MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014731	AAG	2	6	67013	67018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116882
1502	NC_014731	CGT	2	6	67123	67128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116882
1503	NC_014731	CGG	2	6	67282	67287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116883
1504	NC_014731	CGC	2	6	67328	67333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
1505	NC_014731	CGA	2	6	67334	67339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1506	NC_014731	CCG	2	6	67387	67392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
1507	NC_014731	GAC	2	6	67407	67412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1508	NC_014731	TCG	2	6	67427	67432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1509	NC_014731	CAC	2	6	67449	67454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116883
1510	NC_014731	CGC	2	6	67467	67472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
1511	NC_014731	TCC	2	6	67531	67536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116883
1512	NC_014731	ACG	2	6	67556	67561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1513	NC_014731	GC	4	8	67631	67638	0 %	0 %	50 %	50 %	313116883
1514	NC_014731	TCG	2	6	67693	67698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1515	NC_014731	CCG	2	6	67739	67744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
1516	NC_014731	CGT	2	6	67775	67780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1517	NC_014731	GCG	2	6	67813	67818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116883
1518	NC_014731	GCC	2	6	67830	67835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
1519	NC_014731	GTA	2	6	67875	67880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116883
1520	NC_014731	AGTC	2	8	68021	68028	25 %	25 %	25 %	25 %	313116883
1521	NC_014731	ACCCTC	2	12	68037	68048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	313116883
1522	NC_014731	CGGTTC	2	12	68109	68120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1523	NC_014731	GAC	2	6	68166	68171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116883
1524	NC_014731	TAA	2	6	68207	68212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313116883
1525	NC_014731	TG	3	6	68241	68246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014731	GT	3	6	68262	68267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014731	GAC	2	6	68298	68303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116884
1528	NC_014731	TCT	2	6	68311	68316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116884
1529	NC_014731	GCG	2	6	68317	68322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116884
1530	NC_014731	CGA	2	6	68351	68356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116884
1531	NC_014731	CGG	2	6	68390	68395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116884
1532	NC_014731	GAA	2	6	68412	68417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116884
1533	NC_014731	CG	3	6	68428	68433	0 %	0 %	50 %	50 %	313116884
1534	NC_014731	GCT	2	6	68451	68456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116884
1535	NC_014731	CAT	2	6	68567	68572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116884
1536	NC_014731	ACC	2	6	68605	68610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116884
1537	NC_014731	TAC	2	6	68640	68645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116884
1538	NC_014731	GAG	2	6	68679	68684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116884
1539	NC_014731	CTA	2	6	68702	68707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116884
1540	NC_014731	ACCG	2	8	68717	68724	25 %	0 %	25 %	50 %	313116884
1541	NC_014731	CGA	2	6	68726	68731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116884
1542	NC_014731	CGG	2	6	68831	68836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116884
1543	NC_014731	TCG	2	6	68860	68865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116884
1544	NC_014731	G	6	6	69127	69132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014731	CGA	2	6	69167	69172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014731	ACG	2	6	69215	69220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1547	NC_014731	GAC	2	6	69247	69252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1548	NC_014731	TCG	2	6	69329	69334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1549	NC_014731	CGC	2	6	69352	69357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116885
1550	NC_014731	CT	3	6	69366	69371	0 %	50 %	0 %	50 %	313116885
1551	NC_014731	AAC	2	6	69400	69405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116885
1552	NC_014731	GGC	2	6	69477	69482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116885
1553	NC_014731	CGT	2	6	69510	69515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1554	NC_014731	TCGG	2	8	69620	69627	0 %	25 %	50 %	25 %	313116885
1555	NC_014731	TAC	2	6	69634	69639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116885
1556	NC_014731	CTC	2	6	69643	69648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116885
1557	NC_014731	CGA	2	6	69693	69698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1558	NC_014731	ACC	2	6	69704	69709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116885
1559	NC_014731	CGA	2	6	69717	69722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1560	NC_014731	GCG	2	6	69745	69750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116885
1561	NC_014731	AGA	2	6	69758	69763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116885
1562	NC_014731	ATC	2	6	69784	69789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116885
1563	NC_014731	CAA	2	6	69798	69803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116885
1564	NC_014731	AGC	2	6	69841	69846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1565	NC_014731	GA	3	6	69882	69887	50 %	0 %	50 %	0 %	313116885
1566	NC_014731	TCA	2	6	69953	69958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116885
1567	NC_014731	GGC	2	6	69975	69980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116885
1568	NC_014731	GAA	2	6	69982	69987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116885
1569	NC_014731	CCT	2	6	70014	70019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116885
1570	NC_014731	CCG	2	6	70058	70063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116885
1571	NC_014731	CGAA	2	8	70088	70095	50 %	0 %	25 %	25 %	313116885
1572	NC_014731	CGAC	2	8	70136	70143	25 %	0 %	25 %	50 %	313116885
1573	NC_014731	CAG	2	6	70144	70149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1574	NC_014731	CGT	2	6	70167	70172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1575	NC_014731	CTG	2	6	70291	70296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116885
1576	NC_014731	GTCA	2	8	70392	70399	25 %	25 %	25 %	25 %	313116885
1577	NC_014731	CGGT	2	8	70402	70409	0 %	25 %	50 %	25 %	313116885
1578	NC_014731	GCC	2	6	70447	70452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116885
1579	NC_014731	GAC	2	6	70608	70613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116886
1580	NC_014731	GTCGCC	2	12	70623	70634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	313116886
1581	NC_014731	GCC	2	6	70662	70667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116886
1582	NC_014731	TAC	2	6	70692	70697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116886
1583	NC_014731	GAG	2	6	70704	70709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116886
1584	NC_014731	ATG	2	6	70710	70715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116886
1585	NC_014731	GAT	2	6	70716	70721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116886
1586	NC_014731	ACGCCG	2	12	70749	70760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	313116886
1587	NC_014731	AC	3	6	70761	70766	50 %	0 %	0 %	50 %	313116886
1588	NC_014731	GAG	2	6	70869	70874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116886
1589	NC_014731	TTC	2	6	70911	70916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116886
1590	NC_014731	CGA	2	6	70946	70951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116886
1591	NC_014731	CCA	2	6	71001	71006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116886
1592	NC_014731	GGT	2	6	71049	71054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116886
1593	NC_014731	CTC	2	6	71058	71063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116886
1594	NC_014731	TCC	2	6	71089	71094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116886
1595	NC_014731	ACC	2	6	71152	71157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116886
1596	NC_014731	CCA	2	6	71159	71164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116886
1597	NC_014731	CGC	2	6	71168	71173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116886
1598	NC_014731	CGT	2	6	71218	71223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116886
1599	NC_014731	AC	3	6	71239	71244	50 %	0 %	0 %	50 %	313116886
1600	NC_014731	GAC	2	6	71337	71342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116886
1601	NC_014731	AGA	2	6	71444	71449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116886
1602	NC_014731	TCGC	2	8	71472	71479	0 %	25 %	25 %	50 %	313116886
1603	NC_014731	GA	3	6	71601	71606	50 %	0 %	50 %	0 %	313116887
1604	NC_014731	GAC	2	6	71651	71656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1605	NC_014731	CGT	3	9	71728	71736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1606	NC_014731	CGA	2	6	71742	71747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1607	NC_014731	CGC	2	6	71749	71754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116887
1608	NC_014731	CCAT	2	8	71822	71829	25 %	25 %	0 %	50 %	313116887
1609	NC_014731	CAAC	2	8	71905	71912	50 %	0 %	0 %	50 %	313116887
1610	NC_014731	GAC	2	6	71942	71947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1611	NC_014731	GGCG	2	8	72025	72032	0 %	0 %	75 %	25 %	313116887
1612	NC_014731	GCG	3	9	72030	72038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116887
1613	NC_014731	CGA	2	6	72223	72228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1614	NC_014731	TCG	2	6	72261	72266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1615	NC_014731	GTC	2	6	72278	72283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1616	NC_014731	CG	3	6	72318	72323	0 %	0 %	50 %	50 %	313116887
1617	NC_014731	GAC	3	9	72329	72337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1618	NC_014731	TCG	2	6	72384	72389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116887
1619	NC_014731	TTCG	2	8	72395	72402	0 %	50 %	25 %	25 %	313116887
1620	NC_014731	CG	3	6	72401	72406	0 %	0 %	50 %	50 %	313116887
1621	NC_014731	CCGC	2	8	72418	72425	0 %	0 %	25 %	75 %	313116887
1622	NC_014731	TGT	2	6	72463	72468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116887
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2000	NC_014731	CAA	2	6	87824	87829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116900

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