MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 4373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014736	GCCC	2	8	23573	23580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_014736	CAG	2	6	23602	23607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014736	TCT	2	6	23649	23654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014736	GGTC	2	8	23696	23703	0 %	25 %	50 %	25 %	313122571
505	NC_014736	GC	3	6	23853	23858	0 %	0 %	50 %	50 %	313122571
506	NC_014736	GCG	2	6	23886	23891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122571
507	NC_014736	TCGG	2	8	23921	23928	0 %	25 %	50 %	25 %	313122571
508	NC_014736	CCGC	2	8	23940	23947	0 %	0 %	25 %	75 %	313122571
509	NC_014736	CGG	2	6	23979	23984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122571
510	NC_014736	GAG	2	6	24033	24038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122571
511	NC_014736	CTC	2	6	24070	24075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122571
512	NC_014736	CAA	2	6	24083	24088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122571
513	NC_014736	GTCTC	2	10	24161	24170	0 %	40 %	20 %	40 %	313122571
514	NC_014736	AAT	2	6	24219	24224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122571
515	NC_014736	CAC	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122571
516	NC_014736	CTG	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122571
517	NC_014736	AC	3	6	24341	24346	50 %	0 %	0 %	50 %	313122571
518	NC_014736	CAT	2	6	24353	24358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122571
519	NC_014736	CAC	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122571
520	NC_014736	GGT	2	6	24409	24414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122571
521	NC_014736	ACGTGT	2	12	24466	24477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313122571
522	NC_014736	GAC	2	6	24644	24649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122571
523	NC_014736	CGG	2	6	24655	24660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122571
524	NC_014736	GGT	2	6	24708	24713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122571
525	NC_014736	CAA	2	6	24781	24786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014736	AACG	2	8	24810	24817	50 %	0 %	25 %	25 %	313122572
527	NC_014736	TCGG	2	8	24897	24904	0 %	25 %	50 %	25 %	313122572
528	NC_014736	ACTG	2	8	24948	24955	25 %	25 %	25 %	25 %	313122572
529	NC_014736	ACCC	2	8	24994	25001	25 %	0 %	0 %	75 %	313122572
530	NC_014736	A	6	6	25004	25009	100 %	0 %	0 %	0 %	313122572
531	NC_014736	ACG	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122572
532	NC_014736	AAG	2	6	25090	25095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122572
533	NC_014736	GCA	2	6	25135	25140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122572
534	NC_014736	GAT	2	6	25174	25179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122572
535	NC_014736	CGT	2	6	25236	25241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122572
536	NC_014736	TGCT	2	8	25260	25267	0 %	50 %	25 %	25 %	313122572
537	NC_014736	AC	3	6	25268	25273	50 %	0 %	0 %	50 %	313122572
538	NC_014736	AAAT	2	8	25326	25333	75 %	25 %	0 %	0 %	313122572
539	NC_014736	GGTA	2	8	25366	25373	25 %	25 %	50 %	0 %	313122572
540	NC_014736	CGGA	2	8	25513	25520	25 %	0 %	50 %	25 %	313122572
541	NC_014736	TGG	2	6	25521	25526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122572
542	NC_014736	GCA	2	6	25537	25542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122572
543	NC_014736	GTA	2	6	25583	25588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122572
544	NC_014736	ACG	2	6	25642	25647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122572
545	NC_014736	ACT	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122572
546	NC_014736	CGG	2	6	25710	25715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122572
547	NC_014736	CAC	2	6	25755	25760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122572
548	NC_014736	ACG	2	6	25784	25789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014736	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014736	GAG	2	6	25864	25869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014736	CTGG	2	8	25961	25968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_014736	GA	3	6	26097	26102	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
553	NC_014736	TGA	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122573
554	NC_014736	TCGG	2	8	26201	26208	0 %	25 %	50 %	25 %	313122573
555	NC_014736	G	6	6	26207	26212	0 %	0 %	100 %	0 %	313122573
556	NC_014736	AGA	2	6	26235	26240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122573
557	NC_014736	ACCGC	2	10	26246	26255	20 %	0 %	20 %	60 %	313122573
558	NC_014736	CGC	2	6	26344	26349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122573
559	NC_014736	AG	3	6	26350	26355	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
560	NC_014736	TG	3	6	26368	26373	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
561	NC_014736	TGGC	2	8	26428	26435	0 %	25 %	50 %	25 %	313122573
562	NC_014736	CATT	2	8	26582	26589	25 %	50 %	0 %	25 %	313122573
563	NC_014736	GCC	2	6	26622	26627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122573
564	NC_014736	ATCT	2	8	26641	26648	25 %	50 %	0 %	25 %	313122573
565	NC_014736	TG	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
566	NC_014736	AT	3	6	26691	26696	50 %	50 %	0 %	0 %	313122573
567	NC_014736	CT	3	6	26796	26801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_014736	TCT	2	6	26832	26837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014736	CTT	2	6	26976	26981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122574
570	NC_014736	GCC	2	6	26985	26990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122574
571	NC_014736	GCC	2	6	27100	27105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122574
572	NC_014736	CGT	2	6	27119	27124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
573	NC_014736	ATC	2	6	27136	27141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122574
574	NC_014736	TCC	2	6	27190	27195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122574
575	NC_014736	GTT	2	6	27207	27212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122574
576	NC_014736	TCG	2	6	27223	27228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
577	NC_014736	TCG	2	6	27268	27273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
578	NC_014736	GC	3	6	27281	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	313122574
579	NC_014736	ATG	2	6	27299	27304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122574
580	NC_014736	TGTC	2	8	27377	27384	0 %	50 %	25 %	25 %	313122574
581	NC_014736	AGC	2	6	27391	27396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
582	NC_014736	CGA	2	6	27404	27409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
583	NC_014736	GCA	2	6	27424	27429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
584	NC_014736	TCG	2	6	27436	27441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
585	NC_014736	AAC	2	6	27472	27477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122574
586	NC_014736	TCG	2	6	27527	27532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
587	NC_014736	GAC	2	6	27567	27572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
588	NC_014736	CCG	2	6	27586	27591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122574
589	NC_014736	CTG	2	6	27620	27625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
590	NC_014736	GCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
591	NC_014736	CGCC	2	8	27707	27714	0 %	0 %	25 %	75 %	313122574
592	NC_014736	ACG	2	6	27733	27738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
593	NC_014736	GAC	2	6	27741	27746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
594	NC_014736	CCT	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122574
595	NC_014736	GA	3	6	27793	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	313122574
596	NC_014736	CGG	2	6	27809	27814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
597	NC_014736	CGG	2	6	27836	27841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
598	NC_014736	GAT	2	6	27894	27899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122574
599	NC_014736	GTCT	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	313122574
600	NC_014736	CGAG	2	8	27982	27989	25 %	0 %	50 %	25 %	313122574
601	NC_014736	CAAC	2	8	28016	28023	50 %	0 %	0 %	50 %	313122574
602	NC_014736	CTT	2	6	28088	28093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122574
603	NC_014736	TGCC	2	8	28131	28138	0 %	25 %	25 %	50 %	313122574
604	NC_014736	AGT	2	6	28151	28156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122574
605	NC_014736	TC	3	6	28244	28249	0 %	50 %	0 %	50 %	313122574
606	NC_014736	GCT	2	6	28364	28369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
607	NC_014736	CTG	2	6	28388	28393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
608	NC_014736	TTGG	2	8	28394	28401	0 %	50 %	50 %	0 %	313122574
609	NC_014736	ATAA	2	8	28444	28451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014736	TTG	2	6	28469	28474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014736	CAT	2	6	28536	28541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122575
612	NC_014736	GTC	2	6	28611	28616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
613	NC_014736	GTT	2	6	28736	28741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122575
614	NC_014736	AGT	2	6	28801	28806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122575
615	NC_014736	TGC	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
616	NC_014736	TCT	2	6	28927	28932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122575
617	NC_014736	CAG	2	6	28938	28943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
618	NC_014736	TAG	2	6	28960	28965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122575
619	NC_014736	CGG	2	6	28970	28975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122575
620	NC_014736	TCG	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
621	NC_014736	TCTGTC	2	12	29037	29048	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313122575
622	NC_014736	GGT	2	6	29082	29087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122575
623	NC_014736	GTCG	2	8	29171	29178	0 %	25 %	50 %	25 %	313122575
624	NC_014736	GCT	2	6	29204	29209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
625	NC_014736	TG	3	6	29248	29253	0 %	50 %	50 %	0 %	313122575
626	NC_014736	TCT	2	6	29254	29259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122575
627	NC_014736	AGC	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
628	NC_014736	CAG	3	9	29333	29341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
629	NC_014736	GTC	2	6	29361	29366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
630	NC_014736	CAGC	2	8	29380	29387	25 %	0 %	25 %	50 %	313122575
631	NC_014736	AGC	3	9	29400	29408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
632	NC_014736	CGA	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
633	NC_014736	AT	3	6	29455	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014736	TA	3	6	29483	29488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014736	GCTCA	2	10	29612	29621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
636	NC_014736	CGAC	2	8	29664	29671	25 %	0 %	25 %	50 %	313122576
637	NC_014736	GCT	2	6	29696	29701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122576
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642	NC_014736	CAGT	2	8	29980	29987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_014736	CA	3	6	29988	29993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
644	NC_014736	TCC	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122577
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657	NC_014736	GC	3	6	30803	30808	0 %	0 %	50 %	50 %	313122577
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756	NC_014736	TGA	2	6	35738	35743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122580
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