MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014654	AGC	2	6	602344	602349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142889
16003	NC_014654	ATG	2	6	602394	602399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
16004	NC_014654	TCA	2	6	602473	602478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142889
16005	NC_014654	TGC	2	6	602560	602565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142889
16006	NC_014654	GAA	2	6	602579	602584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142889
16007	NC_014654	ACA	2	6	602597	602602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142889
16008	NC_014654	ATG	2	6	602627	602632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
16009	NC_014654	TAA	2	6	602641	602646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142889
16010	NC_014654	AAGA	2	8	602689	602696	75 %	0 %	25 %	0 %	312142889
16011	NC_014654	TGT	2	6	602719	602724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142889
16012	NC_014654	AGAGA	2	10	602756	602765	60 %	0 %	40 %	0 %	312142889
16013	NC_014654	TGA	2	6	602791	602796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
16014	NC_014654	GAT	2	6	602797	602802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
16015	NC_014654	ATT	2	6	602865	602870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142889
16016	NC_014654	AGAA	2	8	602900	602907	75 %	0 %	25 %	0 %	312142889
16017	NC_014654	CAA	2	6	602921	602926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142889
16018	NC_014654	GA	3	6	602962	602967	50 %	0 %	50 %	0 %	312142889
16019	NC_014654	GGT	2	6	603046	603051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142889
16020	NC_014654	TGG	2	6	603088	603093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142889
16021	NC_014654	AGA	2	6	603106	603111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142889
16022	NC_014654	GCC	2	6	603155	603160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312142889
16023	NC_014654	TGG	2	6	603229	603234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142889
16024	NC_014654	A	6	6	603248	603253	100 %	0 %	0 %	0 %	312142889
16025	NC_014654	CTG	2	6	603255	603260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142889
16026	NC_014654	TGA	2	6	603277	603282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
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16029	NC_014654	TA	3	6	603335	603340	50 %	50 %	0 %	0 %	312142889
16030	NC_014654	GGT	2	6	603434	603439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142889
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16032	NC_014654	CTCGG	2	10	603452	603461	0 %	20 %	40 %	40 %	312142889
16033	NC_014654	TGC	2	6	603475	603480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142889
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16038	NC_014654	GAT	2	6	603718	603723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142889
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16042	NC_014654	AGGAG	2	10	603833	603842	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_014654	AT	3	6	603844	603849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_014654	TGC	2	6	603961	603966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142890
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16053	NC_014654	GCA	2	6	604346	604351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142890
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16104	NC_014654	ATA	2	6	606234	606239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_014654	TAT	2	6	606321	606326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_014654	TTTTA	2	10	606344	606353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_014654	T	7	7	606368	606374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_014654	GAA	2	6	606379	606384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_014654	AG	3	6	606421	606426	50 %	0 %	50 %	0 %	312142892
16110	NC_014654	CTT	2	6	606483	606488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142892
16111	NC_014654	CTTT	2	8	606550	606557	0 %	75 %	0 %	25 %	312142892
16112	NC_014654	CTG	2	6	606594	606599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142892
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16118	NC_014654	AT	3	6	606978	606983	50 %	50 %	0 %	0 %	312142892
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16122	NC_014654	TGA	2	6	607125	607130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142893
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16497	NC_014654	TCA	2	6	621106	621111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16498	NC_014654	TTC	2	6	621138	621143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16499	NC_014654	TCA	2	6	621178	621183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16500	NC_014654	AT	3	6	621195	621200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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