MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 4579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014732	TCA	2	6	61333	61338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122430
1502	NC_014732	GTC	2	6	61371	61376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1503	NC_014732	GA	3	6	61387	61392	50 %	0 %	50 %	0 %	313122430
1504	NC_014732	TCA	2	6	61426	61431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122430
1505	NC_014732	CGC	2	6	61447	61452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122430
1506	NC_014732	GTG	2	6	61453	61458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122430
1507	NC_014732	CGC	2	6	61467	61472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122430
1508	NC_014732	CCG	2	6	61597	61602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122430
1509	NC_014732	CCCG	2	8	61671	61678	0 %	0 %	25 %	75 %	313122430
1510	NC_014732	CCA	2	6	61685	61690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122430
1511	NC_014732	CGA	2	6	61697	61702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1512	NC_014732	AAG	2	6	61770	61775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122430
1513	NC_014732	CGT	2	6	61835	61840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1514	NC_014732	GC	3	6	61920	61925	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
1515	NC_014732	CGA	2	6	62024	62029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1516	NC_014732	CGG	2	6	62090	62095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122430
1517	NC_014732	CG	4	8	62133	62140	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
1518	NC_014732	TCG	2	6	62146	62151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1519	NC_014732	GTC	2	6	62159	62164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122430
1520	NC_014732	CG	3	6	62299	62304	0 %	0 %	50 %	50 %	313122430
1521	NC_014732	CGG	2	6	62471	62476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122430
1522	NC_014732	AGT	2	6	62586	62591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014732	ATC	2	6	62592	62597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_014732	CAA	2	6	62600	62605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014732	CGT	2	6	62730	62735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122431
1526	NC_014732	GTC	2	6	62828	62833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122431
1527	NC_014732	GCG	2	6	62838	62843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122431
1528	NC_014732	TTC	2	6	62863	62868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122431
1529	NC_014732	CCA	2	6	62971	62976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122431
1530	NC_014732	GGT	2	6	63089	63094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014732	TCG	2	6	63291	63296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122432
1532	NC_014732	GCC	2	6	63320	63325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122432
1533	NC_014732	CCT	2	6	63407	63412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122432
1534	NC_014732	TCG	4	12	63460	63471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122432
1535	NC_014732	TAC	2	6	63528	63533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122432
1536	NC_014732	TCC	2	6	63595	63600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122432
1537	NC_014732	CGC	2	6	63613	63618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122432
1538	NC_014732	TGGA	2	8	63676	63683	25 %	25 %	50 %	0 %	313122432
1539	NC_014732	CGT	3	9	63713	63721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122432
1540	NC_014732	TGG	2	6	63726	63731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122432
1541	NC_014732	CAG	2	6	63757	63762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122432
1542	NC_014732	CTAA	2	8	63803	63810	50 %	25 %	0 %	25 %	313122432
1543	NC_014732	ATT	2	6	63825	63830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014732	ATA	2	6	63849	63854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014732	GGA	2	6	63875	63880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014732	CGT	2	6	63887	63892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1547	NC_014732	CCG	2	6	63907	63912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122433
1548	NC_014732	GAT	2	6	63984	63989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122433
1549	NC_014732	CGT	2	6	64085	64090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1550	NC_014732	GTTG	2	8	64097	64104	0 %	50 %	50 %	0 %	313122433
1551	NC_014732	CGA	2	6	64190	64195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1552	NC_014732	AGA	2	6	64243	64248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122433
1553	NC_014732	ACA	2	6	64260	64265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122433
1554	NC_014732	CTG	2	6	64275	64280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1555	NC_014732	TCG	2	6	64329	64334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1556	NC_014732	ACGC	2	8	64338	64345	25 %	0 %	25 %	50 %	313122433
1557	NC_014732	GAC	2	6	64388	64393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1558	NC_014732	ACG	3	9	64420	64428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1559	NC_014732	CGG	2	6	64429	64434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122433
1560	NC_014732	CG	3	6	64447	64452	0 %	0 %	50 %	50 %	313122433
1561	NC_014732	CGA	2	6	64466	64471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1562	NC_014732	CGA	2	6	64489	64494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1563	NC_014732	CGAA	2	8	64639	64646	50 %	0 %	25 %	25 %	313122433
1564	NC_014732	GAC	2	6	64709	64714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1565	NC_014732	ACG	2	6	64726	64731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1566	NC_014732	TTCA	2	8	64752	64759	25 %	50 %	0 %	25 %	313122433
1567	NC_014732	GCC	2	6	64794	64799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122433
1568	NC_014732	CGC	2	6	64829	64834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122433
1569	NC_014732	GTC	2	6	64891	64896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1570	NC_014732	GAC	2	6	65022	65027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1571	NC_014732	CCTG	2	8	65060	65067	0 %	25 %	25 %	50 %	313122433
1572	NC_014732	CT	3	6	65077	65082	0 %	50 %	0 %	50 %	313122433
1573	NC_014732	TCG	2	6	65101	65106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122433
1574	NC_014732	GACG	2	8	65113	65120	25 %	0 %	50 %	25 %	313122433
1575	NC_014732	CAA	2	6	65121	65126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122433
1576	NC_014732	CGT	2	6	65208	65213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014732	AGA	2	6	65243	65248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014732	AC	3	6	65295	65300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_014732	TAG	2	6	65430	65435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014732	GCG	2	6	65521	65526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_014732	CTG	2	6	65544	65549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014732	CCG	2	6	65558	65563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_014732	CAG	2	6	65587	65592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014732	AGT	2	6	65656	65661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014732	GTA	2	6	65686	65691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014732	CGA	2	6	65722	65727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1587	NC_014732	ACG	2	6	65814	65819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1588	NC_014732	GCCGA	2	10	65829	65838	20 %	0 %	40 %	40 %	313122434
1589	NC_014732	GC	3	6	65842	65847	0 %	0 %	50 %	50 %	313122434
1590	NC_014732	CGA	2	6	65867	65872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1591	NC_014732	AGCC	2	8	65885	65892	25 %	0 %	25 %	50 %	313122434
1592	NC_014732	GAC	3	9	65907	65915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1593	NC_014732	CGGCGT	2	12	65918	65929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313122434
1594	NC_014732	CGA	2	6	65933	65938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1595	NC_014732	CGG	2	6	65941	65946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122434
1596	NC_014732	GAC	3	9	65964	65972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1597	NC_014732	CGT	2	6	66015	66020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1598	NC_014732	GT	3	6	66025	66030	0 %	50 %	50 %	0 %	313122434
1599	NC_014732	AT	3	6	66073	66078	50 %	50 %	0 %	0 %	313122434
1600	NC_014732	ACGTG	2	10	66113	66122	20 %	20 %	40 %	20 %	313122434
1601	NC_014732	CGA	2	6	66185	66190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1602	NC_014732	ACG	2	6	66220	66225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1603	NC_014732	GAC	2	6	66240	66245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1604	NC_014732	CCG	2	6	66268	66273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122434
1605	NC_014732	CGT	2	6	66332	66337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1606	NC_014732	GCC	2	6	66418	66423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122434
1607	NC_014732	CGA	2	6	66508	66513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1608	NC_014732	CGAGT	2	10	66537	66546	20 %	20 %	40 %	20 %	313122434
1609	NC_014732	CGC	2	6	66551	66556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122434
1610	NC_014732	CGA	2	6	66602	66607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1611	NC_014732	CGA	2	6	66728	66733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1612	NC_014732	GCG	2	6	66760	66765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122434
1613	NC_014732	CGC	2	6	66786	66791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122434
1614	NC_014732	GCG	2	6	66801	66806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122434
1615	NC_014732	AACC	2	8	66821	66828	50 %	0 %	0 %	50 %	313122434
1616	NC_014732	TCG	2	6	66850	66855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122434
1617	NC_014732	CGG	2	6	66887	66892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122434
1618	NC_014732	CGC	3	9	67043	67051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_014732	CGC	2	6	67090	67095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_014732	CAA	2	6	67126	67131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122435
1621	NC_014732	GAA	2	6	67164	67169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122435
1622	NC_014732	AAC	2	6	67189	67194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122435
1623	NC_014732	CGC	2	6	67241	67246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122435
1624	NC_014732	ATC	2	6	67252	67257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122435
1625	NC_014732	GTC	2	6	67329	67334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122435
1626	NC_014732	CGA	2	6	67514	67519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122435
1627	NC_014732	TCT	2	6	67555	67560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122435
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1632	NC_014732	CGCGG	2	10	67817	67826	0 %	0 %	60 %	40 %	313122435
1633	NC_014732	GA	3	6	67885	67890	50 %	0 %	50 %	0 %	313122435
1634	NC_014732	CGA	2	6	67973	67978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122435
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1642	NC_014732	CGA	2	6	68413	68418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122435
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1645	NC_014732	GGA	2	6	68567	68572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122435
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1651	NC_014732	GCG	2	6	69018	69023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1694	NC_014732	ATT	2	6	70730	70735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1749	NC_014732	GTCG	2	8	73433	73440	0 %	25 %	50 %	25 %	313122437
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