MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014731	TCG	2	6	175764	175769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4002	NC_014731	ACG	2	6	175838	175843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4003	NC_014731	TCA	2	6	175862	175867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116986
4004	NC_014731	CT	3	6	175884	175889	0 %	50 %	0 %	50 %	313116986
4005	NC_014731	GA	3	6	175892	175897	50 %	0 %	50 %	0 %	313116986
4006	NC_014731	A	6	6	175913	175918	100 %	0 %	0 %	0 %	313116986
4007	NC_014731	GGA	2	6	175924	175929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116986
4008	NC_014731	CGC	2	6	175942	175947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
4009	NC_014731	GAG	2	6	176021	176026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116986
4010	NC_014731	GTC	2	6	176044	176049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4011	NC_014731	CAG	2	6	176055	176060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4012	NC_014731	ACCG	2	8	176168	176175	25 %	0 %	25 %	50 %	313116986
4013	NC_014731	GTC	2	6	176231	176236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4014	NC_014731	GACGCC	2	12	176252	176263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	313116986
4015	NC_014731	CCG	2	6	176280	176285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
4016	NC_014731	CGA	2	6	176394	176399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4017	NC_014731	ACG	2	6	176451	176456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4018	NC_014731	GGC	2	6	176459	176464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
4019	NC_014731	TCC	2	6	176505	176510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116986
4020	NC_014731	GCACA	2	10	176511	176520	40 %	0 %	20 %	40 %	313116986
4021	NC_014731	TCG	2	6	176532	176537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4022	NC_014731	TCG	2	6	176610	176615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4023	NC_014731	TCG	2	6	176636	176641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4024	NC_014731	GAC	2	6	176672	176677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4025	NC_014731	GCC	2	6	176731	176736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
4026	NC_014731	CGC	2	6	176815	176820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
4027	NC_014731	GCGG	2	8	176825	176832	0 %	0 %	75 %	25 %	313116986
4028	NC_014731	GAAC	2	8	176911	176918	50 %	0 %	25 %	25 %	313116986
4029	NC_014731	TGC	2	6	176923	176928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4030	NC_014731	TTG	2	6	176942	176947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116986
4031	NC_014731	GCG	2	6	176950	176955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
4032	NC_014731	GAC	2	6	177022	177027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4033	NC_014731	CTC	2	6	177035	177040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116986
4034	NC_014731	CGT	2	6	177078	177083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4035	NC_014731	TCG	2	6	177084	177089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4036	NC_014731	TCG	2	6	177126	177131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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4039	NC_014731	GC	4	8	177188	177195	0 %	0 %	50 %	50 %	313116986
4040	NC_014731	CGCGT	2	10	177196	177205	0 %	20 %	40 %	40 %	313116986
4041	NC_014731	CGG	2	6	177277	177282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
4042	NC_014731	GA	3	6	177310	177315	50 %	0 %	50 %	0 %	313116986
4043	NC_014731	TGA	2	6	177448	177453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116986
4044	NC_014731	CGG	2	6	177469	177474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
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4050	NC_014731	CG	3	6	177758	177763	0 %	0 %	50 %	50 %	313116986
4051	NC_014731	CGA	2	6	177880	177885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4052	NC_014731	GTT	2	6	177910	177915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116986
4053	NC_014731	CGG	3	9	177925	177933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
4054	NC_014731	AC	3	6	177963	177968	50 %	0 %	0 %	50 %	313116986
4055	NC_014731	ACG	3	9	177987	177995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4056	NC_014731	CG	3	6	178015	178020	0 %	0 %	50 %	50 %	313116986
4057	NC_014731	CAC	2	6	178056	178061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116986
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4059	NC_014731	CGT	2	6	178177	178182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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4061	NC_014731	TCG	2	6	178224	178229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4062	NC_014731	CGT	2	6	178233	178238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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4064	NC_014731	CGC	2	6	178270	178275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
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4069	NC_014731	TCG	2	6	178422	178427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4070	NC_014731	GAC	2	6	178436	178441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
4071	NC_014731	CCG	2	6	178451	178456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_014731	AGT	2	6	178477	178482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116987
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4088	NC_014731	ATT	2	6	179270	179275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313116987
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4093	NC_014731	TCGC	2	8	179498	179505	0 %	25 %	25 %	50 %	313116987
4094	NC_014731	ACG	2	6	179511	179516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116987
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4102	NC_014731	TCG	2	6	179940	179945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116987
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4107	NC_014731	TGA	2	6	180260	180265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116987
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4111	NC_014731	CTC	2	6	180531	180536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_014731	AT	3	6	180551	180556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014731	TG	3	6	180570	180575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014731	TCG	2	6	180621	180626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_014731	CAGC	2	8	180692	180699	25 %	0 %	25 %	50 %	313116988
4116	NC_014731	GTCGA	2	10	180701	180710	20 %	20 %	40 %	20 %	313116988
4117	NC_014731	GTC	2	6	180777	180782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116988
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4120	NC_014731	GTA	2	6	180842	180847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116988
4121	NC_014731	ACC	2	6	180880	180885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116988
4122	NC_014731	TCG	2	6	180909	180914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116988
4123	NC_014731	TCG	2	6	180972	180977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116988
4124	NC_014731	CGA	2	6	180982	180987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116988
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4126	NC_014731	CGT	2	6	181009	181014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116988
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4130	NC_014731	CGT	2	6	181142	181147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116988
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4140	NC_014731	TAA	2	6	181539	181544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_014731	CCAC	2	8	181653	181660	25 %	0 %	0 %	75 %	313116989
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4144	NC_014731	ACAG	2	8	181872	181879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4145	NC_014731	CAT	2	6	181912	181917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116990
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4150	NC_014731	GTA	2	6	182053	182058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116990
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4199	NC_014731	C	6	6	183756	183761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4200	NC_014731	CGG	2	6	183806	183811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4221	NC_014731	ACG	2	6	184839	184844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116993
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4230	NC_014731	CGTC	2	8	185250	185257	0 %	25 %	25 %	50 %	313116993
4231	NC_014731	TCG	2	6	185324	185329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116993
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4235	NC_014731	CAC	2	6	185500	185505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4236	NC_014731	GTCT	2	8	185518	185525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4237	NC_014731	CGACCG	2	12	185560	185571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4238	NC_014731	AAT	2	6	185583	185588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_014731	AAT	2	6	185603	185608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313116994
4240	NC_014731	GTC	2	6	185649	185654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116994
4241	NC_014731	CGG	3	9	185660	185668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116994
4242	NC_014731	CGG	2	6	185683	185688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116994
4243	NC_014731	CGC	2	6	185696	185701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116994
4244	NC_014731	GTC	2	6	185721	185726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116994
4245	NC_014731	CGGT	2	8	185735	185742	0 %	25 %	50 %	25 %	313116994
4246	NC_014731	ATCGAC	2	12	185796	185807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313116994
4247	NC_014731	GCC	2	6	185841	185846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116994
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4322	NC_014731	CCGGT	2	10	188606	188615	0 %	20 %	40 %	40 %	313116997
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4352	NC_014731	C	6	6	189421	189426	0 %	0 %	0 %	100 %	313116998
4353	NC_014731	GAC	2	6	189440	189445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116998
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4364	NC_014731	TC	3	6	189787	189792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4365	NC_014731	TTG	2	6	189853	189858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_014731	ATC	2	6	189874	189879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116999
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4500	NC_014731	AGATC	2	10	195347	195356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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