MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014654	GTTT	2	8	543515	543522	0 %	75 %	25 %	0 %	312142849
14502	NC_014654	TGC	2	6	543633	543638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142849
14503	NC_014654	TAAT	2	8	543704	543711	50 %	50 %	0 %	0 %	312142849
14504	NC_014654	TA	3	6	543716	543721	50 %	50 %	0 %	0 %	312142849
14505	NC_014654	TGGT	2	8	543782	543789	0 %	50 %	50 %	0 %	312142849
14506	NC_014654	TTAA	2	8	543800	543807	50 %	50 %	0 %	0 %	312142850
14507	NC_014654	A	6	6	543929	543934	100 %	0 %	0 %	0 %	312142850
14508	NC_014654	A	8	8	544010	544017	100 %	0 %	0 %	0 %	312142850
14509	NC_014654	CTTA	2	8	544045	544052	25 %	50 %	0 %	25 %	312142850
14510	NC_014654	AAG	2	6	544098	544103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142850
14511	NC_014654	A	6	6	544140	544145	100 %	0 %	0 %	0 %	312142850
14512	NC_014654	AAT	2	6	544163	544168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142850
14513	NC_014654	TTTGAA	2	12	544217	544228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142850
14514	NC_014654	AGATT	2	10	544251	544260	40 %	40 %	20 %	0 %	312142850
14515	NC_014654	T	6	6	544336	544341	0 %	100 %	0 %	0 %	312142850
14516	NC_014654	GA	3	6	544376	544381	50 %	0 %	50 %	0 %	312142850
14517	NC_014654	T	6	6	544432	544437	0 %	100 %	0 %	0 %	312142850
14518	NC_014654	A	6	6	544442	544447	100 %	0 %	0 %	0 %	312142850
14519	NC_014654	AAG	2	6	544479	544484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142850
14520	NC_014654	TCC	2	6	544492	544497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142850
14521	NC_014654	AAT	2	6	544498	544503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142850
14522	NC_014654	ATT	2	6	544516	544521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142850
14523	NC_014654	TAAA	2	8	544530	544537	75 %	25 %	0 %	0 %	312142850
14524	NC_014654	GA	3	6	544541	544546	50 %	0 %	50 %	0 %	312142850
14525	NC_014654	ATTT	2	8	544553	544560	25 %	75 %	0 %	0 %	312142850
14526	NC_014654	TAA	2	6	544603	544608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142850
14527	NC_014654	AGCA	2	8	544625	544632	50 %	0 %	25 %	25 %	312142850
14528	NC_014654	GAA	2	6	544646	544651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142850
14529	NC_014654	ATA	2	6	544694	544699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_014654	TATAAT	2	12	544744	544755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_014654	GA	3	6	544767	544772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_014654	GAA	2	6	544786	544791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14533	NC_014654	TAA	2	6	544830	544835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142851
14534	NC_014654	TTTTCT	2	12	544845	544856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312142851
14535	NC_014654	T	6	6	544859	544864	0 %	100 %	0 %	0 %	312142851
14536	NC_014654	ATT	2	6	544931	544936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14537	NC_014654	CAG	2	6	544960	544965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142851
14538	NC_014654	AAG	2	6	544971	544976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14539	NC_014654	ATT	2	6	545017	545022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14540	NC_014654	AGA	2	6	545071	545076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14541	NC_014654	GCT	2	6	545117	545122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142851
14542	NC_014654	AACT	2	8	545217	545224	50 %	25 %	0 %	25 %	312142851
14543	NC_014654	T	6	6	545265	545270	0 %	100 %	0 %	0 %	312142851
14544	NC_014654	TGA	2	6	545272	545277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142851
14545	NC_014654	TAT	2	6	545304	545309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14546	NC_014654	GAA	2	6	545330	545335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14547	NC_014654	TG	3	6	545357	545362	0 %	50 %	50 %	0 %	312142851
14548	NC_014654	A	6	6	545370	545375	100 %	0 %	0 %	0 %	312142851
14549	NC_014654	TTA	2	6	545397	545402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14550	NC_014654	AGA	2	6	545426	545431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14551	NC_014654	ATT	3	9	545445	545453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14552	NC_014654	AAT	2	6	545495	545500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142851
14553	NC_014654	ATT	2	6	545513	545518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14554	NC_014654	TAT	2	6	545538	545543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142851
14555	NC_014654	GTT	2	6	545567	545572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142851
14556	NC_014654	GAT	2	6	545645	545650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142851
14557	NC_014654	TCA	2	6	545788	545793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142851
14558	NC_014654	TGA	2	6	545800	545805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142851
14559	NC_014654	TAA	2	6	545811	545816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142851
14560	NC_014654	ATC	2	6	545891	545896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142851
14561	NC_014654	AAG	2	6	545949	545954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14562	NC_014654	AGA	2	6	546022	546027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14563	NC_014654	CT	3	6	546037	546042	0 %	50 %	0 %	50 %	312142851
14564	NC_014654	GAA	2	6	546087	546092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142851
14565	NC_014654	T	8	8	546130	546137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_014654	ATTTA	2	10	546142	546151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_014654	GATT	2	8	546174	546181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_014654	AGG	2	6	546251	546256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_014654	TTG	2	6	546331	546336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142852
14570	NC_014654	GAA	2	6	546381	546386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14571	NC_014654	AG	3	6	546474	546479	50 %	0 %	50 %	0 %	312142852
14572	NC_014654	ATG	2	6	546517	546522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
14573	NC_014654	TGC	2	6	546596	546601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142852
14574	NC_014654	TTTA	2	8	546613	546620	25 %	75 %	0 %	0 %	312142852
14575	NC_014654	TGT	2	6	546647	546652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142852
14576	NC_014654	ATGG	2	8	546689	546696	25 %	25 %	50 %	0 %	312142852
14577	NC_014654	T	6	6	546710	546715	0 %	100 %	0 %	0 %	312142852
14578	NC_014654	GTCG	2	8	546722	546729	0 %	25 %	50 %	25 %	312142852
14579	NC_014654	CTG	2	6	546754	546759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142852
14580	NC_014654	AAT	2	6	546801	546806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142852
14581	NC_014654	GAA	2	6	546849	546854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14582	NC_014654	TTA	2	6	546934	546939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142852
14583	NC_014654	GGTCC	2	10	546945	546954	0 %	20 %	40 %	40 %	312142852
14584	NC_014654	A	6	6	546958	546963	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14585	NC_014654	A	6	6	547004	547009	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14586	NC_014654	GAA	2	6	547059	547064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
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14588	NC_014654	A	6	6	547173	547178	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14589	NC_014654	CGC	2	6	547251	547256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312142852
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14592	NC_014654	GAA	3	9	547401	547409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14593	NC_014654	AT	3	6	547422	547427	50 %	50 %	0 %	0 %	312142852
14594	NC_014654	CAA	2	6	547454	547459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142852
14595	NC_014654	ATA	2	6	547474	547479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142852
14596	NC_014654	ATC	2	6	547680	547685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142852
14597	NC_014654	A	7	7	547701	547707	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14598	NC_014654	CTA	2	6	547720	547725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142852
14599	NC_014654	TGG	2	6	547778	547783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142852
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14601	NC_014654	TGA	2	6	547961	547966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
14602	NC_014654	ATG	2	6	548068	548073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
14603	NC_014654	TAAA	2	8	548080	548087	75 %	25 %	0 %	0 %	312142852
14604	NC_014654	TTAT	2	8	548098	548105	25 %	75 %	0 %	0 %	312142852
14605	NC_014654	A	6	6	548146	548151	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14606	NC_014654	TGA	2	6	548177	548182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
14607	NC_014654	TGA	2	6	548219	548224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
14608	NC_014654	GAA	2	6	548313	548318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14609	NC_014654	AAAAG	2	10	548321	548330	80 %	0 %	20 %	0 %	312142852
14610	NC_014654	ATC	3	9	548331	548339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142852
14611	NC_014654	A	6	6	548362	548367	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
14612	NC_014654	ATT	2	6	548400	548405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142852
14613	NC_014654	ATA	2	6	548455	548460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142852
14614	NC_014654	AGA	2	6	548573	548578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14615	NC_014654	TAG	2	6	548581	548586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
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14617	NC_014654	AAG	2	6	548620	548625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
14618	NC_014654	ATT	2	6	548659	548664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142852
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14620	NC_014654	CAG	2	6	548723	548728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142852
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