MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	AG	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014731	CAG	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014731	GCC	2	6	64	69	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014731	TAGT	2	8	132	139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014731	TAAA	2	8	193	200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014731	GCG	2	6	285	290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
7	NC_014731	CGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
8	NC_014731	CAC	3	9	299	307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
9	NC_014731	CGG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
10	NC_014731	GTT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116828
11	NC_014731	CGC	2	6	389	394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
12	NC_014731	TTC	2	6	486	491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
13	NC_014731	CCA	2	6	531	536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
14	NC_014731	CGT	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
15	NC_014731	CAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
16	NC_014731	TTC	2	6	631	636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
17	NC_014731	CGG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
18	NC_014731	CGA	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
19	NC_014731	CGC	2	6	686	691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
20	NC_014731	CA	3	6	738	743	50 %	0 %	0 %	50 %	313116828
21	NC_014731	CTG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
22	NC_014731	ACT	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116828
23	NC_014731	TCG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
24	NC_014731	TCG	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
25	NC_014731	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014731	CGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014731	CCG	2	6	1099	1104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014731	TC	3	6	1135	1140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014731	CCATC	2	10	1266	1275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014731	GCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014731	AGCA	3	12	1284	1295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014731	GGC	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014731	AGT	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014731	CTTT	2	8	1374	1381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014731	TTCG	2	8	1559	1566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014731	GTG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014731	CTC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
38	NC_014731	AGT	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
39	NC_014731	CGT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
40	NC_014731	CGA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
41	NC_014731	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
42	NC_014731	ATC	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116829
43	NC_014731	TTG	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
44	NC_014731	ACG	3	9	2281	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
45	NC_014731	GTA	3	9	2464	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
46	NC_014731	GTC	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
47	NC_014731	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
48	NC_014731	CT	3	6	2753	2758	0 %	50 %	0 %	50 %	313116829
49	NC_014731	TTC	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
50	NC_014731	CT	3	6	2791	2796	0 %	50 %	0 %	50 %	313116829
51	NC_014731	AGG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116829
52	NC_014731	TCC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
53	NC_014731	AGAACG	2	12	2860	2871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313116829
54	NC_014731	TTC	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
55	NC_014731	T	7	7	2939	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
56	NC_014731	G	6	6	2984	2989	0 %	0 %	100 %	0 %	313116829
57	NC_014731	AAAG	2	8	3010	3017	75 %	0 %	25 %	0 %	313116829
58	NC_014731	CT	3	6	3059	3064	0 %	50 %	0 %	50 %	313116829
59	NC_014731	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313116829
60	NC_014731	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
61	NC_014731	AGT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
62	NC_014731	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
63	NC_014731	AGT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
64	NC_014731	ACC	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116829
65	NC_014731	GTC	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
66	NC_014731	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
67	NC_014731	TATCT	2	10	3436	3445	20 %	60 %	0 %	20 %	313116829
68	NC_014731	AT	3	6	3459	3464	50 %	50 %	0 %	0 %	313116829
69	NC_014731	GA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014731	ATCT	2	8	3712	3719	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
71	NC_014731	CA	3	6	3756	3761	50 %	0 %	0 %	50 %	313116830
72	NC_014731	TCC	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
73	NC_014731	ATG	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
74	NC_014731	CAA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116830
75	NC_014731	CAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
76	NC_014731	GAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
77	NC_014731	AGT	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
78	NC_014731	CTG	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
79	NC_014731	TC	5	10	4062	4071	0 %	50 %	0 %	50 %	313116830
80	NC_014731	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
81	NC_014731	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
82	NC_014731	ATGGG	2	10	4180	4189	20 %	20 %	60 %	0 %	313116830
83	NC_014731	TCC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
84	NC_014731	GCGA	2	8	4216	4223	25 %	0 %	50 %	25 %	313116830
85	NC_014731	ACG	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
86	NC_014731	GTGGTC	2	12	4268	4279	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	313116830
87	NC_014731	GA	3	6	4333	4338	50 %	0 %	50 %	0 %	313116830
88	NC_014731	AG	3	6	4367	4372	50 %	0 %	50 %	0 %	313116830
89	NC_014731	ATG	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
90	NC_014731	GA	3	6	4490	4495	50 %	0 %	50 %	0 %	313116830
91	NC_014731	TAG	3	9	4505	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
92	NC_014731	AC	3	6	4526	4531	50 %	0 %	0 %	50 %	313116830
93	NC_014731	GTC	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
94	NC_014731	AC	3	6	4595	4600	50 %	0 %	0 %	50 %	313116830
95	NC_014731	ACAAA	2	10	4623	4632	80 %	0 %	0 %	20 %	313116830
96	NC_014731	ATCT	2	8	4638	4645	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
97	NC_014731	AG	4	8	4670	4677	50 %	0 %	50 %	0 %	313116830
98	NC_014731	TGG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116830
99	NC_014731	AC	3	6	4758	4763	50 %	0 %	0 %	50 %	313116830
100	NC_014731	GGA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
101	NC_014731	TGA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
102	NC_014731	TCG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
103	NC_014731	GAG	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
104	NC_014731	GGA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
105	NC_014731	GAC	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
106	NC_014731	AGA	2	6	5030	5035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
107	NC_014731	GGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
108	NC_014731	GA	3	6	5055	5060	50 %	0 %	50 %	0 %	313116830
109	NC_014731	AAG	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
110	NC_014731	ACG	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
111	NC_014731	TTC	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
112	NC_014731	CTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
113	NC_014731	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
114	NC_014731	GAC	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
115	NC_014731	GTTCG	2	10	5283	5292	0 %	40 %	40 %	20 %	313116830
116	NC_014731	GAC	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
117	NC_014731	G	6	6	5335	5340	0 %	0 %	100 %	0 %	313116830
118	NC_014731	AAATC	2	10	5341	5350	60 %	20 %	0 %	20 %	313116830
119	NC_014731	ACC	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116830
120	NC_014731	TC	3	6	5464	5469	0 %	50 %	0 %	50 %	313116830
121	NC_014731	CT	5	10	5485	5494	0 %	50 %	0 %	50 %	313116830
122	NC_014731	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
123	NC_014731	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
124	NC_014731	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
125	NC_014731	CAG	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
126	NC_014731	TGA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
127	NC_014731	AGA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
128	NC_014731	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
129	NC_014731	TCA	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
130	NC_014731	GCT	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
131	NC_014731	TTC	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
132	NC_014731	AGA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
133	NC_014731	TTG	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116830
134	NC_014731	ATC	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
135	NC_014731	AAC	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014731	TCG	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014731	GAC	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014731	CGA	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116831
139	NC_014731	TGCT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	25 %	25 %	313116831
140	NC_014731	ACCGA	2	10	6479	6488	40 %	0 %	20 %	40 %	313116831
141	NC_014731	GTCAG	2	10	6532	6541	20 %	20 %	40 %	20 %	313116831
142	NC_014731	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	313116831
143	NC_014731	ACT	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116831
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186	NC_014731	TGAC	2	8	8646	8653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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255	NC_014731	AGAA	2	8	11257	11264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014731	TGT	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116836
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263	NC_014731	GTC	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116836
264	NC_014731	A	6	6	11565	11570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014731	GCC	2	6	11596	11601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
266	NC_014731	GC	3	6	11648	11653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
267	NC_014731	TGA	2	6	11663	11668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014731	TGG	2	6	11716	11721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014731	GT	3	6	11723	11728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014731	GAA	2	6	11758	11763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014731	CCG	2	6	11766	11771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_014731	CGC	2	6	11772	11777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_014731	GAG	2	6	11857	11862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014731	GCC	2	6	11922	11927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_014731	A	8	8	12219	12226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_014731	TCG	2	6	18848	18853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116843
403	NC_014731	CGT	2	6	18863	18868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116843
404	NC_014731	GCT	2	6	18885	18890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116843
405	NC_014731	GCG	2	6	18928	18933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116843
406	NC_014731	GGC	2	6	18951	18956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116843
407	NC_014731	AG	3	6	18984	18989	50 %	0 %	50 %	0 %	313116843
408	NC_014731	GAC	2	6	18997	19002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
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410	NC_014731	GGC	2	6	19056	19061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116843
411	NC_014731	CGA	2	6	19071	19076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
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413	NC_014731	GAC	2	6	19123	19128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
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422	NC_014731	TCC	2	6	19613	19618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116843
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427	NC_014731	CAACG	2	10	19848	19857	40 %	0 %	20 %	40 %	313116843
428	NC_014731	TCGA	2	8	19864	19871	25 %	25 %	25 %	25 %	313116843
429	NC_014731	GAC	2	6	19972	19977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
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431	NC_014731	TGG	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116843
432	NC_014731	GGGC	2	8	20091	20098	0 %	0 %	75 %	25 %	313116843
433	NC_014731	GGC	2	6	20147	20152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_014731	CGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_014731	GAC	2	6	20223	20228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_014731	CAG	2	6	20339	20344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_014731	TCC	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_014731	CGA	2	6	20366	20371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_014731	CGA	2	6	20438	20443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
440	NC_014731	GT	3	6	20499	20504	0 %	50 %	50 %	0 %	313116844
441	NC_014731	GAC	2	6	20520	20525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
442	NC_014731	CGTC	2	8	20545	20552	0 %	25 %	25 %	50 %	313116844
443	NC_014731	GGC	2	6	20582	20587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
444	NC_014731	CGG	2	6	20644	20649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
445	NC_014731	CGA	2	6	20735	20740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
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451	NC_014731	TCG	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116844
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454	NC_014731	CTG	2	6	21202	21207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116844
455	NC_014731	ACG	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
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459	NC_014731	ACC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116844
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461	NC_014731	GTT	2	6	21443	21448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116844
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465	NC_014731	GCC	2	6	21546	21551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116844
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467	NC_014731	CGG	2	6	21613	21618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
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469	NC_014731	CGGT	2	8	21767	21774	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
470	NC_014731	GCTG	2	8	21812	21819	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
471	NC_014731	GAG	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116844
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479	NC_014731	GCG	2	6	22293	22298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
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496	NC_014731	CG	3	6	23074	23079	0 %	0 %	50 %	50 %	313116845
497	NC_014731	CGC	2	6	23099	23104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116845
498	NC_014731	CGT	3	9	23107	23115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
499	NC_014731	GTC	2	6	23116	23121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
500	NC_014731	GC	3	6	23150	23155	0 %	0 %	50 %	50 %	313116845

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