MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014654	GTT	2	6	564656	564661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142864
15002	NC_014654	ATA	2	6	564666	564671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
15003	NC_014654	GAA	2	6	564689	564694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
15004	NC_014654	CAT	2	6	564699	564704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142864
15005	NC_014654	AGA	2	6	564790	564795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
15006	NC_014654	GTG	2	6	564843	564848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142864
15007	NC_014654	GATA	2	8	564895	564902	50 %	25 %	25 %	0 %	312142864
15008	NC_014654	AGA	2	6	564964	564969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
15009	NC_014654	AGT	2	6	565039	565044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
15010	NC_014654	TAT	2	6	565064	565069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142864
15011	NC_014654	TCC	2	6	565093	565098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142864
15012	NC_014654	GAT	2	6	565103	565108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
15013	NC_014654	AGA	2	6	565118	565123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
15014	NC_014654	CTG	2	6	565166	565171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142864
15015	NC_014654	AAT	2	6	565198	565203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
15016	NC_014654	TTCT	2	8	565216	565223	0 %	75 %	0 %	25 %	312142864
15017	NC_014654	CT	3	6	565242	565247	0 %	50 %	0 %	50 %	312142864
15018	NC_014654	AGA	2	6	565282	565287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
15019	NC_014654	TGG	2	6	565298	565303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142864
15020	NC_014654	GAT	2	6	565304	565309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
15021	NC_014654	AAT	2	6	565340	565345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_014654	AGGG	2	8	565364	565371	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_014654	TCC	2	6	565375	565380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15024	NC_014654	T	8	8	565384	565391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_014654	AAT	2	6	565463	565468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
15026	NC_014654	TAA	3	9	565474	565482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
15027	NC_014654	T	7	7	565484	565490	0 %	100 %	0 %	0 %	312142865
15028	NC_014654	ACTAT	2	10	565500	565509	40 %	40 %	0 %	20 %	312142865
15029	NC_014654	T	6	6	565509	565514	0 %	100 %	0 %	0 %	312142865
15030	NC_014654	ATGG	2	8	565557	565564	25 %	25 %	50 %	0 %	312142865
15031	NC_014654	AGA	2	6	565574	565579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142865
15032	NC_014654	TAG	2	6	565621	565626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
15033	NC_014654	TATTT	2	10	565632	565641	20 %	80 %	0 %	0 %	312142865
15034	NC_014654	TCATT	2	10	565677	565686	20 %	60 %	0 %	20 %	312142865
15035	NC_014654	TTA	2	6	565794	565799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
15036	NC_014654	TAG	2	6	565837	565842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
15037	NC_014654	G	6	6	565842	565847	0 %	0 %	100 %	0 %	312142865
15038	NC_014654	TAT	2	6	565892	565897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
15039	NC_014654	CTGG	2	8	565910	565917	0 %	25 %	50 %	25 %	312142865
15040	NC_014654	ACCA	2	8	565925	565932	50 %	0 %	0 %	50 %	312142865
15041	NC_014654	AAT	2	6	565979	565984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
15042	NC_014654	ATT	2	6	565993	565998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
15043	NC_014654	ATCTT	2	10	566005	566014	20 %	60 %	0 %	20 %	312142865
15044	NC_014654	GAC	2	6	566021	566026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142865
15045	NC_014654	TAT	2	6	566037	566042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
15046	NC_014654	TGT	2	6	566180	566185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142865
15047	NC_014654	GTA	3	9	566229	566237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
15048	NC_014654	GGT	2	6	566240	566245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142865
15049	NC_014654	ATG	3	9	566325	566333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
15050	NC_014654	GGTCT	2	10	566337	566346	0 %	40 %	40 %	20 %	312142865
15051	NC_014654	CAG	2	6	566359	566364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142865
15052	NC_014654	G	6	6	566408	566413	0 %	0 %	100 %	0 %	312142865
15053	NC_014654	AAAT	2	8	566414	566421	75 %	25 %	0 %	0 %	312142865
15054	NC_014654	A	6	6	566432	566437	100 %	0 %	0 %	0 %	312142866
15055	NC_014654	TGC	2	6	566472	566477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142866
15056	NC_014654	ATA	2	6	566501	566506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
15057	NC_014654	ATA	2	6	566549	566554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
15058	NC_014654	ATGA	2	8	566606	566613	50 %	25 %	25 %	0 %	312142866
15059	NC_014654	TGA	2	6	566641	566646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
15060	NC_014654	GTT	2	6	566672	566677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142866
15061	NC_014654	AGC	2	6	566725	566730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142866
15062	NC_014654	TGG	2	6	566737	566742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142866
15063	NC_014654	AT	5	10	566743	566752	50 %	50 %	0 %	0 %	312142866
15064	NC_014654	GAAAT	2	10	566831	566840	60 %	20 %	20 %	0 %	312142866
15065	NC_014654	TACAGA	2	12	566902	566913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312142866
15066	NC_014654	GTA	2	6	567093	567098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
15067	NC_014654	CTT	2	6	567132	567137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142866
15068	NC_014654	GCTG	2	8	567172	567179	0 %	25 %	50 %	25 %	312142866
15069	NC_014654	ATG	2	6	567240	567245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
15070	NC_014654	GAT	2	6	567263	567268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
15071	NC_014654	CT	3	6	567283	567288	0 %	50 %	0 %	50 %	312142866
15072	NC_014654	ATG	2	6	567357	567362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
15073	NC_014654	AAG	2	6	567394	567399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142866
15074	NC_014654	T	6	6	567494	567499	0 %	100 %	0 %	0 %	312142866
15075	NC_014654	TATG	2	8	567538	567545	25 %	50 %	25 %	0 %	312142866
15076	NC_014654	TGGT	2	8	567564	567571	0 %	50 %	50 %	0 %	312142866
15077	NC_014654	AGC	2	6	567577	567582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142866
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15080	NC_014654	T	6	6	567652	567657	0 %	100 %	0 %	0 %	312142866
15081	NC_014654	TTG	2	6	567666	567671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142866
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15083	NC_014654	ATA	2	6	567791	567796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
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15087	NC_014654	TTCA	2	8	568017	568024	25 %	50 %	0 %	25 %	312142866
15088	NC_014654	TGG	3	9	568055	568063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142866
15089	NC_014654	ATT	2	6	568078	568083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142866
15090	NC_014654	TG	3	6	568088	568093	0 %	50 %	50 %	0 %	312142866
15091	NC_014654	GAG	2	6	568155	568160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142866
15092	NC_014654	CCTGAA	2	12	568175	568186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312142866
15093	NC_014654	AATAA	2	10	568215	568224	80 %	20 %	0 %	0 %	312142866
15094	NC_014654	CAA	2	6	568339	568344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142867
15095	NC_014654	TGG	2	6	568346	568351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142867
15096	NC_014654	TAG	2	6	568354	568359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142867
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15098	NC_014654	ATTT	2	8	568564	568571	25 %	75 %	0 %	0 %	312142867
15099	NC_014654	GTT	2	6	568644	568649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142867
15100	NC_014654	GCGATG	2	12	568653	568664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312142867
15101	NC_014654	TGT	2	6	568715	568720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142867
15102	NC_014654	CAAAA	2	10	568758	568767	80 %	0 %	0 %	20 %	312142867
15103	NC_014654	TTC	2	6	568772	568777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142867
15104	NC_014654	AGT	2	6	568805	568810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142867
15105	NC_014654	CAG	2	6	568831	568836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142867
15106	NC_014654	TATG	2	8	568838	568845	25 %	50 %	25 %	0 %	312142867
15107	NC_014654	CCGG	2	8	568846	568853	0 %	0 %	50 %	50 %	312142867
15108	NC_014654	AG	3	6	568875	568880	50 %	0 %	50 %	0 %	312142867
15109	NC_014654	ATC	2	6	568897	568902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142867
15110	NC_014654	TTA	2	6	568918	568923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142867
15111	NC_014654	GCG	2	6	568944	568949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142867
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15113	NC_014654	CCA	2	6	568980	568985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142867
15114	NC_014654	AAAG	2	8	569019	569026	75 %	0 %	25 %	0 %	312142867
15115	NC_014654	TAG	2	6	569092	569097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142867
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15117	NC_014654	T	7	7	569261	569267	0 %	100 %	0 %	0 %	312142867
15118	NC_014654	A	8	8	569273	569280	100 %	0 %	0 %	0 %	312142867
15119	NC_014654	GCA	2	6	569396	569401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142867
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15121	NC_014654	GTT	2	6	569490	569495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142867
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15245	NC_014654	TCTTG	2	10	574030	574039	0 %	60 %	20 %	20 %	312142872
15246	NC_014654	TTA	2	6	574047	574052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142872
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15248	NC_014654	T	6	6	574088	574093	0 %	100 %	0 %	0 %	312142872
15249	NC_014654	ATT	2	6	574116	574121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142872
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15263	NC_014654	GCT	2	6	574913	574918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142872
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15273	NC_014654	TTA	2	6	575198	575203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15274	NC_014654	AGG	2	6	575225	575230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15275	NC_014654	ATTAT	2	10	575263	575272	40 %	60 %	0 %	0 %	312142873
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15285	NC_014654	T	6	6	575697	575702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15311	NC_014654	TA	3	6	576597	576602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15312	NC_014654	TGA	2	6	576621	576626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15363	NC_014654	T	8	8	578567	578574	0 %	100 %	0 %	0 %	312142876
15364	NC_014654	GCA	2	6	578692	578697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142876
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15493	NC_014654	TGA	2	6	582562	582567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142879
15494	NC_014654	A	6	6	582590	582595	100 %	0 %	0 %	0 %	312142879
15495	NC_014654	GAA	3	9	582596	582604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142879
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