MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014654	TTC	2	6	121931	121936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142506
3502	NC_014654	TCA	3	9	121959	121967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142506
3503	NC_014654	TTC	2	6	121976	121981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142506
3504	NC_014654	AT	3	6	121984	121989	50 %	50 %	0 %	0 %	312142506
3505	NC_014654	T	7	7	121989	121995	0 %	100 %	0 %	0 %	312142506
3506	NC_014654	T	6	6	122020	122025	0 %	100 %	0 %	0 %	312142506
3507	NC_014654	T	6	6	122027	122032	0 %	100 %	0 %	0 %	312142506
3508	NC_014654	TCTTA	2	10	122054	122063	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3509	NC_014654	TAA	2	6	122071	122076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014654	TA	3	6	122125	122130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014654	AAAATT	2	12	122153	122164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014654	CAGAT	2	10	122172	122181	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3513	NC_014654	T	7	7	122181	122187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014654	ACA	2	6	122195	122200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014654	TA	3	6	122242	122247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014654	TTTA	2	8	122311	122318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014654	TAA	2	6	122355	122360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3518	NC_014654	AAT	2	6	122370	122375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3519	NC_014654	TAC	2	6	122387	122392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142507
3520	NC_014654	ATA	2	6	122419	122424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3521	NC_014654	GTAG	2	8	122473	122480	25 %	25 %	50 %	0 %	312142507
3522	NC_014654	TGC	2	6	122499	122504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142507
3523	NC_014654	TAT	2	6	122525	122530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142507
3524	NC_014654	TGGC	2	8	122564	122571	0 %	25 %	50 %	25 %	312142507
3525	NC_014654	TAT	2	6	122664	122669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142507
3526	NC_014654	AGA	3	9	122724	122732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142507
3527	NC_014654	TAT	2	6	122797	122802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142507
3528	NC_014654	TCA	2	6	122809	122814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142507
3529	NC_014654	GTT	2	6	122869	122874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142507
3530	NC_014654	ATT	2	6	122881	122886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142507
3531	NC_014654	T	6	6	122916	122921	0 %	100 %	0 %	0 %	312142507
3532	NC_014654	CGG	2	6	122937	122942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142507
3533	NC_014654	AGC	2	6	122943	122948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142507
3534	NC_014654	TA	3	6	122995	123000	50 %	50 %	0 %	0 %	312142507
3535	NC_014654	AATTA	2	10	123021	123030	60 %	40 %	0 %	0 %	312142507
3536	NC_014654	T	6	6	123043	123048	0 %	100 %	0 %	0 %	312142507
3537	NC_014654	A	6	6	123066	123071	100 %	0 %	0 %	0 %	312142507
3538	NC_014654	CAG	2	6	123092	123097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142507
3539	NC_014654	TTG	2	6	123146	123151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142507
3540	NC_014654	TGC	2	6	123174	123179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142507
3541	NC_014654	CTG	2	6	123203	123208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142507
3542	NC_014654	TAA	2	6	123209	123214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3543	NC_014654	AAT	2	6	123249	123254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3544	NC_014654	AAC	2	6	123278	123283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142507
3545	NC_014654	TGG	2	6	123380	123385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142507
3546	NC_014654	TAA	2	6	123410	123415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142507
3547	NC_014654	GCTTTT	2	12	123445	123456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312142507
3548	NC_014654	T	6	6	123526	123531	0 %	100 %	0 %	0 %	312142507
3549	NC_014654	TATT	2	8	123571	123578	25 %	75 %	0 %	0 %	312142507
3550	NC_014654	AATTT	2	10	123587	123596	40 %	60 %	0 %	0 %	312142507
3551	NC_014654	TGG	2	6	123613	123618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142507
3552	NC_014654	GTT	2	6	123637	123642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142507
3553	NC_014654	A	6	6	123670	123675	100 %	0 %	0 %	0 %	312142507
3554	NC_014654	ATTT	2	8	123710	123717	25 %	75 %	0 %	0 %	312142508
3555	NC_014654	GA	3	6	123719	123724	50 %	0 %	50 %	0 %	312142508
3556	NC_014654	GTT	2	6	123885	123890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142508
3557	NC_014654	GCT	2	6	123974	123979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142508
3558	NC_014654	TAA	2	6	124069	124074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142508
3559	NC_014654	AT	3	6	124076	124081	50 %	50 %	0 %	0 %	312142508
3560	NC_014654	TGA	2	6	124099	124104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142508
3561	NC_014654	AAAAG	2	10	124158	124167	80 %	0 %	20 %	0 %	312142508
3562	NC_014654	ACT	2	6	124180	124185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_014654	GAA	2	6	124317	124322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142509
3564	NC_014654	AGA	2	6	124354	124359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142509
3565	NC_014654	CTT	2	6	124416	124421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142509
3566	NC_014654	TGT	2	6	124507	124512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142509
3567	NC_014654	A	6	6	124521	124526	100 %	0 %	0 %	0 %	312142509
3568	NC_014654	ATA	2	6	124533	124538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142509
3569	NC_014654	AT	4	8	124541	124548	50 %	50 %	0 %	0 %	312142509
3570	NC_014654	AGA	2	6	124616	124621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142509
3571	NC_014654	A	7	7	124647	124653	100 %	0 %	0 %	0 %	312142509
3572	NC_014654	TCT	2	6	124667	124672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142509
3573	NC_014654	GAT	2	6	124679	124684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142509
3574	NC_014654	GAT	2	6	124718	124723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142509
3575	NC_014654	ATG	2	6	124764	124769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142510
3576	NC_014654	GCAAAG	2	12	124810	124821	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312142510
3577	NC_014654	GAA	2	6	124872	124877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142510
3578	NC_014654	ATA	2	6	124882	124887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142510
3579	NC_014654	ATT	2	6	124891	124896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142510
3580	NC_014654	A	7	7	124905	124911	100 %	0 %	0 %	0 %	312142510
3581	NC_014654	ATTG	2	8	124920	124927	25 %	50 %	25 %	0 %	312142510
3582	NC_014654	TCAGC	2	10	124944	124953	20 %	20 %	20 %	40 %	312142510
3583	NC_014654	TAATT	2	10	125070	125079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014654	ATT	2	6	125179	125184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014654	AAT	2	6	125205	125210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014654	TAA	3	9	125216	125224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014654	GGA	2	6	125247	125252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014654	ATG	2	6	125364	125369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142511
3589	NC_014654	AGA	2	6	125425	125430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142511
3590	NC_014654	TTA	2	6	125442	125447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142511
3591	NC_014654	AGAT	2	8	125481	125488	50 %	25 %	25 %	0 %	312142511
3592	NC_014654	TAA	2	6	125500	125505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142511
3593	NC_014654	CTGG	2	8	125512	125519	0 %	25 %	50 %	25 %	312142511
3594	NC_014654	AG	3	6	125656	125661	50 %	0 %	50 %	0 %	312142511
3595	NC_014654	AAG	2	6	125688	125693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142511
3596	NC_014654	GTT	3	9	125705	125713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142511
3597	NC_014654	AGC	2	6	125734	125739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142511
3598	NC_014654	TAA	2	6	125755	125760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142511
3599	NC_014654	T	6	6	125780	125785	0 %	100 %	0 %	0 %	312142511
3600	NC_014654	GTAGAT	2	12	125795	125806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142511
3601	NC_014654	TAT	2	6	125809	125814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142511
3602	NC_014654	GAA	2	6	125816	125821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142511
3603	NC_014654	TA	3	6	125822	125827	50 %	50 %	0 %	0 %	312142511
3604	NC_014654	TGAT	2	8	125856	125863	25 %	50 %	25 %	0 %	312142511
3605	NC_014654	TTC	2	6	125884	125889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142511
3606	NC_014654	TAT	2	6	125948	125953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142511
3607	NC_014654	AGA	2	6	125971	125976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142511
3608	NC_014654	AAAG	2	8	126020	126027	75 %	0 %	25 %	0 %	312142511
3609	NC_014654	T	6	6	126029	126034	0 %	100 %	0 %	0 %	312142511
3610	NC_014654	GAT	2	6	126056	126061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142511
3611	NC_014654	GGT	2	6	126101	126106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142511
3612	NC_014654	TAA	2	6	126175	126180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142511
3613	NC_014654	T	6	6	126218	126223	0 %	100 %	0 %	0 %	312142511
3614	NC_014654	AGAA	2	8	126230	126237	75 %	0 %	25 %	0 %	312142511
3615	NC_014654	GAT	2	6	126263	126268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142511
3616	NC_014654	AAC	2	6	126275	126280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142511
3617	NC_014654	AT	3	6	126289	126294	50 %	50 %	0 %	0 %	312142511
3618	NC_014654	GTTTT	2	10	126348	126357	0 %	80 %	20 %	0 %	312142511
3619	NC_014654	AGG	2	6	126417	126422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142511
3620	NC_014654	TCA	2	6	126529	126534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142512
3621	NC_014654	GGA	2	6	126535	126540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142512
3622	NC_014654	AGT	2	6	126625	126630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142512
3623	NC_014654	AT	3	6	126705	126710	50 %	50 %	0 %	0 %	312142512
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3625	NC_014654	TTA	2	6	126731	126736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142512
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