MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014731	C	6	6	335096	335101	0 %	0 %	0 %	100 %	313117128
7502	NC_014731	GTC	2	6	335105	335110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117128
7503	NC_014731	CAGC	2	8	335130	335137	25 %	0 %	25 %	50 %	313117128
7504	NC_014731	GCT	2	6	335144	335149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117128
7505	NC_014731	CCG	2	6	335163	335168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117128
7506	NC_014731	CGTCG	2	10	335184	335193	0 %	20 %	40 %	40 %	313117128
7507	NC_014731	TTC	2	6	335255	335260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_014731	AGT	2	6	335289	335294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_014731	C	6	6	335324	335329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7510	NC_014731	AATTG	2	10	335402	335411	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_014731	CA	3	6	335457	335462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_014731	AAT	2	6	335589	335594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_014731	TCC	2	6	335701	335706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7514	NC_014731	TTG	2	6	335792	335797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117129
7515	NC_014731	GAA	2	6	335830	335835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117129
7516	NC_014731	CCGT	2	8	335856	335863	0 %	25 %	25 %	50 %	313117129
7517	NC_014731	TTG	2	6	335883	335888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117129
7518	NC_014731	TATC	2	8	335950	335957	25 %	50 %	0 %	25 %	313117129
7519	NC_014731	ATT	2	6	336106	336111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_014731	GGA	2	6	336126	336131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_014731	ATC	2	6	336142	336147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_014731	GGA	2	6	336156	336161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_014731	ACA	2	6	336252	336257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_014731	AT	3	6	336262	336267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_014731	CCG	2	6	336287	336292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7526	NC_014731	GAG	2	6	336324	336329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_014731	GA	3	6	336380	336385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_014731	GAC	2	6	336395	336400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_014731	TGT	2	6	336405	336410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_014731	GGAA	2	8	336453	336460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_014731	GA	3	6	336479	336484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_014731	CAA	2	6	336610	336615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_014731	ATTA	2	8	336616	336623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_014731	ACTT	2	8	336632	336639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7535	NC_014731	GGT	2	6	336721	336726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117130
7536	NC_014731	AGC	2	6	336747	336752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117130
7537	NC_014731	ACT	2	6	336798	336803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117130
7538	NC_014731	CT	3	6	336819	336824	0 %	50 %	0 %	50 %	313117130
7539	NC_014731	TGC	2	6	336855	336860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117130
7540	NC_014731	TCA	2	6	336932	336937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117130
7541	NC_014731	TAT	2	6	337122	337127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117130
7542	NC_014731	AGT	2	6	337141	337146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117130
7543	NC_014731	TCA	2	6	337163	337168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117130
7544	NC_014731	AAG	2	6	337214	337219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117130
7545	NC_014731	TCA	2	6	337309	337314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117130
7546	NC_014731	CCA	2	6	337334	337339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117130
7547	NC_014731	TCG	3	9	337399	337407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117130
7548	NC_014731	TCAGT	2	10	337435	337444	20 %	40 %	20 %	20 %	313117130
7549	NC_014731	GTG	2	6	337631	337636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117130
7550	NC_014731	GGA	2	6	337651	337656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117130
7551	NC_014731	TTG	2	6	337716	337721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117130
7552	NC_014731	AAC	2	6	337756	337761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_014731	TTC	2	6	337766	337771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_014731	T	6	6	337822	337827	0 %	100 %	0 %	0 %	313117131
7555	NC_014731	CA	4	8	337886	337893	50 %	0 %	0 %	50 %	313117131
7556	NC_014731	TCA	2	6	337919	337924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117131
7557	NC_014731	CT	4	8	337945	337952	0 %	50 %	0 %	50 %	313117131
7558	NC_014731	CTATT	2	10	338027	338036	20 %	60 %	0 %	20 %	313117131
7559	NC_014731	ATT	2	6	338055	338060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117131
7560	NC_014731	CTT	2	6	338100	338105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_014731	CCA	2	6	338245	338250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7562	NC_014731	CCG	2	6	338261	338266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7563	NC_014731	CA	3	6	338323	338328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7564	NC_014731	TAC	2	6	338342	338347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_014731	GAAC	2	8	338403	338410	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7566	NC_014731	GAT	2	6	338477	338482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_014731	CGAC	2	8	338522	338529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_014731	TCTG	2	8	338574	338581	0 %	50 %	25 %	25 %	313117132
7569	NC_014731	CGC	2	6	338645	338650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117132
7570	NC_014731	CCGA	2	8	338670	338677	25 %	0 %	25 %	50 %	313117132
7571	NC_014731	CCA	2	6	338697	338702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117132
7572	NC_014731	CCGT	2	8	338713	338720	0 %	25 %	25 %	50 %	313117132
7573	NC_014731	CGT	3	9	338777	338785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117132
7574	NC_014731	AT	3	6	338789	338794	50 %	50 %	0 %	0 %	313117132
7575	NC_014731	ATC	2	6	338802	338807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117132
7576	NC_014731	CCG	2	6	338872	338877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117132
7577	NC_014731	GTC	2	6	338914	338919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117132
7578	NC_014731	TCACT	2	10	338926	338935	20 %	40 %	0 %	40 %	313117132

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.