MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_014654	CT	3	6	525202	525207	0 %	50 %	0 %	50 %	312142834
14003	NC_014654	GAT	2	6	525230	525235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142834
14004	NC_014654	TGGA	2	8	525295	525302	25 %	25 %	50 %	0 %	312142834
14005	NC_014654	AGA	2	6	525374	525379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142834
14006	NC_014654	ATT	2	6	525382	525387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142834
14007	NC_014654	GTTC	2	8	525399	525406	0 %	50 %	25 %	25 %	312142834
14008	NC_014654	AAT	2	6	525429	525434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142834
14009	NC_014654	AT	3	6	525467	525472	50 %	50 %	0 %	0 %	312142834
14010	NC_014654	AAG	2	6	525493	525498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142834
14011	NC_014654	GAAAT	2	10	525546	525555	60 %	20 %	20 %	0 %	312142834
14012	NC_014654	ATA	2	6	525577	525582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142834
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14016	NC_014654	CAG	2	6	525750	525755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142834
14017	NC_014654	AGA	2	6	525779	525784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142834
14018	NC_014654	TGGA	2	8	525832	525839	25 %	25 %	50 %	0 %	312142834
14019	NC_014654	GTC	2	6	525858	525863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142834
14020	NC_014654	GTC	2	6	525880	525885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142834
14021	NC_014654	TAA	2	6	525901	525906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142834
14022	NC_014654	AAATT	2	10	525932	525941	60 %	40 %	0 %	0 %	312142834
14023	NC_014654	ATT	2	6	525948	525953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_014654	TAA	2	6	525978	525983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014654	A	8	8	526016	526023	100 %	0 %	0 %	0 %	312142835
14026	NC_014654	CAG	3	9	526068	526076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142835
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14028	NC_014654	TGA	2	6	526210	526215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142835
14029	NC_014654	ATTT	2	8	526245	526252	25 %	75 %	0 %	0 %	312142835
14030	NC_014654	AGA	3	9	526255	526263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142835
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14032	NC_014654	CTA	2	6	526381	526386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142835
14033	NC_014654	GTGGA	2	10	526428	526437	20 %	20 %	60 %	0 %	312142835
14034	NC_014654	AGG	2	6	526544	526549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_014654	AGA	2	6	526572	526577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142836
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14038	NC_014654	GGT	3	9	526729	526737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142836
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14105	NC_014654	GGCT	2	8	529267	529274	0 %	25 %	50 %	25 %	312142839
14106	NC_014654	CTG	2	6	529290	529295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142839
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14113	NC_014654	A	6	6	529520	529525	100 %	0 %	0 %	0 %	312142839
14114	NC_014654	TCT	2	6	529545	529550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142839
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14116	NC_014654	AATAT	2	10	529614	529623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14120	NC_014654	GAA	2	6	529994	529999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142840
14121	NC_014654	GAA	2	6	530006	530011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142840
14122	NC_014654	TAA	2	6	530029	530034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142840
14123	NC_014654	AGA	3	9	530047	530055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142840
14124	NC_014654	AATG	2	8	530119	530126	50 %	25 %	25 %	0 %	312142840
14125	NC_014654	GAA	2	6	530129	530134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142840
14126	NC_014654	CTT	2	6	530167	530172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142840
14127	NC_014654	AGA	2	6	530194	530199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142840
14128	NC_014654	TGT	2	6	530206	530211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142840
14129	NC_014654	ATG	2	6	530223	530228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142840
14130	NC_014654	CAA	2	6	530250	530255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142840
14131	NC_014654	ATA	2	6	530271	530276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_014654	T	8	8	530332	530339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_014654	A	6	6	530353	530358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_014654	AGA	2	6	530360	530365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14135	NC_014654	AT	3	6	530384	530389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_014654	AT	3	6	530414	530419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_014654	T	7	7	530419	530425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_014654	A	6	6	530426	530431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_014654	TAT	2	6	530450	530455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_014654	A	6	6	530486	530491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_014654	TTAG	2	8	530496	530503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_014654	T	6	6	530513	530518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_014654	A	7	7	530536	530542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_014654	A	6	6	530546	530551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14145	NC_014654	A	6	6	530563	530568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14146	NC_014654	AGT	2	6	530574	530579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_014654	GGA	2	6	530603	530608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14148	NC_014654	AAT	2	6	530635	530640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142841
14149	NC_014654	TTAT	2	8	530654	530661	25 %	75 %	0 %	0 %	312142841
14150	NC_014654	CAG	2	6	530679	530684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142841
14151	NC_014654	GCA	2	6	530690	530695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142841
14152	NC_014654	CAGG	2	8	530756	530763	25 %	0 %	50 %	25 %	312142841
14153	NC_014654	AGA	2	6	530788	530793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142841
14154	NC_014654	TGA	3	9	530830	530838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14155	NC_014654	TGA	2	6	530842	530847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14156	NC_014654	TGA	2	6	530890	530895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14157	NC_014654	AG	3	6	530930	530935	50 %	0 %	50 %	0 %	312142841
14158	NC_014654	ATGATT	2	12	530940	530951	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142841
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14161	NC_014654	TGA	2	6	531052	531057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14162	NC_014654	AGT	3	9	531058	531066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14163	NC_014654	AGA	2	6	531074	531079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142841
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14165	NC_014654	T	6	6	531200	531205	0 %	100 %	0 %	0 %	312142841
14166	NC_014654	AAC	2	6	531234	531239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142841
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14178	NC_014654	TGA	2	6	531703	531708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14179	NC_014654	ATG	2	6	531726	531731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
14180	NC_014654	CTA	2	6	531732	531737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142841
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14182	NC_014654	AGC	2	6	531790	531795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142841
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14192	NC_014654	ATA	2	6	532248	532253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142841
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14195	NC_014654	AGT	2	6	532349	532354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
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14197	NC_014654	TAA	2	6	532534	532539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142841
14198	NC_014654	AT	3	6	532551	532556	50 %	50 %	0 %	0 %	312142841
14199	NC_014654	TGC	2	6	532558	532563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142841
14200	NC_014654	ATA	2	6	532665	532670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142841
14201	NC_014654	AT	3	6	532680	532685	50 %	50 %	0 %	0 %	312142841
14202	NC_014654	TGC	2	6	532687	532692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142841
14203	NC_014654	TAT	2	6	532750	532755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142841
14204	NC_014654	CAT	2	6	532884	532889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142841
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14206	NC_014654	TACT	2	8	532920	532927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14207	NC_014654	GA	3	6	532945	532950	50 %	0 %	50 %	0 %	312142842
14208	NC_014654	GT	3	6	532962	532967	0 %	50 %	50 %	0 %	312142842
14209	NC_014654	TCAA	2	8	532981	532988	50 %	25 %	0 %	25 %	312142842
14210	NC_014654	TA	4	8	533095	533102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14211	NC_014654	T	6	6	533119	533124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14212	NC_014654	T	7	7	533135	533141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14213	NC_014654	TGA	2	6	533146	533151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14214	NC_014654	AAT	2	6	533189	533194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14215	NC_014654	TCT	2	6	533206	533211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14216	NC_014654	ATT	2	6	533227	533232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14217	NC_014654	AAT	2	6	533252	533257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14218	NC_014654	AATTA	2	10	533306	533315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14219	NC_014654	CAATT	2	10	533334	533343	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14220	NC_014654	CATT	2	8	533379	533386	25 %	50 %	0 %	25 %	312142843
14221	NC_014654	ATT	3	9	533397	533405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142843
14222	NC_014654	AGC	2	6	533418	533423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142843
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14224	NC_014654	CTG	2	6	533480	533485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14225	NC_014654	TTG	2	6	533486	533491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142843
14226	NC_014654	ATC	2	6	533493	533498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142843
14227	NC_014654	TGC	2	6	533544	533549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14228	NC_014654	ATT	2	6	533554	533559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142843
14229	NC_014654	TGA	2	6	533598	533603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142843
14230	NC_014654	CAGA	2	8	533656	533663	50 %	0 %	25 %	25 %	312142843
14231	NC_014654	T	7	7	533673	533679	0 %	100 %	0 %	0 %	312142843
14232	NC_014654	TTA	3	9	533685	533693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142843
14233	NC_014654	GAT	2	6	533701	533706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142843
14234	NC_014654	CTG	2	6	533723	533728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14235	NC_014654	AGA	2	6	533742	533747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142843
14236	NC_014654	CTTTGC	2	12	533781	533792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312142843
14237	NC_014654	GCT	2	6	533806	533811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14238	NC_014654	CTA	2	6	533825	533830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142843
14239	NC_014654	TC	3	6	533833	533838	0 %	50 %	0 %	50 %	312142843
14240	NC_014654	CAG	2	6	533856	533861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14241	NC_014654	GAA	2	6	533908	533913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142843
14242	NC_014654	A	6	6	533918	533923	100 %	0 %	0 %	0 %	312142843
14243	NC_014654	TCA	2	6	533924	533929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142843
14244	NC_014654	TAA	2	6	533948	533953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142843
14245	NC_014654	TGC	2	6	533973	533978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14246	NC_014654	GTA	2	6	533980	533985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142843
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14250	NC_014654	CAG	2	6	534112	534117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142843
14251	NC_014654	ATAG	2	8	534238	534245	50 %	25 %	25 %	0 %	312142843
14252	NC_014654	TTA	2	6	534263	534268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142843
14253	NC_014654	ATGGTC	2	12	534290	534301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312142843
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14255	NC_014654	TGA	2	6	534465	534470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142843
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14257	NC_014654	TAG	2	6	534522	534527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142843
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14263	NC_014654	GCT	2	6	534628	534633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142843
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14273	NC_014654	ATT	2	6	534985	534990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142843
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14280	NC_014654	TGGG	2	8	535533	535540	0 %	25 %	75 %	0 %	312142844
14281	NC_014654	TAA	2	6	535587	535592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142844
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14345	NC_014654	ATC	2	6	537711	537716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142844
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14351	NC_014654	AGT	2	6	537908	537913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142844
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14354	NC_014654	TGAA	2	8	538059	538066	50 %	25 %	25 %	0 %	312142844
14355	NC_014654	ATG	2	6	538074	538079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142844
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14358	NC_014654	ACA	2	6	538176	538181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142844
14359	NC_014654	GTG	2	6	538200	538205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142844
14360	NC_014654	TGATTA	2	12	538240	538251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142844
14361	NC_014654	AGGG	2	8	538265	538272	25 %	0 %	75 %	0 %	312142844
14362	NC_014654	AG	3	6	538334	538339	50 %	0 %	50 %	0 %	312142844
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14488	NC_014654	T	6	6	542970	542975	0 %	100 %	0 %	0 %	312142849
14489	NC_014654	TTG	2	6	542999	543004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142849
14490	NC_014654	AATTTT	2	12	543093	543104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142849
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