MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014736	GAC	2	6	47374	47379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122589
1002	NC_014736	CCT	2	6	47397	47402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122589
1003	NC_014736	ACG	2	6	47429	47434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122589
1004	NC_014736	CTA	2	6	47436	47441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122589
1005	NC_014736	CGA	2	6	47472	47477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122589
1006	NC_014736	CTACGA	2	12	47574	47585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122589
1007	NC_014736	GTG	2	6	47621	47626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122589
1008	NC_014736	CGA	2	6	47643	47648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122589
1009	NC_014736	CACG	2	8	47697	47704	25 %	0 %	25 %	50 %	313122589
1010	NC_014736	CGC	2	6	47709	47714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122589
1011	NC_014736	GCT	2	6	47901	47906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014736	TAA	2	6	47951	47956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014736	AC	3	6	47960	47965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014736	GAAA	2	8	47974	47981	75 %	0 %	25 %	0 %	313122590
1015	NC_014736	GCA	2	6	48011	48016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122590
1016	NC_014736	CTCA	2	8	48140	48147	25 %	25 %	0 %	50 %	313122590
1017	NC_014736	TCG	2	6	48152	48157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122590
1018	NC_014736	ACCA	2	8	48164	48171	50 %	0 %	0 %	50 %	313122590
1019	NC_014736	CCA	2	6	48225	48230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122590
1020	NC_014736	ACCG	2	8	48242	48249	25 %	0 %	25 %	50 %	313122590
1021	NC_014736	CGA	2	6	48331	48336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122590
1022	NC_014736	CGC	2	6	48388	48393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122590
1023	NC_014736	CGT	2	6	48453	48458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122590
1024	NC_014736	CTA	2	6	48484	48489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122590
1025	NC_014736	CTC	2	6	48501	48506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_014736	AGT	2	6	48521	48526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014736	TTTA	2	8	48538	48545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014736	T	6	6	48685	48690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014736	GTT	2	6	48721	48726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014736	TGG	2	6	48752	48757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014736	GCG	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014736	TC	3	6	48877	48882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_014736	TCC	2	6	48893	48898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_014736	ATT	2	6	48966	48971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014736	CTCA	2	8	49023	49030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_014736	AT	3	6	49075	49080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014736	GAAC	2	8	49160	49167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_014736	GGAG	2	8	49193	49200	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014736	ACG	2	6	49258	49263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122591
1040	NC_014736	CGC	2	6	49268	49273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122591
1041	NC_014736	CGC	2	6	49397	49402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122591
1042	NC_014736	GTC	2	6	49407	49412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122591
1043	NC_014736	ACT	2	6	49515	49520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122591
1044	NC_014736	CCG	2	6	49557	49562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014736	CGT	2	6	49564	49569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014736	TCG	3	9	49572	49580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014736	CAC	2	6	49667	49672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014736	CAA	2	6	49707	49712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014736	A	6	6	49723	49728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014736	TAC	2	6	49815	49820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122592
1051	NC_014736	GCG	2	6	49880	49885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122592
1052	NC_014736	CGC	2	6	49902	49907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122592
1053	NC_014736	CCA	2	6	49934	49939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122592
1054	NC_014736	AAT	2	6	49972	49977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122592
1055	NC_014736	CGC	2	6	50004	50009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122592
1056	NC_014736	TCT	2	6	50016	50021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122592
1057	NC_014736	GTC	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122592
1058	NC_014736	GTC	2	6	50054	50059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122592
1059	NC_014736	CGA	2	6	50091	50096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122592
1060	NC_014736	TCC	2	6	50147	50152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122592
1061	NC_014736	TGC	2	6	50178	50183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122592
1062	NC_014736	GAG	2	6	50197	50202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122592
1063	NC_014736	CGG	2	6	50361	50366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122592
1064	NC_014736	ACT	2	6	50459	50464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_014736	TCA	2	6	50503	50508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014736	ACA	2	6	50539	50544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014736	A	6	6	50619	50624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014736	GATA	2	8	50658	50665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014736	TTG	2	6	50816	50821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014736	CGC	2	6	50879	50884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_014736	GA	3	6	50894	50899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014736	CT	3	6	50971	50976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_014736	GAC	2	6	50994	50999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_014736	CAAC	2	8	51056	51063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_014736	CTCA	2	8	51079	51086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_014736	CAT	2	6	51089	51094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014736	TAC	2	6	51104	51109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_014736	ACA	2	6	51118	51123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014736	AGTCA	2	10	51146	51155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_014736	TCG	2	6	51298	51303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122593
1081	NC_014736	TCGA	2	8	51352	51359	25 %	25 %	25 %	25 %	313122593
1082	NC_014736	TCG	2	6	51388	51393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122593
1083	NC_014736	CAC	2	6	51401	51406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122593
1084	NC_014736	TCCA	2	8	51442	51449	25 %	25 %	0 %	50 %	313122593
1085	NC_014736	TCG	2	6	51455	51460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014736	GTC	2	6	51498	51503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014736	GA	3	6	51511	51516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014736	TCA	2	6	51556	51561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014736	GAC	2	6	51567	51572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014736	TTCT	2	8	51596	51603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014736	GTCA	2	8	51605	51612	25 %	25 %	25 %	25 %	313122594
1092	NC_014736	GTC	2	6	51748	51753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122594
1093	NC_014736	TTG	2	6	51884	51889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122594
1094	NC_014736	GCG	2	6	51890	51895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122594
1095	NC_014736	CTCG	2	8	51943	51950	0 %	25 %	25 %	50 %	313122594
1096	NC_014736	AAG	2	6	51988	51993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122594
1097	NC_014736	AGA	2	6	52111	52116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014736	GGTA	2	8	52128	52135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014736	GAA	2	6	52151	52156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014736	TGA	2	6	52200	52205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014736	CAA	2	6	52231	52236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014736	ATC	2	6	52268	52273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014736	AGC	2	6	52432	52437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1104	NC_014736	GTC	2	6	52440	52445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1105	NC_014736	CTC	2	6	52518	52523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122595
1106	NC_014736	CGA	2	6	52556	52561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1107	NC_014736	GTT	2	6	52578	52583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122595
1108	NC_014736	GAC	2	6	52650	52655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1109	NC_014736	ATC	2	6	52699	52704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122595
1110	NC_014736	CGC	2	6	52736	52741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122595
1111	NC_014736	AGT	2	6	52829	52834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122595
1112	NC_014736	GAC	2	6	52857	52862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1113	NC_014736	GGA	2	6	52928	52933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122595
1114	NC_014736	GCCA	2	8	52998	53005	25 %	0 %	25 %	50 %	313122595
1115	NC_014736	CGG	2	6	53036	53041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122595
1116	NC_014736	ACG	2	6	53043	53048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1117	NC_014736	GC	3	6	53095	53100	0 %	0 %	50 %	50 %	313122595
1118	NC_014736	CGT	2	6	53124	53129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1119	NC_014736	CGTA	2	8	53136	53143	25 %	25 %	25 %	25 %	313122595
1120	NC_014736	GTC	2	6	53154	53159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1121	NC_014736	CT	3	6	53167	53172	0 %	50 %	0 %	50 %	313122595
1122	NC_014736	CGT	2	6	53177	53182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1123	NC_014736	TCG	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1124	NC_014736	GTC	2	6	53206	53211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1125	NC_014736	TCG	2	6	53290	53295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1126	NC_014736	GCC	2	6	53328	53333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122595
1127	NC_014736	GTT	2	6	53379	53384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122595
1128	NC_014736	ACG	2	6	53413	53418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
1129	NC_014736	GCA	2	6	53461	53466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122595
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1142	NC_014736	CGT	4	12	53831	53842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122595
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1246	NC_014736	CG	4	8	57923	57930	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
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1250	NC_014736	GC	3	6	58155	58160	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1251	NC_014736	CTC	2	6	58165	58170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122599
1252	NC_014736	TCGT	2	8	58226	58233	0 %	50 %	25 %	25 %	313122599
1253	NC_014736	CG	3	6	58234	58239	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1254	NC_014736	CGT	2	6	58317	58322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122600
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1369	NC_014736	CGTG	2	8	63549	63556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1370	NC_014736	CA	4	8	63663	63670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1371	NC_014736	GGT	2	6	63697	63702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1375	NC_014736	AAACCA	2	12	63908	63919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_014736	TAC	2	6	63950	63955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_014736	AAG	2	6	63957	63962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_014736	ACT	2	6	63978	63983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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