95992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122628
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2054	NC_014736	GTCGAA	2	12	96107	96118	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313122628
2055	NC_014736	CGG	2	6	96136	96141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122628
2056	NC_014736	ACG	2	6	96147	96152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122628
2057	NC_014736	GAT	2	6	96185	96190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122628
2058	NC_014736	AGA	2	6	96235	96240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122628
2059	NC_014736	GGA	3	9	96259	96267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122628
2060	NC_014736	GTT	2	6	96318	96323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122629
2061	NC_014736	CGA	2	6	96366	96371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122629
2062	NC_014736	GGT	2	6	96404	96409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122629
2063	NC_014736	GAG	2	6	96412	96417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122629
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2065	NC_014736	CGA	2	6	96552	96557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122629
2066	NC_014736	CAA	2	6	96609	96614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122630
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2069	NC_014736	TGA	2	6	96839	96844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122630
2070	NC_014736	AAGA	2	8	96858	96865	75 %	0 %	25 %	0 %	313122630
2071	NC_014736	AG	3	6	96885	96890	50 %	0 %	50 %	0 %	313122630
2072	NC_014736	CGTGG	2	10	96944	96953	0 %	20 %	60 %	20 %	313122630
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2084	NC_014736	GCG	2	6	97419	97424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122631
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2089	NC_014736	ACG	2	6	97710	97715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_014736	CGG	2	6	97729	97734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_014736	CCG	2	6	97763	97768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122632
2092	NC_014736	CGA	2	6	97795	97800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122632
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2095	NC_014736	TCG	2	6	97902	97907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122632
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2099	NC_014736	CGAAC	2	10	98071	98080	40 %	0 %	20 %	40 %	313122632
2100	NC_014736	TG	3	6	98081	98086	0 %	50 %	50 %	0 %	313122632
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2105	NC_014736	AGA	2	6	98265	98270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122632
2106	NC_014736	TC	3	6	98323	98328	0 %	50 %	0 %	50 %	313122632
2107	NC_014736	TACT	2	8	98334	98341	25 %	50 %	0 %	25 %	313122632
2108	NC_014736	CAC	2	6	98342	98347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122632
2109	NC_014736	CGG	2	6	98401	98406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122632
2110	NC_014736	TTC	2	6	98460	98465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122632
2111	NC_014736	TG	3	6	98515	98520	0 %	50 %	50 %	0 %	313122632
2112	NC_014736	CCT	2	6	98566	98571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122632
2113	NC_014736	CTG	2	6	98594	98599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122632
2114	NC_014736	ACTG	2	8	98614	98621	25 %	25 %	25 %	25 %	313122632
2115	NC_014736	TCG	2	6	98667	98672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122632
2116	NC_014736	CCGC	2	8	98673	98680	0 %	0 %	25 %	75 %	313122632
2117	NC_014736	GCC	2	6	98694	98699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122632
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2119	NC_014736	GTC	2	6	98774	98779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122632
2120	NC_014736	GCC	2	6	98800	98805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122632
2121	NC_014736	CGA	2	6	98833	98838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122632
2122	NC_014736	CAG	2	6	98866	98871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122632
2123	NC_014736	CAC	2	6	98909	98914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122632
2124	NC_014736	GGC	2	6	99017	99022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122632
2125	NC_014736	GAC	2	6	99029	99034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122632
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2141	NC_014736	AT	3	6	99973	99978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_014736	AACA	2	8	99998	100005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2143	NC_014736	TA	3	6	100008	100013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_014736	GAC	2	6	100066	100071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122633
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2231	NC_014736	CAA	2	6	104245	104250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2232	NC_014736	CGA	2	6	104262	104267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2233	NC_014736	CTG	2	6	104282	104287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2234	NC_014736	CCT	2	6	104369	104374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2235	NC_014736	GAA	2	6	104421	104426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122637
2236	NC_014736	GCC	2	6	104427	104432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122637
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2238	NC_014736	TCGAAC	2	12	104542	104553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122637
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2240	NC_014736	TGA	3	9	104647	104655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122637
2241	NC_014736	AGA	2	6	104737	104742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122637
2242	NC_014736	T	6	6	104815	104820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_014736	TGAG	2	8	104869	104876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_014736	GTC	2	6	104907	104912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_014736	TGG	2	6	104955	104960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122638
2246	NC_014736	GAA	2	6	104990	104995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122638
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2248	NC_014736	GACA	2	8	105155	105162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2249	NC_014736	CGG	2	6	105174	105179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_014736	CGCT	2	8	105199	105206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2251	NC_014736	TCG	2	6	105240	105245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_014736	AAC	2	6	105380	105385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_014736	CCA	2	6	105395	105400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_014736	GTT	2	6	105408	105413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_014736	ATA	2	6	105453	105458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_014736	CATT	2	8	105534	105541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2257	NC_014736	GCG	2	6	105574	105579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_014736	CTACG	2	10	105680	105689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2262	NC_014736	TG	3	6	105960	105965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_014736	TCA	2	6	105968	105973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122639
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2350	NC_014736	ATTT	2	8	110278	110285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2351	NC_014736	TAT	2	6	110303	110308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2353	NC_014736	GAAC	2	8	110390	110397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2370	NC_014736	TGC	2	6	111376	111381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2371	NC_014736	CAGA	2	8	111411	111418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2372	NC_014736	AGC	2	6	111460	111465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2373	NC_014736	GAA	2	6	111650	111655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122644
2374	NC_014736	AAC	2	6	111708	111713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122644
2375	NC_014736	CGA	2	6	111787	111792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122644
2376	NC_014736	TC	3	6	111910	111915	0 %	50 %	0 %	50 %	313122644
2377	NC_014736	ACT	2	6	111922	111927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122644
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2385	NC_014736	ACG	2	6	112359	112364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122645
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2393	NC_014736	GA	3	6	112780	112785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2394	NC_014736	GAA	2	6	112841	112846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_014736	ACTT	2	8	112940	112947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2396	NC_014736	TCC	2	6	112981	112986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2397	NC_014736	GTG	2	6	113050	113055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2401	NC_014736	ATC	2	6	113260	113265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2403	NC_014736	AAAT	2	8	113379	113386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2478	NC_014736	CTT	2	6	116990	116995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2479	NC_014736	CTG	2	6	117010	117015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2480	NC_014736	ATA	2	6	117094	117099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2481	NC_014736	AAT	2	6	117101	117106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_014736	CACC	2	8	117143	117150	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2483	NC_014736	CGA	2	6	117240	117245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122651
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2489	NC_014736	CTG	2	6	117485	117490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_014736	GT	3	6	117495	117500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_014736	TAG	2	6	117638	117643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_014736	A	6	6	117676	117681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_014736	TCC	2	6	117709	117714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2494	NC_014736	CAG	2	6	117798	117803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2495	NC_014736	GTC	2	6	117876	117881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_014736	CGC	2	6	117908	117913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2497	NC_014736	TCG	2	6	117977	117982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_014736	TCG	2	6	118003	118008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_014736	GGT	2	6	118063	118068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_014736	CAGTC	2	10	118155	118164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

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