MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	GTCTCG	2	12	184	195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
2	NC_014735	GC	3	6	257	262	0 %	0 %	50 %	50 %	313117185
3	NC_014735	CGT	2	6	276	281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
4	NC_014735	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
5	NC_014735	TCG	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
6	NC_014735	GTA	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
7	NC_014735	AATC	2	8	407	414	50 %	25 %	0 %	25 %	313117185
8	NC_014735	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117185
9	NC_014735	TTG	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117185
10	NC_014735	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
11	NC_014735	CGG	2	6	605	610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117185
12	NC_014735	GTC	3	9	714	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
13	NC_014735	ATAA	2	8	879	886	75 %	25 %	0 %	0 %	313117185
14	NC_014735	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117185
15	NC_014735	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117186
16	NC_014735	TA	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	313117186
17	NC_014735	GA	3	6	1207	1212	50 %	0 %	50 %	0 %	313117186
18	NC_014735	AGTA	2	8	1215	1222	50 %	25 %	25 %	0 %	313117186
19	NC_014735	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
20	NC_014735	TAC	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
21	NC_014735	TCA	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
22	NC_014735	CAAG	2	8	1479	1486	50 %	0 %	25 %	25 %	313117186
23	NC_014735	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117186
24	NC_014735	TCCT	2	8	1642	1649	0 %	50 %	0 %	50 %	313117186
25	NC_014735	AAG	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
26	NC_014735	GTC	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117186
27	NC_014735	CAAT	2	8	1827	1834	50 %	25 %	0 %	25 %	313117186
28	NC_014735	AAT	2	6	1970	1975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117186
29	NC_014735	TTTC	2	8	2019	2026	0 %	75 %	0 %	25 %	313117186
30	NC_014735	CTC	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117186
31	NC_014735	CCG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117186
32	NC_014735	CAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117186
33	NC_014735	A	9	9	2121	2129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014735	ACA	2	6	2176	2181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014735	GCGTC	2	10	2201	2210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014735	AC	3	6	2308	2313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014735	CCAG	2	8	2400	2407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014735	ATT	2	6	2454	2459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014735	TC	3	6	2526	2531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014735	AAG	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014735	CA	3	6	2600	2605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014735	ATCTGT	2	12	2615	2626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014735	GTTC	2	8	2627	2634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014735	AATA	2	8	2701	2708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014735	GAA	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014735	TCT	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014735	CAGA	2	8	3044	3051	50 %	0 %	25 %	25 %	313117187
48	NC_014735	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117187
49	NC_014735	TCG	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117187
50	NC_014735	TGA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117187
51	NC_014735	ACT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117187
52	NC_014735	ATT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014735	GAG	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014735	GAC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014735	ATA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014735	AGTT	2	8	3665	3672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014735	AGA	2	6	3721	3726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014735	CGCGA	2	10	3764	3773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014735	AG	3	6	3916	3921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014735	TTC	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014735	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117188
62	NC_014735	GCTG	2	8	3990	3997	0 %	25 %	50 %	25 %	313117188
63	NC_014735	CGAAGC	2	12	4020	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117188
64	NC_014735	GTT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
65	NC_014735	TTG	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
66	NC_014735	CT	3	6	4243	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	313117188
67	NC_014735	ATTC	2	8	4355	4362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014735	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014735	TTA	2	6	4527	4532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014735	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014735	AGT	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014735	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014735	CAGA	2	8	4625	4632	50 %	0 %	25 %	25 %	313117189
74	NC_014735	CGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117189
75	NC_014735	TGC	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117189
76	NC_014735	TGG	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117189
77	NC_014735	AGT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117189
78	NC_014735	GCA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117189
79	NC_014735	GGC	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117189
80	NC_014735	AAT	2	6	5037	5042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117189
81	NC_014735	TCA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
82	NC_014735	TCA	3	9	5253	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
83	NC_014735	AAGA	2	8	5424	5431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014735	TTC	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117191
85	NC_014735	GGCG	2	8	5533	5540	0 %	0 %	75 %	25 %	313117191
86	NC_014735	AAC	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117191
87	NC_014735	ACG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
88	NC_014735	CGA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
89	NC_014735	CGGT	2	8	5816	5823	0 %	25 %	50 %	25 %	313117191
90	NC_014735	GAT	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117191
91	NC_014735	CCG	2	6	5876	5881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117191
92	NC_014735	ACCA	2	8	5898	5905	50 %	0 %	0 %	50 %	313117191
93	NC_014735	GAG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
94	NC_014735	GAG	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
95	NC_014735	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117192
96	NC_014735	ACC	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
97	NC_014735	TCA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
98	NC_014735	TCA	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
99	NC_014735	CCA	2	6	6270	6275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
100	NC_014735	ATG	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117192
101	NC_014735	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
102	NC_014735	GTCA	2	8	6339	6346	25 %	25 %	25 %	25 %	313117192
103	NC_014735	ACGA	2	8	6358	6365	50 %	0 %	25 %	25 %	313117192
104	NC_014735	CA	3	6	6398	6403	50 %	0 %	0 %	50 %	313117192
105	NC_014735	ATGG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	50 %	0 %	313117192
106	NC_014735	TCT	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117192
107	NC_014735	CGAC	2	8	6491	6498	25 %	0 %	25 %	50 %	313117192
108	NC_014735	CGT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117192
109	NC_014735	CGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
110	NC_014735	CGA	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
111	NC_014735	CTC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117192
112	NC_014735	GGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117192
113	NC_014735	AAACG	2	10	6624	6633	60 %	0 %	20 %	20 %	313117192
114	NC_014735	AAC	2	6	6637	6642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117192
115	NC_014735	CAT	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
116	NC_014735	TCA	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
117	NC_014735	TGG	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117193
118	NC_014735	GAA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117193
119	NC_014735	CGA	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
120	NC_014735	GT	3	6	6853	6858	0 %	50 %	50 %	0 %	313117193
121	NC_014735	ATC	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
122	NC_014735	CGA	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
123	NC_014735	GCA	2	6	6945	6950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
124	NC_014735	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
125	NC_014735	CGA	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
126	NC_014735	GTC	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
127	NC_014735	CGA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
128	NC_014735	TCC	2	6	7078	7083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117193
129	NC_014735	TGAC	2	8	7096	7103	25 %	25 %	25 %	25 %	313117193
130	NC_014735	ACA	2	6	7114	7119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117193
131	NC_014735	GA	3	6	7168	7173	50 %	0 %	50 %	0 %	313117194
132	NC_014735	CGA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
133	NC_014735	CAG	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
134	NC_014735	TG	3	6	7255	7260	0 %	50 %	50 %	0 %	313117194
135	NC_014735	AT	3	6	7320	7325	50 %	50 %	0 %	0 %	313117194
136	NC_014735	GA	3	6	7400	7405	50 %	0 %	50 %	0 %	313117194
137	NC_014735	CTT	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014735	T	6	6	7426	7431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014735	CCAA	2	8	7434	7441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014735	ACGT	2	8	7467	7474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014735	GCTA	2	8	7519	7526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014735	TCG	3	9	7718	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117195
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147	NC_014735	GAG	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117195
148	NC_014735	CGGC	2	8	7949	7956	0 %	0 %	50 %	50 %	313117195
149	NC_014735	CA	3	6	7967	7972	50 %	0 %	0 %	50 %	313117195
150	NC_014735	ACCG	2	8	7984	7991	25 %	0 %	25 %	50 %	313117195
151	NC_014735	ACGAC	2	10	8068	8077	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014735	TCC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_014735	GTC	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014735	CTC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_014735	TCC	2	6	8168	8173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014735	GAA	2	6	8205	8210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014735	TGA	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014735	GGAA	2	8	8284	8291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_014735	TCG	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
174	NC_014735	TCG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
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183	NC_014735	TTA	2	6	9293	9298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014735	CGTA	2	8	9310	9317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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254	NC_014735	GAG	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_014735	TTG	2	6	13272	13277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014735	GCG	2	6	13333	13338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_014735	GTC	2	6	13557	13562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_014735	T	6	6	13592	13597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014735	GAC	3	9	13663	13671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_014735	GTC	2	6	13809	13814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_014735	ATA	2	6	13823	13828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_014735	AAT	3	9	19871	19879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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