MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 7578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014731	CGAG	2	8	195401	195408	25 %	0 %	50 %	25 %	313117006
4502	NC_014731	CCG	2	6	195440	195445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4503	NC_014731	CGC	2	6	195468	195473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4504	NC_014731	TCG	2	6	195476	195481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4505	NC_014731	CGG	3	9	195492	195500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117006
4506	NC_014731	GCC	2	6	195508	195513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4507	NC_014731	TCG	2	6	195556	195561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4508	NC_014731	GTA	2	6	195631	195636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117006
4509	NC_014731	CGT	2	6	195637	195642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4510	NC_014731	CGT	2	6	195675	195680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4511	NC_014731	AAG	2	6	195682	195687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117006
4512	NC_014731	CCGT	2	8	195692	195699	0 %	25 %	25 %	50 %	313117006
4513	NC_014731	GAA	2	6	195706	195711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117006
4514	NC_014731	GATC	2	8	195780	195787	25 %	25 %	25 %	25 %	313117006
4515	NC_014731	CCT	2	6	195837	195842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117006
4516	NC_014731	GAA	2	6	195856	195861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117006
4517	NC_014731	TGATC	2	10	195864	195873	20 %	40 %	20 %	20 %	313117006
4518	NC_014731	TCG	2	6	195881	195886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4519	NC_014731	GTC	2	6	195910	195915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4520	NC_014731	TGA	2	6	195930	195935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117006
4521	NC_014731	CGT	2	6	196000	196005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4522	NC_014731	TGG	2	6	196014	196019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117006
4523	NC_014731	CGGT	2	8	196118	196125	0 %	25 %	50 %	25 %	313117006
4524	NC_014731	GGA	2	6	196176	196181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117006
4525	NC_014731	CGCGC	2	10	196219	196228	0 %	0 %	40 %	60 %	313117006
4526	NC_014731	CGC	2	6	196291	196296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4527	NC_014731	TCG	2	6	196406	196411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4528	NC_014731	TTC	2	6	196552	196557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117006
4529	NC_014731	CGG	2	6	196710	196715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117006
4530	NC_014731	CGCC	2	8	196743	196750	0 %	0 %	25 %	75 %	313117006
4531	NC_014731	CTC	2	6	196789	196794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117006
4532	NC_014731	TCG	2	6	196850	196855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4533	NC_014731	CGG	2	6	196893	196898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117006
4534	NC_014731	TCG	2	6	196925	196930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4535	NC_014731	GCCGC	2	10	196997	197006	0 %	0 %	40 %	60 %	313117006
4536	NC_014731	CGC	2	6	197029	197034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4537	NC_014731	CGT	2	6	197040	197045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4538	NC_014731	CCG	2	6	197144	197149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4539	NC_014731	GTG	2	6	197170	197175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117006
4540	NC_014731	GTC	2	6	197203	197208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4541	NC_014731	AGG	2	6	197229	197234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117006
4542	NC_014731	GCGTCG	2	12	197268	197279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313117006
4543	NC_014731	CGT	2	6	197307	197312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4544	NC_014731	GTC	2	6	197338	197343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4545	NC_014731	CTC	2	6	197344	197349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117006
4546	NC_014731	TGA	2	6	197424	197429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117006
4547	NC_014731	GTC	2	6	197473	197478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4548	NC_014731	TCG	2	6	197507	197512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4549	NC_014731	ACCG	2	8	197520	197527	25 %	0 %	25 %	50 %	313117006
4550	NC_014731	AGG	2	6	197546	197551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117006
4551	NC_014731	CGC	2	6	197562	197567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4552	NC_014731	CGC	2	6	197578	197583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4553	NC_014731	CGT	2	6	197599	197604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4554	NC_014731	TCG	3	9	197612	197620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4555	NC_014731	GCC	2	6	197664	197669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117006
4556	NC_014731	CAG	2	6	197679	197684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4557	NC_014731	CGT	2	6	197769	197774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4558	NC_014731	TCG	2	6	197816	197821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4559	NC_014731	CGT	2	6	197871	197876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4560	NC_014731	GTC	2	6	197885	197890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117006
4561	NC_014731	TG	3	6	197891	197896	0 %	50 %	50 %	0 %	313117006
4562	NC_014731	GGACC	2	10	197925	197934	20 %	0 %	40 %	40 %	313117007
4563	NC_014731	CGTCT	2	10	197942	197951	0 %	40 %	20 %	40 %	313117007
4564	NC_014731	TCG	2	6	197979	197984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4565	NC_014731	CTC	2	6	197990	197995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117007
4566	NC_014731	CGA	2	6	198082	198087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4567	NC_014731	GACGA	2	10	198093	198102	40 %	0 %	40 %	20 %	313117007
4568	NC_014731	TCG	2	6	198162	198167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4569	NC_014731	GCC	2	6	198200	198205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117007
4570	NC_014731	CGTC	2	8	198237	198244	0 %	25 %	25 %	50 %	313117007
4571	NC_014731	T	6	6	198248	198253	0 %	100 %	0 %	0 %	313117007
4572	NC_014731	CGT	2	6	198287	198292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4573	NC_014731	GAAC	2	8	198299	198306	50 %	0 %	25 %	25 %	313117007
4574	NC_014731	CGG	2	6	198321	198326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117007
4575	NC_014731	CGA	2	6	198327	198332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4576	NC_014731	GGT	2	6	198335	198340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117007
4577	NC_014731	CGA	2	6	198364	198369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117007
4578	NC_014731	TGT	2	6	198446	198451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014731	AT	3	6	198473	198478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014731	GAT	2	6	198494	198499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014731	CGAA	2	8	198563	198570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_014731	CGG	2	6	198579	198584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_014731	ACC	2	6	198588	198593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_014731	TC	3	6	198609	198614	0 %	50 %	0 %	50 %	313117008
4585	NC_014731	TAC	2	6	198705	198710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117008
4586	NC_014731	TCG	2	6	198721	198726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4587	NC_014731	GCC	2	6	198744	198749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117008
4588	NC_014731	GTG	2	6	198780	198785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117008
4589	NC_014731	TCG	2	6	198829	198834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4590	NC_014731	ACG	2	6	198889	198894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4591	NC_014731	TCGAG	2	10	198898	198907	20 %	20 %	40 %	20 %	313117008
4592	NC_014731	AGG	2	6	198925	198930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117008
4593	NC_014731	CGT	3	9	198956	198964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4594	NC_014731	CAC	2	6	199006	199011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117008
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4596	NC_014731	TCG	2	6	199213	199218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4597	NC_014731	GCG	2	6	199269	199274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117008
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4599	NC_014731	TCG	2	6	199402	199407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4600	NC_014731	CGA	2	6	199441	199446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117008
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4602	NC_014731	TCG	2	6	199534	199539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117008
4603	NC_014731	GAT	2	6	199562	199567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117008
4604	NC_014731	CTGAC	2	10	199579	199588	20 %	20 %	20 %	40 %	313117008
4605	NC_014731	GTG	2	6	199637	199642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014731	CGA	2	6	199672	199677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_014731	CGAAG	2	10	199680	199689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4608	NC_014731	GAC	2	6	199699	199704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014731	CTC	2	6	199825	199830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117009
4610	NC_014731	GTGG	2	8	199889	199896	0 %	25 %	75 %	0 %	313117009
4611	NC_014731	CGTT	2	8	199907	199914	0 %	50 %	25 %	25 %	313117009
4612	NC_014731	GTT	2	6	199945	199950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117009
4613	NC_014731	CTG	2	6	200016	200021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117009
4614	NC_014731	GGC	2	6	200061	200066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117009
4615	NC_014731	TTG	2	6	200150	200155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014731	CTT	2	6	200181	200186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014731	CGG	2	6	200275	200280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117010
4618	NC_014731	CGAGCG	2	12	200381	200392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	313117010
4619	NC_014731	GAC	2	6	200456	200461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117010
4620	NC_014731	ACG	2	6	200511	200516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117010
4621	NC_014731	GGC	2	6	200546	200551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117010
4622	NC_014731	CGT	2	6	200618	200623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117010
4623	NC_014731	CGG	2	6	200624	200629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117010
4624	NC_014731	ACC	2	6	200638	200643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117010
4625	NC_014731	GGAC	2	8	200665	200672	25 %	0 %	50 %	25 %	313117010
4626	NC_014731	GA	3	6	200760	200765	50 %	0 %	50 %	0 %	313117010
4627	NC_014731	CG	3	6	200784	200789	0 %	0 %	50 %	50 %	313117010
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4630	NC_014731	ACG	2	6	200974	200979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117010
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4633	NC_014731	CGA	2	6	201024	201029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117010
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4653	NC_014731	GGTG	2	8	202116	202123	0 %	25 %	75 %	0 %	313117011
4654	NC_014731	CGT	2	6	202124	202129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117011
4655	NC_014731	CTGTC	2	10	202194	202203	0 %	40 %	20 %	40 %	313117011
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4657	NC_014731	CGAA	2	8	202275	202282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4658	NC_014731	TCC	2	6	202334	202339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117012
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4661	NC_014731	TCG	2	6	202455	202460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117012
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4682	NC_014731	CGTCGG	2	12	203461	203472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313117014
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4727	NC_014731	ATCCA	2	10	205163	205172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4728	NC_014731	GAT	2	6	205335	205340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117016
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4732	NC_014731	AGGGG	2	10	205624	205633	20 %	0 %	80 %	0 %	313117016
4733	NC_014731	AATCG	2	10	205659	205668	40 %	20 %	20 %	20 %	313117016
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4739	NC_014731	GAC	2	6	205863	205868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4740	NC_014731	TC	3	6	205901	205906	0 %	50 %	0 %	50 %	313117016
4741	NC_014731	GGA	2	6	206165	206170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117016
4742	NC_014731	CGC	2	6	206234	206239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117016
4743	NC_014731	CGA	2	6	206261	206266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4744	NC_014731	GTG	2	6	206278	206283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117016
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4746	NC_014731	CTCG	2	8	206351	206358	0 %	25 %	25 %	50 %	313117016
4747	NC_014731	TGG	2	6	206386	206391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117016
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4783	NC_014731	CTGG	2	8	208250	208257	0 %	25 %	50 %	25 %	313117017
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4858	NC_014731	GAC	2	6	211238	211243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4864	NC_014731	ATTTCT	2	12	211393	211404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313117021
4865	NC_014731	CTC	2	6	211421	211426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117021
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4867	NC_014731	GCA	2	6	211472	211477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117021
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4985	NC_014731	ACC	2	6	215870	215875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117027
4986	NC_014731	CGG	2	6	215883	215888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117027
4987	NC_014731	GCGCG	2	10	215889	215898	0 %	0 %	60 %	40 %	313117027
4988	NC_014731	CG	3	6	215966	215971	0 %	0 %	50 %	50 %	313117027
4989	NC_014731	TCG	2	6	216008	216013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117027
4990	NC_014731	ACGCCG	2	12	216020	216031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	313117027
4991	NC_014731	CGCC	2	8	216048	216055	0 %	0 %	25 %	75 %	313117027
4992	NC_014731	CCG	2	6	216099	216104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117027
4993	NC_014731	GAC	2	6	216232	216237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117027
4994	NC_014731	CGA	2	6	216399	216404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117027
4995	NC_014731	GGAGT	2	10	216428	216437	20 %	20 %	60 %	0 %	313117027
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4998	NC_014731	ACG	2	6	216588	216593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117028
4999	NC_014731	GCG	2	6	216612	216617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117028
5000	NC_014731	ACGACC	2	12	216636	216647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	313117028

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